More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2555 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2555  anti-sigma-factor antagonist  100 
 
 
249 aa  508  1e-143  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2161  anti-sigma-factor antagonist  54.25 
 
 
250 aa  271  7e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1195  anti-sigma-factor antagonist  53.63 
 
 
269 aa  265  7e-70  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.123525  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1422  anti-sigma-factor antagonist  48.36 
 
 
250 aa  225  4e-58  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2331  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.31 
 
 
151 aa  94.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.571842  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1929  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  42.52 
 
 
139 aa  92.4  5e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0887571  normal  0.148865 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0750  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.82 
 
 
141 aa  91.7  1e-17  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.194451  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_4032  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.59 
 
 
155 aa  89.4  5e-17  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1160  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.08 
 
 
138 aa  88.6  8e-17  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.620968  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1666  sensor histidine kinase  37.84 
 
 
142 aa  87.4  2e-16  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2469  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.29 
 
 
135 aa  87.4  2e-16  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_5013  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.13 
 
 
141 aa  87.4  2e-16  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0933  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  40.2 
 
 
142 aa  85.1  0.000000000000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0815302  normal  0.189071 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1525  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.92 
 
 
141 aa  81.6  0.00000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0063  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  31.82 
 
 
140 aa  80.5  0.00000000000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0713993 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2664  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  37.12 
 
 
139 aa  80.9  0.00000000000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2556  anti-sigma-factor antagonist  39.81 
 
 
116 aa  79.7  0.00000000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1159  anti-sigma-factor antagonist  37.74 
 
 
121 aa  79.3  0.00000000000005  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.562047  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2160  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 
116 aa  79.3  0.00000000000005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1040  putative anti-sigma regulatory factor (serine/threonine protein kinase)  33.59 
 
 
143 aa  79.3  0.00000000000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.469899  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0751  anti-sigma-factor antagonist  42.55 
 
 
111 aa  78.6  0.00000000000009  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0517631  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2857  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  39.45 
 
 
136 aa  78.6  0.00000000000009  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0863  putative anti-sigma regulatory factor  32.82 
 
 
143 aa  77.8  0.0000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.286315 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2467  anti-sigma-factor antagonist  35.24 
 
 
118 aa  77.4  0.0000000000002  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1795  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  39.22 
 
 
110 aa  77  0.0000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1624  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.46 
 
 
154 aa  77  0.0000000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1663  anti-anti-sigma factor family protein  37.76 
 
 
108 aa  76.3  0.0000000000004  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.88575  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1194  anti-sigma-factor antagonist  38.89 
 
 
116 aa  76.3  0.0000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.179967  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2462  anti-sigma-factor antagonist  34.91 
 
 
142 aa  75.1  0.000000000001  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0862  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.11 
 
 
112 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.895218  normal  0.283894 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1039  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  37.11 
 
 
112 aa  74.7  0.000000000001  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.305591  normal  0.536702 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0494  putative anti-anti-sigma regulatory factor  34.26 
 
 
116 aa  74.3  0.000000000002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.937687 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4441  protein serine phosphatase with GAF(s) sensor(s)  34.82 
 
 
792 aa  74.3  0.000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.794262  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3451  anti-sigma-factor antagonist  37.76 
 
 
110 aa  73.9  0.000000000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2330  anti-sigma-factor antagonist  34.62 
 
 
124 aa  73.6  0.000000000003  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2452  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.09 
 
 
147 aa  73.6  0.000000000003  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3500  anti-sigma regulatory factor  32.69 
 
 
133 aa  72.8  0.000000000004  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.314034  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1997  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  32.3 
 
 
495 aa  73.2  0.000000000004  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_1794  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.23 
 
 
134 aa  72.8  0.000000000005  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1930  anti-sigma-factor antagonist  41.44 
 
 
110 aa  72  0.000000000009  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0790604  normal  0.266518 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3034  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  38.52 
 
 
155 aa  71.6  0.00000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00000275353 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0122  anti-sigma factor antagonist  36 
 
 
117 aa  71.6  0.00000000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.672861  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0700  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  31.82 
 
 
136 aa  71.6  0.00000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1085  serine-protein kinase RsbW  31.25 
 
 
160 aa  70.9  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0927  serine-protein kinase RsbW  30.77 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1924  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.12 
 
 
492 aa  70.9  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.184744 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0991  serine-protein kinase RsbW  30.77 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1067  serine-protein kinase RsbW  30.77 
 
 
160 aa  70.5  0.00000000002  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  4.13388e-38 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4302  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  39.18 
 
 
113 aa  70.1  0.00000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5320  anti-sigma-factor antagonist  36 
 
 
115 aa  70.1  0.00000000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.232831 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1032  serine-protein kinase RsbW  30.07 
 
 
160 aa  70.1  0.00000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2083  anti-anti-sigma factor  31.43 
 
 
183 aa  69.7  0.00000000004  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.118848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2143  anti-sigma-factor antagonist  40.2 
 
