More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2667 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2651  putative PAS/PAC sensor protein  55.47 
 
 
653 aa  678    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1372  putative PAS/PAC sensor protein  66.05 
 
 
655 aa  866    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2667  putative PAS/PAC sensor protein  100 
 
 
653 aa  1328    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000189051 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3536  putative PAS/PAC sensor protein  67.49 
 
 
653 aa  885    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0821285  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4199  putative PAS/PAC sensor protein  64.92 
 
 
562 aa  461  9.999999999999999e-129  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00362058 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4189  putative PAS/PAC sensor protein  39.59 
 
 
428 aa  232  1e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000679447 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0604  putative PAS/PAC sensor protein  41.83 
 
 
428 aa  230  7e-59  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0938215  hitchhiker  0.000133748 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3800  putative PAS/PAC sensor protein  38.72 
 
 
430 aa  218  2e-55  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4067  putative PAS/PAC sensor protein  41.52 
 
 
429 aa  217  5e-55  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.220594 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2225  putative PAS/PAC sensor protein  38.75 
 
 
509 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00360384  normal  0.281465 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1962  putative PAS/PAC sensor protein  30.91 
 
 
538 aa  204  5e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.118262  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2373  putative PAS/PAC sensor protein  40.38 
 
 
424 aa  200  7e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0322633  normal  0.629706 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2953  putative PAS/PAC sensor protein  31.42 
 
 
549 aa  197  6e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3527  putative PAS/PAC sensor protein  32.27 
 
 
667 aa  176  9.999999999999999e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2789  putative PAS/PAC sensor protein  61.69 
 
 
323 aa  176  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_2336  signal transduction histidine kinase  32.66 
 
 
3706 aa  169  1e-40  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2509  anti-sigma-factor antagonist  57.05 
 
 
388 aa  165  3e-39  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.840655 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1662  anti-sigma-factor antagonist  51.48 
 
 
290 aa  163  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.80194  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0128  putative PAS/PAC sensor protein  34.51 
 
 
433 aa  162  2e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009973  Haur_5198  putative PAS/PAC sensor protein  30.82 
 
 
694 aa  159  1e-37  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1520  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.14 
 
 
777 aa  158  3e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1921  putative PAS/PAC sensor protein  54 
 
 
295 aa  158  4e-37  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.134745  hitchhiker  0.0000024656 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0273  diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  29.57 
 
 
1078 aa  157  9e-37  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2751  anti-sigma-factor antagonist  55.17 
 
 
357 aa  156  1e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2851  putative PAS/PAC sensor protein  36.27 
 
 
315 aa  149  1.0000000000000001e-34  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0451  anti-sigma-factor antagonist  52.55 
 
 
312 aa  145  2e-33  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2483  anti-sigma-factor antagonist  54.76 
 
 
291 aa  144  6e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.872627  normal  0.455884 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2484  anti-sigma-factor antagonist  54.62 
 
 
281 aa  143  9.999999999999999e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.817104  normal  0.435935 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3162  putative PAS/PAC sensor protein  40.36 
 
 
638 aa  142  1.9999999999999998e-32  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.13851  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2482  anti-sigma-factor antagonist  53.08 
 
 
293 aa  142  3e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.700951  normal  0.474316 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3016  anti-sigma-factor antagonist  51.09 
 
 
510 aa  139  1e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.00000586353  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2460  putative PAS/PAC sensor protein  44.79 
 
 
306 aa  140  1e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0675728  normal 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1441  PAS  45.51 
 
 
794 aa  139  2e-31  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.876573  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0647  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  27.66 
 
 
1741 aa  139  2e-31  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.294056 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4420  anti-sigma-factor antagonist  51.91 
 
 
271 aa  137  4e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4421  anti-sigma-factor antagonist  51.15 
 
 
271 aa  137  5e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0281  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.29 
 
 
688 aa  135  1.9999999999999998e-30  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.113851 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0462  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.9 
 
 
1138 aa  136  1.9999999999999998e-30  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.84915  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1645  anti-sigma-factor antagonist  47.22 
 
 
358 aa  132  2.0000000000000002e-29  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2495  anti-sigma-factor antagonist  50.37 
 
 
568 aa  132  3e-29  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2716  anti-sigma-factor antagonist  49.33 
 
 
559 aa  132  3e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1475  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  47.29 
 
 
272 aa  131  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000603056  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2805  anti-sigma-factor antagonist  50.77 
 
 
275 aa  131  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1671  anti-sigma-factor antagonist  44.53 
 
 
288 aa  130  7.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.128227 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2307  anti-sigma-factor antagonist  49.26 
 
 
439 aa  130  8.000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5779  anti-sigma-factor antagonist  48.89 
 
 
288 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0799  anti-sigma-factor antagonist  48.46 
 
 
286 aa  129  2.0000000000000002e-28  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.224753  hitchhiker  0.00639287 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2416  anti-sigma-factor antagonist  49.23 
 
 
288 aa  129  2.0000000000000002e-28  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0129  anti-sigma-factor antagonist  46.92 
 
 
287 aa  127  8.000000000000001e-28  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1492  anti-sigma-factor antagonist  46.92 
 
 
282 aa  127  9e-28  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.0622527 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2486  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  50 
 
