More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2416 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2416  extracellular solute-binding protein family 1  100 
 
 		 349 aa  707    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0000133122  normal  0.0884701 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1722  extracellular solute-binding protein  61.89 
 
 		 379 aa  394  1e-109  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.0000849376  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1175  extracellular solute-binding protein  57.74 
 
 		 372 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.282862  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6601  extracellular solute-binding protein family 1  47.26 
 
 		 356 aa  304  1.0000000000000001e-81  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.252568 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8130  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  44.54 
 
 		 340 aa  303  3.0000000000000004e-81  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.201233 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3363  extracellular solute-binding protein  44.41 
 
 		 342 aa  299  5e-80  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  0.950181 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1664  extracellular solute-binding protein family 1  49.36 
 
 		 366 aa  299  5e-80  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.0000133453  normal  0.0424658 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3093  extracellular solute-binding protein  43.18 
 
 		 340 aa  297  1e-79  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.383646  normal  0.418833 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_06280  ABC-type Fe3+ transport system, periplasmic component  48.71 
 
 		 363 aa  297  2e-79  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.124476  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1431  extracellular solute-binding protein  43.82 
 
 		 355 aa  288  1e-76  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.452816  hitchhiker  0.000555172 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2070  extracellular solute-binding protein family 1  43.32 
 
 		 345 aa  267  2.9999999999999995e-70  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.620132  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2015  extracellular solute-binding protein family 1  43.37 
 
 		 328 aa  240  2.9999999999999997e-62  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  unclonable  0.00000000268441  normal  1 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0162  ABC-type iron(III) transport system,substrate-binding protein  40.91 
 
 		 385 aa  238  1e-61  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2720  extracellular solute-binding protein family 1  39.71 
 
 		 353 aa  236  4e-61  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.015536  normal  0.702037 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2837  extracellular solute-binding protein  37.34 
 
 		 337 aa  221  1.9999999999999999e-56  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.383478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_2022  extracellular solute-binding protein  36.69 
 
 		 333 aa  219  3.9999999999999997e-56  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0434097  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4881  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  37.91 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2521  extracellular solute-binding protein family 1  37.01 
 
 		 338 aa  217  2e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4761  extracellular solute-binding protein  37.91 
 
 		 337 aa  217  2e-55  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0315146  normal  0.468263 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4937  extracellular solute-binding protein  37.58 
 
 		 337 aa  215  9.999999999999999e-55  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000349724 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0736  extracellular solute-binding protein family 1  34.39 
 
 		 352 aa  214  1.9999999999999998e-54  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_4828  extracellular solute-binding protein family 1  35.69 
 
 		 347 aa  214  1.9999999999999998e-54  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.024874  normal  0.037775 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2277  extracellular solute-binding protein family 1  40.36 
 
 		 397 aa  213  3.9999999999999995e-54  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3650  extracellular solute-binding protein family 1  38.64 
 
 		 343 aa  210  3e-53  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.0546711  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1463  extracellular solute-binding protein  33.76 
 
 		 339 aa  210  3e-53  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_62000  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  36.18 
 
 		 335 aa  210  3e-53  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.617589  normal  0.0992069 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1835  ABC Fe+3 transporter, periplasmic ligand binding protein  34.95 
 
 		 343 aa  209  6e-53  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.236208  normal  0.444011 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0607  extracellular solute-binding protein  34.63 
 
 		 351 aa  209  8e-53  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2710  iron(III)-binding periplasmic protein  33.76 
 
 		 339 aa  208  9e-53  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.452654  normal  0.0367844 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5394  ferric iron-binding periplasmic protein HitA  35.86 
 
 		 335 aa  208  1e-52  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2430  extracellular solute-binding protein family 1  35.06 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.334988  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2919  extracellular solute-binding protein family 1  34.74 
 
 		 338 aa  207  2e-52  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1350  iron(III) ABC transporter, permease protein, periplasmic iron(III)-binding protein  33.44 
 
 		 339 aa  207  2e-52  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.379147  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3171  extracellular solute-binding protein  34.2 
 
 		 382 aa  206  5e-52  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1359  extracellular solute-binding protein family 1  34.74 
 
 		 338 aa  206  5e-52  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.902305  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0531  extracellular solute-binding protein  37.19 
 
 		 336 aa  206  6e-52  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.139557 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2534  extracellular solute-binding protein  34.74 
 
 		 338 aa  205  1e-51  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7421  extracellular solute-binding protein family 1  37.07 
 
 		 348 aa  204  1e-51  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.306518  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3950  ABC Fe3+ transporter, periplasmic ligand binding protein  35.18 
 
 		 344 aa  201  1.9999999999999998e-50  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0258476  normal  0.044916 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1962  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.139482  normal  0.859404 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_2028  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.159304  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1982  extracellular solute-binding protein  35.4 
 
 		 342 aa  200  3.9999999999999996e-50  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.53663  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4671  extracellular solute-binding protein  36.49 
 
 		 337 aa  198  1.0000000000000001e-49  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.164274  normal  0.522234 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5750  extracellular solute-binding protein  36.01 
 
 		 341 aa  197  2.0000000000000003e-49  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.177697  normal  0.666773 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3783  extracellular solute-binding protein family 1  33.99 
 
 		 340 aa  197  3e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1876  extracellular solute-binding protein family 1  37.12 
 
 		 423 aa  195  8.000000000000001e-49  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2294  extracellular solute-binding protein  34.76 
 
 		 381 aa  193  4e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_4112  extracellular solute-binding protein family 1  33.01 
 
 		 338 aa  193  5e-48  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.512643  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2858  extracellular solute-binding protein  36.01 
 
 		 341 aa  192  7e-48  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.329145  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5340  extracellular solute-binding protein  32.55 
 
