More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0051 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0051  LuxR family transcriptional regulator  100 
 
 		 247 aa  487  1e-137  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0498037  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4255  LuxR family transcriptional regulator  40.91 
 
 		 227 aa  58.9  0.00000008  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0102406 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4781  LuxR family transcriptional regulator  39.39 
 
 		 227 aa  57.4  0.0000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0502492  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0394  regulatory protein, LuxR  40.7 
 
 		 185 aa  55.5  0.0000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0417194  normal  0.0540308 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6044  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.72 
 
 		 226 aa  54.3  0.000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1532  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.44 
 
 		 220 aa  53.9  0.000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0114765  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2630  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 243 aa  53.1  0.000004  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2042  two component LuxR family transcriptional regulator  40.79 
 
 		 208 aa  51.6  0.00001  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3254  two component LuxR family transcriptional regulator  52.73 
 
 		 201 aa  52  0.00001  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.49762 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2582  LuxR response regulator receiver  58.7 
 
 		 233 aa  50.8  0.00002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0553  response regulator receiver protein  46.88 
 
 		 213 aa  50.8  0.00002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.82888  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3606  regulatory protein, LuxR  45.9 
 
 		 229 aa  51.2  0.00002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.527821  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0596  two component LuxR family transcriptional regulator  42.03 
 
 		 228 aa  50.1  0.00003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5202  two component transcriptional regulator, LuxR family  39.56 
 
 		 225 aa  50.1  0.00003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.677169  normal  0.920773 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0083  two component LuxR family transcriptional regulator  54.35 
 
 		 210 aa  50.4  0.00003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4226  two component transcriptional regulator, LuxR family  56.52 
 
 		 210 aa  49.7  0.00004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2604  transcriptional regulator, LuxR family  44.64 
 
 		 74 aa  49.3  0.00005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4126  transcriptional regulator, LuxR family  51.92 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000353041 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3244  response regulator receiver protein  41.46 
 
 		 218 aa  49.3  0.00006  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  hitchhiker  0.000568428  normal  0.332742 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0859  two component LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.883984  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3002  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 210 aa  49.3  0.00006  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.000000000000242381  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  60.47 
 
 		 218 aa  48.5  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4040  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 216 aa  48.5  0.00009  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.56786  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2293  LuxR family DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 211 aa  48.1  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0444  transcriptional regulator, LuxR family  46.43 
 
 		 938 aa  48.1  0.0001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.192623  normal  0.240024 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3229  two component LuxR family transcriptional regulator  47.27 
 
 		 224 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1238  LuxR family transcriptional regulator  43.64 
 
 		 167 aa  48.5  0.0001  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.233099  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_41040  Two-component response regulator, LuxR family  55.56 
 
 		 208 aa  48.1  0.0001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.136918  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6085  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.35 
 
 		 217 aa  48.1  0.0001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3175  LuxR family transcriptional regulator  51.92 
 
 		 148 aa  48.5  0.0001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4382  regulatory protein, LuxR  50 
 
 		 1006 aa  48.1  0.0001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.172901  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0649  LuxR family two component transcriptional regulator  56.52 
 
 		 212 aa  47.8  0.0001  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.93281  normal  0.368826 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1229  response regulator receiver protein  56.52 
 
 		 212 aa  48.1  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.643884  hitchhiker  0.00799583 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1690  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104312 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3033  two component transcriptional regulator, LuxR family  48.21 
 
 		 232 aa  47.8  0.0002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.666463  hitchhiker  0.000783277 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0829  two component LuxR family transcriptional regulator  53.85 
 
 		 219 aa  47.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0121621 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5878  two component transcriptional regulator, LuxR family  40 
 
 		 441 aa  47.4  0.0002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.464013 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5114  two component LuxR family transcriptional regulator  43.55 
 
 		 230 aa  47.4  0.0002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00554548 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5233  two component transcriptional regulator, LuxR family  54.35 
 
 		 223 aa  47.8  0.0002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.114456  hitchhiker  0.000738291 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0555  two component LuxR family transcriptional regulator  45.45 
 
 		 228 aa  47.4  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4662  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.26 
 
 		 221 aa  47.4  0.0002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.142047  hitchhiker  0.00679998 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1848  transcriptional regulator NarL  40.32 
 
 		 215 aa  47.4  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4684  two component LuxR family transcriptional regulator  46.15 
 
 		 223 aa  47.4  0.0002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.51425  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2414  two component transcriptional regulator, LuxR family  45.9 
 
 		 215 aa  47.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2270  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.05 
 
 		 242 aa  47.4  0.0002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000113212 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1505  transcriptional regulator, LuxR family  47.17 
 
 		 522 aa  46.6  0.0003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4214  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.0601429  normal  0.0532868 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0281  transcriptional regulator, LuxR family  51.06 
 
