More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2982 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009972  Haur_2507  type II secretion system protein E  70.99 
 
 
513 aa  635  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.000823712  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1876  type II secretion system protein E  78.35 
 
 
477 aa  770  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3241  type II secretion system protein E  76.95 
 
 
478 aa  760  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2982  type II secretion system protein E  100 
 
 
487 aa  985  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.330952  hitchhiker  0.00479532 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3210  type II secretion system protein E  58.79 
 
 
463 aa  563  1e-159  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.532215 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1274  type II secretion system protein E  57.86 
 
 
463 aa  542  1e-153  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1682  type II secretion system protein E  61.96 
 
 
465 aa  537  1e-151  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  8.47512e-06 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4613  type II secretion system protein E  56.25 
 
 
467 aa  507  1e-142  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1019  type II secretion system protein E  59.33 
 
 
472 aa  503  1e-141  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1041  type II secretion system protein E  64.3 
 
 
444 aa  499  1e-140  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.437209  n/a   
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4444  type II secretion system protein E  54.73 
 
 
465 aa  479  1e-134  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00432597 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2116  type II secretion system protein E  64.52 
 
 
457 aa  479  1e-134  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.768773  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3422  type II secretion system protein E  61.82 
 
 
468 aa  476  1e-133  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.351074  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2316  type II secretion system protein E  60.11 
 
 
677 aa  462  1e-129  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2648  type II secretion system protein E  49.8 
 
 
498 aa  459  1e-128  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2738  type II secretion system protein E  56.88 
 
 
624 aa  453  1e-126  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2933  type II secretion system protein E  59.01 
 
 
495 aa  454  1e-126  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.242377  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2925  type II secretion system protein E  52.19 
 
 
471 aa  450  1e-125  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.120672  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4155  type II secretion system protein E  54.04 
 
 
471 aa  450  1e-125  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.55327 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2639  type II secretion system protein E  50.63 
 
 
491 aa  448  1e-124  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2647  type II secretion system protein E  49.27 
 
 
459 aa  447  1e-124  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0641  type II secretion system protein E  55.73 
 
 
456 aa  443  1e-123  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.677023  normal  0.303221 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0652  secretion ATPase protein  51.06 
 
 
453 aa  442  1e-123  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.199713 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6002  type II secretion system protein E  50.78 
 
 
455 aa  440  1e-122  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.661496  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0748  FHA domain-containing protein  47.93 
 
 
572 aa  441  1e-122  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6298  type II secretion system protein E  50.78 
 
 
455 aa  439  1e-122  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7195  Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  50.44 
 
 
455 aa  439  1e-122  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.141277  normal  0.285879 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1918  type II secretion system protein E  55.56 
 
 
442 aa  441  1e-122  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.250738  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2921  type II/IV secretion system protein E  51.21 
 
 
638 aa  440  1e-122  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5324  type II secretion system protein E  52.94 
 
 
462 aa  439  1e-122  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0350722  decreased coverage  0.000466022 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3352  type II secretion system protein E  53.33 
 
 
471 aa  440  1e-122  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.695645  normal 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0588  type II secretion system protein E  55.82 
 
 
454 aa  438  1e-121  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.106283  normal  0.228191 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2349  type II secretion system protein E  54.13 
 
 
485 aa  436  1e-121  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.413673 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0422  type II secretion system protein E  48.93 
 
 
508 aa  437  1e-121  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1498  type II secretion system protein E  54.81 
 
 
468 aa  435  1e-121  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0708  type II/IV secretion system protein E  48.64 
 
 
589 aa  437  1e-121  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.844285  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3116  type II secretion system protein E  55.11 
 
 
491 aa  437  1e-121  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.761799  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6778  type II secretion system protein E  50.78 
 
 
454 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.367997  normal  0.399772 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_5492  type II secretion system protein E  50.78 
 
 
454 aa  438  1e-121  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.0157969  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6366  type II secretion system protein E  50.56 
 
 
454 aa  437  1e-121  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.595615  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1852  type II secretion system protein E  56.66 
 
 
470 aa  436  1e-121  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.00303958  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2019  type II secretion system protein E  51.28 
 
 
442 aa  437  1e-121  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.547771  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2366  putative pilus assembly protein  57.38 
 
 
441 aa  436  1e-121  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.108206  normal  0.102588 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_6876  FHA domain containing protein  50.99 
 
 
634 aa  432  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.4951  normal  0.233177 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3091  type II/IV secretion system protein  53.97 
 
 
455 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1316  type II secretion system protein  53.97 
 
 
455 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2966  type II/IV secretion system protein  53.97 
 
 
455 aa  434  1e-120  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.265625  n/a   
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4617  type II secretion system protein E  51.91 
 
 
460 aa  435  1e-120  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.511137 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0302  type II secretion system protein E  47.83 
 
 
484 aa  432  1e-120  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0799  type II secretion system protein E  57.95 
 
 
452 aa  433  1e-120  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0994  type II secretion system protein E  48.39 
 
