More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2488 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013440  Hoch_5150  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.67 
 
 
1124 aa  715    Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.910447  normal  0.74946 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3513  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  48.55 
 
 
1331 aa  989    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0648874  normal  0.682211 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3338  Type II secretory pathway pullulanase PulA and related glycosidase-like protein  52.57 
 
 
1942 aa  863    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal  0.0998506 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04828  pullulanase  43.68 
 
 
1328 aa  710    Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_28060  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.93 
 
 
2068 aa  856    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.329007  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1170  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  47.8 
 
 
1855 aa  705    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2712  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  46.23 
 
 
2156 aa  746    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.971607  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2521  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.65 
 
 
1975 aa  874    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2329  Alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  49.72 
 
 
991 aa  814    Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.0783894  normal  0.0180008 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3061  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  53.01 
 
 
946 aa  862    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.57883  normal  0.116697 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4105  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.7 
 
 
1035 aa  730    Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06650  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  44.03 
 
 
1248 aa  865    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001089  putative pullulanase precursor  43.87 
 
 
1329 aa  720    Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3767  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  51.42 
 
 
1025 aa  925    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39745  predicted protein  45.63 
 
 
1062 aa  772    Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1413  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  49.35 
 
 
1117 aa  1017    Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.960844 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0096  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  55.92 
 
 
891 aa  976    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.380747  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2488  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  100 
 
 
1176 aa  2391    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.331345 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0747  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  45.89 
 
 
1891 aa  867    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1316  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.64 
 
 
1440 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal  0.0748066 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3074  alpha-1,6-glucosidase, pullulanase-type  40.64 
 
 
1440 aa  632  1e-179  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000101349 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0287  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  39.8 
 
 
1441 aa  614  9.999999999999999e-175  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_0996  alpha amylase family protein  38.5 
 
 
998 aa  611  1e-173  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.621113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0560  putative pullulanase precursor  39.15 
 
 
1432 aa  597  1e-169  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.594398  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1941  alpha-1,6-glucosidases, pullulanase-type  38.85 
 
 
1450 aa  597  1e-169  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2273  pullulanase  43.87 
 
 
717 aa  554  1e-156  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1694  putative pullulanase  37.76 
 
 
1429 aa  553  1e-156  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01882  putative pullulanase  36.32 
 
 
1472 aa  540  9.999999999999999e-153  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2304  pullulanase, type I  30.6 
 
 
1043 aa  348  3e-94  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1522  pullulanase precursor  31.83 
 
 
655 aa  336  2e-90  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.0360874  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1803  pullulanase, type I  31.05 
 
 
655 aa  329  2.0000000000000001e-88  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.248563  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2737  putative pullulanase  31.7 
 
 
852 aa  321  5e-86  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.31165e-23 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2463  pullulanase  31.44 
 
 
850 aa  319  2e-85  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2498  pullulanase  31.44 
 
 
852 aa  318  3e-85  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00309415  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2542  pullulanase  31.57 
 
 
852 aa  318  4e-85  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.814075  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2728  pullulanase  31.57 
 
 
852 aa  318  4e-85  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00354349  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1087  pullulanase family protein  30.68 
 
 
2638 aa  315  1.9999999999999998e-84  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2786  pullulanase, type I  31.56 
 
 
848 aa  316  1.9999999999999998e-84  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0751626  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0609  pullulanase, type I  30.86 
 
 
1136 aa  313  2e-83  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0177218  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_13880  pullulanase, type I  30.46 
 
 
640 aa  313  2e-83  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2331  pullulanase, type I  31.77 
 
 
647 aa  310  1.0000000000000001e-82  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2552  putative pullulanase  30.8 
 
 
852 aa  301  5e-80  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000407246  decreased coverage  0.0000000000706623 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2741  putative pullulanase  30.76 
 
 
852 aa  297  6e-79  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0379063  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0959  pullulanase, type I  29.43 
 
 
843 aa  295  3e-78  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.557051  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2761  pullulanase, putative  31.23 
 
 
848 aa  295  4e-78  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00586404  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2416  pullulanase, type I  30.41 
 
 
856 aa  293  1e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00697767  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0978  pullulanase, type I  29.16 
 
 
843 aa  291  4e-77  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.912818  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19550  pullulanase, type I  29.72 
 
 
874 aa  286  2.0000000000000002e-75  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0061  pullulanase, type I  30.03 
 
 
899 aa  284  6.000000000000001e-75  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0448  pullulanase, type I  29.16 
 
 
825 aa  284  9e-75  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0459  pullulanase, type I  27.37 
 
 
842 aa  279  2e-73  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.712908  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0057  pullulanase, type I  31.09 
 
 
928 aa  279  3e-73  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1427  pullulanase, type I  28.81 
 
 
841 aa  278  6e-73  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.671793  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0610  pullulanase, type I  28.15 
 
 
1888 aa  270  1e-70  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1839  putative pullulanase  27.86 
 
