More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0023 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010338  Caul_0023  hypothetical protein  100 
 
 		 162 aa  326  7e-89  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0474552  normal  0.677353 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2336  hypothetical protein  49.69 
 
 		 154 aa  131  3.9999999999999996e-30  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0470  hypothetical protein  48.32 
 
 		 168 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.736744 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0240  hypothetical protein  45.4 
 
 		 195 aa  130  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0756  hypothetical protein  48.05 
 
 		 162 aa  129  2.0000000000000002e-29  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0016  hypothetical protein  44.1 
 
 		 190 aa  127  4.0000000000000003e-29  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.0297149 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3401  protein of unknown function UPF0054  47.13 
 
 		 161 aa  127  4.0000000000000003e-29  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0559162  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3206  hypothetical protein  46.5 
 
 		 161 aa  127  5.0000000000000004e-29  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3530  protein of unknown function UPF0054  46.5 
 
 		 161 aa  127  8.000000000000001e-29  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.258059  normal  0.388673 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3693  hypothetical protein  46.67 
 
 		 174 aa  126  1.0000000000000001e-28  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.607801  normal  1 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3874  hypothetical protein  45.88 
 
 		 167 aa  125  3e-28  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.249382  normal  1 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_2068  hypothetical protein  53.98 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  hitchhiker  0.00222514  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR2156  hypothetical protein  53.98 
 
 		 158 aa  124  6e-28  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0171886  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1015  protein of unknown function UPF0054  44.64 
 
 		 181 aa  124  7e-28  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  hitchhiker  0.00876846  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0637  hypothetical protein  47.74 
 
 		 159 aa  122  2e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.563713 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0450  protein of unknown function UPF0054  48.39 
 
 		 167 aa  121  5e-27  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0891  hypothetical protein  50.81 
 
 		 154 aa  120  9e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.151419  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1812  hypothetical protein  48.73 
 
 		 176 aa  120  9e-27  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.160006  normal  0.244952 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2137  protein of unknown function UPF0054  55.75 
 
 		 171 aa  120  9.999999999999999e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.150042  normal  0.171752 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2389  hypothetical protein  55.46 
 
 		 169 aa  119  9.999999999999999e-27  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0703  hypothetical protein  43.83 
 
 		 160 aa  119  9.999999999999999e-27  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.323161 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3035  hypothetical protein  46.36 
 
 		 160 aa  119  1.9999999999999998e-26  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3180  hypothetical protein  42.14 
 
 		 159 aa  119  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0338745  normal  0.0323303 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0023  hypothetical protein  44.97 
 
 		 190 aa  118  3.9999999999999996e-26  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1352  putative metalloprotease  55.17 
 
 		 161 aa  117  4.9999999999999996e-26  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000594068  normal  1 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2159  hypothetical protein  53.33 
 
 		 168 aa  116  9.999999999999999e-26  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.475025 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3529  hypothetical protein  49.61 
 
 		 149 aa  115  3e-25  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.603425  normal  0.0221884 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00449  putative metalloprotease  53.45 
 
 		 137 aa  114  6e-25  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  hitchhiker  0.00790076  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0592  hypothetical protein  44.85 
 
 		 195 aa  113  1.0000000000000001e-24  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0029  protein of unknown function UPF0054  41.88 
 
 		 171 aa  112  2.0000000000000002e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.0226276 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0980  hypothetical protein  48.84 
 
 		 167 aa  112  2.0000000000000002e-24  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.864504  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_09050  putative metalloprotease  51.35 
 
 		 162 aa  112  2.0000000000000002e-24  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.322809  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0396  hypothetical protein  45.75 
 
 		 166 aa  112  2.0000000000000002e-24  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.548723 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1884  putative metalloprotease  50.88 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.0220408  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1949  putative metalloprotease  50.88 
 
 		 161 aa  110  7.000000000000001e-24  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0440  hypothetical protein  42.07 
 
 		 167 aa  110  8.000000000000001e-24  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.510456  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3619  hypothetical protein  42.94 
 
 		 185 aa  109  1.0000000000000001e-23  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1126  putative metalloprotease  51.64 
 
 		 168 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.769061  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0233  protein of unknown function UPF0054  40.74 
 
 		 159 aa  108  3e-23  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.468321  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_12310  putative metalloprotease  51.64 
 
 		 160 aa  108  3e-23  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0626  hypothetical protein  48.67 
 
 		 206 aa  107  6e-23  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.0872327  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0017  protein of unknown function UPF0054  48.21 
 
 		 171 aa  106  1e-22  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.276542 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2290  metal-dependent hydrolase  43.51 
 
 		 149 aa  105  2e-22  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3772  hypothetical protein  45.81 
 
 		 200 aa  104  4e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3598  hypothetical protein  46.15 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.313573  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0590  hypothetical protein  43.17 
 
 		 155 aa  104  5e-22  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.81862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2911  hypothetical protein  38.82 
 
