148 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3822 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3822  hypothetical protein  100 
 
 
370 aa  766    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0324063 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4237  hypothetical protein  99.46 
 
 
370 aa  759    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.120446  normal 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0765  hypothetical protein  48.24 
 
 
365 aa  360  2e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.63543  normal  0.572705 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3622  SMC domain protein  46.77 
 
 
363 aa  349  4e-95  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3499  SMC domain protein  46.24 
 
 
363 aa  348  6e-95  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0490  hypothetical protein  44.36 
 
 
416 aa  345  8.999999999999999e-94  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4241  hypothetical protein  47.03 
 
 
364 aa  326  3e-88  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.136282  normal  0.228654 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0507  hypothetical protein  46.61 
 
 
373 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4613  SMC domain protein  47.06 
 
 
378 aa  326  4.0000000000000003e-88  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0833889 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2794  SMC domain-containing protein  44.27 
 
 
378 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.00000000199417  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2755  hypothetical protein  43.5 
 
 
370 aa  322  6e-87  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0135345  normal  0.421403 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1775  endonuclease III  44.44 
 
 
357 aa  321  9.999999999999999e-87  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.17856  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2613  SMC domain protein  44.41 
 
 
369 aa  321  9.999999999999999e-87  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0620  SMC domain protein  42.74 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0636  SMC domain protein  42.74 
 
 
367 aa  308  1.0000000000000001e-82  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.696374  normal  0.340192 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3708  ATPase-like protein  42.29 
 
 
364 aa  302  5.000000000000001e-81  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG1025  hypothetical protein  42.78 
 
 
362 aa  299  5e-80  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000305528 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2512  hypothetical protein  42.29 
 
 
378 aa  290  4e-77  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.504364  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1577  hypothetical protein  41.22 
 
 
377 aa  287  2e-76  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00113684  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0421  hypothetical protein  39.42 
 
 
368 aa  280  3e-74  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1080  hypothetical protein  39.36 
 
 
369 aa  272  7e-72  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.629407  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1226  hypothetical protein  42.47 
 
 
384 aa  249  4e-65  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0562  hypothetical protein  42.06 
 
 
370 aa  237  2e-61  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.260913  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2314  hypothetical protein  36.04 
 
 
376 aa  208  1e-52  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.198863 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1460  ABC transport protein, ATP-binding subunit  27.01 
 
 
382 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1486  ATPase-like protein  27.01 
 
 
382 aa  147  3e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.696745 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0278  ABC transport protein, ATP-binding subunit  26.68 
 
 
382 aa  142  9.999999999999999e-33  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0275531 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0103  SMC domain protein  26.51 
 
 
395 aa  109  7.000000000000001e-23  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.000482249  n/a   
 
 
-
 
NC_011092  SeSA_B0013  RecF/RecN/SMC domain protein  27.85 
 
 
362 aa  108  2e-22  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3645  SMC domain protein  24.37 
 
 
386 aa  106  7e-22  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1846  ATPase-like protein  24.16 
 
 
409 aa  100  3e-20  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.207391  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0197  ATPase-like protein  25.86 
 
 
367 aa  92  2e-17  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.875501  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7563  ATPase-like protein  25.3 
 
 
409 aa  91.3  3e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2178  SMC domain-containing protein  26.34 
 
 
398 aa  88.2  2e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0146  ATPase-like  30.19 
 
 
226 aa  87.4  4e-16  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3749  hypothetical protein  28.9 
 
 
394 aa  85.1  0.000000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_3792  hypothetical protein  24.69 
 
 
390 aa  83.6  0.000000000000005  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0843  hypothetical protein  24.56 
 
 
393 aa  83.6  0.000000000000006  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0592  hypothetical protein  26.39 
 
 
361 aa  82.8  0.000000000000008  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0805  hypothetical protein  24.24 
 
 
390 aa  82.8  0.000000000000008  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3510  hypothetical protein  24.43 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.807476 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0588  hypothetical protein  24.61 
 
 
397 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.84533  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4347  hypothetical protein  25.41 
 
 
385 aa  81.3  0.00000000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.0794792  normal  0.0502044 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3134  hypothetical protein  24.24 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2311  SMC domain protein  24.36 
 
 
397 aa  82  0.00000000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0740  hypothetical protein  24.43 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3578  hypothetical protein  24.82 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.916758  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3701  hypothetical protein  24.82 
 
 
390 aa  81.6  0.00000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.576161 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0833  hypothetical protein  24.24 
 
 
390 aa  81.3  0.00000000000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4312  hypothetical protein  26.12 
 
 
388 aa  79.3  0.0000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1171  ATPase, RecF-like protein  24.82 
 
