More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2717 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010084  Bmul_1748  GTP-binding protein TypA  54.67 
 
 
608 aa  639    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.846744  normal  0.0136263 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10011  tyrosine binding protein  54.27 
 
 
599 aa  654    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  normal  0.157886 
 
 
-
 
NC_002936  DET1298  GTP-binding protein TypA  56.03 
 
 
609 aa  698    Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0500  GTP-binding protein TypA  54.87 
 
 
598 aa  661    Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0936  GTP-binding protein TypA  52.75 
 
 
608 aa  639    Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0999  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
608 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.191284  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0696  GTP-binding protein TypA  52.62 
 
 
615 aa  655    Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2852  GTP-binding protein TypA  55.32 
 
 
606 aa  642    Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.011881  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0100  GTP-binding protein TypA  76.27 
 
 
613 aa  957    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.148242  normal 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2183  GTP-binding protein TypA  54.35 
 
 
605 aa  638    Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4003  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
614 aa  658    Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0449963  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3971  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
614 aa  658    Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1191  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
615 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.0472002  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0473  elongation factor Tu family protein  50.41 
 
 
613 aa  637    Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1109  small GTP-binding protein  55.72 
 
 
622 aa  692    Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0657709  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4408  virulence regulator BipA  54.5 
 
 
603 aa  642    Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0167  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
608 aa  642    Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.139003  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3868  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
614 aa  658    Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3701  GTP-binding protein  52.63 
 
 
614 aa  658    Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000145642  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3716  GTP-binding protein  52.63 
 
 
614 aa  657    Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.134306  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1053  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
608 aa  642    Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4378  GTP-binding protein TypA  55.38 
 
 
596 aa  650    'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1843  GTP-binding protein TypA  55.69 
 
 
614 aa  677    Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4575  GTP-binding protein TypA  69.32 
 
 
607 aa  862    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0154436  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1748  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
608 aa  642    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.623717  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1771  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
608 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.374634  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5850  GTP-binding protein TypA/BipA  52.99 
 
 
605 aa  636    Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0948932  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0166  GTP-binding protein TypA  53.16 
 
 
598 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.0168881  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2740  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 
605 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0339  GTP-binding protein TypA  76.94 
 
 
627 aa  961    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.034053  normal 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_3148  GTP-binding protein TypA  56.09 
 
 
605 aa  655    Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.284484  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2726  GTP-binding protein TypA  58.04 
 
 
610 aa  712    Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000416376  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0763  small GTP-binding protein domain-containing protein  55.73 
 
 
596 aa  657    Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.202624 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1923  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
608 aa  642    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.289402  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0678  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 
594 aa  643    Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  0.0381513  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2717  GTP-binding protein TypA  100 
 
 
613 aa  1243    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1211  GTP-binding protein TypA  56.07 
 
 
602 aa  686    Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000229587  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4648  GTP-binding protein TypA  54.5 
 
 
608 aa  641    Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0457537  normal  0.313247 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0213  GTP-binding protein TypA  56.11 
 
 
608 aa  677    Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1236  GTP-binding protein TypA  53.9 
 
 
600 aa  642    Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.292914  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1429  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
608 aa  638    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.329575 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1243  GTP-binding protein TypA  55.04 
 
 
602 aa  650    Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal  0.590892 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3013  GTP-binding protein TypA  53.86 
 
 
598 aa  655    Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.00684443  normal  0.862296 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1007  GTP-binding protein TypA  57.78 
 
 
614 aa  713    Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000478233  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3782  GTP-binding protein TypA  51.97 
 
 
614 aa  652    Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00018087  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4166  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
614 aa  658    Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00701473  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3441  GTP-binding protein TypA  53.34 
 
 
600 aa  660    Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000230192  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0770  tyrosine binding protein  53.24 
 
 
598 aa  637    Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1525  GTP-binding protein TypA  55.88 
 
 
597 aa  662    Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00490404 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1770  GTP-binding protein TypA  54.18 
 
 
603 aa  644    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0712941  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0491  GTP-binding protein TypA  54.35 
 
 
601 aa  651    Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000465728 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1894  GTP-binding protein TypA  54.27 
 
 
592 aa  636    Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00474713  normal 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2557  GTP-binding protein TypA  54.39 
 
 
608 aa  640    Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4202  GTP-binding protein TypA  55.9 
 
