More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2662 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2662  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  100 
 
 
474 aa  941  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0298541 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3027  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  46.41 
 
 
486 aa  300  4e-80  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00722625  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0321  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  43.29 
 
 
682 aa  270  3e-71  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.124455 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0865  hypoxanthine phosphoribosyltransferase  42.06 
 
 
676 aa  246  5e-64  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000888188 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0104  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.1 
 
 
455 aa  213  5e-54  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.192858  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0086  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.05 
 
 
470 aa  213  8e-54  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1203  PP-loop  33.69 
 
 
476 aa  209  7e-53  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0094  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.07 
 
 
454 aa  209  1e-52  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0228  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.75 
 
 
473 aa  204  3e-51  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1229  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.52 
 
 
476 aa  202  1e-50  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.15 
 
 
471 aa  201  2e-50  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0862311  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2788  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.23 
 
 
469 aa  200  6e-50  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0070  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.65 
 
 
476 aa  199  9e-50  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.278443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.65 
 
 
476 aa  199  1e-49  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5246  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.43 
 
 
476 aa  199  1e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.320432  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0061  hypothetical protein  30.22 
 
 
476 aa  198  1e-49  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.625972  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0074  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.22 
 
 
476 aa  198  2e-49  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0125987  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2474  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.79 
 
 
469 aa  198  2e-49  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0058  cell cycle protein  30.22 
 
 
476 aa  197  3e-49  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00560  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.82 
 
 
468 aa  195  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.0427403  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0071  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
476 aa  195  2e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0058  cell cycle protein  30 
 
 
476 aa  195  2e-48  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0062  hypothetical protein  29.78 
 
 
476 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.223025  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0058  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.82 
 
 
476 aa  194  4e-48  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0062  hypothetical protein  29.78 
 
 
476 aa  194  4e-48  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1421  PP-loop family protein  31.59 
 
 
470 aa  191  3e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0079  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.02 
 
 
509 aa  182  1e-44  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  31.77 
 
 
464 aa  175  2e-42  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2255  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.67 
 
 
470 aa  175  2e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  1.64425e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1594  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.84 
 
 
457 aa  174  4e-42  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1810  cell cycle protein MesJ, putative  31.98 
 
 
471 aa  172  8e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0106411  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0060  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.69 
 
 
464 aa  172  1e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0996  cell cycle protein  33.85 
 
 
458 aa  169  1e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.44135e-13  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1265  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.4 
 
 
470 aa  168  2e-40  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.265542  normal  0.258224 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.39 
 
 
457 aa  166  1e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0062  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.92 
 
 
462 aa  162  2e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.0340332  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0125  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.52 
 
 
472 aa  161  3e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0068  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.49 
 
 
480 aa  160  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.552857  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2248  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.14 
 
 
485 aa  158  2e-37  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  7.93902e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1891  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  32.9 
 
 
468 aa  155  1e-36  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  4.60009e-09  hitchhiker  6.38883e-11 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0494  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.15 
 
 
465 aa  154  4e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0964  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.33 
 
 
461 aa  152  1e-35  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0622  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.35 
 
 
456 aa  152  2e-35  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  0.336141  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2138  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.95 
 
 
436 aa  146  6e-34  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.87877  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0093  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.85 
 
 
457 aa  146  7e-34  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  1.67197e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2521  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.76 
 
 
476 aa  146  9e-34  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  decreased coverage  3.32242e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0083  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.05 
 
 
481 aa  145  1e-33  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.24629  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2735  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.15 
 
 
459 aa  145  2e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  9.20326e-09  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3251  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.36 
 
 
344 aa  136  7e-31  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0128413  normal 
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0266  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.48 
 
 
464 aa  135  2e-30  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0185  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.87 
 
 
326 aa  135  2e-30  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0180  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.87 
 
 
326 aa  133  5e-30  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.591688  normal  0.364393 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2187  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  31.58 
 
 
444 aa  132  1e-29  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.150034  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0579  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.05 
 
 
431 aa  132  1e-29  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.992157  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5217  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  26.77 
 