 
390 aa  78.6  0.0000000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4170  hypothetical protein  24.38 
 
 
399 aa  78.6  0.0000000000002  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5825  SMC domain protein  23.75 
 
 
369 aa  78.6  0.0000000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.408353 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1098  hypothetical protein  27.33 
 
 
410 aa  78.6  0.0000000000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1947  ATPase, RecF-like protein  23.74 
 
 
388 aa  78.2  0.0000000000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.942384  normal  0.334746 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2161  hypothetical protein  23.14 
 
 
392 aa  75.9  0.000000000001  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.587323  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2035  hypothetical protein  23.94 
 
 
388 aa  75.5  0.000000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.224754  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2968  SMC domain protein  22.08 
 
 
393 aa  73.9  0.000000000004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0820  hypothetical protein  23.53 
 
 
395 aa  73.6  0.000000000006  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0343  hypothetical protein  28.09 
 
 
385 aa  73.2  0.000000000006  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.261126 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5526  hypothetical protein  25.49 
 
 
384 aa  73.2  0.000000000007  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.768664  normal  0.0253524 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0053  SMC domain protein  23.02 
 
 
397 aa  72.8  0.000000000009  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08280  predicted ATPase  27.82 
 
 
392 aa  72.4  0.00000000001  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0509 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0849  hypothetical protein  21.73 
 
 
410 aa  71.6  0.00000000002  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1811  hypothetical protein  23.96 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.93186  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1858  hypothetical protein  23.96 
 
 
390 aa  70.9  0.00000000004  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal  0.111795 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3220  SMC domain-containing protein  23.13 
 
 
394 aa  70.1  0.00000000005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2181  SMC domain-containing protein  23.99 
 
 
380 aa  70.1  0.00000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0007  ATPase  24.59 
 
 
411 aa  69.7  0.00000000007  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02963  hypothetical protein  23.14 
 
 
376 aa  70.1  0.00000000007  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03536  hypothetical protein  22.14 
 
 
398 aa  69.7  0.00000000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3073  ATPase  24.5 
 
 
388 aa  68.6  0.0000000002  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0204  hypothetical protein  21.75 
 
 
394 aa  68.2  0.0000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0310  SMC domain protein  27.27 
 
 
412 aa  67.8  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1966  hypothetical protein  24.51 
 
 
424 aa  66.6  0.0000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2274  hypothetical protein  23.96 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.618217  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1387  ATPase-like protein  23.65 
 
 
392 aa  66.6  0.0000000007  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.365214  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3070  SMC domain-containing protein  23.81 
 
 
365 aa  65.9  0.000000001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.270072 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2434  hypothetical protein  23.68 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.329765  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2313  hypothetical protein  23.68 
 
 
392 aa  64.7  0.000000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.969478  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1418  hypothetical protein  23.96 
 
 
436 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.936146  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1909  hypothetical protein  23.96 
 
 
436 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A3395  hypothetical protein  23.96 
 
 
436 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1182  hypothetical protein  23.96 
 
 
436 aa  63.9  0.000000004  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0307  SMC domain protein  26.32 
 
 
448 aa  63.9  0.000000004  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.675796  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1754  hypothetical protein  22.87 
 
 
405 aa  63.2  0.000000007  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5187  ATPase-like  22.94 
 
 
391 aa  62  0.00000001  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal  0.633614 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2931  hypothetical protein  26.89 
 
 
382 aa  62.4  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3562  ATPase-like  29.31 
 
 
394 aa  61.6  0.00000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.76495  normal  0.327688 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0229  hypothetical protein  28.49 
 
 
386 aa  60.8  0.00000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.745812  normal 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6192  ATPase-like  22.76 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1887  ATPase-like protein  22.76 
 
 
391 aa  60.8  0.00000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1691  SMC domain protein  38 
 
 
385 aa  60.5  0.00000004  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.253328  hitchhiker  0.000000699352 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3397  hypothetical protein  21.73 
 
 
395 aa  59.7  0.00000007  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.213945  normal  0.39672 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1792  hypothetical protein  23.68 
 
 
390 aa  59.7  0.00000008  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.118132  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1709  SMC domain protein  23.24 
 
 
584 aa  59.7  0.00000009  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  decreased coverage  0.000133048  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1302  ATPase-like  23.93 
 
 
419 aa  59.3  0.0000001  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  hitchhiker  0.000145655  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1320  SMC domain protein  22.83 
 
 
422 aa  58.9  0.0000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1910  ATPase-like protein  22.51 
 
 
391 aa  59.3  0.0000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00358131 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3924  ATPase-like protein  28.43 
 
 
336 aa  58.9  0.0000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.801052  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>