More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2539 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2539  transcriptional regulator, ArsR family  100 
 
 
254 aa  513  1e-144  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.000120354  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2316  ArsR family transcriptional regulator  58.87 
 
 
255 aa  248  5e-65  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.137023  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1228  protein tyrosine phosphatase  55.9 
 
 
254 aa  235  5.0000000000000005e-61  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.699958 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1227  protein tyrosine phosphatase  40.08 
 
 
258 aa  154  9e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.693149 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2315  ArsR family transcriptional regulator  36.96 
 
 
258 aa  145  6e-34  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.911593  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3330  ArsR family transcriptional regulator  38.43 
 
 
257 aa  137  2e-31  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1934  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  55.47 
 
 
138 aa  130  1.0000000000000001e-29  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0335959  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2803  ArsR family transcriptional regulator  39.75 
 
 
269 aa  129  3e-29  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2667  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  48.82 
 
 
143 aa  129  6e-29  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2957  protein tyrosine phosphatase  46.32 
 
 
150 aa  124  2e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.252891  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0526  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.97 
 
 
152 aa  123  3e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0874  protein tyrosine phosphatase  48.36 
 
 
143 aa  123  3e-27  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.0764045  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2878  protein tyrosine phosphatase  48.84 
 
 
139 aa  121  9e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1954  protein tyrosine phosphatase  40.46 
 
 
150 aa  119  4.9999999999999996e-26  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.735313  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2571  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.15 
 
 
137 aa  118  7.999999999999999e-26  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0537  arsenate reductase (thioredoxin)  43.51 
 
 
164 aa  118  9.999999999999999e-26  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0375  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  47.58 
 
 
140 aa  116  3.9999999999999997e-25  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1118  protein tyrosine phosphatase  44.36 
 
 
144 aa  111  1.0000000000000001e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.176181 
 
 
-
 
NC_007960  Nham_4431  ArsR family transcriptional regulator  33.33 
 
 
291 aa  111  1.0000000000000001e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1911  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.28 
 
 
139 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  hitchhiker  0.00000024584  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1896  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.94 
 
 
138 aa  110  3e-23  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0515546  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0397  protein tyrosine phosphatase  42.75 
 
 
142 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  0.14  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1929  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  41.46 
 
 
137 aa  109  4.0000000000000004e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.893973  normal  0.121464 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3324  arsenate reductase  41.73 
 
 
139 aa  108  9.000000000000001e-23  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2345  arsenate reductase, putative  45.19 
 
 
165 aa  108  1e-22  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0933  protein tyrosine phosphatase  44.12 
 
 
141 aa  107  2e-22  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000564011  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0652  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  44.44 
 
 
165 aa  107  2e-22  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.0644228 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3397  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
174 aa  107  2e-22  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1414  protein tyrosine phosphatase  35.34 
 
 
145 aa  106  3e-22  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0091  protein tyrosine phosphatase  46.51 
 
 
143 aa  105  6e-22  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0489  protein tyrosine phosphatase  44.44 
 
 
165 aa  105  9e-22  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2033  arsenate reductase (thioredoxin)  41.13 
 
 
132 aa  104  1e-21  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.00780291  n/a   
 
 
-
 
NC_007490  RSP_4210  ArsR family transcriptional regulator  32.61 
 
 
270 aa  104  1e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.54133  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2317  protein tyrosine phosphatase  43.07 
 
 
162 aa  104  2e-21  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.29117  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0597  protein tyrosine phosphatase  41.48 
 
 
142 aa  104  2e-21  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2712  protein tyrosine phosphatase  43.51 
 
 
140 aa  103  2e-21  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0105  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  37.5 
 
 
226 aa  103  3e-21  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2770  protein tyrosine phosphatase  38.35 
 
 
143 aa  102  5e-21  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2123  arsenate reductase  41.91 
 
 
158 aa  102  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0020679  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1984  protein tyrosine phosphatase  42.96 
 
 
177 aa  102  6e-21  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.565539  normal  0.702205 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1772  protein-tyrosine-phosphatase  40.41 
 
 
148 aa  102  7e-21  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000508591  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3958  protein tyrosine phosphatase  31 
 
 
295 aa  102  7e-21  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.387678 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1111  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
146 aa  102  8e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.660176  normal  0.527551 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1473  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 
142 aa  101  1e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2189  arsenate reductase  41.91 
 
 
158 aa  101  1e-20  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3939  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  43.7 
 
 
141 aa  101  1e-20  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.164667  normal  0.499641 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2022  protein tyrosine phosphatase  45.74 
 
 
142 aa  101  1e-20  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.571189  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1660  protein tyrosine phosphatase  35.11 
 
 
225 aa  100  2e-20  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0913425  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4903  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
224 aa  100  2e-20  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008496  LEUM_A11  protein-tyrosine-phosphatase  38.93 
 
 
138 aa  100  2e-20  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.195973  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1734  protein tyrosine phosphatase  43.97 
 
