More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0165 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0165  heat shock protein GrpE  100 
 
 		 205 aa  412  1e-114  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.261628  normal  0.409706 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2533  ribulose-phosphate 3-epimerase  48.75 
 
 		 217 aa  145  5e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0165  heat shock protein GrpE  46.29 
 
 		 230 aa  144  1e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.507974  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0171  heat shock protein GrpE  46.29 
 
 		 230 aa  143  2e-33  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3544  ribulose-phosphate 3-epimerase  47.83 
 
 		 204 aa  143  2e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.741634 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0008  heat shock protein GrpE  44.91 
 
 		 210 aa  142  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.0916725 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0012  heat shock protein GrpE  45.93 
 
 		 208 aa  142  4e-33  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.976347  hitchhiker  0.000405819 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0427  heat shock protein GrpE  46.07 
 
 		 206 aa  141  7e-33  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0327  heat shock protein GrpE  49.68 
 
 		 205 aa  141  8e-33  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0399  heat shock protein GrpE  45.03 
 
 		 204 aa  140  9.999999999999999e-33  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0008  heat shock protein GrpE  44.62 
 
 		 210 aa  140  9.999999999999999e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000108771 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0153  heat shock protein GrpE  50.68 
 
 		 203 aa  140  9.999999999999999e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2800  GrpE protein  46.84 
 
 		 187 aa  139  1.9999999999999998e-32  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0415  GrpE protein  48.12 
 
 		 202 aa  138  4.999999999999999e-32  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0195  heat shock protein GrpE  48.7 
 
 		 197 aa  138  7e-32  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.721857  normal  0.870484 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0334  heat shock protein GrpE  47.74 
 
 		 207 aa  137  7.999999999999999e-32  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0184084  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0180  heat shock protein GrpE  45.29 
 
 		 228 aa  137  1e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0599175  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3004  GrpE protein  46.7 
 
 		 210 aa  136  3.0000000000000003e-31  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4019  heat shock protein GrpE  45.91 
 
 		 222 aa  135  6.0000000000000005e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.925805  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0188  heat shock protein GrpE  47.34 
 
 		 206 aa  134  6.0000000000000005e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0336  ribulose-phosphate 3-epimerase  46.9 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0383  Ribulose-phosphate 3-epimerase  45.86 
 
 		 202 aa  133  1.9999999999999998e-30  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0929159  normal  0.322075 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3578  GrpE protein  42.93 
 
 		 213 aa  132  3e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.534048  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1334  heat shock protein GrpE  42.37 
 
 		 222 aa  132  3.9999999999999996e-30  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0393  heat shock protein GrpE  48.34 
 
 		 206 aa  132  3.9999999999999996e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1146  GrpE protein  42.69 
 
 		 226 aa  130  1.0000000000000001e-29  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.702649  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2184  ribulose-phosphate 3-epimerase  44.3 
 
 		 207 aa  130  2.0000000000000002e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0403299  normal  0.673418 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1253  GrpE protein  46.94 
 
 		 181 aa  129  3e-29  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.329053 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0337  GrpE protein  42.58 
 
 		 201 aa  127  1.0000000000000001e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.387309  normal  0.17968 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4729  heat shock protein GrpE  43.72 
 
 		 184 aa  125  5e-28  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2059  GrpE protein  44.52 
 
 		 186 aa  123  2e-27  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_42980  heat shock protein GrpE  41.32 
 
 		 187 aa  122  5e-27  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0252  GrpE protein  47.4 
 
 		 181 aa  122  5e-27  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.243208 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3625  heat shock protein GrpE  41.1 
 
 		 189 aa  119  3e-26  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.42288  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1986  GrpE protein  45.65 
 
 		 204 aa  118  4.9999999999999996e-26  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0008  GrpE protein  42.48 
 
 		 179 aa  118  6e-26  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3465  protein GrpE  42 
 
 		 197 aa  117  9.999999999999999e-26  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2880  Fis family transcriptional regulator  38.64 
 
 		 186 aa  117  9.999999999999999e-26  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3643  GrpE protein  39.67 
 
 		 221 aa  116  1.9999999999999998e-25  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.58693  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1219  putative chaperone protein GrpE (heat shock protein)  38.07 
 
 		 189 aa  115  3e-25  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0704  heat shock protein GrpE  42.08 
 
 		 184 aa  115  3e-25  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.94046  hitchhiker  0.000436359 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2734  heat shock protein GrpE  44.44 
 
 		 194 aa  116  3e-25  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.000000056941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02254  heat shock protein GrpE  45.83 
 
 		 211 aa  115  3e-25  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.781248  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62990  heat shock protein GrpE  39.43 
 
 		 186 aa  115  6e-25  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.142705  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4728  heat shock protein GrpE  40.96 
 
 		 185 aa  114  6.9999999999999995e-25  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.079881  hitchhiker  0.00247949 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2656  GrpE protein  40.4 
 
 		 186 aa  114  8.999999999999998e-25  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.23931  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4594  heat shock protein GrpE  40.43 
 
 		 185 aa  114  1.0000000000000001e-24  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.243186 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1356  heat shock protein GrpE  43.97 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  0.000000000827789  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1379  heat shock protein GrpE  43.97 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  decreased coverage  0.000000798826  normal  0.264016 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3005  heat shock protein GrpE  43.97 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  unclonable  0.000000000767299  decreased coverage  0.0000000711999 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1342  heat shock protein GrpE  43.97 
 
