More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0092 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0092  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 570 aa  1117    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0277499 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3288  Signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 		 662 aa  210  7e-53  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.390564  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2023  signal transduction histidine kinase  30.56 
 
 		 596 aa  190  5.999999999999999e-47  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.175935  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2700  signal transduction histidine kinase  31.52 
 
 		 592 aa  138  3.0000000000000003e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1271  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  28.77 
 
 		 593 aa  136  9e-31  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2929  signal transduction histidine kinase  28.35 
 
 		 593 aa  134  3e-30  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3834  signal transduction histidine kinase  27.6 
 
 		 578 aa  134  6e-30  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.391649  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3038  signal transduction histidine kinase  33.5 
 
 		 878 aa  129  1.0000000000000001e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3525  signal transduction histidine kinase  35.03 
 
 		 603 aa  129  2.0000000000000002e-28  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2819  signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 		 597 aa  128  3e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  1  normal  0.753757 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2687  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 215 aa  127  4.0000000000000003e-28  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.693771  normal  0.196612 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3862  signal transduction histidine kinase  37.2 
 
 		 532 aa  127  7e-28  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0118  signal transduction histidine kinase  34.88 
 
 		 774 aa  123  9e-27  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.844509  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 771 aa  122  9.999999999999999e-27  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0913  multisensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 991 aa  122  9.999999999999999e-27  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.650855  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0986  signal transduction histidine kinase  32.88 
 
 		 872 aa  122  1.9999999999999998e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.544559  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1496  signal transduction histidine kinase  33.95 
 
 		 1253 aa  122  1.9999999999999998e-26  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.172842 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2150  signal transduction histidine kinase  35.82 
 
 		 945 aa  120  4.9999999999999996e-26  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2724  signal transduction histidine kinase  24.87 
 
 		 613 aa  119  9.999999999999999e-26  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.524296  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4851  signal transduction histidine kinase  34.23 
 
 		 752 aa  119  1.9999999999999998e-25  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0114486 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3564  signal transduction histidine kinase  28.39 
 
 		 594 aa  119  1.9999999999999998e-25  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.186387  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2710  hypothetical protein  34.92 
 
 		 744 aa  118  3.9999999999999997e-25  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0429  signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 		 1093 aa  117  6.9999999999999995e-25  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1812  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 1390 aa  117  7.999999999999999e-25  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.155927 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0440  signal transduction histidine kinase  33.51 
 
 		 1093 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.790224  normal  0.127185 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5298  signal transduction histidine kinase  32.39 
 
 		 732 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2234  signal transduction histidine kinase  35.94 
 
 		 1676 aa  116  8.999999999999998e-25  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.900765 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3460  signal transduction histidine kinase  32.72 
 
 		 813 aa  116  1.0000000000000001e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.292026  normal  0.144627 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0299  two component sensor histidine kinase  32.51 
 
 		 1239 aa  116  1.0000000000000001e-24  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.669336  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4331  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 545 aa  116  1.0000000000000001e-24  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.364366 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1008  signal transduction histidine kinase  34.2 
 
 		 347 aa  115  1.0000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.681685  normal  0.906099 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0051  signal transduction histidine kinase  31.27 
 
 		 585 aa  115  2.0000000000000002e-24  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.725839 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1370  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 1560 aa  115  2.0000000000000002e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.71177  normal  0.70667 
 
 
-
 
NC_011880  Cyan7425_5451  signal transduction histidine kinase  33.81 
 
 		 547 aa  115  3e-24  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.915879  normal  0.94618 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1953  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 382 aa  115  3e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2096  signal transduction histidine kinase  38.42 
 
 		 526 aa  114  3e-24  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  0.0713574 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1972  signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 		 815 aa  114  7.000000000000001e-24  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000691031  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  31.53 
 
 		 3706 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4136  signal transduction histidine kinase  33 
 
 		 790 aa  112  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4325  Signal transduction histidine kinase  32.7 
 
 		 1654 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1723  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 764 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4138  signal transduction histidine kinase  32.82 
 
 		 1051 aa  112  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.35585 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3010  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 488 aa  112  2.0000000000000002e-23  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0663481  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4528  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  32.87 
 
 		 1668 aa  111  3e-23  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5678  signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 		 747 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.302282 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4852  signal transduction histidine kinase  32.2 
 
 		 746 aa  110  7.000000000000001e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.0325493 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3899  signal transduction histidine kinase  30.65 
 
 		 613 aa  110  7.000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.796516 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0454  signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 		 657 aa  109  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.263033 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3509  signal transduction histidine kinase  36.04 
 
 		 439 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.2468 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1234  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  34.16 
 