 		 154 aa  104  5e-22  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3283  hypothetical protein  46.15 
 
 		 167 aa  104  5e-22  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.780852 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0042  hypothetical protein  44.92 
 
 		 168 aa  103  7e-22  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.215952  hitchhiker  0.00000000741924 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3921  hypothetical protein  52.63 
 
 		 163 aa  103  1e-21  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1245  hypothetical protein  44.64 
 
 		 158 aa  103  1e-21  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3781  putative metalloprotease  51.79 
 
 		 151 aa  102  2e-21  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.170938 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0813  putative metalloprotease  38.36 
 
 		 153 aa  102  2e-21  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0068  protein of unknown function UPF0054  37.74 
 
 		 202 aa  101  3e-21  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317437 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1224  hypothetical protein  46.49 
 
 		 152 aa  102  3e-21  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0649  hypothetical protein  45.95 
 
 		 149 aa  101  3e-21  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0048  hypothetical protein  43.56 
 
 		 169 aa  101  4e-21  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004213  predicted metal-dependent hydrolase  45.95 
 
 		 154 aa  101  4e-21  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.522311  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0632  putative metalloprotease  53.98 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.00341468  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2925  putative metalloprotease  46.02 
 
 		 157 aa  101  5e-21  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00599548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2697  hypothetical protein  47.97 
 
 		 189 aa  101  5e-21  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0190  hypothetical protein  39.39 
 
 		 194 aa  101  5e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4667  protein of unknown function UPF0054  50 
 
 		 152 aa  101  5e-21  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0529  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  48.65 
 
 		 255 aa  100  6e-21  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0265894  normal  0.0489009 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2895  protein of unknown function UPF0054  42.86 
 
 		 176 aa  100  6e-21  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.365942 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1217  hypothetical protein  48.65 
 
 		 157 aa  100  6e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.06226  normal  0.585303 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_2704  hypothetical protein  48.65 
 
 		 147 aa  100  1e-20  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.818289 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02232  hypothetical protein  43.85 
 
 		 158 aa  100  1e-20  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.389778  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01228  putative metalloprotease  45.05 
 
 		 154 aa  99.8  1e-20  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4788  putative metalloprotease  53.1 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.474537  normal  0.075672 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4842  putative metalloprotease  53.1 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4664  putative metalloprotease  53.1 
 
 		 157 aa  99.4  2e-20  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.352382  normal  0.808044 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1106  putative metalloprotease  41.35 
 
 		 161 aa  99  2e-20  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0406  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.93 
 
 		 270 aa  99.4  2e-20  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  0.122176 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4806  hypothetical protein  50 
 
 		 166 aa  98.6  3e-20  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3240  hypothetical protein  38.31 
 
 		 149 aa  99  3e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2208  hypothetical protein  42.97 
 
 		 152 aa  98.6  3e-20  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1438  hypothetical protein  46.67 
 
 		 147 aa  98.6  3e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  0.317044 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3136  putative metalloprotease  45.05 
 
 		 159 aa  98.2  4e-20  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2917  putative metalloprotease  44.53 
 
 		 157 aa  98.2  5e-20  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.0141881  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0421  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  44.2 
 
 		 270 aa  98.2  5e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2950  putative metalloprotease  42.11 
 
 		 161 aa  97.8  5e-20  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.552489  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0475  hypothetical protein  44.29 
 
 		 160 aa  97.4  6e-20  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0482  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 154 aa  97.4  7e-20  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.000119898  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4347  putative metalloprotease  49.15 
 
 		 166 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4952  putative metalloprotease  53.98 
 
 		 164 aa  97.4  7e-20  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.350599 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0867  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45 
 
 		 274 aa  96.7  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0774  putative metalloprotease  44.92 
 
 		 157 aa  96.3  2e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1195  putative metalloprotease  44.14 
 
 		 159 aa  95.9  2e-19  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0451  unkown domain/putative metalloprotease fusion protein  45.95 
 
 		 245 aa  95.5  2e-19  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0153205  normal  0.601986 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3949  hypothetical protein  48.72 
 
 		 160 aa  96.3  2e-19  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2577  putative metalloprotease  47.14 
 
 		 153 aa  96.3  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.130395 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0822  putative metalloprotease  44.92 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0786  putative metalloprotease  44.92 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0737  hypothetical protein  44.14 
 
 		 148 aa  95.1  3e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.208296  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0713  putative metalloprotease  44.92 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0908599  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0727  putative metalloprotease  44.92 
 
 		 157 aa  95.5  3e-19  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  1  normal  0.942478 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3574  hypothetical protein  43.36 
 
 		 155 aa  94.7  5e-19  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.475724  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3139  putative metalloprotease  42.48 
 
 		 156 aa  94.4  5e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.653369  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_0346  metal-dependent hydrolase  38.56 
 
 		 154 aa  94.4  5e-19  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>