More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0194 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0194  50S ribosomal protein L21  100 
 
 		 171 aa  332  1e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.472355 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2784  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  54.13 
 
 		 223 aa  123  1e-27  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.0566987  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3005  50S ribosomal protein L21  53.47 
 
 		 124 aa  117  6e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.765258 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0864  50S ribosomal protein L21P  55.1 
 
 		 103 aa  116  9.999999999999999e-26  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.0835554  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3869  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 105 aa  115  1.9999999999999998e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.43759  normal  0.014081 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_4288  50S ribosomal protein L21  53.85 
 
 		 104 aa  115  1.9999999999999998e-25  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.997468  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4193  50S ribosomal protein L21  52.88 
 
 		 105 aa  115  3e-25  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2219  50S ribosomal protein L21P  52.94 
 
 		 104 aa  110  1.0000000000000001e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000152954  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0309  50S ribosomal protein L21  40.59 
 
 		 157 aa  107  7.000000000000001e-23  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.848766  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3799  50S ribosomal protein L21  50.93 
 
 		 136 aa  107  9.000000000000001e-23  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1782  50S ribosomal protein L21  54.29 
 
 		 188 aa  106  1e-22  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.458304  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1242  50S ribosomal protein L21P  54.37 
 
 		 100 aa  107  1e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.526712  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2238  ribosomal protein L21  52.48 
 
 		 104 aa  106  1e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0929508  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR1850  50S ribosomal protein L21  55.45 
 
 		 142 aa  106  2e-22  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3283  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 125 aa  106  2e-22  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0994442 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3511  50S ribosomal protein L21  48.15 
 
 		 131 aa  105  4e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.917781  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0418  50S ribosomal protein L21  55.88 
 
 		 103 aa  105  4e-22  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.217833 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3819  50S ribosomal protein L21  48.15 
 
 		 131 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.711796  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1050  50S ribosomal protein L21  53.33 
 
 		 129 aa  104  5e-22  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.436024  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0285  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  104  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.253807  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3470  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 103 aa  104  6e-22  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  0.00235402  normal  0.37333 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0462  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 103 aa  104  6e-22  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.953045  hitchhiker  0.00315446 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1848  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0845  50S ribosomal protein L21  52.94 
 
 		 104 aa  103  1e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4103  50S ribosomal protein L21  50.98 
 
 		 140 aa  103  1e-21  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.509637 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4922  50S ribosomal protein L21  52.25 
 
 		 130 aa  102  2e-21  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0179671  normal  0.559364 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2182  ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.035762  normal  0.921653 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2005  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 103 aa  103  2e-21  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0349  50S ribosomal protein L21  51.96 
 
 		 102 aa  103  2e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000000000694207  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1200  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  48.15 
 
 		 198 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2250  50S ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 102 aa  101  5e-21  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00445864  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3189  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 104 aa  101  6e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.136344  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0270  ribosomal protein L21  48.54 
 
 		 103 aa  101  6e-21  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.656841  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3590  50S ribosomal protein L21  50 
 
 		 102 aa  100  7e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.0000000239742  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4414  50S ribosomal protein L21  51.35 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4877  50S ribosomal protein L21  51.35 
 
 		 130 aa  100  7e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1483  ribosomal protein L21  51.92 
 
 		 103 aa  100  7e-21  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3072  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  100  8e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.0000000583134  unclonable  0.0000000178409 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0231  50S ribosomal protein L21  50.96 
 
 		 104 aa  100  1e-20  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1633  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  100  1e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.94154  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0162  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  100  1e-20  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000233925  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3206  ribosomal protein L21  50.49 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.78407  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2280  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  49.06 
 
 		 258 aa  99.4  2e-20  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.372527  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0528  LSU ribosomal protein L21P  47.62 
 
 		 105 aa  99.4  2e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000314721  normal  0.0648097 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0145  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  99  3e-20  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3352  50S ribosomal protein L21P  50 
 
 		 101 aa  99  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000809209  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1815  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0361  50S ribosomal protein L21  48.04 
 
 		 103 aa  98.2  4e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.000287252  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1460  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  50 
 
 		 221 aa  98.6  4e-20  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.0369658 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2058  50S ribosomal protein L21  49.5 
 
