More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0027 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010338  Caul_0027  S-adenosylmethionine synthetase  100 
 
 
407 aa  834    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.114949  normal  0.726212 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2439  S-adenosylmethionine synthetase  65.27 
 
 
388 aa  503  1e-141  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3623  S-adenosylmethionine synthetase  63.12 
 
 
389 aa  496  1e-139  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_3139  S-adenosylmethionine synthetase  61.67 
 
 
406 aa  485  1e-136  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_5288  methionine adenosyltransferase  64.04 
 
 
392 aa  477  1e-133  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.344896 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3776  S-adenosylmethionine synthetase  63.12 
 
 
389 aa  475  1e-133  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0706  S-adenosylmethionine synthetase  62.62 
 
 
393 aa  475  1e-133  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.479174 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5908  S-adenosylmethionine synthetase  63.55 
 
 
392 aa  472  1e-132  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.545702  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3629  Methionine adenosyltransferase  63.79 
 
 
391 aa  474  1e-132  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0654869  normal  0.253839 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3506  Methionine adenosyltransferase  63.79 
 
 
391 aa  472  1e-132  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.996413  normal  0.604274 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3306  methionine adenosyltransferase  63.79 
 
 
391 aa  474  1e-132  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.636766 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4493  methionine adenosyltransferase  63.55 
 
 
392 aa  471  1e-132  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2378  S-adenosylmethionine synthetase  61.65 
 
 
398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.989714  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1062  methionine adenosyltransferase  64.41 
 
 
398 aa  471  1.0000000000000001e-131  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.323236  normal  0.678652 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1588  S-adenosylmethionine synthetase  62.14 
 
 
398 aa  469  1.0000000000000001e-131  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1816  methionine adenosyltransferase  63.26 
 
 
397 aa  471  1.0000000000000001e-131  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.0159943  normal  0.205319 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3280  S-adenosylmethionine synthetase  62.03 
 
 
388 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.861099 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3595  S-adenosylmethionine synthetase  62.03 
 
 
388 aa  464  9.999999999999999e-131  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0230155  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1012  S-adenosylmethionine synthetase  61.54 
 
 
394 aa  467  9.999999999999999e-131  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2753  S-adenosylmethionine synthetase  61.41 
 
 
398 aa  468  9.999999999999999e-131  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.293666  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0193  S-adenosylmethionine synthetase  61.73 
 
 
393 aa  464  9.999999999999999e-131  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.390697  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3373  S-adenosylmethionine synthetase  62.38 
 
 
402 aa  465  9.999999999999999e-131  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.304144 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3877  S-adenosylmethionine synthetase  61.79 
 
 
388 aa  463  1e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4154  S-adenosylmethionine synthetase  61.41 
 
 
398 aa  463  1e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.509299  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4546  S-adenosylmethionine synthetase  60.44 
 
 
398 aa  461  1e-129  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5699  S-adenosylmethionine synthetase  62.08 
 
 
399 aa  464  1e-129  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.464938 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0284  S-adenosylmethionine synthetase  61.52 
 
 
401 aa  458  9.999999999999999e-129  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1596  S-adenosylmethionine synthetase  61.41 
 
 
398 aa  461  9.999999999999999e-129  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1054  S-adenosylmethionine synthetase  62.81 
 
 
395 aa  452  1.0000000000000001e-126  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1873  S-adenosylmethionine synthetase  58.91 
 
 
388 aa  450  1e-125  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.176283  normal  0.7494 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1970  S-adenosylmethionine synthetase  59.8 
 
 
395 aa  447  1.0000000000000001e-124  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR2160  S-adenosylmethionine synthetase  58.29 
 
 
421 aa  437  1e-121  Brucella suis 1330  Bacteria  hitchhiker  0.00603906  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0046  S-adenosylmethionine synthetase  60.96 
 
 
426 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0624552  hitchhiker  0.00000000150767 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2072  S-adenosylmethionine synthetase  58.29 
 
 
421 aa  436  1e-121  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0645702  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0752  S-adenosylmethionine synthetase  58.12 
 
 
420 aa  432  1e-120  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0013  S-adenosylmethionine synthetase  59.76 
 
 
412 aa  430  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.303357  normal  0.0988559 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0015  S-adenosylmethionine synthetase  59.76 
 
 
412 aa  429  1e-119  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.0000616083 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0444  S-adenosylmethionine synthetase  59.52 
 
 
412 aa  424  1e-117  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  hitchhiker  0.00664731  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1249  S-adenosylmethionine synthetase  56.57 
 
 
426 aa  419  1e-116  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3924  S-adenosylmethionine synthetase  58.04 
 
 
426 aa  411  1e-113  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0136  S-adenosylmethionine synthetase  51.36 
 
 
390 aa  391  1e-108  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2262  S-adenosylmethionine synthetase  52.22 
 
 
385 aa  392  1e-108  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4320  methionine adenosyltransferase  50.86 
 
 
387 aa  393  1e-108  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.238534  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1256  S-adenosylmethionine synthetase  51.44 
 
 
395 aa  382  1e-105  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.247936  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0499  S-adenosylmethionine synthetase  52.16 
 
 
396 aa  381  1e-105  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0470  S-adenosylmethionine synthetase  53.12 
 
