More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2633 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2633  geranylgeranyl reductase  100 
 
 		 421 aa  864    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3751  geranylgeranyl reductase  66.25 
 
 		 406 aa  532  1e-150  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0101048  hitchhiker  0.000524672 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3265  geranylgeranyl reductase  65.74 
 
 		 406 aa  530  1e-149  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0200135 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_4038  geranylgeranyl reductase  44.8 
 
 		 406 aa  343  2.9999999999999997e-93  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.670598  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0385  geranylgeranyl reductase  45.3 
 
 		 457 aa  338  7e-92  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1823  geranylgeranyl reductase  44.83 
 
 		 406 aa  338  8e-92  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.626977  normal  0.601961 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1497  geranylgeranyl reductase  43.89 
 
 		 418 aa  337  2.9999999999999997e-91  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1664  geranylgeranyl reductase  43.6 
 
 		 407 aa  333  3e-90  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0173  geranylgeranyl reductase  43.92 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  decreased coverage  0.0000608264  normal  0.261316 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0178  geranylgeranyl reductase  43.92 
 
 		 405 aa  333  4e-90  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4276  geranylgeranyl reductase  42.68 
 
 		 405 aa  329  6e-89  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_08201  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.54 
 
 		 446 aa  315  7e-85  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08221  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.54 
 
 		 446 aa  314  1.9999999999999998e-84  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1239  geranylgeranyl reductase  42.43 
 
 		 452 aa  313  4.999999999999999e-84  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.214331  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1240  geranylgeranyl reductase  42.18 
 
 		 455 aa  311  2e-83  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.525757 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_16731  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.06 
 
 		 468 aa  310  2e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.652632 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0768  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  40.55 
 
 		 446 aa  310  4e-83  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_08231  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.73 
 
 		 445 aa  299  5e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.891697  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10031  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.19 
 
 		 449 aa  294  2e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.245076  normal  0.232729 
 
 
-
 
NC_011669  PHATRDRAFT_50650  predicted protein  39.12 
 
 		 463 aa  283  5.000000000000001e-75  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_119498  geranylgeranyl reductase  40.05 
 
 		 462 aa  282  7.000000000000001e-75  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0164  geranylgeranyl reductase  41.99 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.620405  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_07961  aromatic-ring hydroxylase (flavoprotein monooxygenase)  41.99 
 
 		 443 aa  281  1e-74  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.253418  normal  0.790247 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0023  geranylgeranyl reductase  37.92 
 
 		 379 aa  255  8e-67  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0136897  hitchhiker  0.00371909 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0023  geranylgeranyl reductase  38.52 
 
 		 379 aa  249  5e-65  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.086385  normal  0.74185 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0022  geranylgeranyl reductase  37.5 
 
 		 380 aa  238  1e-61  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0029  geranylgeranyl reductase  36.95 
 
 		 380 aa  238  2e-61  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0044  geranylgeranyl reductase  37.08 
 
 		 380 aa  234  2.0000000000000002e-60  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0035  geranylgeranyl reductase  35.55 
 
 		 380 aa  233  5e-60  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.916237  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0016  geranylgeranyl reductase  37.19 
 
 		 380 aa  227  3e-58  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.828893  normal  0.344079 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3745  geranylgeranyl reductase  36.08 
 
 		 400 aa  223  4.9999999999999996e-57  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000410516 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3990  geranylgeranyl reductase  35.58 
 
 		 400 aa  217  2.9999999999999998e-55  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.407707  normal  0.239363 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0277  geranylgeranyl hydrogenase  34.82 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1920  geranylgeranyl reductase  34.82 
 
 		 394 aa  205  1e-51  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.571775 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1721  geranylgeranyl reductase  35.08 
 
 		 401 aa  202  9.999999999999999e-51  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.889725  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3528  geranylgeranyl reductase  34.9 
 
 		 394 aa  200  3.9999999999999996e-50  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  0.673829 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1602  geranylgeranyl reductase  36.19 
 
 		 405 aa  199  6e-50  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.157827  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1018  geranylgeranyl reductase  34.82 
 
 		 394 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.175097  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1304  geranylgeranyl reductase  33.78 
 
 		 400 aa  198  2.0000000000000003e-49  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3712  geranylgeranyl reductase  35.87 
 
 		 402 aa  189  8e-47  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.407055  hitchhiker  0.000489008 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_1854  geranylgeranyl reductase  34.2 
 
 		 408 aa  183  5.0000000000000004e-45  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0189229 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2063  geranylgeranyl reductase  34.81 
 
 		 399 aa  181  2e-44  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.104109 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0167  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 393 aa  180  4.999999999999999e-44  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6424  geranylgeranyl reductase  32.97 
 
 		 403 aa  178  2e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5367  geranylgeranyl reductase  32.8 
 
 		 397 aa  177  3e-43  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  0.707854 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_5289  geranylgeranyl reductase  33.16 
 
 		 397 aa  171  3e-41  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.683475  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4822  geranylgeranyl reductase  33.16 
 
 		 397 aa  170  4e-41  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.47928  normal  0.0333239 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2779  geranylgeranyl reductase  34.15 
 
 		 330 aa  164  3e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0629  geranylgeranyl reductase  34.14 
 
 		 413 aa  161  2e-38  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.978932  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1268  geranylgeranyl reductase  33.12 
 
