More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0079 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0079  signal transduction histidine kinase  100 
 
 		 639 aa  1261    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.464916 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2344  signal transduction histidine kinase  33.47 
 
 		 500 aa  204  4e-51  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00211814  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0358  signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 		 602 aa  202  1.9999999999999998e-50  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3496  bacteriophytochrome protein  36.57 
 
 		 852 aa  196  1e-48  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.552776  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2330  putative bacteriophytochrome  35.55 
 
 		 842 aa  195  2e-48  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.766617  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1182  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  37.32 
 
 		 846 aa  193  8e-48  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.75997  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0932  signal transduction histidine kinase  38.44 
 
 		 759 aa  191  2e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1241  signal transduction histidine kinase  37.5 
 
 		 631 aa  191  5e-47  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.0246477 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5584  signal transduction histidine kinase  38.64 
 
 		 586 aa  187  7e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009669  Oant_4458  putative GAF sensor protein  33.72 
 
 		 844 aa  185  2.0000000000000003e-45  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3034  putative PAS/PAC sensor protein  34.33 
 
 		 856 aa  184  3e-45  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0858916  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0965  signal transduction histidine kinase  39.12 
 
 		 850 aa  182  2e-44  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3289  putative PAS/PAC sensor protein  33.79 
 
 		 855 aa  182  2e-44  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.363327  normal  0.145052 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3331  signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 503 aa  182  2e-44  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5219  signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 		 512 aa  181  4e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.673975 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1677  signal transduction histidine kinase  39.44 
 
 		 840 aa  177  4e-43  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5270  signal transduction histidine kinase  34.48 
 
 		 559 aa  177  7e-43  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  0.909185 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4495  signal transduction histidine kinase  36.08 
 
 		 571 aa  177  7e-43  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6244  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.01 
 
 		 849 aa  176  1.9999999999999998e-42  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2394  putative GAF sensor protein  35.98 
 
 		 847 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.25898  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3105  PAS sensor protein  34.46 
 
 		 728 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3834  signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 728 aa  172  2e-41  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.284621 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3364  response regulator  34.28 
 
 		 847 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.427552 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2574  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.48 
 
 		 844 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.969915 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2586  response regulator receiver modulated GAF sensor protein  34.77 
 
 		 847 aa  171  3e-41  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.251983 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9083  bacteriophytochrome protein  32.76 
 
 		 856 aa  171  5e-41  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_3626  signal transduction histidine kinase  34.26 
 
 		 792 aa  170  7e-41  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0746201  normal  0.0102319 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0801  signal transduction histidine kinase  39.03 
 
 		 488 aa  170  8e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.185769  normal  0.110715 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1117  PAS sensor protein  33.73 
 
 		 500 aa  168  2e-40  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5905  signal transduction histidine kinase  35.42 
 
 		 601 aa  168  2.9999999999999998e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.584764  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3662  alcohol dehydrogenase  32.71 
 
 		 733 aa  166  1.0000000000000001e-39  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.899908  normal  0.588935 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0288  signal transduction histidine kinase  30.15 
 
 		 514 aa  166  2.0000000000000002e-39  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.328365  normal  0.664954 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3500  signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 		 583 aa  164  4.0000000000000004e-39  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.319784  normal  0.0807687 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5290  signal transduction histidine kinase  33.71 
 
 		 662 aa  164  5.0000000000000005e-39  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.249657 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4932  signal transduction histidine kinase  35.14 
 
 		 907 aa  164  6e-39  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.752686 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4542  PAS sensor protein  31.13 
 
 		 1096 aa  164  6e-39  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.220973  normal  0.0899725 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1267  signal transduction histidine kinase  33.66 
 
 		 500 aa  164  6e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0835  signal transduction histidine kinase  38.31 
 
 		 488 aa  163  9e-39  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.0971828 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0875  PAS sensor protein  37.93 
 
 		 488 aa  163  1e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.111744 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3623  signal transduction histidine kinase  34.47 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.173185  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3300  PAS sensor protein  34.47 
 
 		 583 aa  162  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.928069  normal  1 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6933  signal transduction histidine kinase  36.05 
 
 		 488 aa  161  3e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0223762  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1881  PAS sensor protein  34.57 
 
 		 872 aa  162  3e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2563  signal transduction histidine kinase  38.18 
 
 		 409 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5055  signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 		 1111 aa  160  9e-38  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.372822  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5002  signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 		 1096 aa  159  2e-37  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1984  signal transduction histidine kinase  36.13 
 
 		 713 aa  155  2.9999999999999998e-36  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6552  signal transduction histidine kinase  41.56 
 
 		 489 aa  154  4e-36  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.433672 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6901  signal transduction histidine kinase  35.37 
 
 		 465 aa  151  3e-35  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0620  signal transduction histidine kinase  39.51 
 
 		 725 aa  151  4e-35  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0588  sensory box protein  36.29 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0118  HWE histidine kinase  31.77 
 
 		 538 aa  149  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4317  sensor histidine kinase  32.92 
 
 		 499 aa  149  1.0000000000000001e-34  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.305311  normal  1 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0554  sensory box protein  36.29 
 