 		 102 aa  97.8  6e-20  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.550778  normal  0.848803 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2583  50S ribosomal protein L21  50.5 
 
 		 102 aa  97.8  6e-20  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.5903200000000002e-23  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3277  50S ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 103 aa  97.8  7e-20  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00049339 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0488  ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  97.8  7e-20  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1573  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.337451  normal  0.754011 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1268  ribosomal protein L21  47.57 
 
 		 131 aa  96.7  1e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.00033008  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1755  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 103 aa  97.1  1e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.092624  normal  0.0601991 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2822  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  96.3  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  hitchhiker  0.00195381  normal  0.322563 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2576  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 103 aa  96.7  2e-19  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0160  50S ribosomal protein L21  44.55 
 
 		 103 aa  96.3  2e-19  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00136073  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0304  50S ribosomal protein L21  46.53 
 
 		 102 aa  96.7  2e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000000140365  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1380  50S ribosomal protein L21  48.51 
 
 		 102 aa  96.7  2e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3236  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 102 aa  95.5  3e-19  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  unclonable  0.0000156169  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2692  50S ribosomal protein L21P  46.53 
 
 		 149 aa  95.5  3e-19  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  decreased coverage  0.00184818  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_02720  50S ribosomal protein L21  39.45 
 
 		 224 aa  95.9  3e-19  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3461  50S ribosomal protein L21/unknown domain fusion protein  56.44 
 
 		 230 aa  95.1  4e-19  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.2589  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2704  50S ribosomal protein L21  47.52 
 
 		 103 aa  95.1  5e-19  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0839  50S ribosomal protein L21  44.66 
 
 		 103 aa  94.7  5e-19  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.236203  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03051  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00856225  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0521  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000111872  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3974  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  unclonable  0.00000000000270537  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3671  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  unclonable  0.000000000000125607  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3622  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.4  6e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  unclonable  0.00000000442245  normal  0.259667 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3612  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  decreased coverage  5.09393e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3482  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.000000000216305  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0514  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000928168  normal  0.0169565 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3584  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  unclonable  6.68689e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3379  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  unclonable  2.03555e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03002  hypothetical protein  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.00734484  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4508  50S ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  unclonable  0.000000000766256  normal  1 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3757  50S ribosomal protein L21  43.14 
 
 		 103 aa  94.7  6e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  decreased coverage  0.0000000620592  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3601  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  unclonable  0.0000243272  normal  0.724724 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3494  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000360043  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3565  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  94  8e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  hitchhiker  0.00265959  normal  1 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0751  50S ribosomal protein L21  43.69 
 
 		 103 aa  94  1e-18  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00510595 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0497  ribosomal protein L21  51.46 
 
 		 98 aa  93.2  1e-18  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2657  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.0146122  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0341  ribosomal protein L21  49.51 
 
 		 104 aa  94  1e-18  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000133447  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3067  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  94  1e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.89662  normal  1 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0678  ribosomal protein L21  45.28 
 
 		 116 aa  93.6  1e-18  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  hitchhiker  0.0000153253  normal  0.209425 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2385  50S ribosomal protein L21  51.65 
 
 		 103 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.26832  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2097  50S ribosomal protein L21  51.65 
 
 		 103 aa  93.6  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  decreased coverage  0.000000174433  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3496  50S ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 103 aa  93.6  1e-18  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  decreased coverage  0.00000280512  normal  1 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0926  ribosomal protein L21  45.1 
 
 		 102 aa  93.6  1e-18  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.0000000000598947  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3141  ribosomal protein L21  46.08 
 
 		 104 aa  92.8  2e-18  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0664347  normal  0.717377 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4218  ribosomal protein L21  45.63 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.7758  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0194  50S ribosomal protein L21  43.56 
 
 		 103 aa  92.8  2e-18  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  decreased coverage  0.0000399206  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00800  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  92.4  3e-18  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0474  50S ribosomal protein L21P  47.06 
 
 		 103 aa  92  3e-18  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.030685  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2853  50S ribosomal protein L21  45.54 
 
 		 103 aa  92.4  3e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000000634591  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2958  50S ribosomal protein L21  42.57 
 
 		 103 aa  91.7  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.18334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>