More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Caul_0008 on replicon NC_010338
Organism: Caulobacter sp. K31



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009049  Rsph17029_2879  DNA mismatch repair protein MutS  50.51 
 
 		 880 aa  757    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3599  DNA mismatch repair protein MutS  54.53 
 
 		 908 aa  882    Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002978  WD0190  DNA mismatch repair protein MutS  41.77 
 
 		 820 aa  655    Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4282  DNA mismatch repair protein MutS  50.72 
 
 		 916 aa  773    Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004310  BR0147  DNA mismatch repair protein MutS  52.17 
 
 		 910 aa  862    Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0299  DNA mismatch repair protein MutS  47.31 
 
 		 873 aa  654    Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.391446  normal  0.153174 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2326  DNA mismatch repair protein MutS  50.11 
 
 		 925 aa  749    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.160487 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0423  DNA mismatch repair protein MutS  52.46 
 
 		 883 aa  849    Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0513  DNA mismatch repair protein MutS  52.8 
 
 		 907 aa  842    Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0827  DNA mismatch repair protein MutS  52.08 
 
 		 878 aa  792    Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.133627  normal  1 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_0035  DNA mismatch repair protein MutS  53.68 
 
 		 921 aa  828    Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.892203 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0260  DNA mismatch repair protein MutS  40.36 
 
 		 804 aa  654    Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.76262  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6533  DNA mismatch repair protein MutS  50.16 
 
 		 962 aa  734    Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.948742  normal  0.317969 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0142  DNA mismatch repair protein MutS  52.17 
 
 		 898 aa  861    Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0490  DNA mismatch repair protein MutS  52.1 
 
 		 888 aa  813    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1218  DNA mismatch repair protein MutS  50.62 
 
 		 875 aa  757    Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.318661  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7642  DNA mismatch repair protein MutS  51.05 
 
 		 910 aa  814    Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.532158 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_0159  DNA mismatch repair protein MutS  52.79 
 
 		 910 aa  874    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0621  DNA mismatch repair protein MutS  50.16 
 
 		 905 aa  735    Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.720679  normal  0.722964 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3466  DNA mismatch repair protein MutS  51.84 
 
 		 877 aa  791    Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3541  DNA mismatch repair protein MutS  54.71 
 
 		 929 aa  810    Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0528  DNA mismatch repair protein MutS  53.13 
 
 		 911 aa  831    Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0799066  normal  1 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3293  DNA mismatch repair protein MutS  48.93 
 
 		 858 aa  714    Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0310827  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0209  DNA mismatch repair protein MutS  49.89 
 
 		 877 aa  788    Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  0.784326 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1299  DNA mismatch repair protein MutS  47.58 
 
 		 914 aa  801    Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.141225  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0363  DNA mismatch repair protein MutS  52.28 
 
 		 882 aa  825    Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0030  DNA mismatch repair protein MutS  52.42 
 
 		 915 aa  819    Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000355609 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_0032  DNA mismatch repair protein MutS  52.45 
 
 		 880 aa  840    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  0.317103 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7101  DNA mismatch repair protein MutS  50.33 
 
 		 929 aa  731    Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.743761  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0321  DNA mismatch repair protein MutS  52.23 
 
 		 923 aa  824    Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.784021  normal  0.870381 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1263  DNA mismatch repair protein MutS  49.19 
 
 		 919 aa  776    Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0902404 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0614  DNA mismatch repair protein MutS  52.08 
 
 		 907 aa  844    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2875  DNA mismatch repair protein MutS  49.78 
 
 		 879 aa  790    Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.928835 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2791  DNA mismatch repair protein MutS  49.83 
 
 		 864 aa  718    Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.494407 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0008  DNA mismatch repair protein MutS  100 
 
 		 904 aa  1795    Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_4031  DNA mismatch repair protein MutS  53.36 
 
 		 881 aa  859    Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.137829  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2655  DNA mismatch repair protein MutS  50.62 
 
 		 876 aa  758    Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.607224  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_3021  DNA mismatch repair protein MutS  53.95 
 
 		 897 aa  867    Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4799  DNA mismatch repair protein MutS  50.67 
 
 		 896 aa  774    Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.720607 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_0047  DNA mismatch repair protein MutS  53.05 
 
 		 908 aa  847    Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.967716  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4649  DNA mismatch repair protein MutS  50.45 
 
 		 916 aa  772    Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.427089 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2761  DNA mismatch repair protein MutS  50.82 
 
 		 904 aa  734    Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.572948  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0824  DNA mismatch repair protein MutS  39.52 
 
 		 804 aa  632  1e-180  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1449  DNA mismatch repair protein MutS  41.46 
 
 		 868 aa  599  1e-170  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  unclonable  0.0000177149  normal  0.302427 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0913  DNA mismatch repair protein MutS  45.53 
 
 		 882 aa  586  1e-166  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1594  DNA mismatch repair protein MutS  38.3 
 
 		 871 aa  573  1.0000000000000001e-162  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  0.0845017  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1496  DNA mismatch repair protein MutS  36.96 
 
 		 869 aa  575  1.0000000000000001e-162  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.241092  hitchhiker  0.0000395311 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_4057  DNA mismatch repair protein MutS  39.37 
 
 		 891 aa  573  1.0000000000000001e-162  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.101447  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1510  DNA mismatch repair protein MutS  37.85 
 
 		 870 aa  559  1e-158  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000101093  n/a   
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0335  DNA mismatch repair protein MutS  38.18 
 
 		 815 aa  562  1e-158  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.213975  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0777  DNA mismatch repair protein MutS  35.88 
 