 		 206 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.0000000000163417  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1974  GrpE protein  41.72 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.26677  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01132  heat shock protein GrpE  46.38 
 
 		 212 aa  114  1.0000000000000001e-24  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0509  GrpE protein  43.28 
 
 		 210 aa  114  1.0000000000000001e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.552704  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2437  heat shock protein GrpE  45.39 
 
 		 200 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  unclonable  0.0000000045112  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0762  heat shock protein GrpE  38.38 
 
 		 189 aa  113  2.0000000000000002e-24  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0546948  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3965  GrpE protein  43.75 
 
 		 192 aa  113  2.0000000000000002e-24  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.54707 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1274  heat shock protein GrpE  44.37 
 
 		 206 aa  113  2.0000000000000002e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  decreased coverage  0.0000000125429  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004293  heat shock protein GrpE  44.2 
 
 		 198 aa  113  2.0000000000000002e-24  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.0129991  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3330  heat shock protein GrpE  39.66 
 
 		 209 aa  112  5e-24  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.000166428  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1524  heat shock protein GrpE  42.57 
 
 		 206 aa  112  5e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2732  heat shock protein GrpE  44.37 
 
 		 203 aa  112  5e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.00000000369534  normal  0.883865 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4196  heat shock protein GrpE  39.76 
 
 		 187 aa  111  8.000000000000001e-24  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.00395445  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5482  heat shock protein GrpE  39.2 
 
 		 189 aa  111  9e-24  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.601194  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4506  heat shock protein GrpE  39.76 
 
 		 187 aa  110  1.0000000000000001e-23  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.316473  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1227  heat shock protein GrpE  43.05 
 
 		 189 aa  111  1.0000000000000001e-23  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.830838  hitchhiker  0.00575896 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2902  heat shock protein GrpE  41.03 
 
 		 206 aa  110  1.0000000000000001e-23  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  decreased coverage  0.0000000775754  normal  0.0175654 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0924  GrpE protein  42.38 
 
 		 184 aa  110  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.929146  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2772  heat shock protein GrpE  43.36 
 
 		 205 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000976111  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2992  heat shock protein GrpE  40 
 
 		 200 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000163848  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2805  heat shock protein GrpE  43.66 
 
 		 203 aa  110  2.0000000000000002e-23  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000498857  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5230  heat shock protein GrpE  43.14 
 
 		 181 aa  109  3e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_3095  GrpE protein  41.4 
 
 		 210 aa  108  4.0000000000000004e-23  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0800  heat shock protein GrpE  35.4 
 
 		 189 aa  108  5e-23  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.200393  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1359  GrpE protein  41.45 
 
 		 186 aa  108  6e-23  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.000141941  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0381  heat shock protein GrpE  43.48 
 
 		 200 aa  108  7.000000000000001e-23  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.901514  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3823  co-chaperone GrpE  42.25 
 
 		 209 aa  107  1e-22  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.131676  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0150  co-chaperone GrpE  38.1 
 
 		 179 aa  107  1e-22  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  hitchhiker  0.0073017  n/a   
 
 
-
 
NC_011685  PHATRDRAFT_15032  predicted protein  41.67 
 
 		 157 aa  107  1e-22  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.189878  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2240  GrpE protein  39.07 
 
 		 193 aa  106  2e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0231109  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0649  heat shock protein GrpE  41.06 
 
 		 195 aa  106  2e-22  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.127631  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0459  GrpE protein  42.86 
 
 		 193 aa  105  3e-22  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.585573  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0208  GrpE protein  39.33 
 
 		 188 aa  106  3e-22  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.791743 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0980  heat shock protein GrpE  42.86 
 
 		 181 aa  105  4e-22  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1313  heat shock protein GrpE  39.86 
 
 		 191 aa  105  4e-22  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1348  molecular chaperone GrpE (heat shock protein)  40.35 
 
 		 189 aa  105  4e-22  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  hitchhiker  0.00499702  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2572  heat shock protein GrpE  37.57 
 
 		 201 aa  105  5e-22  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000957049  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7788  putative heat shock protein (HSP-70 cofactor), grpE  41.32 
 
 		 181 aa  105  6e-22  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0272135  normal  0.30698 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1901  GrpE protein  40.97 
 
 		 218 aa  104  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.489852  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2874  GrpE protein  35.85 
 
 		 187 aa  104  8e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.423884 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1770  heat shock protein GrpE  40.13 
 
 		 184 aa  104  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1485  heat shock protein GrpE  39.47 
 
 		 182 aa  103  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2812  GrpE protein  43.57 
 
 		 210 aa  103  2e-21  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.0237715  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1713  heat shock protein GrpE  39.74 
 
 		 179 aa  103  2e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.385192  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1970  GrpE protein  40.85 
 
 		 187 aa  103  2e-21  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  hitchhiker  0.000003831  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3217  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2791  heat shock protein GrpE  36.93 
 
 		 201 aa  103  2e-21  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.0000000103997  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_2045  co-chaperone GrpE  39.6 
 
 		 180 aa  103  2e-21  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  hitchhiker  0.00817363  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2570  heat shock protein GrpE  41.72 
 
 		 178 aa  103  2e-21  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0111  GrpE protein  36.6 
 
 		 199 aa  102  3e-21  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>