32 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0074 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_004347  SO_1751  hypothetical protein  36.84 
 
 
1185 aa  801    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2630  hypothetical protein  36.88 
 
 
1194 aa  815    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1188  hypothetical protein  37.44 
 
 
1186 aa  775    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.78018 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1560  hypothetical protein  36.54 
 
 
1185 aa  804    Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1453  hypothetical protein  36.04 
 
 
1185 aa  800    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0623006  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2790  hypothetical protein  36.7 
 
 
1185 aa  807    Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1028  hypothetical protein  40.58 
 
 
1194 aa  816    Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.937491  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0074  hypothetical protein  100 
 
 
1216 aa  2480    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1589  hypothetical protein  36.62 
 
 
1185 aa  804    Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148352  normal  0.910022 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4874  hypothetical protein  31.82 
 
 
1215 aa  578  1.0000000000000001e-163  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.70631  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5233  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  28.4 
 
 
1162 aa  473  1e-132  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000537621 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1979  aminopeptidase N-like protein  27.43 
 
 
1179 aa  442  9.999999999999999e-123  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.881454  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0293  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  25 
 
 
504 aa  62.4  0.00000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.03684  normal  0.0231195 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2423  aminopeptidase N  27 
 
 
489 aa  62.4  0.00000006  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2348  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  27.78 
 
 
480 aa  61.6  0.00000009  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.0816785  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2801  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  37.5 
 
 
506 aa  60.1  0.0000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.184287  normal  0.402753 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0576  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  23.3 
 
 
869 aa  59.3  0.0000004  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0251  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  25.35 
 
 
504 aa  59.3  0.0000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  unclonable  0.000018463  normal  0.187628 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1564  hypothetical protein  25.61 
 
 
922 aa  58.5  0.0000007  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0116827  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3140  peptidase, M1 family protein  24.14 
 
 
690 aa  52.4  0.00006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.763793  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2928  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  28.33 
 
 
686 aa  51.2  0.0001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.105993  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1169  hypothetical protein  26 
 
 
277 aa  51.2  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0738  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  33.64 
 
 
559 aa  50.4  0.0002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00291351  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3210  hypothetical protein  23.81 
 
 
758 aa  50.8  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.336034  hitchhiker  0.00714683 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1191  peptidase M1, membrane alanine aminopeptidase  22.39 
 
 
640 aa  48.1  0.001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.820594  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1084  peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  27.97 
 
 
482 aa  47  0.002  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.799271  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03140  putative cold-active aminopeptidase; secreted using a signal peptide  25.35 
 
 
643 aa  46.6  0.003  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.409297  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_10463  aminopeptidase  22.47 
 
 
688 aa  46.2  0.003  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1946  hypothetical protein  29.13 
 
 
829 aa  46.2  0.004  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1828  aminopeptidase N  25.08 
 
 
853 aa  46.2  0.004  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00705438  normal  0.315608 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1966  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.79 
 
 
835 aa  45.4  0.006  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_6044  Peptidase M1 membrane alanine aminopeptidase  20.32 
 
 
649 aa  45.1  0.008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.334803  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>