More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2999 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2999  30S ribosomal protein S11  100 
 
 
137 aa  279  1e-74  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00737948 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1160  30S ribosomal protein S11  90.37 
 
 
139 aa  228  3e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000271221  normal  0.0868676 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4001  30S ribosomal protein S11  89.63 
 
 
138 aa  227  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000341479  hitchhiker  0.000619325 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4938  30S ribosomal protein S11  84.48 
 
 
137 aa  209  7e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000118735  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2833  30S ribosomal protein S11  77.39 
 
 
131 aa  192  2e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.279532  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_19730  SSU ribosomal protein S11P  71.43 
 
 
131 aa  191  3e-48  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.000382809  normal  0.755388 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1772  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 
129 aa  189  8e-48  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.586668  normal  0.347372 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0651  30S ribosomal protein S11  75.65 
 
 
131 aa  189  1e-47  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.5695  hitchhiker  0.00000456607 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2037  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 
129 aa  188  2e-47  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.594548  normal  0.506463 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2665  30S ribosomal protein S11  68.55 
 
 
129 aa  187  4e-47  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2990  30S ribosomal protein S11  70.73 
 
 
129 aa  187  5e-47  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.319049 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1931  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 
129 aa  186  1e-46  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.194194  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3384  30S ribosomal protein S11  69.34 
 
 
137 aa  186  1e-46  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0704  30S ribosomal protein S11  69.42 
 
 
131 aa  186  1e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00000283991  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2685  30S ribosomal protein S11  75.76 
 
 
138 aa  186  1e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000312441  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0731  ribosomal protein S11  68.8 
 
 
128 aa  186  1e-46  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000706792  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13496  30S ribosomal protein S11  71.94 
 
 
139 aa  186  1e-46  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  5.2344e-17  normal  0.330141 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0330  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 
129 aa  185  2e-46  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.726774  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1210  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 
129 aa  185  2e-46  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.286667  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1173  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 
129 aa  185  2e-46  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.067515  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1090  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 
131 aa  185  2e-46  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.258039  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1979  30S ribosomal protein S11  69.92 
 
 
129 aa  185  2e-46  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.38607  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2759  ribosomal protein S11  67.2 
 
 
129 aa  185  2e-46  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.27094 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4972  30S ribosomal protein S11  71.85 
 
 
136 aa  185  2e-46  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.544163 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2193  30S ribosomal protein S11  69.35 
 
 
129 aa  184  2e-46  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0789543  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1434  30S ribosomal protein S11  75.81 
 
 
137 aa  185  2e-46  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1637  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  184  3e-46  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0662534  normal  0.0192025 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_2252  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0467149  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0741  ribosomal protein S11  85.09 
 
 
134 aa  184  3e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_2293  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  184  3e-46  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1866  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  184  3e-46  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1806  30S ribosomal protein S11  70.25 
 
 
129 aa  184  4e-46  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.533264  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1371  30S ribosomal protein S11  73.04 
 
 
130 aa  184  4e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.202358  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0566  30S ribosomal protein S11  69.35 
 
 
129 aa  184  4e-46  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.628191 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1327  30S ribosomal protein S11  68.55 
 
 
129 aa  183  6e-46  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.784215 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0870  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
131 aa  183  6e-46  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000918972  hitchhiker  0.00608711 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1009  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  183  7e-46  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.636565  normal  0.191083 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1111  30S ribosomal protein S11  75.81 
 
 
138 aa  183  8e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1140  30S ribosomal protein S11  75.81 
 
 
138 aa  183  8e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.257393 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1128  30S ribosomal protein S11  75.81 
 
 
138 aa  183  8e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.469294  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3643  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  182  9e-46  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.360656  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2141  30S ribosomal protein S11  69.11 
 
 
129 aa  182  1.0000000000000001e-45  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0893  30S ribosomal protein S11  71.32 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000000494342  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1568  30S ribosomal protein S11  66.17 
 
 
130 aa  182  1.0000000000000001e-45  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0898739  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1116  ribosomal protein S11  69.34 
 
 
134 aa  182  1.0000000000000001e-45  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.625499  normal  0.619073 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1387  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
130 aa  182  2.0000000000000003e-45  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.368178 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0608  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
134 aa  182  2.0000000000000003e-45  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3425  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal  0.185884 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5047  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  182  2.0000000000000003e-45  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0249835  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4288  30S ribosomal protein S11  71.53 
 
