More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3310 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3310  ABC transporter related  100 
 
 
505 aa  1003    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.156818  hitchhiker  0.00192862 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2725  ABC transporter related  88.93 
 
 
501 aa  878    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2304  ABC transporter related protein  52.3 
 
 
505 aa  501  1e-140  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0415  ABC transporter related  49.4 
 
 
503 aa  499  1e-140  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00000110391  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0946  ABC transporter related  53.21 
 
 
499 aa  488  1e-136  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0298167  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5275  ABC transporter related  52.57 
 
 
508 aa  479  1e-134  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0254262  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_3463  ABC transporter related  51.3 
 
 
516 aa  479  1e-134  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal  0.309481 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5684  ABC transporter related  51.21 
 
 
509 aa  475  1e-132  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.878529 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3699  ABC transporter related protein  51.1 
 
 
510 aa  474  1e-132  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.92688  normal  0.324088 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1035  ABC sugar transporter, ATPase subunit  51.21 
 
 
516 aa  471  1.0000000000000001e-131  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.474314  normal  0.672241 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2458  ABC transporter-related protein  51.72 
 
 
498 aa  468  1.0000000000000001e-131  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3041  ABC transporter related  50.7 
 
 
500 aa  468  1.0000000000000001e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012852  Rleg_6012  ABC transporter related  49.69 
 
 
861 aa  467  9.999999999999999e-131  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1890  ABC transporter related  48.26 
 
 
524 aa  466  9.999999999999999e-131  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.232644 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4569  ABC sugar transporter, ATPase subunit  48.16 
 
 
527 aa  463  1e-129  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0943  ABC transporter related  48.16 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.157228  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1425  ABC transporter related  48.16 
 
 
524 aa  463  1e-129  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0484861  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1403  ABC transporter related  47.96 
 
 
524 aa  461  1e-129  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_2929  ABC transporter related  48.69 
 
 
521 aa  463  1e-129  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal  0.180289 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5155  ABC transporter related  45.87 
 
 
512 aa  462  1e-129  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1212  ABC transporter related  49.7 
 
 
511 aa  465  1e-129  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1242  sugar ATP-binding ABC transporter protein  48.47 
 
 
518 aa  461  9.999999999999999e-129  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1305  ABC transporter related  48.16 
 
 
524 aa  460  9.999999999999999e-129  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2433  ribose import ATP-binding protein  49.89 
 
 
510 aa  460  9.999999999999999e-129  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0061  ABC transporter related  48.67 
 
 
516 aa  459  9.999999999999999e-129  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_50310  ABC transporter ATP-binding protein  48.58 
 
 
523 aa  460  9.999999999999999e-129  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.433727  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3489  sugar ABC transporter, ATP-binding protein  48.1 
 
 
525 aa  457  1e-127  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1344  ABC transporter related  47.76 
 
 
524 aa  458  1e-127  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2823  ABC transporter related  47.17 
 
 
511 aa  456  1e-127  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22700  ABC transporter related  45.33 
 
 
501 aa  453  1.0000000000000001e-126  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  decreased coverage  0.00201717  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5471  ABC transporter related  48.37 
 
 
520 aa  453  1.0000000000000001e-126  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.428158  normal 
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5810  ABC transporter related  47.56 
 
 
511 aa  452  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.644683  normal  0.0896237 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0164  ABC transporter related  44.67 
 
 
496 aa  453  1.0000000000000001e-126  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3855  ABC transporter related  47.55 
 
 
513 aa  454  1.0000000000000001e-126  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.585208  normal  0.343425 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3330  ABC transporter related protein  47.26 
 
 
497 aa  453  1.0000000000000001e-126  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2851  ABC transporter related protein  50.9 
 
 
504 aa  454  1.0000000000000001e-126  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.291073  normal  0.688126 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0975  ABC transporter related  46.86 
 
 
495 aa  451  1e-125  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.000220508  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1254  ABC transporter related  48.37 
 
 
515 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1228  ABC transporter related  48.58 
 
 
517 aa  449  1e-125  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6267  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein  47.26 
 
 
511 aa  448  1e-125  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3569  ABC transporter related  46.65 
 
 
516 aa  451  1e-125  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.585388  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0881  ABC transporter related protein  49.09 
 
 
499 aa  449  1e-125  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.873937  n/a   
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6711  ABC transporter related  47.56 
 
 
511 aa  451  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.87316 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4183  ABC transporter related  46.73 
 
 
513 aa  449  1e-125  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6315  ABC transporter related  48.78 
 
 
514 aa  448  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.681428  normal  0.300453 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6474  ABC transporter related  48.78 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.891446  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1684  ABC transporter related  48 
 
 
519 aa  445  1.0000000000000001e-124  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.200207  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6709  ABC transporter related  48.78 
 
 
514 aa  447  1.0000000000000001e-124  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.268301  normal  0.306288 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1683  ABC transporter related  46.63 
 
 
503 aa  445  1.0000000000000001e-124  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0305806  normal  0.363885 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4071  ABC transporter related  44.29 
 
