More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_3142 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  100 
 
 
1352 aa  2713    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1473  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.59 
 
 
1380 aa  322  3e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.6 
 
 
1363 aa  320  9e-86  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  38.57 
 
 
687 aa  310  1.0000000000000001e-82  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  36.24 
 
 
1346 aa  309  3e-82  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.85 
 
 
927 aa  306  2.0000000000000002e-81  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  36.24 
 
 
970 aa  305  3.0000000000000004e-81  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.8 
 
 
1274 aa  305  5.000000000000001e-81  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  31.31 
 
 
1046 aa  303  1e-80  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0258  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.2 
 
 
1040 aa  303  1e-80  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.119641 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.8 
 
 
1267 aa  303  1e-80  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  37.26 
 
 
998 aa  302  3e-80  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  34.84 
 
 
1361 aa  299  3e-79  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0617  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.57 
 
 
1398 aa  297  1e-78  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.536457  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.08 
 
 
823 aa  295  3e-78  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
1362 aa  295  4e-78  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  37.77 
 
 
921 aa  292  2e-77  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1204  sensory box histidine kinase/response regulator  37.5 
 
 
1177 aa  292  3e-77  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
791 aa  292  3e-77  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3600  histidine kinase  41.4 
 
 
548 aa  291  8e-77  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.94225  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1390  multi-sensor hybrid histidine kinase  40.09 
 
 
1977 aa  288  4e-76  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  40.3 
 
 
923 aa  288  5.999999999999999e-76  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  36.81 
 
 
977 aa  286  2.0000000000000002e-75  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.8 
 
 
858 aa  285  4.0000000000000003e-75  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2206  histidine kinase  42.55 
 
 
556 aa  284  7.000000000000001e-75  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1949  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.25 
 
 
1397 aa  283  1e-74  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.539898  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  36.1 
 
 
910 aa  283  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3158  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.83 
 
 
1131 aa  282  3e-74  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0979379 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  34.74 
 
 
1161 aa  282  3e-74  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3920  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  37.56 
 
 
758 aa  282  4e-74  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0903  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.72 
 
 
977 aa  281  4e-74  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.393558  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  35.84 
 
 
1137 aa  281  6e-74  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1056  two component hybrid sensor histidine kinase  34.49 
 
 
1014 aa  281  7e-74  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1596  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.31 
 
 
705 aa  280  1e-73  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  33.39 
 
 
1782 aa  280  2e-73  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1616  multi-sensor hybrid histidine kinase  37.43 
 
 
1240 aa  279  3e-73  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.98218  normal  0.696471 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.44 
 
 
991 aa  278  4e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2891  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  37.17 
 
 
858 aa  278  7e-73  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.432629 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2953  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.79 
 
 
1202 aa  277  8e-73  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.999143  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2865  Signal transduction histidine kinase-like protein  33.68 
 
 
2213 aa  277  8e-73  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000000726448 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.66 
 
 
1137 aa  277  9e-73  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2890  peptidase M52, hydrogen uptake protein  36.96 
 
 
1053 aa  277  1.0000000000000001e-72  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1754  histidine kinase  36.79 
 
 
1407 aa  277  1.0000000000000001e-72  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1564  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
1550 aa  276  2.0000000000000002e-72  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.047002  normal  0.324166 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4059  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.02 
 
 
1326 aa  276  2.0000000000000002e-72  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.129878 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0384  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.2 
 
 
1692 aa  275  5.000000000000001e-72  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1501  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
925 aa  273  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0961  multi-sensor hybrid histidine kinase  38.45 
 
 
1611 aa  273  1e-71  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.100608  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1474  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.91 
 
 
950 aa  274  1e-71  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1730  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.19 
 
 
833 aa  273  2e-71  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.76 
 
 
796 aa  272  2.9999999999999997e-71  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  34.55 
 
 
1763 aa  272  2.9999999999999997e-71  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.15 
 
 
887 aa  272  2.9999999999999997e-71  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0829  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
1240 aa  271  5.9999999999999995e-71  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1505  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.55 
 
 
818 aa  271  7e-71  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.81 
 
 
1022 aa  270  1e-70  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3070  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.88 
 
 
1166 aa  269  2.9999999999999995e-70  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00109625 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0040  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.12 
 
 
1193 aa  268  5e-70  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.802864 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.58 
 
 
1165 aa  268  5.999999999999999e-70  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0601  Signal transduction histidine kinase-like protein  34.29 
 
 
1442 aa  268  7e-70  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  33.27 
 
 
1765 aa  267  1e-69  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.62 
 
 
1333 aa  267  1e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1215  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  32.63 
 
 
944 aa  267  1e-69  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.960151  normal  0.101285 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2892  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.38 
 
 
1126 aa  267  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.121173  normal  0.0690104 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2150  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.56 
 
 
1643 aa  266  2e-69  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.133009  n/a   
 
 
-
 
NC_009670  Oant_4784  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.86 
 
 
1141 aa  266  2e-69  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2762  PAS sensor protein  34.71 
 
 
1135 aa  266  2e-69  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.449168  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  36.94 
 
 
1142 aa  266  2e-69  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0979  sensor histidine kinase  32.35 
 
 
1574 aa  266  2e-69  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00449169 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.06 
 
 
1284 aa  265  4.999999999999999e-69  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2575  sensor histidine kinase/response regulator  37 
 
 
850 aa  265  6e-69  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.88 
 
 
1310 aa  265  6e-69  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2718  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.01 
 
 
1255 aa  265  6e-69  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0403107 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1271  hybrid signal transduction histidine kinase and diguanylate cyclase/phosphodiesterase  33.71 
 
 
1499 aa  264  8.999999999999999e-69  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.422796  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2842  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.05 
 
 
936 aa  264  1e-68  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.870655 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.38 
 
 
936 aa  264  1e-68  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3612  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  35.82 
 
 
770 aa  263  1e-68  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.019984 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1767 aa  263  1e-68  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.03 
 
 
1767 aa  264  1e-68  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3703  Hpt sensor hybrid histidine kinase  36.46 
 
 
1021 aa  264  1e-68  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0219575 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2377  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.53 
 
 
1124 aa  263  1e-68  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.506766  normal 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4029  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  34.37 
 
 
835 aa  263  2e-68  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.15703 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2694  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.83 
 
 
1118 aa  263  2e-68  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.35 
 
 
975 aa  263  2e-68  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_27550  putative sensor/response regulator hybrid  35.73 
 
 
786 aa  263  2e-68  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00922112 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  33.53 
 
 
792 aa  262  3e-68  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.53 
 
 
803 aa  262  4e-68  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
1767 aa  262  4e-68  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2711  Hpt sensor hybrid histidine kinase  34.24 
 
 
818 aa  261  5.0000000000000005e-68  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0181892 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  33.62 
 
 
920 aa  261  6e-68  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01175  GGDEF domain protein  32.69 
 
 
1351 aa  261  7e-68  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2754  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  36.12 
 
 
1275 aa  260  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.727357 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_4142  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.75 
 
 
916 aa  260  1e-67  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.37 
 
 
974 aa  260  1e-67  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0260  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.07 
 
 
1287 aa  260  1e-67  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.579693  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 
1064 aa  260  1e-67  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.96 
 
 
1143 aa  259  2e-67  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4113  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.98 
 
 
801 aa  259  2e-67  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0059237 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0290  histidine kinase  31.22 
 
 
931 aa  259  3e-67  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000039083 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.01 
 
 
1145 aa  259  3e-67  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>