More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2504 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2504  peptidyl-tRNA hydrolase  100 
 
 
188 aa  382  1e-105  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00873234  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1729  peptidyl-tRNA hydrolase  74.19 
 
 
214 aa  279  2e-74  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1001  peptidyl-tRNA hydrolase  72.04 
 
 
217 aa  278  5e-74  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0310  aminoacyl-tRNA hydrolase  52.69 
 
 
206 aa  214  7e-55  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3516  Aminoacyl-tRNA hydrolase  53.19 
 
 
213 aa  199  3e-50  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0382669  normal  0.238994 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2631  peptidyl-tRNA hydrolase  52.15 
 
 
196 aa  194  5.000000000000001e-49  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21210  Aminoacyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 
187 aa  194  9e-49  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000292391  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0782  peptidyl-tRNA hydrolase  49.19 
 
 
195 aa  192  3e-48  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.229787 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0209  peptidyl-tRNA hydrolase  51.06 
 
 
196 aa  190  9e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0111  aminoacyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
191 aa  189  2.9999999999999997e-47  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.212396  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3951  peptidyl-tRNA hydrolase  48.13 
 
 
197 aa  187  5.999999999999999e-47  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.72777  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3708  peptidyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 
202 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.219994  normal  0.225382 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3654  Aminoacyl-tRNA hydrolase  47.85 
 
 
202 aa  187  8e-47  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0048  peptidyl-tRNA hydrolase  48.92 
 
 
186 aa  187  1e-46  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0119  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 
185 aa  186  2e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000476771  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 
186 aa  185  3e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
207 aa  184  6e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5260  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
207 aa  184  7e-46  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0049  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
210 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0050  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0046  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0060  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0056  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0050  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
186 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0057  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
207 aa  183  1.0000000000000001e-45  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2414  peptidyl-tRNA hydrolase  53.26 
 
 
194 aa  182  2.0000000000000003e-45  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.294546  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2870  peptidyl-tRNA hydrolase  47.4 
 
 
219 aa  181  4.0000000000000006e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0478866 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3091  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
189 aa  180  9.000000000000001e-45  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0046  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 
186 aa  180  1e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4538  peptidyl-tRNA hydrolase  48.39 
 
 
228 aa  180  1e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0234872  normal  0.341746 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3152  peptidyl-tRNA hydrolase  48.11 
 
 
209 aa  179  2e-44  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.936943  normal  0.265918 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0070  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
183 aa  178  4e-44  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0140  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 
190 aa  177  4.999999999999999e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.290971  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0591  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
184 aa  177  5.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.00307137  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0171  peptidyl-tRNA hydrolase  47.34 
 
 
198 aa  177  7e-44  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1073  peptidyl-tRNA hydrolase  48.94 
 
 
199 aa  177  8e-44  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2073  peptidyl-tRNA hydrolase  50.54 
 
 
195 aa  177  1e-43  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0417  peptidyl-tRNA hydrolase  47.78 
 
 
213 aa  176  1e-43  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0968  peptidyl-tRNA hydrolase  45.21 
 
 
195 aa  176  2e-43  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_0006  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
189 aa  176  2e-43  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4490  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 
210 aa  175  3e-43  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0602  peptidyl-tRNA hydrolase  44.39 
 
 
180 aa  175  4e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000903861  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2808  peptidyl-tRNA hydrolase  41.4 
 
 
188 aa  174  5e-43  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1290  aminoacyl-tRNA hydrolase  46.74 
 
 
187 aa  174  5e-43  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0071  aminoacyl-tRNA hydrolase  50.27 
 
 
195 aa  174  7e-43  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.287226  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0227  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 
208 aa  174  7e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal  0.353061 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0653  peptidyl-tRNA hydrolase  47.31 
 
 
189 aa  173  9.999999999999999e-43  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2494  peptidyl-tRNA hydrolase  40.86 
 
 
188 aa  174  9.999999999999999e-43  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0180  peptidyl-tRNA hydrolase  46.24 
 
 
191 aa  173  1.9999999999999998e-42  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1354  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 
193 aa  172  1.9999999999999998e-42  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8605  Aminoacyl-tRNA hydrolase  45.41 
 
 
201 aa  173  1.9999999999999998e-42  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1688  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 
189 aa  172  3.9999999999999995e-42  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0007  peptidyl-tRNA hydrolase  40.96 
 
 
191 aa  171  5.999999999999999e-42  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0109  aminoacyl-tRNA hydrolase  47.8 
 
 
206 aa  171  6.999999999999999e-42  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000213906  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_1919  peptidyl-tRNA hydrolase  45.55 
 
 
209 aa  169  1e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.245056  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_4633  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.557373 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_4254  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_4340  peptidyl-tRNA hydrolase  45.6 
 