 
170 aa  69.7  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00880865  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5360  anti-sigma-factor antagonist  41.41 
 
 
138 aa  70.1  0.00000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4828  anti-sigma-factor antagonist  34.65 
 
 
117 aa  70.1  0.00000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0221  anti-sigma-factor antagonist  34.31 
 
 
116 aa  69.7  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1178  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
109 aa  69.3  0.00000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  decreased coverage  0.0000418281  normal  0.248441 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0912  serine-protein kinase RsbW  30.56 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000281084  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0895  serine-protein kinase RsbW  30.56 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0062  anti-sigma-factor antagonist domain-containing protein  36.46 
 
 
116 aa  69.3  0.00000000005  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.0726506 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2515  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  35.04 
 
 
148 aa  69.3  0.00000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.538602  normal  0.204677 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1158  serine-protein kinase RsbW  30.77 
 
 
160 aa  69.3  0.00000000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1975  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 
113 aa  68.6  0.00000000008  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.441965  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0902  serine-protein kinase RsbW  30.07 
 
 
160 aa  68.2  0.0000000001  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.954937  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0312  anti-sigma-factor antagonist  39.18 
 
 
113 aa  68.2  0.0000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4271  serine-protein kinase RsbW  30.07 
 
 
160 aa  67.8  0.0000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0304057  hitchhiker  0.00223112 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1526  anti-sigma-factor antagonist  39.08 
 
 
111 aa  67.4  0.0000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4167  cyclic nucleotide-binding protein  28.03 
 
 
570 aa  67  0.0000000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8450  anti-sigma-factor antagonist  37.11 
 
 
113 aa  67  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000560985 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2419  cyclic nucleotide-binding protein  26.32 
 
 
563 aa  66.6  0.0000000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.871595  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1678  serine-protein kinase RsbW  33.33 
 
 
159 aa  66.2  0.0000000005  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03913  hypothetical protein  28.57 
 
 
143 aa  65.9  0.0000000006  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1874  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  29.46 
 
 
137 aa  65.9  0.0000000006  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.122382  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2317  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.73 
 
 
155 aa  65.9  0.0000000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.128595  normal  0.13523 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2436  anti-sigma-factor antagonist  36.27 
 
 
111 aa  65.9  0.0000000006  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  hitchhiker  0.000162384  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2440  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 
111 aa  65.5  0.0000000009  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2661  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  36.27 
 
 
151 aa  65.5  0.0000000009  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0789133  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1427  anti-anti-sigma factor  36.79 
 
 
111 aa  65.1  0.000000001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.473908  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1313  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.83 
 
 
135 aa  65.1  0.000000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0067  anti-anti-sigma factor family protein  31.19 
 
 
123 aa  65.1  0.000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0702  anti-sigma-factor antagonist  32.04 
 
 
110 aa  65.1  0.000000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3767  anti-sigma-factor antagonist  31.25 
 
 
117 aa  64.7  0.000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0751293  unclonable  0.00000923115 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2982  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.4 
 
 
138 aa  65.1  0.000000001  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2418  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
111 aa  65.1  0.000000001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.217831  normal  0.711574 
 
 
-
 
NC_002620  TC0707  anti-anti-sigma factor  24.35 
 
 
116 aa  63.9  0.000000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.0434926  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0483  anti-sigma-factor antagonist  37.36 
 
 
122 aa  64.3  0.000000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0339513  hitchhiker  0.00320787 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2113  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  30.3 
 
 
137 aa  64.3  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1827  anti-sigma-factor antagonist  39.36 
 
 
111 aa  63.9  0.000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1492  anti-sigma-factor antagonist  39.22 
 
 
134 aa  64.3  0.000000002  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1117  anti-sigma-factor antagonist  32.69 
 
 
117 aa  64.3  0.000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.113154  normal  0.94353 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5267  anti-sigma-factor antagonist  38.95 
 
 
118 aa  64.3  0.000000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_2983  anti-sigma-factor antagonist  35.71 
 
 
111 aa  64.3  0.000000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0872  anti-sigma-factor antagonist  33.33 
 
 
120 aa  63.5  0.000000003  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  34.55 
 
 
143 aa  63.5  0.000000003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1452  hypothetical protein  29.77 
 
 
777 aa  63.5  0.000000003  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0720  anti-anti-sigma regulatory factor, SpoIIAA  29.17 
 
 
110 aa  63.5  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0371  anti-anti-sigma factor  37.37 
 
 
112 aa  63.9  0.000000003  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.117703  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5092  anti-sigma-factor antagonist  39.58 
 
 
108 aa  63.2  0.000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.511097  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0065  putative anti-sigma regulatory factor, serine/threonine protein kinase  33.67 
 
 
146 aa  63.2  0.000000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.459983  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0837  RsbW protein, putative  31.39 
 
 
152 aa  62.8  0.000000005  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>