More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3199 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3199  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  100 
 
 
613 aa  1231  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  1.04981e-05  normal  0.61313 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1535  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  55.75 
 
 
599 aa  631  1e-179  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.495544  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2293  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.5 
 
 
644 aa  581  1e-164  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.566282  normal  0.158563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3922  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  52.47 
 
 
575 aa  546  1e-154  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0150926  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1386  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  40.03 
 
 
550 aa  403  1e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_524  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  37.56 
 
 
562 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000305256  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0585  DNA polymerase III, gamma and tau subunits, putative  37.8 
 
 
559 aa  382  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0559  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.54 
 
 
570 aa  382  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.42957  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0050  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.69 
 
 
554 aa  327  3e-88  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  2.2733e-08  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3422  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.24 
 
 
582 aa  324  3e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.087707  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.67 
 
 
540 aa  322  1e-86  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2107  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  43.34 
 
 
534 aa  318  1e-85  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00560473  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.76 
 
 
589 aa  317  4e-85  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4327  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.47 
 
 
579 aa  313  6e-84  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.923822  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.8 
 
 
447 aa  313  6e-84  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  3.24435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.31 
 
 
518 aa  313  7e-84  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.54 
 
 
589 aa  309  1e-82  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0046  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.72 
 
 
522 aa  309  1e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.241439  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.85 
 
 
547 aa  306  5e-82  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.24 
 
 
547 aa  306  9e-82  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0094  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  35.2 
 
 
579 aa  305  1e-81  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0212  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.47 
 
 
582 aa  304  3e-81  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.783119  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2789  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.45 
 
 
602 aa  304  3e-81  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.226663  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35 
 
 
547 aa  303  5e-81  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.38 
 
 
567 aa  303  5e-81  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01580  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  39.03 
 
 
900 aa  302  1e-80  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110622 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0242  DNA polymerase III subunits gamma and tau  37.87 
 
 
562 aa  300  5e-80  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  decreased coverage  2.27385e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0603  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.89 
 
 
735 aa  299  9e-80  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  normal  0.705665 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0374  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.39 
 
 
582 aa  299  9e-80  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  9.45747e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3762  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.33 
 
 
606 aa  298  2e-79  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.440006  normal  0.772906 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0365  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.79 
 
 
551 aa  297  5e-79  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.00200762  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.06 
 
 
561 aa  296  7e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  1.59056e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.33 
 
 
559 aa  295  1e-78  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20790  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.28 
 
 
588 aa  294  4e-78  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  1.5496e-14  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3778  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.54 
 
 
601 aa  293  5e-78  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.131326  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2130  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.79 
 
 
427 aa  293  5e-78  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0748227  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.71 
 
 
610 aa  293  8e-78  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3695  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.54 
 
 
601 aa  293  9e-78  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0257  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  48.98 
 
 
518 aa  292  1e-77  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.12 
 
 
565 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.12 
 
 
565 aa  292  1e-77  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0521  DNA polymerase III subunits gamma and tau  44.38 
 
 
582 aa  292  1e-77  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.067552  normal  0.421793 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1508  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.21 
 
 
948 aa  292  2e-77  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  unclonable  4.66847e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3649  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.09 
 
 
592 aa  291  2e-77  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.89772  normal  0.739746 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0023  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.94 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0021  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.48 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0259778  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.48 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000589622  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.82 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0804011  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.48 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.48 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.0875141  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.94 
 
 
562 aa  291  2e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.48 
 
 
562 aa  291  3e-77  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0496501  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6870  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.77 
 
 
649 aa  291  3e-77  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.351092 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.48 
 
 
562 aa  290  4e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0301  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.51 
 
 
569 aa  290  6e-77  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0288678  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5294  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.94 
 
 
562 aa  290  8e-77  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000435365  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2365  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.55 
 
 
580 aa  287  3e-76  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.153654 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0024  DNA polymerase III subunits gamma and tau  39.94 
 
 
562 aa  288  3e-76  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00112319  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0832  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  42.78 
 
 
695 aa  287  5e-76  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0055  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  53.21 
 
