More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0104 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0104  integration host factor subunit beta  100 
 
 		 94 aa  186  7e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.743026  normal  0.488249 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0165  integration host factor subunit beta  67.03 
 
 		 94 aa  130  6.999999999999999e-30  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0153  integration host factor subunit beta  67.03 
 
 		 94 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0148  integration host factor subunit beta  67.03 
 
 		 94 aa  130  6.999999999999999e-30  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.395454  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0147  integration host factor, beta subunit  70.33 
 
 		 110 aa  130  6.999999999999999e-30  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3672  integration host factor, beta subunit  65.96 
 
 		 94 aa  128  2.0000000000000002e-29  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0058  integration host factor subunit beta  66.67 
 
 		 101 aa  128  3e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0950435  normal  0.185512 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3585  integration host factor subunit beta  67.02 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.0516176  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0202  integration host factor subunit beta  64.89 
 
 		 95 aa  128  3e-29  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.857447  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0097  integration host factor, beta subunit  69.57 
 
 		 101 aa  127  5.0000000000000004e-29  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3883  integration host factor subunit beta  67.39 
 
 		 93 aa  126  9.000000000000001e-29  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.782365  normal  0.472078 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0066  integration host factor subunit beta  67.03 
 
 		 101 aa  126  1.0000000000000001e-28  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3787  integration host factor subunit beta  65.93 
 
 		 95 aa  125  2.0000000000000002e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0868324  hitchhiker  0.00129518 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3589  integration host factor subunit beta  66.3 
 
 		 93 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.201155  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0069  integration host factor subunit beta  65.59 
 
 		 104 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0203936  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0395  integration host factor subunit beta  65.59 
 
 		 101 aa  125  2.0000000000000002e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0101  integration host factor subunit beta  65.59 
 
 		 103 aa  125  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.92315 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1027  integration host factor subunit beta  64.89 
 
 		 95 aa  124  3e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.692132  normal  0.669303 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3274  integration host factor subunit beta  65.22 
 
 		 93 aa  124  5e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.333041 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2219  integration host factor subunit beta  64.13 
 
 		 94 aa  124  5e-28  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0365391  normal  0.362428 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0638  integration host factor subunit beta  65.93 
 
 		 101 aa  123  7e-28  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.0567003 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0194  integration host factor subunit beta  65.93 
 
 		 101 aa  123  9e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.165433  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0292  integration host factor, beta subunit  64.89 
 
 		 100 aa  122  2e-27  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.167242  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0043  integration host factor subunit beta  61.86 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.621323  normal  0.262305 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0059  integration host factor subunit beta  61.86 
 
 		 99 aa  119  1.9999999999999998e-26  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0409  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 103 aa  119  1.9999999999999998e-26  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1720  integration host factor, beta subunit  63.04 
 
 		 113 aa  117  4.9999999999999996e-26  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.191599  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0021  integration host factor subunit beta  61.54 
 
 		 103 aa  117  7.999999999999999e-26  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00013194 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0144  integration host factor, beta subunit  62.64 
 
 		 96 aa  115  1.9999999999999998e-25  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1371  integration host factor subunit beta  63.74 
 
 		 92 aa  114  3e-25  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0204  integration host factor, beta subunit  61.54 
 
 		 102 aa  115  3e-25  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.137338  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2928  integration host factor, beta subunit  62.64 
 
 		 97 aa  114  5e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.197857  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0165  histone-like DNA-binding protein  60.22 
 
 		 93 aa  114  5e-25  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0179  integration host factor, beta subunit  61.54 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.958396  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0121  integration host factor, beta subunit  61.54 
 
 		 102 aa  114  6e-25  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.879931  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2501  integration host factor, beta subunit  60.87 
 
 		 106 aa  112  1.0000000000000001e-24  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.201217  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2444  integration host factor, beta subunit  60.87 
 
 		 103 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.45625  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2198  integration host factor, beta subunit  60.87 
 
 		 106 aa  112  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1496  histone-like DNA-binding protein  56.52 
 
 		 92 aa  111  3e-24  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.963172  normal  0.198293 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2409  histone family protein DNA-binding protein  58.24 
 
 		 92 aa  110  4.0000000000000004e-24  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.0906126 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3199  integration host factor subunit beta  62.64 
 
 		 98 aa  110  5e-24  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0890177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010727  Mpop_5428  integration host factor, beta subunit  61.54 
 
 		 94 aa  109  1.0000000000000001e-23  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0562  integration host factor subunit beta  55.91 
 
