More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2589 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2589  DNA polymerase III, delta prime subunit  100 
 
 
344 aa  692  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  2.88191e-06 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4275  DNA polymerase III, delta prime subunit  60.41 
 
 
354 aa  390  1e-107  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0379488 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3588  DNA polymerase III, delta prime subunit  59.36 
 
 
351 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0791  DNA polymerase III, delta prime subunit  50.59 
 
 
340 aa  312  6e-84  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_476  DNA-directed DNA polymerase, delta prime subunit  34.62 
 
 
339 aa  201  1e-50  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0511  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.43 
 
 
343 aa  193  4e-48  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0535  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.91 
 
 
339 aa  190  3e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1664  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.93 
 
 
327 aa  184  2e-45  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.988179  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3154  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.82 
 
 
320 aa  181  1e-44  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  5.90012e-05  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1360  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.62 
 
 
345 aa  177  2e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1947  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
331 aa  172  5e-42  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.497646  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1692  DNA polymerase III, gamma/tau subunits  34.03 
 
 
321 aa  170  3e-41  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  1.00228e-10  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20360  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.84 
 
 
326 aa  170  3e-41  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3913  DNA polymerase III, delta prime subunit  30.21 
 
 
330 aa  167  4e-40  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0056  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.65 
 
 
324 aa  165  8e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.907797  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0060  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.14 
 
 
335 aa  164  2e-39  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0492451  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2230  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.82 
 
 
323 aa  164  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.688016  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2319  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.12 
 
 
318 aa  162  7e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.247884  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2644  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.34 
 
 
363 aa  160  2e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2548  DNA polymerase III, delta prime subunit  36.62 
 
 
363 aa  161  2e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.017144  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2105  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.67 
 
 
329 aa  158  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000107011  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0040  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 
327 aa  150  3e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5280  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0029  DNA polymerase III subunit delta'  29.22 
 
 
327 aa  150  5e-35  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0036  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 
327 aa  149  5e-35  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.661417  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0101  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.41 
 
 
358 aa  148  2e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.307739  unclonable  3.42072e-10 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1351  DNA-directed DNA polymerase  30.9 
 
 
365 aa  147  4e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.916733  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0026  DNA polymerase III subunit delta'  29.22 
 
 
327 aa  146  4e-34  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0028  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 
327 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0030  DNA polymerase III subunit delta'  29.52 
 
 
327 aa  146  5e-34  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.454552  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2254  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.51 
 
 
391 aa  145  7e-34  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0268836  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.22 
 
 
327 aa  145  1e-33  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0036  DNA polymerase III subunit delta'  29.22 
 
 
327 aa  145  1e-33  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.22 
 
 
327 aa  144  2e-33  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.637086  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1312  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.49 
 
 
370 aa  141  1e-32  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0789  DNA-directed DNA polymerase  29.54 
 
 
326 aa  141  2e-32  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2119  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.24 
 
 
320 aa  139  7e-32  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.000331733  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0026  DNA polymerase III subunit delta'  28.83 
 
 
327 aa  139  7e-32  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0038  DNA-directed DNA polymerase  33.18 
 
 
320 aa  139  9e-32  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1058  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.53 
 
 
320 aa  138  2e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.54633e-15 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0515  DNA-directed DNA polymerase  27.71 
 
 
320 aa  137  3e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0983279  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_3206  DNA polymerase III, delta prime subunit  33.33 
 
 
332 aa  136  5e-31  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3205  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.94 
 
 
320 aa  136  5e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0191854  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0037  DNA polymerase III, delta prime subunit  38.43 
 
 
338 aa  135  1e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.418255  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0027  DNA polymerase III subunit delta'  29.39 
 
 
337 aa  134  2e-30  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0159  DNA polymerase III, delta prime subunit  26.98 
 
 
322 aa  133  5e-30  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1091  DNA-directed DNA polymerase  30.23 
 
 
389 aa  131  2e-29  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011775  BCG9842_0093  DNA polymerase III subunit delta'  28.66 
 
 
326 aa  130  3e-29  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1146  DNA polymerase III, delta prime subunit  27.86 
 
 
383 aa  129  5e-29  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.651472  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0042  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.96 
 
 
320 aa  127  2e-28  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0152578  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0156  DNA polymerase III, delta prime subunit  32.08 
 
 
335 aa  128  2e-28  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.986059 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0025  DNA polymerase III subunit delta'  40.11 
 
 
330 aa  125  7e-28  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0277  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.68 
 
