173 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3750 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3750  LrgA family protein  100 
 
 
113 aa  211  1.9999999999999998e-54  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3105  LrgA  53.64 
 
 
119 aa  108  2.0000000000000002e-23  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0425  LrgA family protein  50.89 
 
 
116 aa  103  7e-22  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.0197927 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1205  LrgA  52.68 
 
 
122 aa  99.8  1e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00283313  normal  0.0677491 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3767  LrgA family protein  51.96 
 
 
124 aa  98.6  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.58563  normal  0.0600127 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0129  LrgA family protein  50.45 
 
 
121 aa  97.4  5e-20  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1269  LrgA family protein  49.11 
 
 
121 aa  95.1  3e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1939  LrgA  45.19 
 
 
122 aa  94  6e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2557  LrgA family protein  48.18 
 
 
117 aa  93.2  1e-18  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0686612  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2930  LrgA  46.85 
 
 
128 aa  88.2  3e-17  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0432  LrgA  50 
 
 
123 aa  87  8e-17  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0332666  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1854  LrgA family protein  45.45 
 
 
123 aa  86.3  1e-16  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.310348  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3282  LrgA family protein  50 
 
 
124 aa  82.4  0.000000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.623303  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2794  LrgA  42.34 
 
 
130 aa  81.6  0.000000000000003  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1793  LrgA  47 
 
 
127 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3645  LrgA family protein  45.31 
 
 
128 aa  78.6  0.00000000000003  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.820486  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3938  LrgA family protein  45.31 
 
 
128 aa  77.8  0.00000000000004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2255  putative transmembrane protein  47.27 
 
 
117 aa  78.2  0.00000000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.837001  normal  0.471476 
 
 
-
 
NC_003295  RSc2669  hypothetical protein  43.75 
 
 
125 aa  77  0.00000000000007  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.293278  normal  0.241183 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2298  LrgA family protein  40.74 
 
 
133 aa  74.7  0.0000000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3065  LrgA family protein  46.3 
 
 
126 aa  75.1  0.0000000000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.348494  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1160  LrgA family protein  40.18 
 
 
116 aa  72.8  0.000000000001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3389  LrgA family protein  47 
 
 
134 aa  73.6  0.000000000001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.209606  normal  0.0893866 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0887  LrgA family protein  46.39 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000005  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0665  LrgA family protein  49.06 
 
 
123 aa  70.9  0.000000000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.810198  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2682  putative murein hydrolase exporter LrgA(holin) like  41.44 
 
 
119 aa  69.3  0.00000000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1570  hypothetical protein  36.7 
 
 
135 aa  68.2  0.00000000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3004  LrgA family protein  44.55 
 
 
130 aa  67  0.00000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.149466 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3577  putative integral membrane protein  43.1 
 
 
125 aa  67  0.00000000008  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_2905  LrgA family protein  39.29 
 
 
125 aa  67  0.00000000009  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_0292  LrgA family protein  45.71 
 
 
127 aa  67  0.00000000009  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2235  lrgA family protein  39 
 
 
125 aa  66.6  0.0000000001  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.601171  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1947  lrgA family protein  37.61 
 
 
125 aa  66.2  0.0000000001  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2499  LrgA family protein  39.29 
 
 
129 aa  66.6  0.0000000001  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.694502 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1498  hypothetical protein  35.24 
 
 
135 aa  65.5  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0714  LrgA family protein  33.04 
 
 
118 aa  65.9  0.0000000002  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00234079  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0493  LrgA  42.61 
 
 
132 aa  65.5  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3929  LrgA family protein  44.76 
 
 
128 aa  65.5  0.0000000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.319977 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2967  hypothetical protein  35.24 
 
 
135 aa  64.7  0.0000000004  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.577764  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2426  LrgA  42.34 
 
 
138 aa  63.9  0.0000000007  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5838  LrgA family protein  42.86 
 
 
123 aa  63.2  0.000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.809167 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2559  hypothetical protein  32.38 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.22344  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_2460  hypothetical protein  32.38 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1358  LrgA family protein  31.07 
 
 
115 aa  62.8  0.000000002  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000000290916  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3025  hypothetical protein  32.38 
 
 
135 aa  62.8  0.000000002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.318626  normal  0.0401094 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0158  LrgA family protein  32.43 
 