 
1064 aa  269  2e-70  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1558  pullulanase precursor  28.15 
 
 
1064 aa  268  4e-70  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.430377  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0681  pullulanase, type I  33.94 
 
 
718 aa  262  2e-68  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0421  pullulanase, type I  31.68 
 
 
601 aa  256  1.0000000000000001e-66  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4597  pullulanase  26.05 
 
 
713 aa  253  2e-65  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4953  pullulanase  26.05 
 
 
713 aa  253  2e-65  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4837  putative pullulanase  25.76 
 
 
713 aa  252  3e-65  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.837132  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4844  pullulanase, putative  25.76 
 
 
713 aa  251  5e-65  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4434  pullulanase  25.92 
 
 
713 aa  250  1e-64  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4819  putative pullulanase  25.79 
 
 
713 aa  249  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4452  pullulanase  25.67 
 
 
713 aa  247  9.999999999999999e-64  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0422  putative pullulanase  25.47 
 
 
713 aa  245  3.9999999999999997e-63  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3365  pullulanase, type I  26.55 
 
 
712 aa  239  2e-61  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG0852  pullulanase, putative  27.48 
 
 
766 aa  236  2.0000000000000002e-60  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.865256  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4814  putative pullulanase  25.16 
 
 
713 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4533  pullulanase, type I  26.92 
 
 
713 aa  236  2.0000000000000002e-60  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1298  pullulanase, type I  31.25 
 
 
669 aa  229  3e-58  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0872  pullulanase, type I  25.66 
 
 
640 aa  211  5e-53  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2452  alpha amylase, catalytic region  51.24 
 
 
1401 aa  207  1e-51  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0187956  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2327  alpha amylase catalytic region  54.55 
 
 
1401 aa  204  9.999999999999999e-51  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.775797  normal  0.294215 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0868  pullulanase, extracellular  25.16 
 
 
776 aa  199  3e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1216  pullulanase, putative  26.83 
 
 
1252 aa  190  1e-46  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0305928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0681  glycogen debranching enzyme GlgX  26.61 
 
 
700 aa  135  5e-30  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6067  glycogen debranching enzyme GlgX  27.26 
 
 
701 aa  131  8.000000000000001e-29  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0573704  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1045  glycogen debranching enzyme GlgX  24.61 
 
 
711 aa  130  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1074  glycogen debranching enzyme GlgX  24.61 
 
 
711 aa  129  2.0000000000000002e-28  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.652944 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1401  glycogen debranching protein GlgX  22.9 
 
 
701 aa  126  3e-27  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1982  glycogen debranching enzyme GlgX  24.52 
 
 
721 aa  125  7e-27  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.0850587  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3439  glycogen debranching enzyme GlgX  25.68 
 
 
708 aa  122  3e-26  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000000000000156565 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0906  glycogen debranching enzyme GlgX  23.61 
 
 
721 aa  122  4.9999999999999996e-26  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  hitchhiker  0.00297293  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0822  glycogen debranching enzyme GlgX  25.48 
 
 
706 aa  119  3e-25  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3828  glycoside hydrolase family 13 protein  24.35 
 
 
817 aa  119  5e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.535052 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0256  alpha amylase, catalytic region  36.63 
 
 
1005 aa  118  6e-25  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2700  glycogen debranching enzyme GlgX  24.33 
 
 
845 aa  117  8.999999999999998e-25  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7550  glycogen debranching enzyme GlgX  25.15 
 
 
702 aa  117  2.0000000000000002e-24  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.317676  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0480  alpha amylase catalytic region  34.36 
 
 
1017 aa  114  9e-24  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1514  putative bifunctional 4-alpha-glucanotransferase/glycogen debranching enzyme  24.17 
 
 
1464 aa  113  2.0000000000000002e-23  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.117562  normal  0.556808 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0759  glycogen debranching enzyme GlgX  23.45 
 
 
708 aa  114  2.0000000000000002e-23  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1775  glycogen debranching enzyme GlgX  24.76 
 
 
701 aa  112  3e-23  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.318288  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1812  glycogen debranching enzyme GlgX  24.89 
 
 
718 aa  112  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2363  glycogen debranching enzyme GlgX  26.33 
 
 
701 aa  113  3e-23  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal  0.0149674 
 
 
-
 
NC_010511  M446_4873  glycogen debranching enzyme GlgX  24.5 
 
 
757 aa  113  3e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.325281  normal  0.0620959 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6811  glycogen debranching enzyme GlgX  26.72 
 
 
702 aa  112  4.0000000000000004e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.37065 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2820  glycogen debranching enzyme GlgX  25.15 
 
 
720 aa  112  5e-23  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.888887 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1249  glycogen debranching enzyme GlgX  25.47 
 
 
735 aa  112  5e-23  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1088  glycogen debranching enzyme GlgX  23.93 
 
 
718 aa  112  6e-23  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.231339 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>