 
382 aa  383  1e-105  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2777  S-adenosylmethionine synthetase  49.52 
 
 
403 aa  378  1e-104  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000102854  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4967  S-adenosylmethionine synthetase  51.92 
 
 
396 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.3549  normal 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2521  S-adenosylmethionine synthetase  50.86 
 
 
388 aa  380  1e-104  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.53813 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1821  S-adenosylmethionine synthetase  50.25 
 
 
385 aa  379  1e-104  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0267535  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4840  S-adenosylmethionine synthetase  51.92 
 
 
396 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.905564  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5016  S-adenosylmethionine synthetase  51.92 
 
 
396 aa  379  1e-104  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.330289 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2574  S-adenosylmethionine synthetase  51.7 
 
 
395 aa  380  1e-104  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0485425  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0879  S-adenosylmethionine synthetase  52 
 
 
388 aa  379  1e-104  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000307684  hitchhiker  0.000000742555 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0349  S-adenosylmethionine synthetase  52.48 
 
 
388 aa  377  1e-103  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000664302  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2251  methionine adenosyltransferase  50.61 
 
 
397 aa  378  1e-103  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.0000000460807  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0139  S-adenosylmethionine synthetase  51.72 
 
 
389 aa  377  1e-103  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0929  S-adenosylmethionine synthetase  51.12 
 
 
383 aa  377  1e-103  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0659  S-adenosylmethionine synthetase  49.52 
 
 
403 aa  375  1e-103  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2084  methionine adenosyltransferase  49.76 
 
 
395 aa  377  1e-103  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.191002  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1877  S-adenosylmethionine synthetase  50.24 
 
 
398 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3331  S-adenosylmethionine synthetase  50.37 
 
 
383 aa  376  1e-103  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.175486  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0871  S-adenosylmethionine synthetase  51.12 
 
 
383 aa  378  1e-103  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0772  S-adenosylmethionine synthetase  51.61 
 
 
383 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3251  S-adenosylmethionine synthetase  51.61 
 
 
383 aa  377  1e-103  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0646  S-adenosylmethionine synthetase  50.62 
 
 
383 aa  375  1e-103  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00167645  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1841  S-adenosylmethionine synthetase  50.24 
 
 
398 aa  377  1e-103  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3354  S-adenosylmethionine synthetase  51.61 
 
 
383 aa  377  1e-103  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4914  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  373  1e-102  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.11754  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4886  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0383  S-adenosylmethionine synthetase  52.96 
 
 
396 aa  372  1e-102  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4660  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4500  S-adenosylmethionine synthetase  49.76 
 
 
399 aa  372  1e-102  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4517  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.536795  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0945  S-adenosylmethionine synthetase  46.88 
 
 
393 aa  374  1e-102  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1332  S-adenosylmethionine synthetase  50.37 
 
 
389 aa  372  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000124955  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1290  S-adenosylmethionine synthetase  50.37 
 
 
389 aa  372  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  unclonable  0.00000000000000134106  hitchhiker  0.0000021958 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5017  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
399 aa  374  1e-102  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00446313  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3437  S-adenosylmethionine synthetase  49.76 
 
 
399 aa  373  1e-102  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.109386  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2541  S-adenosylmethionine synthetase  51.36 
 
 
399 aa  372  1e-102  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.245618  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0751  S-adenosylmethionine synthetase  50.62 
 
 
383 aa  372  1e-102  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4877  S-adenosylmethionine synthetase  49.76 
 
 
399 aa  372  1e-102  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.000842328  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0018  S-adenosylmethionine synthetase  47.01 
 
 
392 aa  373  1e-102  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1082  S-adenosylmethionine synthetase  50.87 
 
 
383 aa  374  1e-102  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0507835  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0385  S-adenosylmethionine synthetase  50.12 
 
 
406 aa  373  1e-102  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0787  S-adenosylmethionine synthetase  50.37 
 
 
384 aa  373  1e-102  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.451532  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0413  S-adenosylmethionine synthetase  51.87 
 
 
390 aa  374  1e-102  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0737611  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4904  S-adenosylmethionine synthetase  49.76 
 
 
399 aa  372  1e-102  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.0000363625  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1071  S-adenosylmethionine synthetase  51.22 
 
 
393 aa  373  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0298396  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0454  S-adenosylmethionine synthetase  51.68 
 
 
396 aa  372  1e-102  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0753  Non-specific protein-tyrosine kinase  50 
 
 
384 aa  371  1e-101  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl1999  S-adenosylmethionine synthetase  49.75 
 
 
382 aa  370  1e-101  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0828  S-adenosylmethionine synthetase  49.5 
 
 
388 aa  369  1e-101  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.296122  normal  0.0311874 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3099  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
384 aa  371  1e-101  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3374  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
384 aa  370  1e-101  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3042  S-adenosylmethionine synthetase  51.82 
 
 
396 aa  369  1e-101  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.983396  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3880  S-adenosylmethionine synthetase  48.9 
 
 
393 aa  369  1e-101  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.356419  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3284  S-adenosylmethionine synthetase  50 
 
 
384 aa  371  1e-101  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3541  S-adenosylmethionine synthetase  50.62 
 
 
383 aa  371  1e-101  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0044  S-adenosylmethionine synthetase  51.24 
 
 
388 aa  370  1e-101  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000084119  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>