 
597 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2431  GTP-binding protein TypA  55.24 
 
 
608 aa  643    Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.318705  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4008  GTP-binding protein TypA  53.69 
 
 
599 aa  647    Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.0000000475691  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_45830  small GTP-binding protein TypA  52.39 
 
 
606 aa  637    Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0732  GTP-binding protein TypA  55.78 
 
 
616 aa  686    Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08221  tyrosine binding protein  53.07 
 
 
598 aa  636    Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.848748  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1430  GTP-binding protein TypA  57.24 
 
 
609 aa  680    Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.000885386  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0472  GTP-binding protein TypA  56.83 
 
 
608 aa  683    Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1471  GTP-binding protein TypA  56.31 
 
 
605 aa  701    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.885287  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1181  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
614 aa  657    Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.15687  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4241  GTP-binding protein TypA  55.9 
 
 
597 aa  672    Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.972345  hitchhiker  0.000558258 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08241  tyrosine binding protein  53.07 
 
 
598 aa  636    Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0995  GTP-binding protein TypA  53.36 
 
 
612 aa  653    Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.609502 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0413  GTP-binding protein TypA  54 
 
 
603 aa  635    Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0969  GTP-binding protein TypA  54.53 
 
 
613 aa  667    Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1536  GTP-binding protein TypA  51.92 
 
 
608 aa  635    Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00994584  normal  0.0110769 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4404  GTP-binding protein TypA  54.12 
 
 
605 aa  648    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0864  GTP-binding protein TypA  55.97 
 
 
593 aa  654    Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.490555 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1499  GTP-binding protein TypA  54.56 
 
 
608 aa  642    Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.584386  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4075  GTP-binding protein TypA  52.63 
 
 
614 aa  658    Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0000478887  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1027  GTP-binding protein TypA  54.83 
 
 
608 aa  642    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0474  GTP-binding protein TypA  54.52 
 
 
601 aa  655    Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1483  GTP-binding protein TypA  54.83 
 
 
608 aa  642    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal  0.394271 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08211  tyrosine binding protein  53.68 
 
 
600 aa  641    Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.96814  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2027  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 
610 aa  667    Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1744  GTP-binding protein TypA  53.65 
 
 
610 aa  666    Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4059  GTP-binding protein TypA  52.47 
 
 
614 aa  657    Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.124295  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4442  GTP-binding protein TypA  55.73 
 
 
596 aa  667    Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0306  GTP-binding protein TypA  54.67 
 
 
603 aa  644    Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.562357  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3718  GTP-binding protein TypA  54.67 
 
 
603 aa  644    Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal  0.0253074 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0896  GTP-binding protein TypA  52.07 
 
 
608 aa  638    Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0560855  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_0324  GTP-binding protein TypA  55 
 
 
603 aa  644    Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  decreased coverage  0.000010951  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1169  GTP-binding protein TypA  53.68 
 
 
615 aa  665    Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0173416  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1389  GTP-binding protein TypA  54.17 
 
 
608 aa  638    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1716  GTP-binding protein TypA  56.41 
 
 
596 aa  661    Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0151298  hitchhiker  0.00768442 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1790  GTP-binding protein TypA  55.9 
 
 
608 aa  692    Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0279363  normal  0.247565 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3551  GTP-binding protein TypA  56.58 
 
 
597 aa  671    Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00119172 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_2361  GTP-binding protein TypA  54.92 
 
 
632 aa  647    Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  hitchhiker  0.0000579697  unclonable  0.0000000000944183 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3415  virulence regulator BipA  53.41 
 
 
604 aa  635    Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal  0.349187 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0771  GTP-binding protein TypA/BipA (tyrosine phosphorylated protein A)  51.4 
 
 
615 aa  638    Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0726544  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1507  GTP-binding protein TypA  54.83 
 
 
608 aa  642    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2868  GTP-binding protein TypA  54.48 
 
 
594 aa  635    Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2150  GTP-binding protein TypA  58.04 
 
 
606 aa  714    Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00000561063  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0301  GTP-binding protein TypA  54.83 
 
 
603 aa  644    Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00567265 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07981  tyrosine binding protein  53.16 
 
 
598 aa  635    Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.633904 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3506  GTP-binding protein TypA  53.59 
 
 
601 aa  654    Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.0000140002  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2658  GTP-binding protein TypA  52.8 
 
 
614 aa  657    Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.0030836  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>