 		 102 aa  108  2.0000000000000002e-23  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.399271  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1213  integration host factor, beta subunit  58.7 
 
 		 98 aa  108  3e-23  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0453781  normal  0.184792 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0975  integration host factor subunit beta  56.04 
 
 		 94 aa  107  7.000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.00000516669  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1544  integration host factor, beta subunit  56.52 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.106384  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2465  integration host factor subunit beta  53.76 
 
 		 96 aa  103  8e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  unclonable  0.00000000804162  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02859  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 94 aa  102  2e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003021  integration host factor beta subunit  54.95 
 
 		 93 aa  102  2e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  unclonable  0.00000000932268  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2152  integration host factor, beta subunit  52.69 
 
 		 98 aa  101  3e-21  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0462696  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2236  integration host factor subunit beta  54.95 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  hitchhiker  0.00572513  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0868  histone-like DNA-binding protein  50 
 
 		 95 aa  100  5e-21  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0392256  normal  0.0328691 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1504  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 92 aa  100  5e-21  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000278051  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0932  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 		 100 aa  100  5e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.802461  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2336  integration host factor, beta subunit  52.75 
 
 		 95 aa  100  7e-21  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  hitchhiker  0.00131749  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2068  integration host factor, beta subunit  53.85 
 
 		 94 aa  99.8  1e-20  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  hitchhiker  0.00010112  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0926  integration host factor, beta subunit  54.84 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00174707  normal  0.404226 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1070  integration host factor, beta subunit  54.84 
 
 		 95 aa  99.4  1e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00234309  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3223  integration host factor, beta subunit  51.06 
 
 		 102 aa  99.8  1e-20  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  hitchhiker  0.00795206  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2602  DNA-binding protein HU  51.65 
 
 		 96 aa  99.4  2e-20  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0717937  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00892  integration host factor subunit beta  54.35 
 
 		 103 aa  99.4  2e-20  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0417223  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2278  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  0.000000000000837765  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2071  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00000034854  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2067  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00000000478736  unclonable  0.0000000000012991 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2395  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  98.6  2e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  unclonable  0.0000000343473  unclonable  0.00000762549 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2122  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  99.4  2e-20  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.0000000000593472  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1431  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Enterobacter sp. 638  Bacteria  hitchhiker  0.0064808  normal  1 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2041  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  unclonable  0.0000000000705182  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1855  integration host factor subunit beta  51.06 
 
 		 95 aa  98.2  3e-20  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.756472  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0181  integration host factor, beta subunit  52.13 
 
 		 113 aa  97.8  4e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000858176  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1737  integration host factor subunit beta  51.09 
 
 		 95 aa  97.8  4e-20  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000122677  hitchhiker  0.00231326 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1199  integration host factor, beta subunit  51.09 
 
 		 108 aa  97.8  4e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3034  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 95 aa  97.4  5e-20  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0949718  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0946  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0427  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.496954  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2571  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.444385  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1281  integration host factor subunit beta  53.85 
 
 		 94 aa  97.4  5e-20  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.218086  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2992  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2944  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.846703  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2135  hypothetical protein  51.65 
 
 		 98 aa  97.4  5e-20  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00481013  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0202  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2881  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.8  5e-20  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0601006  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1773  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 100 aa  97.4  6e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.976325  normal  0.0185498 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1639  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 107 aa  97.4  6e-20  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.79916  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1411  integration host factor, beta subunit  50 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00234399  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2074  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  97.1  7e-20  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.0000000000549511  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1647  integration host factor subunit beta  53.26 
 
 		 101 aa  97.1  8e-20  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0979657  normal  0.0681876 
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1596  integration host factor subunit beta  52.17 
 
 		 111 aa  97.1  8e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.878202  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1955  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  97.1  8e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00000000468135  unclonable  0.00000320833 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0262  integration host factor beta-subunit  51.65 
 
 		 112 aa  96.7  9e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_2401  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1710  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 94 aa  96.7  9e-20  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.000353276  normal  0.984922 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1978  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00000000261968  unclonable  0.000000000047672 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2297  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000102507  unclonable  0.0000000000697895 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1925  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000000000515528  unclonable  0.0000000000266845 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2053  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 95 aa  96.7  9e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.000000159286  unclonable  0.0000244011 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2667  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  hitchhiker  0.00090839  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3641  integration host factor subunit beta  50 
 
 		 98 aa  96.3  1e-19  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.222556  normal  0.634422 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2579  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.00000135913  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1956  integration host factor subunit beta  52.75 
 
 		 94 aa  96.7  1e-19  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  0.0000034151  normal  0.296627 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>