More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3557 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3557  TrkA-N domain protein  100 
 
 
223 aa  455  1e-127  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.647516  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2087  TrkA domain-containing protein  58.37 
 
 
222 aa  256  2e-67  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.798772 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1781  TrkA domain-containing protein  57.01 
 
 
222 aa  251  6e-66  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.08127  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0430  TrkA-N domain protein  42.38 
 
 
217 aa  190  1e-47  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.00150602  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1380  TrkA domain-containing protein  39.52 
 
 
215 aa  172  5e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  2.26197e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0012  TrkA-N domain protein  41.67 
 
 
216 aa  171  6e-42  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11690  TrkA-N domain protein  39.52 
 
 
215 aa  169  2e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00343321  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2142  putative potassium uptake protein  36.89 
 
 
221 aa  169  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.897368  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1854  potassium uptake protein  36.89 
 
 
221 aa  169  3e-41  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0461191  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1754  hypothetical protein  39.52 
 
 
227 aa  168  8e-41  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0169137  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1826  TrkA-N domain protein  40.09 
 
 
220 aa  167  9e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1617  TrkA domain-containing protein  39.05 
 
 
217 aa  165  5e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  1.38787e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0064  K+ transport systems, NAD-binding component  37.61 
 
 
221 aa  164  1e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_1584  TrkA-N  41.06 
 
 
219 aa  163  2e-39  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.514465  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1081  hypothetical protein  39.72 
 
 
233 aa  163  2e-39  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00425328 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0104  TrkA-N domain protein  35.43 
 
 
220 aa  162  4e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  2.00527e-08  hitchhiker  1.67844e-14 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0674  potassium uptake protein TrkA  38.57 
 
 
219 aa  162  4e-39  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3465  TrkA-N domain-containing protein  41.9 
 
 
231 aa  162  5e-39  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4091  TrkA-N domain protein  40.47 
 
 
229 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0232188  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4052  TrkA-N domain protein  40.47 
 
 
229 aa  160  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3209  TrkA-N domain protein  41.74 
 
 
231 aa  160  2e-38  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.580767  normal  0.652247 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0523  TrkA-N domain protein  40.67 
 
 
223 aa  159  3e-38  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0267  TrkA-N domain protein  37.62 
 
 
233 aa  159  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0952  TrkA-N domain protein  39.41 
 
 
217 aa  158  5e-38  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1148  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
220 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.967319  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1170  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
220 aa  158  5e-38  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.241712  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2680  TrkA domain-containing protein  37.62 
 
 
221 aa  157  1e-37  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  decreased coverage  3.38081e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4081  potassium uptake protein, TrkA family  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4098  potassium uptake protein, TrkA family  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00103413  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1159  potassium uptake protein, TrkA family  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.10257  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3993  potassium uptake protein, TrkA family  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3736  Trk family potassium uptake protein  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3888  TrkA family potassium uptake protein  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.475517  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4191  TrkA family potassium uptake protein  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.841712  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3720  Trk family potassium uptake protein  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.430715  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4027  TrkA family potassium uptake protein  37.14 
 
 
221 aa  156  2e-37  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.426006  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3805  TrkA domain-containing protein  37.14 
 
 
221 aa  156  3e-37  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0251033  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4804  TrkA-N  41.31 
 
 
231 aa  156  3e-37  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_4247  TrkA-N domain protein  39.38 
 
 
225 aa  154  7e-37  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.61262 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3882  TrkA-N  37.04 
 
 
232 aa  154  8e-37  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.94887  decreased coverage  0.00720211 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1711  TrkA-N domain protein  40.95 
 
 
220 aa  154  1e-36  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.382687  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2828  TrkA-N domain protein  39.07 
 
 
250 aa  153  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0119084 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0416  TrkA domain-containing protein  35.91 
 
 
217 aa  151  8e-36  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  1.30553e-07  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0141  TrkA domain-containing protein  35.55 
 
 
217 aa  150  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00479404  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0249  TrkA-N domain protein  33.81 
 
 
219 aa  148  5e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  decreased coverage  0.00172297  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0398  TrkA-N  38.74 
 
 
224 aa  147  1e-34  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.81484  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_36690  K+ transport system, NAD-binding component  38.1 
 
 
224 aa  146  3e-34  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.164115  normal  0.724398 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2303  putative cation transporter  38.57 
 
 
222 aa  145  5e-34  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4249  TrkA-N domain protein  35.89 
 
 
213 aa  144  9e-34  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6144  TrkA-N  39.52 
 
 
220 aa  143  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.674267  normal  0.153677 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1557  TrkA domain-containing protein  34.67 
 
 
222 aa  142  3e-33  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  0.176981  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1513  TrkA-N domain-containing protein  38.68 
 
 
224 aa  142  4e-33  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.621068 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1392  TrkA-N domain protein  35 
 