 
444 aa  132  2e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3780  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  34.34 
 
 
336 aa  130  5e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.782786  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3018  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  25.2 
 
 
450 aa  130  5e-29  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0144  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.9 
 
 
472 aa  129  1e-28  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  1.75887e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0511  PP-loop  34.24 
 
 
342 aa  127  4e-28  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0791  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.88 
 
 
458 aa  126  8e-28  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  3.25177e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09873  putative cell-cycle protein  25.85 
 
 
436 aa  125  1e-27  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.55826  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0198  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.08 
 
 
475 aa  125  2e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.723741  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.53 
 
 
455 aa  124  4e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0139  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.35 
 
 
492 aa  122  1e-26  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00237598  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1310  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.73 
 
 
446 aa  121  2e-26  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.615384  normal  0.623923 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1805  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.81 
 
 
439 aa  120  5e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.193318  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1051  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.07 
 
 
442 aa  120  6e-26  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1671  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  28.6 
 
 
455 aa  120  8e-26  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.121682 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0016  tRNA(Ile)-lysidine synthetase, MesJ  24.83 
 
 
422 aa  119  1e-25  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0640  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  22.49 
 
 
456 aa  119  1e-25  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.180708  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4955  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.39 
 
 
324 aa  119  1e-25  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00345657  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2997  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  32.76 
 
 
323 aa  118  2e-25  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2027  ketose-bisphosphate aldolase, class-II  34.03 
 
 
357 aa  117  4e-25  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.481135  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1125  PP-loop  31.11 
 
 
484 aa  117  6e-25  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.00891393  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG2046  hypothetical protein  26.06 
 
 
454 aa  116  1e-24  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  8.39704e-06 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1815  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  21.83 
 
 
450 aa  114  3e-24  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.195712  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1138  hypothetical protein  30.28 
 
 
336 aa  114  4e-24  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.743192  normal  0.140512 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0598  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  29.25 
 
 
334 aa  113  6e-24  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.070597 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0878  cell cycle protein MesJ  33.33 
 
 
433 aa  113  8e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1609  MesJ protein  30.87 
 
 
332 aa  113  9e-24  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.368084 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3762  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  24.95 
 
 
445 aa  112  1e-23  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0801202  hitchhiker  0.00083153 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1097  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.94 
 
 
434 aa  112  1e-23  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1249  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like protein  29.8 
 
 
425 aa  112  1e-23  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.686873 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1618  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  33.67 
 
 
524 aa  112  1e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.0950801 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1004  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  36.23 
 
 
521 aa  111  2e-23  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.925519  normal  0.368038 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0846  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.14 
 
 
469 aa  111  4e-23  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00012547  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0175  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  36.49 
 
 
535 aa  110  7e-23  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2869  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  27.92 
 
 
469 aa  108  1e-22  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD1254  cell cycle protein MesJ, putative  34.03 
 
 
431 aa  108  2e-22  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0357  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30.64 
 
 
414 aa  107  3e-22  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.173835  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2410  tRNA(Ile)-lysidine synthase  26.44 
 
 
443 aa  107  4e-22  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1746  MesJ protein  27.83 
 
 
354 aa  107  4e-22  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0541  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  30 
 
 
336 aa  107  7e-22  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.41194  normal  0.862893 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0077  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  43.94 
 
 
326 aa  105  1e-21  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2362  tRNA(Ile)-lysidine synthetase-like  39.22 
 
 
430 aa  105  1e-21  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.54755  normal  0.628106 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0861  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  35.47 
 
 
442 aa  105  1e-21  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0164  hypothetical protein  34.96 
 
 
525 aa  106  1e-21  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.156481  unclonable  1.74204e-06 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0339  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  31.19 
 
 
419 aa  105  2e-21  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_1198  hypothetical protein  31.05 
 
 
454 aa  105  2e-21  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0013516 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0872  tRNA(Ile)-lysidine synthetase  23.89 
 
 
311 aa  104  3e-21  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.203605  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>