 		 1663 aa  109  1e-22  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.745042  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3004  Signal transduction histidine kinase  29.81 
 
 		 941 aa  108  2e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3023  signal transduction histidine kinase  35.41 
 
 		 361 aa  108  2e-22  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.183877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0064  Signal transduction histidine kinase  31.73 
 
 		 1714 aa  107  5e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.274411 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5851  signal transduction histidine kinase  35.56 
 
 		 437 aa  107  6e-22  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.883245  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1364  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 382 aa  107  6e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00521592 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3911  signal transduction histidine kinase  31.78 
 
 		 1093 aa  107  7e-22  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.25512  normal  0.0971599 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1001  signal transduction histidine kinase  33.16 
 
 		 674 aa  106  9e-22  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58641  normal  0.0795268 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_4766  signal transduction histidine kinase  34.91 
 
 		 461 aa  106  1e-21  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.134291  normal  0.334258 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1756  Signal transduction histidine kinase  34.43 
 
 		 362 aa  106  1e-21  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.38054  normal  0.143124 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3009  hypothetical protein  31.16 
 
 		 783 aa  106  1e-21  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2192  signal transduction histidine kinase  35.47 
 
 		 362 aa  105  2e-21  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3670  signal transduction histidine kinase  34.3 
 
 		 832 aa  105  2e-21  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1002  signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 		 932 aa  105  2e-21  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.353608  normal  0.0662086 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4236  signal transduction histidine kinase  31.22 
 
 		 771 aa  104  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.931107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2206  signal transduction histidine kinase  34.03 
 
 		 272 aa  105  3e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000133722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5459  signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 		 749 aa  105  3e-21  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  0.164522 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4081  histidine kinase dimerisation/phosphoacceptor  35.78 
 
 		 895 aa  104  4e-21  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.628066  normal  0.498394 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2705  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 856 aa  104  4e-21  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0591  signal transduction histidine kinase  34.39 
 
 		 367 aa  104  4e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.76494 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4449  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.78 
 
 		 875 aa  104  5e-21  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2428  signal transduction histidine kinase  35.38 
 
 		 360 aa  104  5e-21  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.391955  decreased coverage  0.00462713 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2286  multisensor signal transduction histidine kinase  25.33 
 
 		 834 aa  104  6e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.461732  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1527  signal transduction histidine kinase  33.99 
 
 		 1227 aa  103  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.823974 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4126  signal transduction histidine kinase  34.41 
 
 		 345 aa  103  7e-21  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.583634  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1359  signal transduction histidine kinase  34.85 
 
 		 631 aa  103  8e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.0321472 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2710  signal transduction histidine kinase  33.85 
 
 		 363 aa  102  1e-20  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.304131  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3192  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.11 
 
 		 864 aa  103  1e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0309229 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0116  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 698 aa  103  1e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4519  signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 		 366 aa  102  2e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.175783  normal  0.446714 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3796  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 500 aa  102  2e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2872  signal transduction histidine kinase  33.67 
 
 		 362 aa  102  2e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.401413  normal  0.23232 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4139  signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 		 913 aa  102  2e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.329059 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0079  signal transduction histidine kinase  31.16 
 
 		 909 aa  102  3e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  0.130581 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4407  signal transduction histidine kinase  37.1 
 
 		 366 aa  101  4e-20  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.993369 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4037  PAS sensor protein  37.1 
 
 		 366 aa  101  4e-20  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.221223 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1806  signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 		 681 aa  101  4e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.286721 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3428  signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 		 693 aa  101  4e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.435354  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4562  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.33 
 
 		 874 aa  101  4e-20  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0865092  normal  0.846022 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0298  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 349 aa  101  5e-20  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.228007  hitchhiker  0.00285782 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4308  signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 		 739 aa  101  5e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.057717 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0643  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 		 616 aa  100  6e-20  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3723  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.59 
 
 		 871 aa  100  6e-20  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.086011 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2288  signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 		 400 aa  100  6e-20  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.184339  normal  1 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5893  signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 		 465 aa  100  6e-20  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3458  signal transduction histidine kinase  35.55 
 
 		 358 aa  100  9e-20  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3538  hypothetical protein  31.91 
 
 		 754 aa  100  1e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0655709  normal  0.940328 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4219  signal transduction histidine kinase  33.65 
 
 		 362 aa  99.8  1e-19  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0119  signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 		 757 aa  99.8  1e-19  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2296  signal transduction histidine kinase  34.78 
 
 		 541 aa  99.8  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.0982064  normal  0.378772 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1729  signal transduction histidine kinase  29.65 
 
 		 964 aa  99.8  1e-19  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.0370864  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>