 		 375 aa  122  1.9999999999999998e-26  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0172  bacteriochlorophyll synthase  30.23 
 
 		 396 aa  113  8.000000000000001e-24  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.935683 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1375  geranylgeranyl reductase  28.86 
 
 		 390 aa  108  1e-22  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.545102  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0808  geranylgeranyl reductase  29.66 
 
 		 378 aa  108  2e-22  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000424296 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2205  geranylgeranyl reductase  33.33 
 
 		 363 aa  103  4e-21  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1386  geranylgeranyl reductase  28.7 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1250  geranylgeranyl reductase  26.91 
 
 		 390 aa  103  5e-21  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.375977  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1307  geranylgeranyl reductase  27.42 
 
 		 391 aa  102  1e-20  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.398981  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1077  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 399 aa  101  2e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0240225  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1602  hypothetical protein  24.71 
 
 		 387 aa  100  4e-20  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0522  geranylgeranyl reductase  29.15 
 
 		 390 aa  100  4e-20  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0369  geranylgeranyl reductase  28.01 
 
 		 408 aa  100  5e-20  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0683691  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0864  geranylgeranyl reductase  24.4 
 
 		 396 aa  99.4  1e-19  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.0000799674  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0879  geranylgeranyl reductase  27.83 
 
 		 370 aa  98.6  2e-19  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.917387  normal  0.163245 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0444  geranylgeranyl reductase  31.66 
 
 		 341 aa  97.1  5e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2824  geranylgeranyl reductase  30.79 
 
 		 379 aa  95.9  1e-18  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1193  geranylgeranyl reductase  28.57 
 
 		 362 aa  93.6  6e-18  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0917874  hitchhiker  0.0000705466 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0303  geranylgeranyl reductase  28.95 
 
 		 396 aa  93.2  7e-18  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.411579  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0643  geranylgeranyl reductase  30.98 
 
 		 360 aa  93.2  7e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.770726  normal  0.124546 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0660  geranylgeranyl reductase  33.79 
 
 		 406 aa  92  2e-17  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.0877902 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0578  geranylgeranyl reductase  27.68 
 
 		 395 aa  91.3  3e-17  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0279  geranylgeranyl reductase  29.43 
 
 		 424 aa  91.3  3e-17  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.615542  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0133  geranylgeranyl reductase  28.43 
 
 		 368 aa  91.3  3e-17  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1603  geranylgeranyl reductase  27.51 
 
 		 374 aa  89  2e-16  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0064  geranylgeranyl reductase  28.83 
 
 		 373 aa  88.2  2e-16  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.535363  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0962  geranylgeranyl reductase  27.87 
 
 		 399 aa  87.4  4e-16  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.493163  normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0044  geranylgeranyl reductase  24.93 
 
 		 391 aa  87  6e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.345503  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3777  geranylgeranyl reductase  28.18 
 
 		 368 aa  86.3  8e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.218559 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0671  geranylgeranyl reductase  29.55 
 
 		 381 aa  86.7  8e-16  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.421353  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1199  geranylgeranyl reductase  28.13 
 
 		 423 aa  86.3  0.000000000000001  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1134  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 389 aa  84.7  0.000000000000003  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.719323  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_2536  geranylgeranyl reductase  30.35 
 
 		 382 aa  84  0.000000000000004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000189662 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2696  geranylgeranyl reductase, plantal and  29.59 
 
 		 435 aa  83.2  0.000000000000008  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0506  geranylgeranyl reductase  28.8 
 
 		 398 aa  83.2  0.000000000000008  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6208  monooxygenase FAD-binding protein  29.71 
 
 		 403 aa  83.2  0.000000000000009  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  decreased coverage  0.00171157  normal  0.384261 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1711  geranylgeranyl reductase  29.24 
 
 		 365 aa  82.4  0.00000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1330  geranylgeranyl reductase  27.27 
 
 		 376 aa  81.6  0.00000000000002  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1604  geranylgeranyl reductase  27.22 
 
 		 391 aa  82  0.00000000000002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0630  geranylgeranyl reductase  28.53 
 
 		 373 aa  82.4  0.00000000000002  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.685888 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5969  geranylgeranyl reductase  29.47 
 
 		 409 aa  81.6  0.00000000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.365894  normal  0.508891 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1308  geranylgeranyl reductase  27.63 
 
 		 406 aa  82  0.00000000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0266  geranylgeranyl reductase  30.35 
 
 		 445 aa  82  0.00000000000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.224418  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0718  geranylgeranyl reductase  23.71 
 
 		 387 aa  81.6  0.00000000000002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3481  geranylgeranyl reductase  27.78 
 
 		 374 aa  82  0.00000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8053  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 423 aa  80.9  0.00000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.661392 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1945  geranylgeranyl reductase  26.89 
 
 		 398 aa  80.9  0.00000000000004  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0501  geranylgeranyl reductase  27.88 
 
 		 376 aa  80.1  0.00000000000007  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0714  geranylgeranyl reductase  26.44 
 
 		 386 aa  79.3  0.0000000000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_05841  NAD binding site  24.48 
 
 		 377 aa  79.3  0.0000000000001  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.188024  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3043  geranylgeranyl reductase  28.12 
 
 		 376 aa  77.8  0.0000000000003  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.483009 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1123  geranylgeranyl reductase  24.14 
 
 		 402 aa  78.2  0.0000000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>