More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3368 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3368  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  100 
 
 
457 aa  940    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.852365  hitchhiker  0.00221589 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0855  coproporphyrinogen III oxidase  47.54 
 
 
461 aa  402  1e-111  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2771  coproporphyrinogen III oxidase  44.54 
 
 
487 aa  400  9.999999999999999e-111  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0315162 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3122  coproporphyrinogen III oxidase  47.1 
 
 
461 aa  398  1e-109  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3323  coproporphyrinogen III oxidase  45.29 
 
 
489 aa  397  1e-109  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2783  coproporphyrinogen III oxidase  44.64 
 
 
460 aa  398  1e-109  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.682554  normal  0.601804 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1217  coproporphyrinogen III oxidase  44.59 
 
 
458 aa  395  1e-109  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0602  coproporphyrinogen III oxidase  46.99 
 
 
470 aa  396  1e-109  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1092  coproporphyrinogen III oxidase  44.4 
 
 
460 aa  394  1e-108  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1464  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.11 
 
 
462 aa  392  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.000299867  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1089  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 
458 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1008  coproporphyrinogen III oxidase  44.4 
 
 
460 aa  394  1e-108  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3774  coproporphyrinogen III oxidase  44.91 
 
 
468 aa  394  1e-108  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.46395  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1148  coproporphyrinogen III oxidase  44.37 
 
 
458 aa  393  1e-108  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1162  coproporphyrinogen III oxidase  44.4 
 
 
460 aa  390  1e-107  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1938  coproporphyrinogen III oxidase  43.76 
 
 
465 aa  391  1e-107  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.1825  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1208  coproporphyrinogen III oxidase  45.35 
 
 
462 aa  391  1e-107  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.710207  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0791  coproporphyrinogen III oxidase  45.98 
 
 
463 aa  390  1e-107  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.680878  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3122  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 
464 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4018  coproporphyrinogen III oxidase  45.09 
 
 
463 aa  385  1e-106  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.809241  normal  0.669249 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1509  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 
464 aa  388  1e-106  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0230115  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3096  coproporphyrinogen III oxidase  45.33 
 
 
464 aa  385  1e-106  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4779  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.42 
 
 
465 aa  386  1e-106  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.0897448 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1531  coproporphyrinogen III oxidase  44.57 
 
 
460 aa  387  1e-106  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.304653  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1362  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  45.65 
 
 
458 aa  387  1e-106  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.82538  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0115  coproporphyrinogen III oxidase  44.44 
 
 
465 aa  384  1e-105  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2477  coproporphyrinogen III oxidase  45.52 
 
 
482 aa  384  1e-105  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.99297  normal 
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2571  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 
464 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA2171  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 
464 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.467483  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0802  coproporphyrinogen III oxidase  45.09 
 
 
463 aa  384  1e-105  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.519619  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0435  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 
463 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3061  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 
464 aa  383  1e-105  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_2042  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 
464 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.241644  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A0738  coproporphyrinogen III oxidase  44.87 
 
 
464 aa  382  1e-105  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.507081  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0914  coproporphyrinogen III oxidase  45.11 
 
 
463 aa  382  1e-105  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.652481  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0884  coproporphyrinogen III oxidase  44.89 
 
 
463 aa  380  1e-104  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.599698 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4393  coproporphyrinogen III oxidase  42.47 
 
 
472 aa  381  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000149984 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0099  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.32 
 
 
465 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.98373 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0102  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  41.32 
 
 
465 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1813  coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 
460 aa  373  1e-102  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4099  coproporphyrinogen III oxidase  42.45 
 
 
457 aa  372  1e-102  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.740793  normal  0.772417 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00581  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 
463 aa  375  1e-102  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3474  coproporphyrinogen III oxidase  44.39 
 
 
500 aa  372  1e-102  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001911  coproporphyrinogen III oxidase oxygen-independent  41.69 
 
 
463 aa  374  1e-102  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19920  coproporphyrinogen III oxidase  43.22 
 
 
458 aa  374  1e-102  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2603  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.83 
 
 
469 aa  371  1e-101  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc3284  coproporphyrinogen III oxidase  44.14 
 
 
510 aa  370  1e-101  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2394  coproporphyrinogen III oxidase  44.07 
 
 
483 aa  371  1e-101  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA0618  coproporphyrinogen III oxidase  43.85 
 
 
481 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2818  coproporphyrinogen III oxidase  43.85 
 
 
481 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2754  coproporphyrinogen III oxidase  43.85 
 
