More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2388 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  100 
 
 		 138 aa  284  4e-76  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  60.53 
 
 		 151 aa  177  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  53.29 
 
 		 166 aa  173  6e-43  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  58.82 
 
 		 152 aa  172  1.9999999999999998e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  62.31 
 
 		 175 aa  169  9e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  61.61 
 
 		 192 aa  159  2e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  59.13 
 
 		 175 aa  155  2e-37  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  58.26 
 
 		 176 aa  154  6e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  53.38 
 
 		 147 aa  145  2.0000000000000003e-34  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  41.88 
 
 		 172 aa  138  3e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  54.05 
 
 		 165 aa  137  7e-32  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  53.15 
 
 		 166 aa  135  1e-31  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  42.68 
 
 		 157 aa  135  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  49.58 
 
 		 161 aa  132  1.9999999999999998e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  41.1 
 
 		 163 aa  132  1.9999999999999998e-30  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  41.14 
 
 		 158 aa  132  1.9999999999999998e-30  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  50.45 
 
 		 171 aa  130  5e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  48.44 
 
 		 188 aa  129  1.0000000000000001e-29  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  42.95 
 
 		 157 aa  127  5.0000000000000004e-29  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  47.79 
 
 		 242 aa  127  7.000000000000001e-29  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  45.58 
 
 		 149 aa  125  1.0000000000000001e-28  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 146 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  45.89 
 
 		 148 aa  125  2.0000000000000002e-28  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  48.65 
 
 		 220 aa  125  2.0000000000000002e-28  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  48.2 
 
 		 135 aa  124  6e-28  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2746  single-strand binding protein  45.16 
 
 		 154 aa  124  6e-28  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  49.55 
 
 		 231 aa  123  8.000000000000001e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  45 
 
 		 160 aa  122  1e-27  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  44.95 
 
 		 164 aa  123  1e-27  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0449  single-strand binding protein  48.25 
 
 		 143 aa  123  1e-27  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  decreased coverage  0.000000857397  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  47.48 
 
 		 135 aa  122  1e-27  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  48.65 
 
 		 225 aa  122  2e-27  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  46.43 
 
 		 135 aa  121  3e-27  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  54.55 
 
 		 160 aa  120  6e-27  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2293  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 155 aa  118  1.9999999999999998e-26  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  50.94 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  45.97 
 
 		 201 aa  119  1.9999999999999998e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  50.94 
 
 		 163 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  50.94 
 
 		 161 aa  119  1.9999999999999998e-26  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  51.75 
 
 		 180 aa  118  1.9999999999999998e-26  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  43.75 
 
 		 146 aa  117  4.9999999999999996e-26  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  50.45 
 
 		 175 aa  117  7.999999999999999e-26  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  41.51 
 
 		 158 aa  116  7.999999999999999e-26  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0044  single-strand binding protein  47.06 
 
 		 137 aa  116  9e-26  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.139232  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  50 
 
 		 156 aa  116  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  50 
 
 		 172 aa  116  9.999999999999999e-26  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  40 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  40 
 
 		 159 aa  116  9.999999999999999e-26  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  44.14 
 
 		 147 aa  116  9.999999999999999e-26  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  51.85 
 
 		 166 aa  116  9.999999999999999e-26  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1260  single-strand binding protein  42.14 
 
 		 161 aa  116  9.999999999999999e-26  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.0616311  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  41.51 
 
 		 158 aa  115  1.9999999999999998e-25  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 186 aa  115  1.9999999999999998e-25  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0571  single-strand binding protein  47.11 
 
 		 222 aa  113  7.999999999999999e-25  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.00000000499632  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2227  single-strand binding protein  42.67 
 
 		 152 aa  113  8.999999999999998e-25  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.261214  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_4028  single-strand binding protein  46.72 
 
 		 238 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_0587  single-strand binding protein  43.17 
 