 
517 aa  124  2e-27  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.433516  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09200  hypothetical protein  28.37 
 
 
382 aa  124  2e-27  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal  0.0621212 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0245  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.6 
 
 
478 aa  123  4e-27  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0243  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  38.6 
 
 
478 aa  123  4e-27  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0389  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.4 
 
 
485 aa  121  2e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0015  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  33.8 
 
 
589 aa  119  5e-26  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00819086  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0030  DNA-directed DNA polymerase  34.59 
 
 
499 aa  118  1e-25  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00564849  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0027  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.61 
 
 
589 aa  117  4e-25  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  1.54817e-05 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0031  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.22 
 
 
447 aa  115  9e-25  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  decreased coverage  3.24435e-06  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0033  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  25.68 
 
 
518 aa  115  1e-24  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.168879  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1869  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.83 
 
 
343 aa  114  2e-24  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0401  DNA polymerase III delta' subunit  32.27 
 
 
312 aa  115  2e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_3026  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.98 
 
 
641 aa  113  4e-24  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal  0.196255 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1367  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.38 
 
 
501 aa  112  7e-24  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_0971  DNA polymerase III subunit delta'  41.78 
 
 
322 aa  112  8e-24  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0387  DNA polymerase III, delta prime subunit  29.58 
 
 
385 aa  112  1e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.210264  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0332  DNA polymerase III subunit delta'  25.45 
 
 
337 aa  112  1e-23  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_16180  DNA polymerase III, gamma/tau subunit  29.06 
 
 
373 aa  110  3e-23  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  decreased coverage  1.4932e-08 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1940  DNA polymerase III subunit delta'  41.82 
 
 
344 aa  110  3e-23  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.990114  normal  0.368252 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0055  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.71 
 
 
547 aa  110  4e-23  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6483  DNA-directed DNA polymerase  37.75 
 
 
298 aa  110  4e-23  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0052  DNA polymerase III subunits gamma and tau  30.71 
 
 
547 aa  110  4e-23  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1801  DNA polymerase III subunit delta'  40 
 
 
342 aa  109  6e-23  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.500907  normal  0.955081 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0016  DNA polymerase III subunits gamma and tau  26.69 
 
 
559 aa  109  7e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0043  DNA-directed DNA polymerase  40.24 
 
 
284 aa  109  8e-23  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  8.56784e-05 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01097  DNA polymerase III subunits gamma and tau  32.97 
 
 
930 aa  109  9e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0856876  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_02011  DNA polymerase III subunit delta'  30.4 
 
 
319 aa  109  9e-23  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.847421 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2144  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.49 
 
 
547 aa  109  9e-23  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00119695  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2451  DNA polymerase III, delta prime subunit  40.94 
 
 
347 aa  108  1e-22  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.632704  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0194  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.48 
 
 
614 aa  107  2e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_2897  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  34.97 
 
 
914 aa  108  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.579528  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0606  DNA-directed DNA polymerase  24.8 
 
 
390 aa  107  2e-22  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.063463  decreased coverage  0.0031746 
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3592  DNA polymerase III subunit delta'  37.39 
 
 
373 aa  107  2e-22  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.57935 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2135  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  32.07 
 
 
737 aa  107  3e-22  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1386  DNA polymerase III, delta prime subunit  28.33 
 
 
368 aa  107  3e-22  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.128473  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2608  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  30.2 
 
 
610 aa  107  3e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1460  DNA polymerase III, delta prime subunit  35.07 
 
 
320 aa  107  3e-22  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3651  DNA polymerase III gamma/tau subunits-like protein  26.09 
 
 
382 aa  107  3e-22  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00198152  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0042  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  28.36 
 
 
540 aa  107  4e-22  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000215305  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02329  DNA polymerase III subunit delta  35.6 
 
 
295 aa  107  4e-22  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1435  DNA polymerase III subunit delta'  37.84 
 
 
337 aa  106  5e-22  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1574  DNA polymerase III subunit delta'  33.33 
 
 
287 aa  106  5e-22  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1963  DNA polymerase III subunit delta'  35.62 
 
 
320 aa  106  7e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  decreased coverage  0.00141399  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0512  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.22 
 
 
565 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1702  DNA polymerase III subunit delta'  37.88 
 
 
374 aa  106  8e-22  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.468151  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0499  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  31.22 
 
 
565 aa  105  8e-22  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0810383  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2444  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  36.16 
 
 
567 aa  105  1e-21  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.453017  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_03320  putative DNA polymerase III, delta subunit  26.23 
 
 
390 aa  105  1e-21  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>