 
294 aa  125  2e-27  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3158  anti-sigma-factor antagonist  49.23 
 
 
445 aa  125  3e-27  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0474  anti-sigma-factor antagonist  47.69 
 
 
279 aa  125  3e-27  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2419  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  38.92 
 
 
1023 aa  125  3e-27  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4411  anti-sigma-factor antagonist  47.69 
 
 
280 aa  125  4e-27  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.118778  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0667  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  29.44 
 
 
1036 aa  124  6e-27  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3744  anti-sigma-factor antagonist  46.27 
 
 
288 aa  123  9.999999999999999e-27  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2793  anti-sigma-factor antagonist  46.97 
 
 
272 aa  122  1.9999999999999998e-26  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3339  anti-sigma-factor antagonist  46.21 
 
 
292 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.123389  normal 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4032  diguanylate cyclase/phosphodiesterase  28.28 
 
 
1036 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.661545 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0391  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  30.6 
 
 
1040 aa  121  3.9999999999999996e-26  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.519884  normal  0.119604 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2937  anti-sigma-factor antagonist  47.93 
 
 
271 aa  121  3.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000434706  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5229  anti-sigma-factor antagonist  46.21 
 
 
291 aa  121  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0512  anti-sigma-factor antagonist  45.71 
 
 
292 aa  120  4.9999999999999996e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4858  anti-sigma-factor antagonist  47.54 
 
 
295 aa  121  4.9999999999999996e-26  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3768  anti-sigma-factor antagonist  42.34 
 
 
284 aa  120  6e-26  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0315517 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0903  anti-sigma-factor antagonist  42.33 
 
 
376 aa  120  6e-26  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000110303  hitchhiker  0.00000527056 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32020  anti-anti-sigma regulatory factor (antagonist of anti-sigma factor)  47.62 
 
 
283 aa  120  6e-26  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.16584  normal  0.174453 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3133  anti-sigma-factor antagonist (STAS)  42.86 
 
 
283 aa  120  7.999999999999999e-26  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.715564 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2269  anti-sigma-factor antagonist  44.36 
 
 
291 aa  120  7.999999999999999e-26  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.169794 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1798  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  37.95 
 
 
1023 aa  120  9e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.100128 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2118  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  40.15 
 
 
285 aa  120  9e-26  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.333632 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0195  putative PAS/PAC sensor protein  30.98 
 
 
255 aa  120  9e-26  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.1074  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4970  Sulfate transporter/antisigma-factor antagonist STAS  45.74 
 
 
284 aa  119  9.999999999999999e-26  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6567  anti-sigma-factor antagonist  47.29 
 
 
286 aa  119  1.9999999999999998e-25  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.967653  normal  0.0460746 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2685  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  49.6 
 
 
660 aa  119  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.41147  normal  0.190122 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1317  anti-sigma-factor antagonist  40.13 
 
 
286 aa  119  1.9999999999999998e-25  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0550  anti-sigma-factor antagonist  38.5 
 
 
372 aa  116  1.0000000000000001e-24  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3437  anti-sigma-factor antagonist  44.2 
 
 
315 aa  116  1.0000000000000001e-24  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0379355  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1903  anti-sigma-factor antagonist  50.88 
 
 
689 aa  114  4.0000000000000004e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_3137  anti-sigma-factor antagonist  40.44 
 
 
283 aa  115  4.0000000000000004e-24  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.225193  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0350  anti-sigma-factor antagonist  45.52 
 
 
385 aa  115  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.341427 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0148  putative PAS/PAC sensor protein  37.97 
 
 
299 aa  114  5e-24  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3859  anti-sigma-factor antagonist  44.8 
 
 
295 aa  114  5e-24  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1219  positive regulator of sigma-B  39.06 
 
 
286 aa  114  8.000000000000001e-24  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.30106  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4771  anti-sigma-factor antagonist  47.9 
 
 
231 aa  113  1.0000000000000001e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4563  signal transduction histidine kinase  37.16 
 
 
771 aa  113  1.0000000000000001e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.633448 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0053  anti-sigma-factor antagonist  46.32 
 
 
377 aa  113  1.0000000000000001e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0493156  normal  0.337885 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4058  anti-sigma-factor antagonist  46.22 
 
 
370 aa  112  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4193  anti-sigma-factor antagonist  45.99 
 
 
388 aa  111  5e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.512657  hitchhiker  0.00496827 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  27.11 
 
 
603 aa  110  6e-23  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3018  diguanylate cyclase/phosphodiesterase with PAS/PAC sensor(s)  27.75 
 
 
1147 aa  110  7.000000000000001e-23  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0590  anti-sigma-factor antagonist  40.34 
 
 
549 aa  109  1e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.641897 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3046  two-component sensor histidine kinase  40.15 
 
 
515 aa  110  1e-22  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.3846  normal  0.30289 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1858  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.27 
 
 
1191 aa  110  1e-22  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0577  anti-sigma-factor antagonist  35.68 
 
 
385 aa  109  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1270  anti-sigma-factor antagonist  44.19 
 
 
325 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0410  anti-sigma-factor antagonist  45.26 
 
 
361 aa  108  2e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695022  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3404  anti-sigma-factor antagonist  43.61 
 
 
361 aa  109  2e-22  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2194  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.03 
 
 
1363 aa  108  3e-22  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>