262 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_R0048 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_R0048  tRNA-Ile  100 
 
 
77 bp  153  7e-36  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00260543  hitchhiker  0.000838943 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_R0020  tRNA-Ile  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0179841  hitchhiker  0.00030602 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_R0022  tRNA-Ile  98.7 
 
 
77 bp  145  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00016919  normal  0.01136 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_R0058  tRNA-Ile  93.51 
 
 
77 bp  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00305768  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0020  tRNA-Ile  89.47 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_R0038  tRNA-Ile  89.47 
 
 
77 bp  87.7  3e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0062  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_R0007  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000177312  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0081  tRNA-Ile  88.31 
 
 
77 bp  81.8  0.00000000000002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0002  tRNA-Ile  88.89 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_R0015  tRNA-Ile  88.89 
 
 
77 bp  79.8  0.00000000000008  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00038109  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.428746  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP_tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_R0066  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0018  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.891633  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_R0066  tRNA-Ile  87.01 
 
 
77 bp  73.8  0.000000000005  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_R0013  tRNA-Ile  87.14 
 
 
77 bp  67.9  0.0000000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0131677  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_R0001  tRNA-Ile  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_00170  tRNA-Ile  86.49 
 
 
74 bp  67.9  0.0000000003  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_R0008  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.135162  normal  0.696922 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0082  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  65.9  0.000000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0466145  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_R0001  tRNA-Ile  87.3 
 
 
74 bp  61.9  0.00000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_R0026  tRNA-Ile  87.93 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.556154 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0034  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.209453  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_R0001  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0057  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0073  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.596138  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0018  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_R0042  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0019  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.191649  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0062  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_R0029  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0072  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0009  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.11936  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_R0002  tRNA-Ile  85.14 
 
 
74 bp  60  0.00000008  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0699442  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_R0019  tRNA-Ile  97.06 
 
 
77 bp  60  0.00000008  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0795  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.48355e-33 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4561  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000271401  normal  0.0816805 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0008  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0344807  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5640  tRNA-Ala  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5643  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5704  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00205374  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5714  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.287498  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5801  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00827668  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5624  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.037102  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4985  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5288  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.330851  normal 
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.00325098  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.667521  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000227383  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.426749  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000656223  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.42 
 
 
80 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.438933  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0032  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.243312  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  decreased coverage  0.0014391  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.182943  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-4  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0663179  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0036  tRNA-Ile  96.97 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0220813  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0009  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0125  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.865634  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0114  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00549183  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0028  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0230  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00182201  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_R0033  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.000392062  normal  0.115132 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5742  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000134738  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0007  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5312  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.122008  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5016  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0220679  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_R0005  tRNA-Ile  96.97 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0870  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000000703823  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5617  tRNA-Ile  84.42 
 
 
79 bp  58  0.0000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0278362  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_R0002  tRNA-Ile  84.42 
 
 
77 bp  58  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  85.94 
 
 
80 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0703604  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  tRNA-Ile-3  tRNA-Ile  85.94 
 
 
77 bp  56  0.000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00000945265  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_00090  tRNA-Ile  85.94 
 
 
77 bp  56  0.000001  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0069  tRNA-Ile  85.94 
 
 
74 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_R0015  tRNA-Ile  85.94 
 
 
74 bp  56  0.000001  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_R0001  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  0.000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_R0001  tRNA-Ile  84.21 
 
 
77 bp  56  0.000001  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00699866 
 
 
-
 
NC_006368  lppt17  tRNA-Met  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lplt17  tRNA-Met  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_R0001  tRNA-Ile  85.71 
 
 
77 bp  54  0.000005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.826373  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_R0029  tRNA-Ile  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.138289  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_R0029  tRNA-Ile  86.44 
 
 
77 bp  54  0.000005  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.303638  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_R0038  tRNA-Ile  84.62 
 
 
78 bp  52  0.00002  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-1  tRNA-Ile  86.21 
 
 
74 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  tRNA-Ile-2  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.575772  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0008  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000331872  normal  0.303515 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_R0072  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0376486  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0008  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.160787  hitchhiker  0.00984378 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0021  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.0000203116  normal  0.0522769 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_R0072  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00892637  normal  0.130437 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0005  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000734395  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0062  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.00713608  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_R0127  tRNA-Ile  86.21 
 
 
77 bp  52  0.00002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  hitchhiker  0.000330359  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>