 		 236 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.0173283  normal  0.785333 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_3023  single-strand binding protein  48.18 
 
 		 163 aa  113  1.0000000000000001e-24  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.208974  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3753  single-strand binding protein  43.17 
 
 		 234 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS155  Bacteria  decreased coverage  0.0000011541  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_0581  single-strand binding protein  43.17 
 
 		 234 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS195  Bacteria  hitchhiker  0.00543875  normal  0.0620215 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_0640  single-strand binding protein  43.17 
 
 		 236 aa  112  1.0000000000000001e-24  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.021198  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5984  single-strand binding protein  46.46 
 
 		 171 aa  113  1.0000000000000001e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.933717 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0556  single-strand binding protein  43.17 
 
 		 234 aa  113  1.0000000000000001e-24  Shewanella baltica OS185  Bacteria  hitchhiker  0.00736875  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3313  single-strand binding protein  48.25 
 
 		 231 aa  112  2.0000000000000002e-24  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0358843  n/a   
 
 
-
 
NC_013930  TK90_2780  single-strand binding protein  42.86 
 
 		 155 aa  112  2.0000000000000002e-24  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0936  single-strand binding protein  37.75 
 
 		 151 aa  111  3e-24  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  48.72 
 
 		 174 aa  111  3e-24  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  50 
 
 		 156 aa  111  4.0000000000000004e-24  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3411  single-strand binding protein  41.1 
 
 		 146 aa  111  4.0000000000000004e-24  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  50.48 
 
 		 167 aa  111  4.0000000000000004e-24  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 139 aa  110  5e-24  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  44.44 
 
 		 200 aa  110  5e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4573  single-stranded DNA-binding protein  38.6 
 
 		 171 aa  110  6e-24  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  50 
 
 		 180 aa  110  6e-24  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2815  single-stranded DNA-binding protein  38.42 
 
 		 177 aa  110  7.000000000000001e-24  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0533  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 236 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0176705  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3590  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 235 aa  110  7.000000000000001e-24  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0152827  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3419  single-strand binding protein  51.49 
 
 		 236 aa  110  8.000000000000001e-24  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.0354621  normal  1 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0025  single-strand binding protein  47.71 
 
 		 185 aa  110  8.000000000000001e-24  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.326087  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0516  single-strand binding protein  50.5 
 
 		 234 aa  110  9e-24  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.490928  normal  0.543357 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2382  single-stranded DNA-binding protein  52.83 
 
 		 176 aa  109  1.0000000000000001e-23  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.226437  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 196 aa  109  1.0000000000000001e-23  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1397  single-strand binding protein  49.15 
 
 		 160 aa  109  1.0000000000000001e-23  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  41.5 
 
 		 149 aa  109  1.0000000000000001e-23  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  41.73 
 
 		 139 aa  108  2.0000000000000002e-23  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2755  single-stranded DNA-binding protein  51.85 
 
 		 169 aa  108  2.0000000000000002e-23  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0658877  normal  0.922249 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  40.96 
 
 		 167 aa  108  2.0000000000000002e-23  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3154  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 		 167 aa  108  3e-23  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  50 
 
 		 169 aa  108  3e-23  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  36.26 
 
 		 170 aa  108  3e-23  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2079  single-stranded DNA-binding protein  50.93 
 
 		 163 aa  108  3e-23  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.180692  n/a   
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0066  single-stranded DNA-binding protein  40.54 
 
 		 150 aa  108  3e-23  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03931  single-strand DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0479609  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3933  single-strand binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1927  single-stranded DNA-binding protein  51.89 
 
 		 169 aa  107  4.0000000000000004e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.332681  normal  1 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4611  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03891  hypothetical protein  37.08 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0417311  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_1608  single-strand binding protein  40.27 
 
 		 151 aa  107  4.0000000000000004e-23  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.409638  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4301  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4521  single-stranded DNA-binding protein  37.08 
 
 		 178 aa  107  4.0000000000000004e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>