82 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0036 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0036  TPR repeat-containing protein  100 
 
 
514 aa  1045    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.83786  normal  0.225653 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4637  beta-lactamase  36.75 
 
 
491 aa  93.2  1e-17  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4636  beta-lactamase  37.14 
 
 
496 aa  80.9  0.00000000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014213  Mesil_3340  protein of unknown function DUF71 ATP-binding region  31.31 
 
 
382 aa  70.5  0.00000000008  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4667  beta-lactamase  35.19 
 
 
498 aa  66.2  0.000000001  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.235616  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0544  beta-lactamase  32.14 
 
 
578 aa  64.3  0.000000005  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.129057 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2074  peptidase S15  36.94 
 
 
524 aa  62  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.419616  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_27760  Platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.03 
 
 
474 aa  62.8  0.00000002  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.0623515  normal  0.667788 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2793  beta-lactamase  29.01 
 
 
510 aa  60.8  0.00000006  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.879811  normal  0.340954 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_12878  beta-lactamase, putative  34.38 
 
 
504 aa  60.1  0.0000001  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3459  carboxylic ester hydrolase  24.64 
 
 
456 aa  58.9  0.0000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.675018  hitchhiker  1.26241e-19 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0005  hypothetical protein  35.58 
 
 
380 aa  58.9  0.0000002  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0500  beta-lactamase  28.57 
 
 
487 aa  58.9  0.0000002  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2596  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  26.72 
 
 
426 aa  55.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.073568  normal  0.0520068 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1888  carboxylic ester hydrolase  23.93 
 
 
456 aa  53.9  0.000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.356613  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2228  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  21.3 
 
 
406 aa  53.5  0.000008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1804  carboxymethylenebutenolidase  29.08 
 
 
291 aa  52  0.00003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.692278  normal  0.911676 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0944  dienelactone hydrolase-like  35.2 
 
 
318 aa  52  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.287245 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2042  carboxymethylenebutenolidase  30.28 
 
 
291 aa  51.2  0.00004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000295478 
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_18539  predicted protein  24.29 
 
 
713 aa  51.2  0.00005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.0118293  decreased coverage  0.000205789 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4221  hypothetical protein  27.19 
 
 
407 aa  50.1  0.00009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.263447  hitchhiker  0.00109479 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2832  dienelactone hydrolase  32.5 
 
 
290 aa  49.7  0.0001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3285  Carboxymethylenebutenolidase  29.13 
 
 
280 aa  49.7  0.0001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3253  hypothetical protein  25.17 
 
 
424 aa  49.7  0.0001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.374377  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3759  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  31.13 
 
 
342 aa  48.9  0.0002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.58888  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1951  dienelactone hydrolase  27.48 
 
 
291 aa  48.9  0.0002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2144  putative esterase  37.97 
 
 
400 aa  48.9  0.0002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.536761  normal  0.363467 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3307  dienelactone hydrolase-like  20.79 
 
 
449 aa  49.3  0.0002  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1926  dienelactone hydrolase-like protein  27.63 
 
 
464 aa  49.3  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0395074  normal  0.388214 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1449  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  28.19 
 
 
436 aa  48.5  0.0003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0776  peptidase S15  33.06 
 
 
517 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0875  twin-arginine translocation pathway signal  30.5 
 
 
291 aa  48.1  0.0003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.0999257  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1104  dipeptidyl peptidase IV  25.76 
 
 
752 aa  48.5  0.0003  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0243  carboxymethylenebutenolidase  32.79 
 
 
278 aa  48.5  0.0003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.110111 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3378  hypothetical protein  32.98 
 
 
546 aa  48.1  0.0004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.127536  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4255  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.64 
 
 
443 aa  48.1  0.0004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.4814 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2140  Carboxymethylenebutenolidase  27.66 
 
 
291 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.324009 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0265  dienelactone hydrolase family protein  32.79 
 
 
290 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3951  carboxymethylenebutenolidase  32.79 
 
 
290 aa  47.8  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3647  dienelactone hydrolase family protein  32.52 
 
