More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2683 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
546 aa  1099  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0196  multi-sensor signal transduction histidine kinase  66.34 
 
 
556 aa  663  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.0666549 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4343  multi-sensor signal transduction histidine kinase  65.56 
 
 
556 aa  650  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.236595  normal  0.180185 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0937  multi-sensor signal transduction histidine kinase  53.26 
 
 
534 aa  522  1e-147  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0830916  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0748  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.72 
 
 
815 aa  251  2e-65  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1057  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.14 
 
 
718 aa  230  4e-59  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.108149  normal  0.980645 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.39 
 
 
695 aa  230  5e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0980  GAF sensor signal transduction histidine kinase  31.49 
 
 
725 aa  224  4e-57  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209286  normal  0.144143 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1221  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.96 
 
 
637 aa  223  7e-57  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.51 
 
 
2161 aa  219  8e-56  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
2153 aa  217  6e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3937  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.63 
 
 
701 aa  213  5e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0833  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.78 
 
 
722 aa  213  1e-53  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.357142  unclonable  1.04285e-09 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1678  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
726 aa  212  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.62189  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.82 
 
 
885 aa  211  3e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0094  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.42 
 
 
621 aa  199  1e-49  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0155  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
1014 aa  196  1e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
621 aa  195  2e-48  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.12 
 
 
604 aa  194  3e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  1.97924e-10  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.54 
 
 
827 aa  194  5e-48  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
2783 aa  193  7e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3458  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.06 
 
 
958 aa  192  1e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3138  sensor histidine kinase/response regulator  35.34 
 
 
484 aa  192  2e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.312332  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.08 
 
 
592 aa  190  6e-47  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  1.1549e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0350  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.42 
 
 
482 aa  189  1e-46  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000480808 
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  34.44 
 
 
581 aa  188  2e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4482  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
718 aa  188  2e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.149473  decreased coverage  0.00105308 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
880 aa  187  6e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.7 
 
 
581 aa  187  6e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0127  Osmosensitive K+ channel histidine kinase-like protein  30.91 
 
 
640 aa  186  7e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.29 
 
 
1021 aa  186  1e-45  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.79 
 
 
584 aa  186  1e-45  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2095  histidine kinase  40.83 
 
 
539 aa  186  1e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.55 
 
 
709 aa  185  2e-45  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  34.63 
 
 
581 aa  185  2e-45  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1618  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
711 aa  185  2e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.491163 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.99 
 
 
489 aa  184  3e-45  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4656  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.09 
 
 
677 aa  184  3e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3420  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
719 aa  184  4e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.688425  normal  0.99318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.86 
 
 
899 aa  184  5e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0484  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.06 
 
 
1017 aa  183  6e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.22 
 
 
584 aa  182  1e-44  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.92 
 
 
609 aa  181  2e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.87 
 
 
581 aa  181  4e-44  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.79 
 
 
905 aa  181  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.29 
 
 
458 aa  180  5e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.49 
 
 
1319 aa  180  6e-44  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.45 
 
 
944 aa  180  6e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2189  histidine kinase  42.17 
 
 
482 aa  180  7e-44  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0786  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.13 
 
 
582 aa  180  7e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0305  GAF sensor signal transduction histidine kinase  29.16 
 
 
754 aa  180  7e-44  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.58 
 
 
589 aa  179  8e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2674  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
585 aa  179  8e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.239294  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3273  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.98 
 
 
585 aa  179  9e-44  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.74 
 
 
611 aa  179  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.11 
 
 
621 aa  179  1e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.82 
 
 
608 aa  179  1e-43  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.66 
 
 
571 aa  179  1e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  33.08 
 
 
1629 aa  179  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  34.38 
 
 
537 aa  178  2e-43  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2261  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.73 
 
 
892 aa  178  2e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1113  multi-sensor signal transduction histidine kinase  40.82 
 
 
1042 aa  178  3e-43  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.57 
 
 
1010 aa  177  4e-43  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3503  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.54 
 
 
1043 aa  177  4e-43  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  32.02 
 
 
613 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  32.02 
 
 
613 aa  177  5e-43  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.33 
 
 
597 aa  177  6e-43  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  31.74 
 
 
613 aa  177  6e-43  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  7.19997e-07  hitchhiker  9.90225e-13 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1115  sensor histidine kinase  31.77 
 
 
446 aa  176  7e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  32.54 
 
 
650 aa  176  8e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1776  GAF sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
710 aa  176  9e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.548217  normal  0.563692 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.17 
 
 
884 aa  176  1e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.52 
 
 
460 aa  176  1e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0039  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.35 
 
 
638 aa  175  2e-42  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.7 
 
 
593 aa  175  2e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  31.74 
 
 
613 aa  175  2e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  39.37 
 
 
590 aa  175  2e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  31.74 
 
 
613 aa  175  2e-42  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.26 
 
 
911 aa  175  2e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3771  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.96 
 
 
1039 aa  175  2e-42  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  unclonable  1.91257e-05 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  31.74 
 
 
613 aa  175  2e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2597  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.07 
 
 
448 aa  175  2e-42  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.067404 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  31.74 
 
 
613 aa  175  2e-42  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
619 aa  174  3e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5479  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.54 
 
 
383 aa  174  3e-42  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.681291 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2638  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  44.64 
 
 
475 aa  174  3e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.96 
 
 
933 aa  174  3e-42  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  3.59369e-05 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  31.46 
 
 
613 aa  174  3e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
587 aa  174  5e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  31.46 
 
 
613 aa  174  5e-42  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  39.06 
 
 
640 aa  173  6e-42  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1495  GAF sensor signal transduction histidine kinase  40.08 
 
 
579 aa  173  7e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1547  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.31 
 
 
520 aa  172  1e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3278  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.88 
 
 
645 aa  172  1e-41  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.179777 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2661  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  33.8 
 
 
602 aa  172  1e-41  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4698  sensory box histidine kinase PhoR  33.15 
 
 
587 aa  171  2e-41  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.92933  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0008  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.36 
 
 
758 aa  171  2e-41  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5265  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.54 
 
 
661 aa  172  2e-41  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4719  sensory box histidine kinase PhoR  32.87 
 
 
587 aa  171  3e-41  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2062  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.87 
 
 
358 aa  171  3e-41  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.27635  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>