 
117 aa  61.6  0.000000003  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0332  LrgA  44.55 
 
 
127 aa  61.2  0.000000004  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2447  hypothetical protein  35.24 
 
 
138 aa  61.6  0.000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3355  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.8  0.000000006  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.455604  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2542  hypothetical protein  33.94 
 
 
136 aa  60.5  0.000000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3686  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.5  0.000000008  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  0.709581 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_3703  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3777  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3424  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.0738558  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3375  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.272811  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1537  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.1  0.000000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.0242133 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3710  holin-like protein  36.73 
 
 
121 aa  60.5  0.000000009  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.343441  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3458  holin-like protein  35.71 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.771163  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3730  holin-like protein  35.71 
 
 
121 aa  59.7  0.00000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.753868  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2321  holin-like protein  34.69 
 
 
121 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000645302  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0411  LrgA family protein  37 
 
 
125 aa  58.9  0.00000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.305812  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1414  LrgA family protein  31.63 
 
 
116 aa  58.9  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.375061  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0545  LrgA family protein  48.31 
 
 
127 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3994  LrgA family protein  42.86 
 
 
119 aa  58.5  0.00000003  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.626323  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0155  putative LrgA family protein  47.57 
 
 
118 aa  57.4  0.00000006  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6074  LrgA family protein  42.86 
 
 
123 aa  57.4  0.00000007  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7209  hypothetical protein  39.58 
 
 
139 aa  57  0.00000008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.621509  normal 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0812  putative effector of murein hydrolase LrgA  32.69 
 
 
134 aa  56.2  0.0000001  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.0000547644  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3766  holin-like protein  32.67 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000368627 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3599  holin-like protein  32.67 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.348579  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_3885  holin-like protein  32.67 
 
 
118 aa  55.8  0.0000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2404  LrgA family protein  46.27 
 
 
124 aa  55.5  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1953  LrgA family protein  41.18 
 
 
151 aa  55.8  0.0000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.849532  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2976  LrgA family protein  44.93 
 
 
124 aa  55.1  0.0000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.952939  normal 
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6060  LrgA family protein  41.96 
 
 
123 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.491092  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3200  hypothetical protein  32.41 
 
 
153 aa  54.7  0.0000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.370954  normal  0.0153861 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1325  LrgA family protein  48.96 
 
 
121 aa  55.1  0.0000004  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0624  LrgA  49.09 
 
 
128 aa  54.7  0.0000004  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.938941  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1066  LrgA family protein  31.43 
 
 
136 aa  54.3  0.0000005  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1443  holin-like protein  32.67 
 
 
118 aa  53.5  0.0000009  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.58028  hitchhiker  0.00000036945 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3333  hypothetical protein  45.33 
 
 
117 aa  53.1  0.000001  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0605  LrgA  47.62 
 
 
118 aa  53.5  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1237  LrgA family protein  34.26 
 
 
138 aa  53.1  0.000001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.783024  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3525  holin-like protein  31.68 
 
 
118 aa  52.4  0.000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1147  hypothetical protein  33.33 
 
 
130 aa  52  0.000003  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  hitchhiker  0.000363842  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0090  LrgA family protein  44.44 
 
 
138 aa  52  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5344  LrgA family protein  42.86 
 
 
123 aa  52  0.000003  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.631803 
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_4059  LrgA family protein  44 
 
 
117 aa  52  0.000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1099  hypothetical protein  47.37 
 
 
132 aa  52  0.000003  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.158876 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3734  LrgA family protein  49.55 
 
 
169 aa  51.6  0.000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.249575  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3273  hypothetical protein  34.62 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.502581 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0100  LrgA family protein  44.44 
 
 
138 aa  51.2  0.000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1009  LrgA family protein  36.63 
 
 
118 aa  51.6  0.000004  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2436  hypothetical protein  34.62 
 
 
132 aa  51.2  0.000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1517  LrgA family protein  33.65 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5769  LrgA  42.72 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1507  hypothetical protein  33.65 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6134  LrgA family protein  42.72 
 
 
123 aa  51.2  0.000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.713199  normal  0.599959 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2275  hypothetical protein  33.65 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02029  hypothetical protein  33.65 
 
 
132 aa  50.8  0.000005  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>