 
135 aa  181  3e-45  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000331944 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2318  30S ribosomal protein S11  68.29 
 
 
129 aa  181  3e-45  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.163155  normal  0.411932 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4292  ribosomal protein S11  69.34 
 
 
133 aa  181  3e-45  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3897  30S ribosomal protein S11  70.8 
 
 
135 aa  180  6e-45  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1923  30S ribosomal protein S11  66.67 
 
 
130 aa  180  6e-45  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.194942  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0251  ribosomal protein S11  73.6 
 
 
128 aa  180  7e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  0.0000000118892  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_04250  SSU ribosomal protein S11P  71.53 
 
 
135 aa  179  9.000000000000001e-45  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.333159  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3877  30S ribosomal protein S11  68.61 
 
 
135 aa  179  9.000000000000001e-45  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0714  30S ribosomal protein S11  72.26 
 
 
135 aa  178  2e-44  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.119408 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0137  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 
129 aa  178  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.00000000000197157  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1549  ribosomal protein S11  68.18 
 
 
131 aa  178  2e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2989  30S ribosomal protein S11  65.85 
 
 
130 aa  178  2e-44  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.108591  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0332  30S ribosomal protein S11  70.45 
 
 
135 aa  178  2e-44  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.147865  hitchhiker  0.000897065 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1170  ribosomal protein S11  68.61 
 
 
136 aa  177  2.9999999999999997e-44  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1655  30S ribosomal protein S11  70.69 
 
 
129 aa  178  2.9999999999999997e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1580  30S ribosomal protein S11  74.38 
 
 
130 aa  177  2.9999999999999997e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0220248  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0308  30S ribosomal protein S11  64.8 
 
 
129 aa  177  4e-44  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.331019 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0133  30S ribosomal protein S11  76.86 
 
 
129 aa  177  4e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3671  30S ribosomal protein S11  67.15 
 
 
135 aa  177  4e-44  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1215  30S ribosomal protein S11  77.69 
 
 
132 aa  177  5.999999999999999e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.0134437 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0783  30S ribosomal protein S11  65.6 
 
 
129 aa  176  7e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.483609  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0448  30S ribosomal protein S11  76.42 
 
 
129 aa  176  8e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0770716  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0276  30S ribosomal protein S11  72.73 
 
 
132 aa  176  9e-44  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1453  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 
129 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.067537  normal  0.300566 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1355  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 
129 aa  176  1e-43  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00844113  normal  0.387403 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5151  30S ribosomal protein S11  68.61 
 
 
134 aa  176  1e-43  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.589824 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1732  30S ribosomal protein S11  73.55 
 
 
132 aa  176  1e-43  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0312  30S ribosomal protein S11  74.8 
 
 
129 aa  176  1e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.830269  normal  0.250998 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2271  30S ribosomal protein S11  61.24 
 
 
127 aa  175  2e-43  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0715573  hitchhiker  0.00306589 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2204  30S ribosomal protein S11  62.02 
 
 
127 aa  174  3e-43  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000733078  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0300  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0251281  normal  0.0760469 
 
 
-
 
NC_006348  BMA2608  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A3145  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.171287  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A1948  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.666677  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_3752  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.347959  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3471  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.905571  normal  0.391554 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0351  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.161221 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3044  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.21907  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0273  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.0134293 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2735  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3780  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3722  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.113628  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3502  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0291  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0372  30S ribosomal protein S11  60.47 
 
 
133 aa  174  4e-43  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.557439  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1315  ribosomal protein S11  70.08 
 
 
132 aa  174  5e-43  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.515443  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0278  30S ribosomal protein S11  64 
 
 
129 aa  174  5e-43  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.778856  normal  0.618273 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6024  30S ribosomal protein S11  78.26 
 
 
134 aa  174  5e-43  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.170324 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3161  30S ribosomal protein S11  68.97 
 
 
129 aa  173  6e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.560785  normal  0.304254 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0338  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
134 aa  173  7e-43  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.578  normal  0.0241058 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2815  30S ribosomal protein S11  58.33 
 
 
134 aa  173  7e-43  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0769737  normal  0.19032 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>