75 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2393 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2393  hypothetical protein  100 
 
 
446 aa  915    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.497343  normal  0.092476 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4040  hypothetical protein  57.43 
 
 
461 aa  503  1e-141  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3670  hypothetical protein  57.47 
 
 
450 aa  502  1e-141  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3882  hypothetical protein  56.22 
 
 
436 aa  446  1.0000000000000001e-124  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.0281101 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0857  hypothetical protein  52.86 
 
 
425 aa  435  1e-121  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.240803  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0331  hypothetical protein  46.24 
 
 
476 aa  395  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.638038  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3991  hypothetical protein  46.41 
 
 
447 aa  390  1e-107  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0970937  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0740  hypothetical protein  54.93 
 
 
434 aa  386  1e-106  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00236672  hitchhiker  0.00490249 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3344  hypothetical protein  44.62 
 
 
453 aa  368  1e-100  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3384  hypothetical protein  41.91 
 
 
408 aa  336  5.999999999999999e-91  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3712  hypothetical protein  46.22 
 
 
597 aa  304  2.0000000000000002e-81  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0239921  hitchhiker  0.00429012 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3535  hypothetical protein  47.63 
 
 
596 aa  298  2e-79  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2394  hypothetical protein  44.35 
 
 
600 aa  297  3e-79  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.010377  normal  0.174901 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3713  hypothetical protein  45.58 
 
 
601 aa  295  8e-79  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.80691  normal  0.0122449 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3536  hypothetical protein  45.3 
 
 
601 aa  294  2e-78  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.517876  normal  0.767209 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3383  hypothetical protein  41.48 
 
 
586 aa  266  5e-70  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0654007  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3256  O-antigen polymerase  27.69 
 
 
1025 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.711295  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2654  hypothetical protein  26.68 
 
 
550 aa  114  4.0000000000000004e-24  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0064  hypothetical protein  25.99 
 
 
544 aa  113  6e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2109  Carbohydrate-binding family 9  27.45 
 
 
1276 aa  103  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  decreased coverage  0.0000203571  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2723  hypothetical protein  26.75 
 
 
550 aa  97.4  5e-19  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2152  hypothetical protein  27.25 
 
 
392 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3040  hypothetical protein  29.46 
 
 
372 aa  84  0.000000000000005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000024541 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2598  hypothetical protein  25.7 
 
 
340 aa  82.4  0.00000000000001  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0262823  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3520  hypothetical protein  27.27 
 
 
380 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4606  hypothetical protein  30.06 
 
 
584 aa  78.6  0.0000000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  unclonable  0.0000237555  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6730  hypothetical protein  23.78 
 
 
554 aa  77.8  0.0000000000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2001  hypothetical protein  24.28 
 
 
596 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.021099  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0408  hypothetical protein  27.87 
 
 
891 aa  75.5  0.000000000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00193386  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4299  hypothetical protein  22.92 
 
 
662 aa  72.4  0.00000000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I2610  hypothetical protein  28.21 
 
 
558 aa  68.9  0.0000000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1696  Beta-xylosidase  28.62 
 
 
510 aa  64.7  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1875  putative lipoprotein  28.62 
 
 
510 aa  64.3  0.000000004  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.126223  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0717  glycosyl hydrolase 53 protein  26.21 
 
 
534 aa  63.2  0.000000009  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0356  hypothetical protein  22.51 
 
 
369 aa  61.6  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000129825  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1721  putative lipoprotein  28.29 
 
 
510 aa  61.6  0.00000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1111  hypothetical protein  30.72 
 
 
452 aa  61.2  0.00000004  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.113286  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0215  putative lipoprotein  30.72 
 
 
510 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.134499  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1553  hypothetical protein  30.72 
 
 
510 aa  60.8  0.00000005  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.389847  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2529  Carbohydrate-binding family 9  22.32 
 
 
1141 aa  60.1  0.00000009  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1096  hypothetical protein  24.33 
 
 
602 aa  59.3  0.0000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00809293 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3039  hypothetical protein  27.19 
 
 
803 aa  58.5  0.0000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0719131  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1344  hypothetical protein  24.43 
 
 
873 aa  58.5  0.0000002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.173048  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3268  Beta-xylosidase-like protein  23.49 
 
 
444 aa  57.4  0.0000005  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.309548  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1063  glycoside hydrolase family 5  21.76 
 
 
398 aa  55.1  0.000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2630  hypothetical protein  26.32 
 
 
801 aa  54.7  0.000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3938  hypothetical protein  22.45 
 
 
604 aa  53.1  0.000009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3764  hypothetical protein  23.46 
 
 
605 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6399  glycoside hydrolase family 5  20.7 
 
 
415 aa  52.4  0.00001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.337804 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3853  hypothetical protein  27.74 
 
 
564 aa  51.2  0.00003  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03060  beta-glucosidase/6-phospho-beta- glucosidase/beta-galactosidase  26.85 
 
 
433 aa  50.4  0.00006  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0843  hypothetical protein  22.54 
 
 
562 aa  49.7  0.0001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0086  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1086  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1246  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1526  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0102  hypothetical protein  29.11 
 
 
442 aa  49.7  0.0001  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2688  putative cellulase  29.11 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2839  Beta-xylosidase  29.11 
 
 
442 aa  49.3  0.0001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1040  hypothetical protein  22.53 
 
 
614 aa  48.5  0.0002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.367897  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2759  glycoside hydrolase family protein  22.22 
 
 
437 aa  47.8  0.0004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0395  hypothetical protein  29.29 
 
 
450 aa  47.4  0.0005  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3314  hypothetical protein  28.05 
 
 
500 aa  46.6  0.0009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.275186 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_35670  putative glycosyl hydrolase  20.92 
 
 
442 aa  46.2  0.001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00000000000648928 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4282  Beta-xylosidase-like protein  23.61 
 
 
444 aa  45.8  0.001  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.296007  hitchhiker  0.00752766 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3306  glycoside hydrolase family protein  22.87 
 
 
437 aa  45.4  0.002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  hitchhiker  0.00744164  normal  0.534122 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0140  glucose/sorbosone dehydrogenase-like protein  35.8 
 
 
451 aa  45.1  0.002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.5933  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3885  hypothetical protein  28.57 
 
 
508 aa  44.7  0.004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.576035  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3132  xylan 1,4-beta-xylosidase  25.47 
 
 
530 aa  44.7  0.004  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal  0.297531 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2114  hypothetical protein  28.02 
 
 
654 aa  44.3  0.005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.325526 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3004  putative glycosyl hydrolase  21.43 
 
 
442 aa  43.9  0.005  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.088022  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1741  hypothetical protein  36.99 
 
 
628 aa  43.9  0.006  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2171  NAD-dependent epimerase/dehydratase  29.41 
 
 
672 aa  43.1  0.01  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal  0.052836 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0914  hypothetical protein  24.31 
 
 
1086 aa  43.1  0.01  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.202389  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0170  Xylan 1,4-beta-xylosidase  28.03 
 
 
611 aa  43.1  0.01  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.268815  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>