More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0073 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0073  ABC transporter related  100 
 
 
292 aa  593  1e-168  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.403382  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2631  ABC transporter related  66.78 
 
 
295 aa  403  1e-111  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.789941  normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1750  ABC transporter, ATP-binding protein  62.67 
 
 
292 aa  379  1e-104  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1588  ABC transporter related  62.33 
 
 
292 aa  376  1e-103  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2791  ABC transporter related  62.33 
 
 
292 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1187  ABC transporter, ATP-binding protein  63.1 
 
 
293 aa  377  1e-103  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1452  ABC transporter related  62.67 
 
 
292 aa  377  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1559  ABC transporter related  62.33 
 
 
292 aa  375  1e-103  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1029  ABC transporter related  62.72 
 
 
300 aa  366  1e-100  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.967418  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4876  ABC transporter related protein  60.48 
 
 
299 aa  364  1e-99  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1980  ABC transporter related  57.29 
 
 
294 aa  357  9.999999999999999e-98  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.240272  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_5232  ABC transporter related  58.33 
 
 
300 aa  343  2.9999999999999997e-93  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.548962  hitchhiker  0.00635683 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0819  ABC transporter related protein  43.71 
 
 
287 aa  231  1e-59  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.989778  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2797  ABC transporter, ATPase subunit  44.91 
 
 
297 aa  230  3e-59  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.689137  normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2277  ABC transporter related  44.25 
 
 
293 aa  229  4e-59  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1984  ABC transporter related  39.38 
 
 
295 aa  226  3e-58  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1458  ABC transporter related  43.88 
 
 
290 aa  224  9e-58  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.237048  normal  0.276078 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2521  ABC transporter related  42.38 
 
 
284 aa  224  1e-57  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.436198 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1076  ABC transporter related  39.3 
 
 
301 aa  224  2e-57  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0949  ABC transporter related  44.94 
 
 
289 aa  221  9.999999999999999e-57  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1168  ABC transporter related protein  43.06 
 
 
288 aa  218  7.999999999999999e-56  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_12100  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  39.72 
 
 
299 aa  213  1.9999999999999998e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_18810  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.51 
 
 
291 aa  212  5.999999999999999e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.222917 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3995  ABC transporter related  43.62 
 
 
286 aa  208  8e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.259313  normal  0.940234 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2664  ABC transporter related  42.57 
 
 
296 aa  206  3e-52  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000181001  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0914  ABC transporter related  36.81 
 
 
290 aa  205  8e-52  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0358  ABC transporter related  37.01 
 
 
303 aa  196  5.000000000000001e-49  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3211  ABC transporter ATP-binding protein  37.37 
 
 
307 aa  193  3e-48  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00761631  normal  0.0394821 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3435  ABC transporter-like protein  40.46 
 
 
295 aa  186  6e-46  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1955  ABC transporter, ATP-binding protein  34.16 
 
 
282 aa  184  1.0000000000000001e-45  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2982  ABC transporter related protein  36.9 
 
 
288 aa  184  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2870  ABC transporter related protein  38.73 
 
 
296 aa  182  4.0000000000000006e-45  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1094  ABC transporter, ATP-binding protein  36.55 
 
 
290 aa  182  4.0000000000000006e-45  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0536636  n/a   
 
 
-
 
NC_013164  Apre_1835  ABC transporter related  33.79 
 
 
295 aa  182  5.0000000000000004e-45  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0297  ABC transporter related protein  36.46 
 
 
289 aa  176  3e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1415  ABC transporter related protein  36.36 
 
 
286 aa  172  5.999999999999999e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0454  ABC transporter related  42.79 
 
 
251 aa  166  4e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0498  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  38.84 
 
 
360 aa  164  1.0000000000000001e-39  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4183  ABC transporter related  38.43 
 
 
240 aa  163  4.0000000000000004e-39  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.804613  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2706  ABC transporter related protein  37.33 
 
 
369 aa  162  5.0000000000000005e-39  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000123322  n/a   
 
 
-
 
NC_013924  Nmag_4107  ABC transporter related protein  38.05 
 
 
356 aa  162  6e-39  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.906748  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0426  ABC transporter, ATPase subunit  41.59 
 
 
315 aa  162  6e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0460  ABC transporter related  41.59 
 
 
315 aa  161  1e-38  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.0955975  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0981  ABC transporter related  39.15 
 
 
325 aa  160  2e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1342  ABC transporter-related protein  36.57 
 
 
301 aa  160  2e-38  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.240118  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1770  ABC transporter related protein  36.19 
 
 
308 aa  159  7e-38  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.471072  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0758  ABC transporter related  38.24 
 
 
305 aa  158  9e-38  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.334038 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0606  ABC transporter related  39.82 
 
 
321 aa  158  9e-38  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.118308  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1343  daunorubicin resistance ABC transporter ATPase subunit  37.13 
 
 
411 aa  158  1e-37  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.557493  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4743  ABC transporter related  42.72 
 