 
496 aa  433  1e-120  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.010804  normal  0.584702 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2274  type II secretion system protein  53.44 
 
 
455 aa  433  1e-120  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1905  putative Flp pilus assembly protein ATPase CpaF  47.31 
 
 
485 aa  430  1e-119  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.094928  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0545  type II secretion system protein E  49.09 
 
 
454 aa  430  1e-119  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.732692 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0644  FHA domain-containing protein  53.47 
 
 
569 aa  429  1e-119  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal  0.61095 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1126  type II secretion system protein E  47.16 
 
 
484 aa  426  1e-118  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.188659  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1522  type II secretion system protein E  47 
 
 
467 aa  427  1e-118  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_0247  type II secretion system protein E  50.68 
 
 
639 aa  426  1e-118  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.68853  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0655  type II secretion system protein  55.04 
 
 
479 aa  428  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.181528 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2700  type II secretion system protein E  51.83 
 
 
437 aa  428  1e-118  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0554  type II secretion system protein E  46.9 
 
 
485 aa  428  1e-118  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2555  type II secretion system protein E  53.25 
 
 
464 aa  427  1e-118  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.174933  normal  0.12963 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0795  type II secretion system protein  48.57 
 
 
472 aa  427  1e-118  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2363  type II/IV secretion system protein  48.29 
 
 
560 aa  422  1e-117  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.158902  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1752  Flp pilus assembly ATPase CpaF  48.31 
 
 
451 aa  422  1e-117  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0804  type II secretion system protein E  54.79 
 
 
473 aa  424  1e-117  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3794  type II secretion system protein E  47.28 
 
 
480 aa  422  1e-117  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0875515  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2694  type II secretion system protein E  54.59 
 
 
474 aa  424  1e-117  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  hitchhiker  0.00162868  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2116  FHA domain containing protein  50.22 
 
 
594 aa  421  1e-116  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_0599  type II/IV secretion system protein  53.21 
 
 
428 aa  420  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3009  type II secretion system protein E  50.11 
 
 
445 aa  421  1e-116  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0260  type II/IV secretion system protein  53.21 
 
 
428 aa  420  1e-116  Yersinia pestis Angola  Bacteria  hitchhiker  6.62566e-05  hitchhiker  7.63288e-08 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0682  type II secretion system protein E  53.21 
 
 
428 aa  419  1e-116  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.667296  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1161  type II secretion system protein E  53.21 
 
 
469 aa  418  1e-115  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1055  type II secretion system protein E  58.06 
 
 
437 aa  417  1e-115  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1109  type II secretion system protein E  54.03 
 
 
608 aa  418  1e-115  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.280352  normal  0.0921606 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2913  type II secretion system protein E  50.23 
 
 
452 aa  418  1e-115  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7034  putative secretory protein kinase, cpaF-like gene  53.72 
 
 
433 aa  414  1e-114  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.473497 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4203  type II secretion system protein E  53.44 
 
 
484 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0834137  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1781  type II secretion system protein E  52.89 
 
 
467 aa  413  1e-114  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.615567  normal  0.227871 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2825  type II secretion system protein E  49.18 
 
 
450 aa  413  1e-114  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4346  FHA domain-containing protein  47.78 
 
 
563 aa  414  1e-114  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.077355  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2830  type II secretion system protein E  54.52 
 
 
482 aa  415  1e-114  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3206  type II secretion system protein E  57.5 
 
 
437 aa  415  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.235983 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0388  type II secretion system protein E  47.2 
 
 
489 aa  412  1e-114  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1833  type II secretion system protein E  51.35 
 
 
437 aa  409  1e-113  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2411  type II secretion system protein E  52.07 
 
 
485 aa  408  1e-113  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2381  type II secretion system protein E  53.39 
 
 
483 aa  410  1e-113  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.587547  normal  0.373771 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2354  type II secretion system protein E  55.75 
 
 
452 aa  409  1e-113  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3523  type II secretion system protein E  52.62 
 
 
482 aa  409  1e-113  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.779224  normal 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5122  type II secretion system protein E  52.73 
 
 
477 aa  409  1e-113  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.0451051 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0298  type II secretion system protein E  52.34 
 
 
488 aa  409  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2706  type II secretion system protein E  52.07 
 
 
482 aa  409  1e-113  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.542458  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3793  type II secretion system protein E  50 
 
 
485 aa  405  1e-112  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3716  type II secretion system protein E  52.34 
 
 
490 aa  408  1e-112  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.058843  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2483  type II secretion system protein E  52.07 
 
 
482 aa  408  1e-112  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.930862 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1528  type II secretion system protein E  51.06 
 
 
457 aa  406  1e-112  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2045  type II secretion system protein E  47.88 
 
 
458 aa  403  1e-111  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.0948744  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0604  type II secretion system protein E  52.46 
 
 
476 aa  404  1e-111  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0898  type II secretion system protein E  47.63 
 
 
467 aa  403  1e-111  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>