 
227 aa  142  5e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.643107  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7573  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
224 aa  140  1e-32  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.879249  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001288  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  37.86 
 
 
217 aa  140  2e-32  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.91889  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2841  TrkA-N domain protein  36.65 
 
 
222 aa  140  2e-32  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.208198  normal  0.066626 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3347  TrkA domain-containing protein  39.2 
 
 
228 aa  139  4e-32  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_18040  K+ transport system, NAD-binding component  36.32 
 
 
225 aa  138  6e-32  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_4480  TrkA domain-containing protein  36.23 
 
 
217 aa  138  8e-32  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  hitchhiker  1.27966e-09 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3145  TrkA-N domain protein  38.69 
 
 
228 aa  137  1e-31  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.436065 
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1043  hypothetical protein  37.09 
 
 
221 aa  136  2e-31  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4281  potassium uptake protein KtrA, putative  44.81 
 
 
214 aa  136  2e-31  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1585  TrkA-N domain protein  32.7 
 
 
216 aa  135  6e-31  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.453253  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0122  TrkA-N domain protein  31.16 
 
 
217 aa  134  2e-30  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.00122863  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0339  TrkA-N domain protein  32.56 
 
 
218 aa  132  6e-30  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.00738023  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2747  TrkA-N domain protein  37.61 
 
 
235 aa  131  6e-30  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0359063  hitchhiker  7.19315e-05 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3574  TrkA domain-containing protein  35.85 
 
 
230 aa  130  1e-29  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.458769 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0372  TrkA domain-containing protein  35.75 
 
 
222 aa  130  2e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.849541  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0428  TrkA-N domain protein  38.46 
 
 
225 aa  130  2e-29  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1273  TrkA-N  37.25 
 
 
224 aa  129  4e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.600058  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01407  hypothetical protein  32.24 
 
 
220 aa  127  1e-28  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0566  potassium uptake protein TrkA, putative  34.47 
 
 
218 aa  127  2e-28  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3270  TrkA-N domain protein  35.1 
 
 
230 aa  127  2e-28  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.588488  normal  0.0361185 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1353  TrkA-N domain protein  34.31 
 
 
217 aa  127  2e-28  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2314  VIC family potassium channel protein  34.58 
 
 
234 aa  126  3e-28  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.537657  normal  0.229836 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0627  TrkA-N domain protein  35.68 
 
 
224 aa  126  3e-28  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0047  TrkA domain-containing protein  39.13 
 
 
232 aa  125  5e-28  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_01511  VIC family potassium channel protein  34.29 
 
 
234 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1449  putative potassium channel, VIC family  34.29 
 
 
234 aa  125  6e-28  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.286988  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1833  TrkA-N domain protein  32.74 
 
 
244 aa  125  7e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.946247 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_0214  TrkA-N  33.95 
 
 
224 aa  125  7e-28  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_00951  VIC family potassium channel protein  33.33 
 
 
234 aa  124  8e-28  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.304573  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0139  TrkA-N domain protein  32.09 
 
 
218 aa  124  8e-28  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0058  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 
232 aa  124  1e-27  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  1.70567e-07 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0050  TrkA domain-containing protein  33.03 
 
 
232 aa  124  1e-27  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00293665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0085  K+ transport systems, NAD-binding component  30.66 
 
 
218 aa  124  1e-27  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  2.73294e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0505  TrkA-N domain protein  37.02 
 
 
254 aa  124  1e-27  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.0590826 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_14840  K+ transport system, NAD-binding component  34.72 
 
 
229 aa  124  2e-27  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.289305  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004055  potassium uptake protein integral membrane component KtrA  31.31 
 
 
220 aa  123  2e-27  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.248543  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0054  TrkA-N domain protein  40.91 
 
 
232 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_00971  VIC family potassium channel protein  34.27 
 
 
234 aa  124  2e-27  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0321337  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1928  TrkA domain-containing protein  29.36 
 
 
223 aa  123  2e-27  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_4304  TrkA domain-containing protein  40.91 
 
 
232 aa  123  2e-27  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.333456  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_00981  VIC family potassium channel protein  32.58 
 
 
234 aa  123  2e-27  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0458  potassium uptake protein KtrA  31.92 
 
 
220 aa  123  2e-27  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0052  TrkA domain-containing protein  33.48 
 
 
232 aa  123  2e-27  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  hitchhiker  1.56349e-06 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1463  TrkA-N domain protein  31.31 
 
 
220 aa  123  3e-27  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  hitchhiker  0.00504118  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0443  TrkA domain-containing protein  33.94 
 
 
222 aa  123  3e-27  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000103493 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1834  TrkA-N  30.8 
 
 
233 aa  122  3e-27  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.423842  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2069  TrkA-N domain protein  33.48 
 
 
228 aa  122  6e-27  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>