 		 947 aa  46.6  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2326  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 210 aa  47  0.0003  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000518478 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1034  two component transcriptional regulator, LuxR family  50.94 
 
 		 213 aa  47  0.0003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4349  two component LuxR family transcriptional regulator  52.17 
 
 		 206 aa  47  0.0003  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.20794  normal  0.534464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0846  transcriptional regulator, LuxR family  39.29 
 
 		 74 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0848  transcriptional regulator, LuxR family  61.11 
 
 		 954 aa  47  0.0003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0277  two component transcriptional regulator, LuxR family  50 
 
 		 228 aa  47  0.0003  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0542563  normal  0.0298075 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3824  response regulator receiver  52.17 
 
 		 228 aa  46.6  0.0003  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.206519  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1293  LuxR family DNA-binding response regulator  52.27 
 
 		 216 aa  46.6  0.0004  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1854  transcriptional regulator, LuxR family  36.76 
 
 		 75 aa  46.6  0.0004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0228  LuxR family two component transcriptional regulator  50.94 
 
 		 206 aa  46.6  0.0004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08490  response regulator containing a CheY-like receiver domain and an HTH DNA-binding domain  42.47 
 
 		 236 aa  46.6  0.0004  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.199706  normal  0.526513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2028  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.515359  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5644  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.19 
 
 		 225 aa  46.6  0.0004  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.114252 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0354  two component transcriptional regulator, LuxR family  52 
 
 		 222 aa  46.6  0.0004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1355  two component LuxR family transcriptional regulator  48.89 
 
 		 230 aa  46.6  0.0004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5322  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 220 aa  46.6  0.0004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  0.929677 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2290  two component LuxR family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 215 aa  46.2  0.0004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2998  two component LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 228 aa  46.6  0.0004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3205  response regulator receiver protein  41.07 
 
 		 74 aa  46.6  0.0004  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.826126  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0105  two component LuxR family transcriptional regulator  43.1 
 
 		 219 aa  46.6  0.0004  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  0.0920509 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2151  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.639034  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2062  LuxR family DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0947149  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0766  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 214 aa  46.6  0.0004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.261512  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1063  LuxR family DNA-binding response regulator  50 
 
 		 232 aa  46.2  0.0005  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.815436  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1518.1  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  hitchhiker  0.000399536  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2343  two component LuxR family transcriptional regulator  63.89 
 
 		 211 aa  46.2  0.0005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.999882  normal  0.0841394 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0560  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 223 aa  46.2  0.0005  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0224831  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0385  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.16 
 
 		 224 aa  46.2  0.0005  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2253  two component transcriptional regulator, LuxR family  41.38 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.174263  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1769  putative response regulator  50 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1267  two component LuxR family transcriptional regulator  49.06 
 
 		 216 aa  46.2  0.0005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3745  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 235 aa  46.2  0.0005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.627677  normal  0.255424 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4428  two component LuxR family transcriptional regulator  38.03 
 
 		 231 aa  46.2  0.0005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0756  LuxR family transcriptional regulator  48.08 
 
 		 228 aa  45.8  0.0006  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.826443 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3348  transcriptional regulator, LuxR family  43.33 
 
 		 238 aa  45.8  0.0006  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6525  two component transcriptional regulator, LuxR family  53.33 
 
 		 216 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0581  two component LuxR family transcriptional regulator  56.41 
 
 		 235 aa  45.8  0.0006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.706783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_2085  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 264 aa  45.8  0.0006  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.844485  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_4511  two component transcriptional regulator, LuxR family  44.62 
 
 		 226 aa  45.8  0.0006  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.11054  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0036  two component LuxR family transcriptional regulator  45.9 
 
 		 221 aa  45.8  0.0006  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.0464925  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2872  two component transcriptional regulator, LuxR family  47.54 
 
 		 218 aa  45.4  0.0007  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3740  LuxR family transcriptional regulator  33.78 
 
 		 403 aa  45.8  0.0007  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0851  DNA-binding response regulator  42.62 
 
 		 223 aa  45.8  0.0007  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0464733  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4715  Two component LuxR family transcriptional regulator  27.21 
 
 		 264 aa  45.8  0.0007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4227  two component LuxR family transcriptional regulator  49.09 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.624898 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1204  two component LuxR family transcriptional regulator  51.61 
 
 		 213 aa  45.8  0.0007  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4226  germination protein  41.07 
 
 		 74 aa  45.4  0.0008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4238  germination protein  41.07 
 
 		 74 aa  45.4  0.0008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4724  germination protein GerE  41.07 
 
 		 74 aa  45.4  0.0008  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.105908  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8243  response regulator receiver protein  44.29 
 
 		 217 aa  45.4  0.0008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.931194  normal  0.230681 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4329  LuxR family transcriptional regulator  41.07 
 
 		 74 aa  45.4  0.0008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0945  two component LuxR family transcriptional regulator  47.83 
 
 		 232 aa  45.4  0.0008  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>