 
290 aa  47.4  0.0006  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_4770  dienelactone hydrolase-like protein  29.93 
 
 
318 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.394941  normal  0.52703 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3689  platelet-activating factor acetylhydrolase, plasma/intracellular isoform II  26.44 
 
 
430 aa  47.4  0.0006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3597  dienelactone hydrolase-like  29.93 
 
 
318 aa  47.4  0.0006  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.477665  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1883  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  25.88 
 
 
393 aa  47.4  0.0007  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2768  beta-lactamase  29.9 
 
 
483 aa  47.4  0.0007  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A1556  CocE/NonD family hydrolase  30.56 
 
 
572 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.56743  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A1638  CocE/NonD family hydrolase  30.56 
 
 
567 aa  47.4  0.0007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5513  dienelactone hydrolase-like protein  29.93 
 
 
318 aa  47  0.0008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.386349  normal 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1988  hypothetical protein  29.36 
 
 
376 aa  47  0.0009  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.872973  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2622  twin-arginine translocation pathway signal  31.01 
 
 
291 aa  47  0.0009  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.626056 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_39860  hypothetical protein  32.64 
 
 
546 aa  46.6  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3933  Carboxymethylenebutenolidase  31.4 
 
 
275 aa  46.6  0.001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4877  Platelet-activating factor acetylhydrolase plasma/intracellular isoform II  27.49 
 
 
396 aa  45.4  0.002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.300745  normal 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A0130  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  29.86 
 
 
572 aa  45.8  0.002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.275557  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2300  dipeptidyl aminopeptidases/acylaminoacyl-peptidases-like  33.33 
 
 
327 aa  46.2  0.002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000887585 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1756  Carboxymethylenebutenolidase  26.95 
 
 
291 aa  45.1  0.003  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8803  hypothetical protein  27.92 
 
 
391 aa  45.1  0.003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II1243  putative ABC transporter ATP-binding protein  29.33 
 
 
572 aa  44.7  0.004  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6851  ABC-type multidrug transport system ATPase component-like protein  30.36 
 
 
866 aa  44.7  0.004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03717  predicted hydrolase  32.23 
 
 
269 aa  44.7  0.004  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4206  dienelactone hydrolase family protein  32.23 
 
 
269 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000877073 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0649  dipeptidyl-peptidase IV  29.09 
 
 
763 aa  45.1  0.004  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000821828  hitchhiker  0.00018889 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4054  dienelactone hydrolase family protein  32.23 
 
 
271 aa  44.3  0.005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4149  Carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
271 aa  44.3  0.005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4351  dienelactone hydrolase family protein  32.23 
 
 
271 aa  44.7  0.005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4178  carboxymethylenebutenolidase  32.23 
 
 
271 aa  44.3  0.005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal  0.0221316 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03666  hypothetical protein  32.23 
 
 
267 aa  44.3  0.005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0186  Carboxymethylenebutenolidase  29.51 
 
 
275 aa  44.3  0.005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2040  Carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 
292 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.143956  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2433  Carboxymethylenebutenolidase  31.47 
 
 
292 aa  44.3  0.005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5271  dienelactone hydrolase family protein  32.23 
 
 
271 aa  44.3  0.005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.198587 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4294  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
291 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4175  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
291 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4198  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
291 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4247  dienelactone hydrolase  32.26 
 
 
291 aa  44.3  0.006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.750594  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_04393  hydrolase CocE/NonD family protein subfamily  30.28 
 
 
218 aa  43.9  0.006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.890391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0950  hypothetical protein  23.44 
 
 
468 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0893  hypothetical protein  23.44 
 
 
468 aa  43.9  0.007  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0869  carboxylic ester hydrolase; acetylhydrolase  23.46 
 
 
468 aa  43.9  0.008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.852168  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0025  hypothetical protein  29.52 
 
 
568 aa  43.5  0.009  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.797513 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4024  twin-arginine translocation pathway signal  24.62 
 
 
278 aa  43.1  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3090  hypothetical protein  33.33 
 
 
545 aa  43.5  0.01  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.000551056  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>