 		 358 aa  191  1e-47  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.927258 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6136  ABC transporter substrate binding protein (iron)  32.79 
 
 		 329 aa  189  7e-47  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.327012  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1592  extracellular solute-binding protein  34.42 
 
 		 354 aa  186  7e-46  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.641275  normal  0.651768 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1462  extracellular solute-binding protein family 1  34.19 
 
 		 392 aa  185  1.0000000000000001e-45  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0869  extracellular solute-binding protein  29.61 
 
 		 372 aa  177  2e-43  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  0.107686  hitchhiker  0.000000984124 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2574  extracellular solute-binding protein  33.87 
 
 		 339 aa  177  4e-43  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232421 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1728  extracellular solute-binding protein  29.38 
 
 		 374 aa  175  9.999999999999999e-43  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.224389  normal  0.563347 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00162  putative ABC-type transport system, periplasmic component  33.52 
 
 		 344 aa  174  2.9999999999999996e-42  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.403818  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_0990  ABC transporter, iron binding protein  34.04 
 
 		 349 aa  169  5e-41  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.599077 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0732  extracellular solute-binding protein  33.12 
 
 		 337 aa  169  6e-41  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.23005  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3754  extracellular solute-binding protein  32.14 
 
 		 355 aa  163  4.0000000000000004e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.684526  normal  0.0834035 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1547  ABC iron transporter, periplasmic binding protein  28.17 
 
 		 374 aa  163  5.0000000000000005e-39  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.231784  normal  0.33336 
 
 
-
 
NC_002947  PP_5196  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein, putative  31.6 
 
 		 333 aa  162  6e-39  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1443  extracellular solute-binding protein family 1  33.87 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1469  extracellular solute-binding protein family 1  33.87 
 
 		 365 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5256  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 333 aa  161  1e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_5103  extracellular solute-binding protein  31.25 
 
 		 333 aa  162  1e-38  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.836408  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1529  extracellular solute-binding protein  30.11 
 
 		 355 aa  160  4e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0014925  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5021  extracellular solute-binding protein  31.6 
 
 		 333 aa  160  4e-38  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1188  extracellular solute-binding protein  31.58 
 
 		 335 aa  160  4e-38  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.244132  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3508  extracellular solute-binding protein family 1  33.33 
 
 		 353 aa  156  5.0000000000000005e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  decreased coverage  0.00278562  normal  0.288833 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1409  iron transport system substrate-binding protein  32.31 
 
 		 340 aa  155  1e-36  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0844  extracellular solute-binding protein  31.33 
 
 		 335 aa  154  2e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.680673  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3844  extracellular solute-binding protein  30.38 
 
 		 347 aa  154  2.9999999999999998e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.367273  hitchhiker  0.0000000311792 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1596  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 		 351 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.924744  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_3377  extracellular solute-binding protein  31.19 
 
 		 349 aa  151  1e-35  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.977933  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5430  extracellular solute-binding protein  30.24 
 
 		 334 aa  151  2e-35  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0277542 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1444  extracellular solute-binding protein family 1  32.76 
 
 		 350 aa  150  2e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1470  extracellular solute-binding protein family 1  32.76 
 
 		 350 aa  150  3e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.848361  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_68900  putative binding protein component of ABC iron transporter  32.29 
 
 		 332 aa  149  5e-35  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.940616  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_0299  extracellular solute-binding protein family 1  33.67 
 
 		 345 aa  149  8e-35  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.0978527  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0455  extracellular solute-binding protein  32 
 
 		 345 aa  149  9e-35  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.479907  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0742  extracellular solute-binding protein family 1  30 
 
 		 333 aa  147  2.0000000000000003e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1526  ABC transporter, periplasmic binding protein  30.43 
 
 		 334 aa  147  2.0000000000000003e-34  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0314  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  29.69 
 
 		 333 aa  147  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5962  putative iron ABC transporter binding protein subunit  31.94 
 
 		 332 aa  147  3e-34  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.22448  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1923  ABC transporter periplasmic substrate-binding protein 1  30.22 
 
 		 379 aa  145  8.000000000000001e-34  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0244  extracellular solute-binding protein  30.58 
 
 		 333 aa  145  1e-33  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007799  ECH_0189  putative iron-binding protein  29.94 
 
 		 346 aa  145  1e-33  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  0.120226  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0128  extracellular solute-binding protein  29.94 
 
 		 347 aa  143  4e-33  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0515184  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0897  iron compound ABC transporter, periplasmic iron compound-binding protein  32.44 
 
 		 341 aa  143  6e-33  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.502953  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_47300  iron ABC transporter, periplasmic iron-binding protein  31.02 
 
 		 334 aa  142  9.999999999999999e-33  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0893  ABC-type transport system, periplasmic component  30.87 
 
 		 326 aa  142  9.999999999999999e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  8.24899e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0124  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 336 aa  140  3e-32  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0118  extracellular solute-binding protein  30.98 
 
 		 339 aa  140  3.9999999999999997e-32  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0549  extracellular solute-binding protein  29.19 
 
 		 341 aa  137  2e-31  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.0429047  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0945  extracellular solute-binding protein  30.48 
 
 		 335 aa  137  2e-31  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.248074  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0327  extracellular solute-binding protein  30.1 
 
 		 346 aa  136  5e-31  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0824216 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0170  extracellular solute-binding protein  28.62 
 
 		 349 aa  136  7.000000000000001e-31  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0949537  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2175  transport system substrate-binding protein  30.74 
 
 		 366 aa  135  9.999999999999999e-31  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.377327 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0005  iron-binding protein  27.33 
 
 		 335 aa  135  9.999999999999999e-31  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  hitchhiker  0.0000237726  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>