 
500 aa  445  1.0000000000000001e-124  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.414928  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3264  ABC transporter  46.69 
 
 
525 aa  442  1e-123  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  decreased coverage  0.000839316  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6345  ABC transporter related  49.39 
 
 
516 aa  443  1e-123  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.174321  normal  0.144091 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2595  ABC transporter related  46.69 
 
 
537 aa  443  1e-123  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.870253  normal  0.943264 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1962  ABC transporter-related protein  45.62 
 
 
494 aa  442  1e-123  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0299142 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1644  ABC transporter related  47.28 
 
 
495 aa  444  1e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.121193  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0226  ABC transporter related  46.31 
 
 
503 aa  443  1e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.973654  normal  0.104566 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0411  ABC transporter related  45.97 
 
 
494 aa  441  9.999999999999999e-123  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.046808  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_3003  ABC transporter related  47.66 
 
 
495 aa  441  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  hitchhiker  0.00261146  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0873  ABC transporter related  48.27 
 
 
514 aa  441  9.999999999999999e-123  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.304732  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3073  ABC transporter related  45.82 
 
 
508 aa  441  9.999999999999999e-123  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011887  Mnod_7809  ABC transporter related  45.19 
 
 
512 aa  439  9.999999999999999e-123  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3604  ABC transporter related  45.69 
 
 
513 aa  440  9.999999999999999e-123  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.88039  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3540  ABC transporter related protein  42.71 
 
 
504 aa  436  1e-121  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.285144  n/a   
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5318  ABC transporter related  47.29 
 
 
508 aa  438  1e-121  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.398307  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3599  ABC transporter related  48.69 
 
 
512 aa  437  1e-121  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.190927  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3347  ABC transporter related  46.17 
 
 
513 aa  436  1e-121  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.0920182  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0562  ABC transporter-related protein  45.23 
 
 
496 aa  436  1e-121  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.00000997744  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A4096  sugar transport ATP-binding protein  44.96 
 
 
507 aa  436  1e-121  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4030  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.96 
 
 
507 aa  436  1e-121  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2905  ABC transporter related  46.56 
 
 
497 aa  437  1e-121  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.077452 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4267  ABC transporter related  45.64 
 
 
513 aa  436  1e-121  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.844031  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0634  ribose ABC transporter ATP-binding protein  45.03 
 
 
494 aa  432  1e-120  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.97602  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0578  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 
494 aa  432  1e-120  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3312  ABC transporter-related protein  44.31 
 
 
515 aa  432  1e-120  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2021  xylose transporter ATP-binding subunit  45.33 
 
 
504 aa  433  1e-120  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4237  D-ribose transporter ATP binding protein  45.14 
 
 
501 aa  435  1e-120  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0287863  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0699  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 
494 aa  432  1e-120  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.159606  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0125  ABC transporter related  45.29 
 
 
507 aa  434  1e-120  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0724  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  45.03 
 
 
494 aa  432  1e-120  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.79429e-30 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5601  ribose import ATP-binding protein RbsA  43.63 
 
 
506 aa  431  1e-119  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0735  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
494 aa  429  1e-119  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0577  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.83 
 
 
494 aa  431  1e-119  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_3328  ABC transporter related  46.89 
 
 
512 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3218  ribose import ATP-binding protein RbsA  45.33 
 
 
501 aa  431  1e-119  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1800  ABC-type sugar transport system, ATPase component  43.67 
 
 
492 aa  431  1e-119  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.225071  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5039  ABC transporter related  46.89 
 
 
512 aa  429  1e-119  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4639  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  44.62 
 
 
494 aa  431  1e-119  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.202571  unclonable  1.04957e-25 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1667  ABC transporter related  47.59 
 
 
502 aa  429  1e-119  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.338027  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0289  ABC transporter related  44.75 
 
 
506 aa  429  1e-119  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.266417 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1399  ABC transporter ATP-binding protein  48.98 
 
 
508 aa  431  1e-119  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.172278 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_5245  ABC transporter related  47.2 
 
 
514 aa  430  1e-119  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.835189 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1644  ABC transporter related  43.7 
 
 
494 aa  426  1e-118  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000081797  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_4967  ABC transporter related  46.89 
 
 
513 aa  425  1e-118  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0624  ABC sugar transporter, ATPase subunit  47.28 
 
 
512 aa  427  1e-118  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0613  ABC transporter related  44.69 
 
 
497 aa  427  1e-118  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5135  ABC transporter nucleotide binding/ATPase protein (ribose)  44.55 
 
 
524 aa  427  1e-118  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.543478  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000341  ribose ABC transport system ATP-binding protein RbsA  42.94 
 
 
501 aa  426  1e-118  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0581  ABC transporter related  44.02 
 
 
496 aa  427  1e-118  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1882  ribose ABC transporter, ATP-binding protein  42.34 
 
 
501 aa  427  1e-118  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.102904  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4170  ABC transporter related  46.4 
 
 
503 aa  426  1e-118  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.611876  normal  0.0273413 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>