 
582 aa  286  7e-76  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.0628794  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2407  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.46 
 
 
939 aa  286  7e-76  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  8.37393e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0796  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.5 
 
 
565 aa  286  7e-76  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.0481374 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0710  DNA polymerase III subunits gamma and tau  51.2 
 
 
582 aa  286  7e-76  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0166  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.66 
 
 
608 aa  286  8e-76  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0092  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.27 
 
 
527 aa  286  8e-76  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  hitchhiker  8.33689e-06 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4269  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.35 
 
 
691 aa  285  1e-75  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0189  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.23 
 
 
622 aa  286  1e-75  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0115  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  44.92 
 
 
755 aa  286  1e-75  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.032481  normal  0.138962 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0529  DNA-directed DNA polymerase  37.53 
 
 
696 aa  285  2e-75  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  unclonable  3.24921e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2302  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  47.12 
 
 
957 aa  285  2e-75  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.000141755  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3637  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.54 
 
 
606 aa  285  2e-75  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.0803944  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0912  DNA polymerase III, tau subunit  42.32 
 
 
652 aa  285  2e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.850857 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1599  DNA polymerase III subunits gamma and tau  43.35 
 
 
692 aa  285  2e-75  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal  0.0852408 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2235  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.44 
 
 
1113 aa  285  2e-75  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  unclonable  0.00400296  decreased coverage  4.93259e-05 
 
 
-
 
NC_004347  SO_2013  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  46.78 
 
 
1002 aa  284  3e-75  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2254  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
1071 aa  283  5e-75  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.000102262  normal  0.239994 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2326  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
1045 aa  283  6e-75  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00214919  hitchhiker  0.000897105 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3834  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.97 
 
 
687 aa  283  9e-75  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.471872 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_2016  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.28 
 
 
637 aa  282  1e-74  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.780836  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2615  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
1137 aa  282  1e-74  Shewanella baltica OS185  Bacteria  unclonable  4.43473e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2446  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
1040 aa  282  1e-74  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  unclonable  0.00022165  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1793  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.99 
 
 
911 aa  281  3e-74  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00315607  hitchhiker  3.97841e-07 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3587  DNA polymerase III subunits gamma and tau  42.71 
 
 
689 aa  281  3e-74  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2690  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
1137 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00745534  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1769  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
1115 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.000438447  hitchhiker  0.00599619 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2574  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.78 
 
 
1147 aa  281  3e-74  Shewanella baltica OS155  Bacteria  unclonable  5.34901e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0114  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  43.42 
 
 
568 aa  280  6e-74  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1335  DNA polymerase III subunits gamma and tau  46.62 
 
 
690 aa  280  6e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0235479  normal 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2381  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  46.1 
 
 
921 aa  280  7e-74  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  1.91992e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2000  DNA polymerase III subunits gamma and tau  52.33 
 
 
614 aa  279  8e-74  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_02330  DNA polymerase III, subunit gamma/tau  43.5 
 
 
807 aa  279  9e-74  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.15041  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  40.44 
 
 
685 aa  279  1e-73  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3876  DNA polymerase III subunits gamma and tau  48.18 
 
 
584 aa  278  1e-73  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.151315 
 
 
-
 
NC_004310  BR0034  DNA polymerase III subunits gamma and tau  47.21 
 
 
602 aa  279  1e-73  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.0330154  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2647  DNA polymerase III subunits gamma and tau  45.31 
 
 
692 aa  279  1e-73  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.377545  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2534  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  37.81 
 
 
752 aa  279  1e-73  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.821414  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2852  DNA-directed DNA polymerase  45.08 
 
 
955 aa  279  1e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.00013426  hitchhiker  9.46714e-07 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1310  DNA-directed DNA polymerase  46.11 
 
 
909 aa  278  2e-73  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.216995  normal  0.0673614 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3646  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  45.81 
 
 
743 aa  278  3e-73  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.923315  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3473  DNA polymerase III subunits gamma and tau  50.52 
 
 
659 aa  277  4e-73  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>