 
127 aa  100  3e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1281  protein tyrosine phosphatase  42.34 
 
 
164 aa  100  3e-20  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.395414  normal 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1703  protein tyrosine phosphatase  43.65 
 
 
145 aa  99.8  3e-20  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal  0.893409 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6113  protein tyrosine phosphatase  35.88 
 
 
138 aa  99.8  3e-20  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4520  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
224 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0848  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
137 aa  100  3e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4607  ArsR family transcriptional regulator  35.65 
 
 
224 aa  100  3e-20  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1387  arsenate reductase, putative  45 
 
 
165 aa  99.8  4e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.782064  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1450  ArsR family transcriptional regulator  30.04 
 
 
317 aa  99.8  4e-20  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2863  protein tyrosine phosphatase  40.71 
 
 
151 aa  99.8  4e-20  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0909  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  38.93 
 
 
137 aa  99.8  4e-20  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.525567  normal  0.101664 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1644  protein tyrosine phosphatase  39.57 
 
 
144 aa  99.4  5e-20  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.644428 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2820  protein tyrosine phosphatase  41.18 
 
 
143 aa  99.4  5e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_30690  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  41.48 
 
 
164 aa  99.4  5e-20  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.227679  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2139  protein tyrosine phosphatase  43.48 
 
 
179 aa  99.4  5e-20  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012849  Rpic12D_5345  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  40.58 
 
 
164 aa  99  6e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.807351  normal  0.94085 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0465  protein tyrosine phosphatase  41.86 
 
 
142 aa  98.6  9e-20  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000366362  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1821  protein tyrosine phosphatase  41.3 
 
 
164 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.0699312 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1852  transcriptional regulator, ArsR family  30.08 
 
 
298 aa  98.2  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.012438  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1493  ArsR family transcriptional regulator  31.94 
 
 
284 aa  97.8  1e-19  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  normal  0.477239 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1210  arsenate reductase (thioredoxin)  40 
 
 
144 aa  98.2  1e-19  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2881  protein tyrosine phosphatase  35.71 
 
 
145 aa  98.2  1e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2828  hypothetical protein  42.03 
 
 
165 aa  97.4  2e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3147  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  33.59 
 
 
139 aa  97.8  2e-19  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.942281  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0218  protein tyrosine phosphatase  41.13 
 
 
143 aa  97.4  2e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3601  protein tyrosine phosphatase  37.32 
 
 
148 aa  97.4  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.458199 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1410  protein tyrosine phosphatase  31.88 
 
 
270 aa  97.4  2e-19  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.315605  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0827  Protein-tyrosine phosphatase low molecular weight  37.88 
 
 
154 aa  97.4  2e-19  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4054  protein tyrosine phosphatase  40.43 
 
 
175 aa  96.7  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.577516 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3054  protein tyrosine phosphatase  39.86 
 
 
165 aa  97.1  3e-19  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.570594 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5093  protein tyrosine phosphatase  34.67 
 
 
225 aa  97.1  3e-19  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1928  arsenate reductase  38.97 
 
 
162 aa  96.3  4e-19  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.245596  unclonable  0.00000025949 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1440  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
147 aa  96.3  4e-19  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0918  protein tyrosine phosphatase  40.88 
 
 
144 aa  95.9  5e-19  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1047  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.72 
 
 
175 aa  95.9  6e-19  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1393  protein tyrosine phosphatase  41.04 
 
 
148 aa  95.9  6e-19  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0172641  normal  0.707508 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1425  protein tyrosine phosphatase  44.19 
 
 
141 aa  95.5  7e-19  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.694751  normal 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0381  protein tyrosine phosphatase  39.85 
 
 
144 aa  95.1  9e-19  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  hitchhiker  0.00670954  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3780  protein tyrosine phosphatase  35.14 
 
 
167 aa  95.1  9e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0223758  normal 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2793  protein tyrosine phosphatase  40 
 
 
144 aa  95.1  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1452  Protein-tyrosine phosphatase, low molecular weight  39.68 
 
 
157 aa  94  2e-18  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00327918  normal  0.121343 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00628  arsenate reductase  39.58 
 
 
176 aa  93.6  2e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.102158  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1707  arsenate reductase  38.46 
 
 
134 aa  94  2e-18  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0993958  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1253  transcriptional regulator  29.62 
 
 
287 aa  93.6  3e-18  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.0585398  normal  0.522722 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_25910  Low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  39.71 
 
 
156 aa  93.6  3e-18  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5707  protein tyrosine phosphatase  39.13 
 
 
164 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.598358  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1909  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  40 
 
 
175 aa  93.6  3e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4019  protein tyrosine phosphatase  41.27 
 
 
151 aa  92  7e-18  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1502  low molecular weight phosphotyrosine protein phosphatase  36.76 
 
 
156 aa  92  8e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.240975  normal 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3344  transcriptional regulator, MarR family  35.2 
 
 
218 aa  91.7  1e-17  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.670275  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>