More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3779 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3779  cyclic nucleotide-binding protein  100 
 
 
453 aa  906    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0440455  normal  0.0476196 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0174  cyclic nucleotide-binding protein  50.22 
 
 
456 aa  422  1e-117  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000271627  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1786  cyclic nucleotide-binding protein  51.45 
 
 
462 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00355982 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2065  cyclic nucleotide-binding protein  49.89 
 
 
462 aa  412  1e-114  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1259  alpha/beta hydrolase fold  54.87 
 
 
284 aa  327  3e-88  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_22090  predicted hydrolase or acyltransferase of alpha/beta superfamily  29.85 
 
 
285 aa  104  4e-21  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00622193 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2481  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
275 aa  102  2e-20  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1553  alpha/beta hydrolase fold protein  29.23 
 
 
286 aa  101  2e-20  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000230075  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0725  alpha/beta hydrolase fold protein  30.4 
 
 
286 aa  100  7e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2696  alpha/beta hydrolase fold  29.86 
 
 
312 aa  99.4  1e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.623815  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5377  alpha/beta hydrolase fold protein  30.82 
 
 
332 aa  98.6  2e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.306055  normal  0.839367 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3756  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
504 aa  98.6  2e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.740741  normal  0.0321393 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0350  alpha/beta hydrolase fold protein  30.11 
 
 
308 aa  95.9  1e-18  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.931364 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1992  alpha/beta hydrolase fold  27.82 
 
 
314 aa  93.6  7e-18  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0487  alpha/beta hydrolase fold  23.6 
 
 
240 aa  92.4  2e-17  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1095  alpha/beta hydrolase fold  29.71 
 
 
302 aa  92.4  2e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0511  alpha/beta hydrolase fold protein  30.17 
 
 
265 aa  89.7  9e-17  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3023  alpha/beta hydrolase fold  27.84 
 
 
294 aa  88.6  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000299925 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0403  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
291 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0412  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
291 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0866892  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3361  alpha/beta hydrolase fold  28.41 
 
 
340 aa  87.8  4e-16  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.013073  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0391  alpha/beta hydrolase fold  26.24 
 
 
291 aa  87.8  4e-16  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.115733 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5043  alpha/beta fold family hydrolase  28.63 
 
 
279 aa  87  5e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0119  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.01 
 
 
380 aa  87  7e-16  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.156608 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1637  alpha/beta hydrolase fold  30.04 
 
 
287 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2528  alpha/beta hydrolase fold  28.62 
 
 
301 aa  86.7  7e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3014  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
340 aa  86.7  8e-16  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1310  alpha/beta hydrolase fold protein  29.35 
 
 
301 aa  86.7  9e-16  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0952  alpha/beta hydrolase fold  28.57 
 
 
350 aa  85.5  0.000000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.167574  normal  0.194203 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1258  putative hydrolase  27.8 
 
 
312 aa  85.5  0.000000000000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0056  alpha/beta hydrolase fold  28.78 
 
 
332 aa  85.9  0.000000000000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5048  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 
279 aa  85.1  0.000000000000002  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1253  alpha/beta hydrolase fold  27.34 
 
 
298 aa  85.1  0.000000000000002  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.188153  normal  0.590935 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0087  alpha/beta hydrolase fold protein  27.9 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4774  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4636  alpha/beta hydrolase fold protein  28.24 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1905  alpha/beta hydrolase fold  27.8 
 
 
354 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0685  Alpha/beta hydrolase fold  20.71 
 
 
287 aa  84.7  0.000000000000003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.339922  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5136  alpha/beta fold family hydrolase  28.24 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5015  hydrolase, alpha/beta fold family  28.24 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8725  alpha/beta hydrolase fold protein  28.52 
 
 
332 aa  84.7  0.000000000000003  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0074  alpha/beta hydrolase fold  28.42 
 
 
275 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.224768  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4726  alpha/beta hydrolase fold  27.62 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3515  alpha/beta hydrolase fold  26.74 
 
 
279 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3071  alpha/beta hydrolase fold  25.93 
 
 
290 aa  84  0.000000000000005  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.357729  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0316  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
316 aa  84  0.000000000000005  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.00247828  hitchhiker  0.00660595 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2918  alpha/beta hydrolase fold  27.44 
 
 
312 aa  84  0.000000000000005  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.906544 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0392  alpha/beta hydrolase fold  24.21 
 
 
273 aa  84  0.000000000000006  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5036  hydrolase, alpha/beta fold family  27.3 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4614  alpha/beta hydrolase fold protein  27.86 
 
 
279 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4082  alpha/beta hydrolase fold  23.86 
 
 
284 aa  83.2  0.000000000000008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.29051 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5150  alpha/beta hydrolase fold  27.65 
 
 
324 aa  83.2  0.000000000000009  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0685525  normal  0.697415 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0102  alpha/beta hydrolase fold  28.31 
 
 
332 aa  83.2  0.000000000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3143  alpha/beta hydrolase fold  29.32 
 
 
309 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.03403  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2885  alpha/beta hydrolase fold protein  26.97 
 
 
275 aa  82.8  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00297178 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0878  alpha/beta hydrolase fold  27.4 
 
 
317 aa  83.2  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0136792  hitchhiker  0.00000592996 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0198  hydrolase, alpha/beta fold family  28.57 
 