 		 463 aa  149  1.0000000000000001e-34  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1700  signal transduction histidine kinase  37.56 
 
 		 339 aa  148  3e-34  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.193151  normal  0.0718068 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2299  signal transduction histidine kinase  35.02 
 
 		 713 aa  147  8.000000000000001e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.924903  normal  0.101705 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2022  PAS sensor protein  35.02 
 
 		 717 aa  146  1e-33  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.620506 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3652  signal transduction histidine kinase  30.75 
 
 		 491 aa  145  3e-33  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2544  Signal transduction histidine kinase  39.32 
 
 		 489 aa  144  5e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4109  signal transduction histidine kinase  41.75 
 
 		 384 aa  141  3e-32  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0421223  normal  0.437508 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1350  signal transduction histidine kinase  35.52 
 
 		 1016 aa  140  6e-32  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.597121 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01099  bacteriophytochrome protein  27.44 
 
 		 822 aa  140  1e-31  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.506628  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0007  signal transduction histidine kinase  37.06 
 
 		 482 aa  139  2e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.489749  n/a   
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3313  hypothetical protein  37.38 
 
 		 480 aa  139  2e-31  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.29262 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4278  putative PAS/PAC sensor protein  35.58 
 
 		 1027 aa  138  3.0000000000000003e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1190  PAS sensor protein  35.22 
 
 		 1041 aa  137  5e-31  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.0314947 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0094  signal transduction histidine kinase  36.33 
 
 		 929 aa  137  5e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0678  two-component sensor histidine kinase  39.71 
 
 		 460 aa  137  5e-31  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.320332 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_0218  signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 		 867 aa  137  6.0000000000000005e-31  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.269004 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0172  signal transduction histidine kinase  34.25 
 
 		 897 aa  137  8e-31  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3048  signal transduction histidine kinase  36.18 
 
 		 1001 aa  137  8e-31  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.143163  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1395  signal transduction histidine kinase  34.46 
 
 		 304 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.695001  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2666  signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 		 446 aa  136  9.999999999999999e-31  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.653198  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0471  signal transduction histidine kinase  33.59 
 
 		 349 aa  135  3e-30  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0741  Signal transduction histidine kinase  33.45 
 
 		 498 aa  134  6.999999999999999e-30  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1377  putative sensor histidine kinase  36.65 
 
 		 561 aa  134  6.999999999999999e-30  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.351027  normal  0.486528 
 
 
-
 
NC_010580  Bind_3835  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  39.5 
 
 		 1167 aa  133  9e-30  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0487  signal transduction histidine kinase  41.3 
 
 		 555 aa  132  1.0000000000000001e-29  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3978  signal transduction histidine kinase  41.33 
 
 		 577 aa  132  1.0000000000000001e-29  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.301159 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3126  signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 		 352 aa  131  3e-29  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2814  putative sensor histidine kinase  34.75 
 
 		 505 aa  132  3e-29  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.467962  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1069  signal transduction histidine kinase  38.54 
 
 		 387 aa  131  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.591232 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2607  signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 		 489 aa  130  7.000000000000001e-29  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.436893  normal  1 
 
 
-
 
NC_007488  RSP_3982  hypothetical protein  36.82 
 
 		 478 aa  129  1.0000000000000001e-28  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5560  signal transduction histidine kinase  37.63 
 
 		 341 aa  129  2.0000000000000002e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.256684  normal  0.0162393 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5515  hypothetical protein  31.85 
 
 		 703 aa  129  2.0000000000000002e-28  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0827  signal transduction histidine kinase  31.8 
 
 		 512 aa  128  3e-28  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0707  MCP methyltransferase/methylesterase, CheR/CheB with PAS/PAC sensor  35.98 
 
 		 1190 aa  128  3e-28  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1130  signal transduction histidine kinase  34.45 
 
 		 1002 aa  127  5e-28  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.039296  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1074  signal transduction histidine kinase  30.66 
 
 		 481 aa  127  5e-28  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.255381  normal  0.984755 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5262  signal transduction histidine kinase  37.78 
 
 		 338 aa  127  5e-28  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2090  signal transduction histidine kinase  36.7 
 
 		 372 aa  127  5e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.893944 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5235  signal transduction histidine kinase  40.4 
 
 		 571 aa  127  8.000000000000001e-28  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.878632  normal  1 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0743  HWE histidine kinase  34.17 
 
 		 483 aa  126  1e-27  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1153  signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 275 aa  126  1e-27  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.614752  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5776  putative PAS/PAC sensor protein  33.59 
 
 		 1160 aa  126  1e-27  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.491611  normal  0.0137055 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6262  sensor histidine kinase  32.06 
 
 		 1202 aa  126  1e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0163021  normal  0.538502 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1944  signal transduction histidine kinase  37.24 
 
 		 507 aa  125  2e-27  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0183597  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4265  signal transduction histidine kinase  35.43 
 
 		 930 aa  125  2e-27  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.588648  normal  0.462436 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2833  signal transduction histidine kinase  35.93 
 
 		 738 aa  125  3e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>