More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0102 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0102  cytidylate kinase  100 
 
 
216 aa  423  1e-117  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.780906 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1111  cytidylate kinase  61.35 
 
 
208 aa  215  4e-55  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_3457  cytidylate kinase  52.66 
 
 
212 aa  214  8e-55  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_4031  cytidylate kinase  52.63 
 
 
215 aa  213  1.9999999999999998e-54  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4361  cytidylate kinase  51.92 
 
 
215 aa  207  1e-52  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0102365 
 
 
-
 
NC_004310  BR0026  cytidylate kinase  52.63 
 
 
219 aa  206  2e-52  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.404349  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0025  cytidylate kinase  52.63 
 
 
219 aa  206  3e-52  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3607  cytidylate kinase  51.64 
 
 
218 aa  203  2e-51  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0733159  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2457  cytidylate kinase  58.13 
 
 
208 aa  202  2e-51  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.164477  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0066  cytidylate kinase  54.59 
 
 
212 aa  202  2e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0168644  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0030  cytidylate kinase  53.11 
 
 
214 aa  202  3e-51  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0193  cytidylate kinase  51.22 
 
 
217 aa  198  5e-50  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0614  cytidylate kinase  54.21 
 
 
216 aa  196  2.0000000000000003e-49  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00523823 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2129  cytidylate kinase  57.49 
 
 
222 aa  192  4e-48  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.29015 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2406  cytidylate kinase  57.49 
 
 
222 aa  191  5e-48  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.477842  normal  0.311621 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0197  cytidylate kinase  54.29 
 
 
203 aa  190  1e-47  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0030  cytidylate kinase  53.85 
 
 
212 aa  189  2.9999999999999997e-47  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2086  cytidylate kinase  56.04 
 
 
222 aa  187  1e-46  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0208  cytidylate kinase  52.86 
 
 
212 aa  186  2e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.300993  normal  0.653073 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0191  cytidylate kinase  51.69 
 
 
212 aa  186  2e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0398  cytidylate kinase  52.17 
 
 
212 aa  186  3e-46  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0099  cytidylate kinase  56.84 
 
 
208 aa  184  8e-46  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal  0.906806 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1494  cytidylate kinase  54.19 
 
 
209 aa  184  9e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.373102 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0150  cytidylate kinase  55.29 
 
 
217 aa  183  2.0000000000000003e-45  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0294  cytidylate kinase  55.83 
 
 
213 aa  182  3e-45  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1023  cytidylate kinase  51 
 
 
212 aa  181  8.000000000000001e-45  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.283753  normal  0.516654 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0641  cytidylate kinase  50.24 
 
 
212 aa  179  2e-44  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.112665 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2938  cytidylate kinase  52.94 
 
 
211 aa  179  4e-44  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.434038  normal 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3881  cytidylate kinase  54.5 
 
 
211 aa  179  4e-44  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.46023  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0104  cytidylate kinase  51.69 
 
 
212 aa  178  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.757727  normal  0.698804 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3784  cytidylate kinase  55.1 
 
 
194 aa  177  1e-43  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.150684  hitchhiker  0.000222577 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5617  cytidylate kinase  54.81 
 
 
212 aa  176  2e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.314381  normal  0.0692072 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1304  cytidylate kinase  45.81 
 
 
215 aa  175  5e-43  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  decreased coverage  0.00011985  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0164  cytidylate kinase  52.17 
 
 
209 aa  174  7e-43  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1324  cytidylate kinase  51.92 
 
 
208 aa  173  1.9999999999999998e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7108  cytidylate kinase  56.4 
 
 
217 aa  173  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.978606  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3276  cytidylate kinase  51.9 
 
 
211 aa  171  6.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.811486  normal  0.522336 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3591  cytidylate kinase  51.9 
 
 
206 aa  171  7.999999999999999e-42  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.39582  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6548  cytidylate kinase  57.14 
 
 
210 aa  169  3e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.219054  normal  0.440161 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0928  cytidylate kinase  43.64 
 
 
226 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.0000000497834  normal  0.452756 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1072  cytidylate kinase  43.64 
 
 
226 aa  162  3e-39  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00000000346962  normal 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2916  cytidylate kinase  50.47 
 
 
219 aa  159  2e-38  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal  0.0479896 
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2946  cytidylate kinase  44.5 
 
 
228 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2883  cytidylate kinase  44.5 
 
 
228 aa  153  2e-36  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0880838  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2995  cytidylate kinase  44.5 
 
 
255 aa  152  4e-36  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0200  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0429  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2570  cytidylate kinase  45.07 
 
 
221 aa  151  5.9999999999999996e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.138254  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0948  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2573  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  151  5.9999999999999996e-36  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.0883038  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2795  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.13 
 
 
667 aa  151  5.9999999999999996e-36  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00233138 
 
 
-
 
NC_006368  lpp1375  cytidylate kinase  38.71 
 
 
230 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1371  cytidylate kinase  38.71 
 