 
279 aa  83.2  0.00000000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0274  Alpha/beta hydrolase fold  26.06 
 
 
289 aa  82.8  0.00000000000001  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.642233  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4590  alpha/beta hydrolase fold protein  29.89 
 
 
327 aa  83.2  0.00000000000001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.775489  normal  0.0737458 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0033  alpha/beta hydrolase fold  30.82 
 
 
290 aa  82.8  0.00000000000001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2565  alpha/beta hydrolase fold protein  27.56 
 
 
287 aa  82.8  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.0288912  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2542  alpha/beta hydrolase fold protein  29.06 
 
 
310 aa  83.2  0.00000000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.106613  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1353  alpha/beta hydrolase fold  25.7 
 
 
339 aa  82.8  0.00000000000001  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.687878  normal  0.202512 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0806  alpha/beta hydrolase fold  26.79 
 
 
279 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0845651 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4681  alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
321 aa  82.8  0.00000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.490512  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3664  alpha/beta hydrolase fold protein  24.44 
 
 
350 aa  83.2  0.00000000000001  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2367  alpha/beta hydrolase fold  27.66 
 
 
291 aa  82.8  0.00000000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.926143  normal 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04531  alpha/beta hydrolase, putative (AFU_orthologue; AFUA_2G02920)  26.43 
 
 
510 aa  82  0.00000000000002  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  decreased coverage  0.00644571 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4692  hydrolase  26.39 
 
 
313 aa  82  0.00000000000002  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.236013  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2404  alpha/beta hydrolase fold  29.01 
 
 
277 aa  82.4  0.00000000000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3543  alpha/beta hydrolase fold  25.53 
 
 
268 aa  82.4  0.00000000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.447096  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4681  alpha/beta hydrolase fold protein  25.75 
 
 
333 aa  81.3  0.00000000000003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8642  hydrolase or acyltransferase (alpha/beta hydrolase superfamily)-like protein  30.24 
 
 
321 aa  81.6  0.00000000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_53540  hydrolase  27.14 
 
 
313 aa  81.3  0.00000000000003  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.187191  decreased coverage  0.0000594216 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0608  alpha/beta hydrolase fold  23.37 
 
 
311 aa  81.6  0.00000000000003  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000717376  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1080  alpha/beta hydrolase fold  27.05 
 
 
296 aa  81.3  0.00000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0672  alpha/beta hydrolase fold  26.09 
 
 
315 aa  80.9  0.00000000000004  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.240082 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13602  2-hydroxy-6-oxo-6-phenylhexa-2,4-dienoate hydrolase bphD  29.47 
 
 
291 aa  81.3  0.00000000000004  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal  0.552922 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1491  alpha/beta hydrolase fold  28.27 
 
 
297 aa  80.9  0.00000000000005  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.00412587  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0598  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  28.02 
 
 
368 aa  80.5  0.00000000000005  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.0447613 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0993  alpha/beta hydrolase fold  25.19 
 
 
345 aa  80.5  0.00000000000005  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.87511  unclonable  0.000000000579867 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0726  Alpha/beta hydrolase fold  27.17 
 
 
297 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.418477  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0769  hydrolase, alpha/beta fold family  24.81 
 
 
294 aa  80.5  0.00000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000000479635  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3847  Alpha/beta hydrolase fold-1  30.04 
 
 
263 aa  80.5  0.00000000000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4279  alpha/beta hydrolase fold  25.17 
 
 
290 aa  80.5  0.00000000000006  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0429244  normal  0.222336 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3776  alpha/beta hydrolase fold  27.59 
 
 
361 aa  80.1  0.00000000000007  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.904669  decreased coverage  0.00241214 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3668  alpha/beta hydrolase fold protein  26.79 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.217537 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0931  alpha/beta hydrolase fold family lipase  24.44 
 
 
291 aa  80.1  0.00000000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.0000302651  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4421  alpha/beta hydrolase fold protein  24.3 
 
 
299 aa  80.1  0.00000000000008  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1824  alpha/beta hydrolase fold protein  24.71 
 
 
309 aa  79.7  0.00000000000009  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3655  alpha/beta hydrolase fold  26.69 
 
 
312 aa  79.7  0.0000000000001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1587  alpha/beta hydrolase fold protein  25.81 
 
 
301 aa  79.7  0.0000000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1248  alpha/beta hydrolase fold-containing protein  25 
 
 
311 aa  79.3  0.0000000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0592  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.63 
 
 
368 aa  79.3  0.0000000000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3745  cyclic nucleotide-binding protein  33.95 
 
 
167 aa  79  0.0000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0517034  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_0553  branched-chain alpha-keto acid dehydrogenase subunit E2  27.84 
 
 
368 aa  79  0.0000000000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011892  Mnod_8523  alpha/beta hydrolase fold protein  26.39 
 
 
323 aa  78.6  0.0000000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1295  3-oxoadipate enol-lactonase  28.21 
 
 
265 aa  78.6  0.0000000000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.523958  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1955  Alpha/beta hydrolase fold  27.27 
 
 
339 aa  78.6  0.0000000000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0521356  normal  0.151931 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2754  alpha/beta hydrolase fold protein  27.34 
 
 
284 aa  79  0.0000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>