 
192 aa  170  1e-41  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.480593  normal  0.292105 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_2121  Aminoacyl-tRNA hydrolase  46.49 
 
 
190 aa  168  4e-41  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal  0.062679 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0537  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
190 aa  168  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0524  peptidyl-tRNA hydrolase  43.32 
 
 
190 aa  168  5e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11032  peptidyl-tRNA hydrolase  47.57 
 
 
191 aa  167  6e-41  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2056  peptidyl-tRNA hydrolase  49.21 
 
 
214 aa  167  6e-41  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1292  peptidyl-tRNA hydrolase  46.32 
 
 
213 aa  167  7e-41  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0595  peptidyl-tRNA hydrolase  42.11 
 
 
189 aa  167  8e-41  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4448  peptidyl-tRNA hydrolase  46.07 
 
 
213 aa  167  8e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.727457  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1944  peptidyl-tRNA hydrolase  46.7 
 
 
196 aa  166  1e-40  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4788  peptidyl-tRNA hydrolase  43.41 
 
 
192 aa  166  2e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.140463  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_30140  peptidyl-tRNA hydrolase  46.63 
 
 
202 aa  165  2.9999999999999998e-40  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.601869 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1220  peptidyl-tRNA hydrolase  46.52 
 
 
194 aa  165  2.9999999999999998e-40  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_535  peptidyl-tRNA hydrolase  41.58 
 
 
189 aa  165  4e-40  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0735  aminoacyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 
196 aa  164  5.9999999999999996e-40  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0068065 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2819  aminoacyl-tRNA hydrolase  43.78 
 
 
193 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  decreased coverage  0.00000000112866  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1000  peptidyl-tRNA hydrolase  46.77 
 
 
206 aa  163  1.0000000000000001e-39  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_05520  peptidyl-tRNA hydrolase  49.46 
 
 
191 aa  163  2.0000000000000002e-39  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0791  aminoacyl-tRNA hydrolase  49.47 
 
 
196 aa  163  2.0000000000000002e-39  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0570  peptidyl-tRNA hydrolase  44.97 
 
 
189 aa  162  2.0000000000000002e-39  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0122304  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  46.28 
 
 
196 aa  162  2.0000000000000002e-39  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000000493335 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1159  peptidyl-tRNA hydrolase  45.45 
 
 
190 aa  162  3e-39  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0912  peptidyl-tRNA hydrolase  43.23 
 
 
217 aa  161  4.0000000000000004e-39  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4550  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 
195 aa  161  6e-39  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal  0.9788 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2628  peptidyl-tRNA hydrolase  45.7 
 
 
191 aa  160  1e-38  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1938  peptidyl-tRNA hydrolase  42.86 
 
 
192 aa  160  1e-38  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.18819  normal 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1165  peptidyl-tRNA hydrolase  44.62 
 
 
186 aa  159  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_32390  peptidyl-tRNA hydrolase  47.28 
 
 
199 aa  159  3e-38  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.438107 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1203  peptidyl-tRNA hydrolase  44.44 
 
 
190 aa  159  3e-38  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.156035  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1290  peptidyl-tRNA hydrolase  44.09 
 
 
186 aa  159  3e-38  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2625  peptidyl-tRNA hydrolase  45.95 
 
 
188 aa  158  5e-38  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.15421 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0778  peptidyl-tRNA hydrolase  40.21 
 
 
199 aa  158  5e-38  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.881763  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0097  peptidyl-tRNA hydrolase  43.5 
 
 
190 aa  157  7e-38  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  unclonable  0.00000000012965  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0010  peptidyl-tRNA hydrolase  39.25 
 
 
188 aa  157  7e-38  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02751  peptidyl-tRNA hydrolase  42.19 
 
 
206 aa  157  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.705281  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0265  peptidyl-tRNA hydrolase  48.57 
 
 
205 aa  156  1e-37  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0990  peptidyl-tRNA hydrolase  48.44 
 
 
199 aa  157  1e-37  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.532871  hitchhiker  0.0022816 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0079  peptidyl-tRNA hydrolase  49.73 
 
 
190 aa  156  2e-37  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.110658  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1940  peptidyl-tRNA hydrolase  44.27 
 
 
205 aa  155  3e-37  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1616  peptidyl-tRNA hydrolase  38.07 
 
 
202 aa  154  5.0000000000000005e-37  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0063  Aminoacyl-tRNA hydrolase  42.55 
 
 
207 aa  155  5.0000000000000005e-37  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000509944  normal 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3210  peptidyl-tRNA hydrolase  46.33 
 
 
194 aa  154  5.0000000000000005e-37  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>