 
230 aa  151  8e-36  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0745  cytidylate kinase  43.06 
 
 
228 aa  150  1e-35  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.804624  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2072  cytidylate kinase  38.03 
 
 
230 aa  150  1e-35  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  0.000000000270816  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1637  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  150  1e-35  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0977  cytidylate kinase  40.54 
 
 
237 aa  150  1e-35  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.000004631  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1615  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.93 
 
 
670 aa  149  2e-35  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0173  cytidylate kinase  42.06 
 
 
225 aa  149  3e-35  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000480933  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1853  cytidylate kinase  42.44 
 
 
221 aa  148  7e-35  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0179513  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0715  cytidylate kinase  52.85 
 
 
204 aa  147  9e-35  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1735  cytidylate kinase  39.52 
 
 
231 aa  147  9e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  hitchhiker  0.0000000610181  decreased coverage  0.000087686 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4723  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.41 
 
 
675 aa  147  1.0000000000000001e-34  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.86018  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2690  cytidylate kinase  38.03 
 
 
218 aa  147  1.0000000000000001e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00000000495966  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2468  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.17 
 
 
673 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.835531  normal  0.361895 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1378  cytidylate kinase  42.33 
 
 
228 aa  145  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.925348  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1332  cytidylate kinase  42.08 
 
 
219 aa  145  3e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  decreased coverage  0.0000433479  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_23320  cytidylate kinase  43.11 
 
 
229 aa  145  3e-34  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000301501  normal  0.0247908 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4073  cytidylate kinase  41.59 
 
 
229 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000293328  normal  0.11895 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2467  cytidylate kinase  38.46 
 
 
225 aa  145  4.0000000000000006e-34  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.00000550284  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3943  cytidylate kinase  42.66 
 
 
225 aa  145  5e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.302806  normal  0.232418 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2310  cytidylate kinase  35.62 
 
 
230 aa  145  5e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00000698578  hitchhiker  0.000000443143 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1392  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  44.17 
 
 
673 aa  145  5e-34  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.121243  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1771  cytidylate kinase  41.74 
 
 
228 aa  145  6e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  decreased coverage  0.00506628  normal  0.0452484 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0721  cytidylate kinase  45.41 
 
 
219 aa  145  6e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0824528  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0849  cytidylate kinase  41.59 
 
 
231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.744629  normal  0.265979 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0778  cytidylate kinase  41.59 
 
 
231 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00825892 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1005  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0567  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1046  cytidylate kinase  44.02 
 
 
228 aa  144  8.000000000000001e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1588  cytidylate kinase  39.21 
 
 
232 aa  144  9e-34  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000460348  hitchhiker  0.0000979309 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0981  cytidylate kinase  43.41 
 
 
228 aa  144  1e-33  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.233916  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1734  cytidylate kinase  39.81 
 
 
225 aa  144  1e-33  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  decreased coverage  0.000603603  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1966  cytidylate kinase  44.23 
 
 
229 aa  144  1e-33  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.64739  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2002  cytidylate kinase  39.81 
 
 
225 aa  143  2e-33  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.0311014  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1495  cytidylate kinase  37.5 
 
 
251 aa  143  2e-33  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  hitchhiker  0.0000000499937  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1429  cytidylate kinase  40.57 
 
 
227 aa  143  2e-33  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.000204841  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2450  cytidylate kinase  40.38 
 
 
227 aa  143  2e-33  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000180887  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1362  cytidylate kinase  41.28 
 
 
228 aa  143  2e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0105821  normal  0.0198977 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3002  cytidylate kinase  43.9 
 
 
228 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.890159  hitchhiker  0.00995031 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0963  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  43.56 
 
 
699 aa  142  4e-33  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0955  cytidylate kinase  44.83 
 
 
225 aa  142  4e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  hitchhiker  0.00000242866  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1749  cytidylate kinase  41.23 
 
 
229 aa  142  5e-33  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  hitchhiker  0.00238031  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2299  cytidylate kinase  35.16 
 
 
230 aa  142  5e-33  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000399193  unclonable  0.0000000000955893 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1279  bifunctional 3-phosphoshikimate 1-carboxyvinyltransferase/cytidine monophosphate kinase  45.37 
 
 
643 aa  141  6e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.091835  normal  0.851498 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4159  cytidylate kinase  42.11 
 
 
228 aa  141  6e-33  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.724551 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1674  cytidylate kinase  37.95 
 
 
251 aa  142  6e-33  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  hitchhiker  0.0000210034  normal  0.368895 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2733  cytidylate kinase  40 
 
 
227 aa  141  7e-33  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000000397985  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2210  cytidylate kinase  40 
 
 
227 aa  141  7e-33  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  decreased coverage  0.0000277871  normal  0.370624 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2686  cytidylate kinase  40 
 
 
227 aa  141  7e-33  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  unclonable  0.0000000200966  normal  0.762789 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>