 
267 aa  158  1e-37  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.249045  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0295  ABC transporter related  36.94 
 
 
315 aa  157  3e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2411  ABC transporter related  39.56 
 
 
360 aa  154  1e-36  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.96204 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27770  ABC transporter ATP-binding protein  37.09 
 
 
310 aa  154  1e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.109755 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0448  multidrug ABC transporter  35.46 
 
 
338 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.380616  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4023  ABC transporter related  40.71 
 
 
344 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000171205 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3073  ABC transporter related  37.73 
 
 
307 aa  153  2.9999999999999998e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1577  ABC transporter related protein  38.57 
 
 
318 aa  153  2.9999999999999998e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05111  putative multidrug efflux ABC transporter  34.66 
 
 
338 aa  153  2.9999999999999998e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13010  ABC transporter related  34.65 
 
 
310 aa  153  4e-36  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1919  ABC transporter related  40.27 
 
 
310 aa  152  5e-36  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.00224779  normal  0.302439 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0726  ABC transporter related  37.61 
 
 
316 aa  152  5e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2203  ABC transporter related protein  38.79 
 
 
336 aa  152  5e-36  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000598238  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1411  ABC transporter-related protein  40.83 
 
 
303 aa  152  5e-36  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2429  ABC transporter-like protein protein  32.17 
 
 
328 aa  152  5.9999999999999996e-36  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2345  ABC transporter ATP-binding protein  36.73 
 
 
310 aa  152  5.9999999999999996e-36  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.246308  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3790  ABC transporter related  35.51 
 
 
304 aa  152  5.9999999999999996e-36  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.021696  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_04731  putative multidrug efflux ABC transporter  35.46 
 
 
338 aa  152  5.9999999999999996e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1470  ABC transporter related  37.78 
 
 
310 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3059  ABC transporter related  36.36 
 
 
328 aa  152  8e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.588956  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1468  ABC transporter related  36.24 
 
 
319 aa  152  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00475192  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_1895  ABC transporter ATP-binding protein  37.78 
 
 
310 aa  151  1e-35  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000838668 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1431  ABC transporter related  36.12 
 
 
316 aa  151  1e-35  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0458  ABC transporter-like protein  33.21 
 
 
309 aa  150  2e-35  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29680  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  33.46 
 
 
312 aa  150  2e-35  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.619183  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_05041  putative multidrug efflux ABC transporter  35.06 
 
 
338 aa  150  2e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.288968  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3820  ABC transporter related  37.41 
 
 
310 aa  149  4e-35  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2842  ATP-binding protein of ABC transporter  37.44 
 
 
317 aa  149  5e-35  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.0000492349  normal  0.269335 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_04471  putative multidrug efflux ABC transporter  34.75 
 
 
337 aa  149  7e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.797798  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4230  ABC transporter-like  37.19 
 
 
331 aa  149  7e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.723514  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1505  ABC transporter related  37.41 
 
 
310 aa  148  8e-35  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3209  ABC transporter related  37.17 
 
 
337 aa  149  8e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.101264  normal  0.112036 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4170  ABC transporter related  35.51 
 
 
304 aa  149  8e-35  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.720041  hitchhiker  0.00203248 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0221  ABC transporter related  39.09 
 
 
253 aa  148  8e-35  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.207021  normal 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4181  ABC transporter-like  38.84 
 
 
310 aa  148  9e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.511532 
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0781  ABC transporter, ATP-binding protein  33.63 
 
 
309 aa  148  9e-35  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3089  ABC transporter, ATP-binding protein  36.04 
 
 
301 aa  147  1.0000000000000001e-34  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.742999  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2419  ABC transporter related  35 
 
 
328 aa  147  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1560  ABC transporter related  34.43 
 
 
344 aa  148  1.0000000000000001e-34  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0503147  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3146  ABC transporter related  34.4 
 
 
319 aa  147  2.0000000000000003e-34  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3855  ABC transporter, ATP-binding protein  38.67 
 
 
310 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.324637  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2142  ABC transporter, ATPase subunit  38.57 
 
 
311 aa  147  3e-34  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.560639  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0907  ABC transporter related  34.67 
 
 
260 aa  147  3e-34  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299465 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_15500  ABC transporter, ATP binding component  38.84 
 
 
310 aa  146  4.0000000000000006e-34  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3319  ABC transporter, ATP-binding protein  36.16 
 
 
301 aa  146  4.0000000000000006e-34  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1781  ABC transporter related  34.8 
 
 
306 aa  145  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00159996  normal  0.877081 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0880  ABC transporter related protein  39.34 
 
 
309 aa  145  8.000000000000001e-34  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3103  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
302 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1630  ABC transporter  38.22 
 
 
310 aa  144  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.0229972  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1751  ATPase  37.55 
 
 
337 aa  145  1e-33  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.253958  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3349  ABC transporter ATP-binding protein  35.59 
 
 
302 aa  144  1e-33  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>