 		 870 aa  558  1e-157  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.235285  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0919  DNA mismatch repair protein MutS  39.26 
 
 		 863 aa  552  1e-156  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1256  DNA mismatch repair protein MutS  38.16 
 
 		 887 aa  552  1e-156  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.280018  hitchhiker  0.00178613 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1145  DNA mismatch repair protein MutS  38.65 
 
 		 872 aa  555  1e-156  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1822  DNA mismatch repair protein MutS  38.85 
 
 		 871 aa  550  1e-155  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0116284  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2087  DNA mismatch repair protein MutS  38.74 
 
 		 874 aa  551  1e-155  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.104539  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1064  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 		 870 aa  548  1e-154  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1424  DNA mismatch repair protein MutS  39.95 
 
 		 872 aa  546  1e-154  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  decreased coverage  0.000000138373  normal  0.619301 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1282  DNA mismatch repair protein MutS  40.53 
 
 		 862 aa  549  1e-154  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0632  DNA mismatch repair protein MutS  37.56 
 
 		 855 aa  543  1e-153  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.0530533  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1146  DNA mismatch repair protein MutS  39.84 
 
 		 858 aa  545  1e-153  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1485  DNA mismatch repair protein MutS  40.77 
 
 		 878 aa  545  1e-153  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1519  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 855 aa  541  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0576  DNA mismatch repair protein MutS  39.82 
 
 		 854 aa  540  9.999999999999999e-153  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0274453  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1913  DNA mismatch repair protein MutS  39.58 
 
 		 893 aa  539  9.999999999999999e-153  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.396246  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0834  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 884 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.63588 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0978  DNA mismatch repair protein MutS  39.69 
 
 		 884 aa  541  9.999999999999999e-153  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17500  DNA mismatch repair protein MutS  39.18 
 
 		 855 aa  542  9.999999999999999e-153  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2247  DNA mismatch repair protein MutS  41.01 
 
 		 882 aa  538  1e-151  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.136567  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1619  DNA mismatch repair protein MutS  39.91 
 
 		 897 aa  537  1e-151  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.510747 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03081  DNA mismatch repair protein(MutS)  38.45 
 
 		 863 aa  538  1e-151  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2107  DNA mismatch repair protein MutS  43.18 
 
 		 882 aa  536  1e-151  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.0317076 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3422  DNA mismatch repair protein MutS  38.91 
 
 		 880 aa  538  1e-151  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.0998408  normal  0.0667766 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0653  DNA mismatch repair protein MutS  38.53 
 
 		 881 aa  535  1e-150  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2381  DNA mismatch repair protein MutS  37 
 
 		 932 aa  532  1e-150  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3341  DNA mismatch repair protein MutS  37.96 
 
 		 858 aa  534  1e-150  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.285192  unclonable  0.0000000411572 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_38640  DNA mismatch repair protein MutS  40.51 
 
 		 855 aa  534  1e-150  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.477357  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2691  DNA mismatch repair protein MutS  38.94 
 
 		 938 aa  533  1e-150  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0407651  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1698  DNA mismatch repair protein MutS  42.15 
 
 		 882 aa  533  1e-150  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2697  DNA mismatch repair protein MutS  38.73 
 
 		 882 aa  534  1e-150  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.60859  normal  0.57313 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2748  DNA mismatch repair protein MutS  38.87 
 
 		 856 aa  535  1e-150  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0837  DNA mismatch repair protein MutS  36.75 
 
 		 878 aa  535  1e-150  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.624644  normal  1 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0879  DNA mismatch repair protein MutS  36.62 
 
 		 859 aa  530  1e-149  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2495  DNA mismatch repair protein MutS  37.22 
 
 		 869 aa  530  1e-149  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1896  DNA mismatch repair protein MutS  36.78 
 
 		 872 aa  531  1e-149  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0824451  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0986  DNA mismatch repair protein MutS  36.73 
 
 		 871 aa  532  1e-149  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3127  DNA mismatch repair protein MutS  38.33 
 
 		 856 aa  530  1e-149  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.407005  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3270  DNA mismatch repair protein MutS  38.34 
 
 		 856 aa  531  1e-149  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.820026  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1214  DNA mismatch repair protein MutS  38.56 
 
 		 855 aa  530  1e-149  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1134  DNA mismatch repair protein MutS  38.96 
 
 		 860 aa  529  1e-149  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1697  DNA mismatch repair protein MutS  35.73 
 
 		 873 aa  530  1e-149  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.189946  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1317  DNA mismatch repair protein MutS  37.65 
 
 		 873 aa  531  1e-149  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.0784135  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1976  DNA mismatch repair protein MutS  39.35 
 
 		 904 aa  531  1e-149  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.0020973  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2386  DNA mismatch repair protein MutS  37.24 
 
 		 872 aa  531  1e-149  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.143678  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1126  DNA mismatch repair protein MutS  38.13 
 
 		 881 aa  529  1e-149  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0124737  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_1125  DNA mismatch repair protein MutS  38.23 
 
 		 861 aa  531  1e-149  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0005  DNA mismatch repair protein MutS  37.28 
 
 		 856 aa  532  1e-149  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_1124  DNA mismatch repair protein MutS  38.5 
 
 		 861 aa  532  1e-149  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0974  DNA mismatch repair protein  37.11 
 
 		 859 aa  532  1e-149  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1194  DNA mismatch repair protein MutS  38.44 
 
 		 859 aa  531  1e-149  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.272547  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>