 
483 aa  369  1e-101  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.36773  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0501  coproporphyrinogen III oxidase  41.5 
 
 
460 aa  371  1e-101  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2893  coproporphyrinogen III oxidase  43.85 
 
 
483 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667583  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2402  coproporphyrinogen III oxidase  41.69 
 
 
480 aa  369  1e-101  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_1708  coproporphyrinogen III oxidase  43.85 
 
 
483 aa  370  1e-101  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.555981  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4251  coproporphyrinogen III oxidase  43.17 
 
 
457 aa  370  1e-101  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.172293  normal  0.0658119 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2697  coproporphyrinogen III oxidase  43.85 
 
 
483 aa  370  1e-101  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03752  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0523071  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4120  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2613  coproporphyrinogen III oxidase  42.89 
 
 
460 aa  365  1e-100  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0494061  normal  0.675142 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1237  coproporphyrinogen III oxidase  43.75 
 
 
465 aa  368  1e-100  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.828394  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1129  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 
471 aa  368  1e-100  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal  0.101804 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2470  coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 
476 aa  368  1e-100  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.097815 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0635  coproporphyrinogen III oxidase  43.08 
 
 
456 aa  366  1e-100  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal  0.603744 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3828  coproporphyrinogen III oxidase  40.32 
 
 
460 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4092  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0515702  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2824  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.23 
 
 
470 aa  367  1e-100  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0116483  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1800  coproporphyrinogen III oxidase  43.92 
 
 
481 aa  367  1e-100  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4386  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0245884  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03701  hypothetical protein  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0677852  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4342  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.343307  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4149  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.20297  normal  0.0195614 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5313  coproporphyrinogen III oxidase  42.95 
 
 
457 aa  368  1e-100  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00391733  normal  0.998982 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2483  coproporphyrinogen III oxidase  41.51 
 
 
484 aa  364  2e-99  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  hitchhiker  0.00279185  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4264  coproporphyrinogen III oxidase  43.6 
 
 
460 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3829  coproporphyrinogen III oxidase  43.37 
 
 
460 aa  363  3e-99  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.618416  normal  0.919193 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1993  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  43.33 
 
 
460 aa  363  4e-99  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0376675  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3582  coproporphyrinogen III oxidase  43.89 
 
 
460 aa  363  4e-99  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.308056  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4215  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 
457 aa  363  4e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.419471  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_44470  coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 
460 aa  363  4e-99  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.063876  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3720  coproporphyrinogen III oxidase  40.49 
 
 
446 aa  362  5.0000000000000005e-99  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.959602  normal 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0159  coproporphyrinogen III oxidase  40.6 
 
 
453 aa  363  5.0000000000000005e-99  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.219729  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0384  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  40.67 
 
 
457 aa  363  5.0000000000000005e-99  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3423  coproporphyrinogen III oxidase  43.14 
 
 
461 aa  362  6e-99  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal  0.0620392 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3483  coproporphyrinogen III oxidase  42.63 
 
 
494 aa  362  7.0000000000000005e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.331416  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4236  coproporphyrinogen III oxidase  41.78 
 
 
485 aa  362  8e-99  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.139524  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1289  coproporphyrinogen III oxidase  42.67 
 
 
473 aa  362  8e-99  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1129  coproporphyrinogen III oxidase  43.46 
 
 
460 aa  362  9e-99  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0669659  decreased coverage  0.00210018 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1604  coproporphyrinogen III oxidase  43.15 
 
 
460 aa  361  1e-98  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0967735  normal  0.0165321 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_0305  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 
463 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0548818  hitchhiker  0.000383686 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1269  coproporphyrinogen III oxidase  42.35 
 
 
463 aa  361  1e-98  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3156  coproporphyrinogen III oxidase  42.63 
 
 
494 aa  361  1e-98  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.574693 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3786  coproporphyrinogen III oxidase  42.79 
 
 
460 aa  362  1e-98  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0810841  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0134  oxygen-independent coproporphyrinogen III oxidase  42.21 
 
 
463 aa  361  1e-98  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4393  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 
457 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3626  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 
446 aa  361  2e-98  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4332  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 
457 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  decreased coverage  0.0040942  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4286  coproporphyrinogen III oxidase  41.56 
 
 
457 aa  361  2e-98  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  decreased coverage  0.00813614  normal 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_0887  coproporphyrinogen III oxidase  40.83 
 
 
453 aa  360  4e-98  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  decreased coverage  0.00571678  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0086  coproporphyrinogen III oxidase  40.18 
 
 
446 aa  360  4e-98  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.652683  normal  0.197179 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>