More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2385 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2385  extracellular solute-binding protein family 5  100 
 
 
594 aa  1215    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_932  ABC-type oligopeptide transport system, periplasmic component  41.68 
 
 
558 aa  376  1e-103  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.00000268358  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0943  extracellular solute-binding protein  40.51 
 
 
558 aa  363  4e-99  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.0446161  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0418  extracellular solute-binding protein family 5  37.38 
 
 
622 aa  350  5e-95  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1223  4-phytase  38.29 
 
 
589 aa  332  2e-89  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0547  extracellular solute-binding protein  34.8 
 
 
531 aa  281  2e-74  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2961  extracellular solute-binding protein  34.56 
 
 
541 aa  278  2e-73  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_512  ABC-type dipeptide/oligopeptide/nickel transport system, periplasmic component  33.93 
 
 
530 aa  267  4e-70  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.135113  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2028  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein  33.01 
 
 
544 aa  261  3e-68  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.593092  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0573  oligopeptide-binding protein, putative  33.6 
 
 
530 aa  259  1e-67  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2742  extracellular solute-binding protein family 5  32.23 
 
 
541 aa  257  4e-67  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0333  extracellular solute-binding protein  33.26 
 
 
528 aa  254  3e-66  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.31964  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0044  extracellular solute-binding protein family 5  33.4 
 
 
538 aa  254  3e-66  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1913  extracellular solute-binding protein family 5  32.63 
 
 
535 aa  253  7e-66  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.988615  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1588  extracellular solute-binding protein family 5  31.77 
 
 
533 aa  244  3.9999999999999997e-63  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2247  extracellular solute-binding protein  32.65 
 
 
535 aa  243  6e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0125251  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3843  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 
530 aa  242  1e-62  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0512301  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_3016  extracellular solute-binding protein family 5  31.74 
 
 
545 aa  240  5e-62  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0244604  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0699  extracellular solute-binding protein family 5  31.45 
 
 
590 aa  239  8e-62  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1984  extracellular solute-binding protein family 5  33.01 
 
 
556 aa  237  6e-61  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0009  extracellular solute-binding protein family 5  32.19 
 
 
544 aa  234  3e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.327799  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2435  extracellular solute-binding protein  29.24 
 
 
549 aa  234  5e-60  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.882532  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1405  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.64 
 
 
532 aa  233  6e-60  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1328  extracellular solute-binding protein  31.86 
 
 
534 aa  232  2e-59  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0008  extracellular solute-binding protein family 5  31.67 
 
 
544 aa  229  9e-59  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  hitchhiker  0.00260142  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0332  extracellular solute-binding protein  33.33 
 
 
523 aa  229  9e-59  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7030  ABC transporter substrate binding protein (oligopeptide)  31.78 
 
 
537 aa  229  1e-58  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.394274  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_1569  extracellular solute-binding protein  31.66 
 
 
534 aa  229  1e-58  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.199164  normal  0.0577205 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01217  oligopeptide transporter subunit  32.29 
 
 
543 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.584763  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2405  extracellular solute-binding protein family 5  32.29 
 
 
558 aa  228  2e-58  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.000000900492  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2024  extracellular solute-binding protein family 5  31.24 
 
 
536 aa  228  2e-58  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000427312  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01227  hypothetical protein  32.29 
 
 
543 aa  228  2e-58  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.595865  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3812  extracellular solute-binding protein family 5  30.1 
 
 
528 aa  228  2e-58  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.0629305 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1391  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.29 
 
 
543 aa  228  2e-58  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.768286  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1352  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.29 
 
 
543 aa  228  2e-58  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0153639  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1897  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.29 
 
 
558 aa  228  2e-58  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.340522  normal  0.197408 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0469  extracellular solute-binding protein family 5  30.54 
 
 
552 aa  228  3e-58  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1729  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.29 
 
 
558 aa  228  3e-58  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.654548  normal  0.238122 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2385  extracellular solute-binding protein  32.29 
 
 
558 aa  228  3e-58  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.190524  hitchhiker  0.0000021243 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1412  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.18 
 
 
543 aa  228  3e-58  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.706367  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0038  extracellular solute-binding protein  31.06 
 
 
533 aa  228  3e-58  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.830083  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2285  extracellular solute-binding protein family 5  32.62 
 
 
556 aa  227  4e-58  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.946227  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3842  extracellular solute-binding protein family 5  30.17 
 
 
535 aa  227  5.0000000000000005e-58  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.298652  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1135  4-phytase  30.62 
 
 
520 aa  227  5.0000000000000005e-58  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00134056  n/a   
 
 
-
 
NC_011724  BbuZS7_B15  oligopeptide ABC transporter OppAIV  31.22 
 
 
530 aa  226  6e-58  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.470524  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1937  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.66 
 
 
543 aa  226  9e-58  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.26638 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1874  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.66 
 
 
543 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1399  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.66 
 
 
543 aa  226  1e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.530492  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1581  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.47 
 
 
543 aa  225  2e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.197291  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2023  extracellular solute-binding protein family 5  31.04 
 
 
531 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  0.0292401  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1590  extracellular solute-binding protein family 5  30.95 
 
 
530 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2743  extracellular solute-binding protein family 5  30.74 
 
 
542 aa  224  3e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000076574  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1880  periplasmic oligopeptide-binding protein  33.66 
 
 
543 aa  224  3e-57  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.558162 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0019  extracellular solute-binding protein  33.08 
 
 
533 aa  224  3e-57  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2238  extracellular solute-binding protein family 5  29.21 
 
 
534 aa  224  4e-57  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  hitchhiker  0.00707838  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0592  extracellular solute-binding protein  33.99 
 
 
545 aa  224  4e-57  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2070  extracellular solute-binding protein  32.35 
 
 
545 aa  223  8e-57  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.174491  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1960  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  32.35 
 
 
545 aa  223  9.999999999999999e-57  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.390049  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2163  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  32.35 
 
 
525 aa  222  9.999999999999999e-57  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.037967  normal  0.0426294 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0190  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.76 
 
 
536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0189  oligopeptide ABC transporter oligopeptide-binding protein  27.76 
 
 
536 aa  221  1.9999999999999999e-56  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2834  extracellular solute-binding protein family 5  30.98 
 
 
526 aa  221  3e-56  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.360597 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0623  4-phytase  31.41 
 
 
552 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000146122  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0546  4-phytase  31.41 
 
 
552 aa  221  3e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.633185  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003657  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  30.97 
 
 
536 aa  221  3e-56  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0587  extracellular solute-binding protein family 5  29.92 
 
 
534 aa  221  3.9999999999999997e-56  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2195  extracellular solute-binding protein family 5  31.7 
 
 
547 aa  217  4e-55  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.337162  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.68 
 
 
536 aa  216  7e-55  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3596  extracellular solute-binding protein  31.01 
 
 
526 aa  216  7e-55  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1448  extracellular solute-binding protein family 5  30.21 
 
 
535 aa  216  7e-55  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_0021  extracellular solute-binding protein  30.66 
 
 
561 aa  216  7e-55  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1612  extracellular solute-binding protein family 5  30.64 
 
 
549 aa  216  8e-55  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA0537  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.73 
 
 
525 aa  216  8e-55  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.75807  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3103  extracellular solute-binding protein family 5  30.45 
 
 
526 aa  215  9.999999999999999e-55  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.529212  normal  0.177978 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2302  extracellular solute-binding protein  31.14 
 
 
544 aa  216  9.999999999999999e-55  Enterobacter sp. 638  Bacteria  decreased coverage  0.00365913  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1985  extracellular solute-binding protein family 5  31 
 
 
545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0190  extracellular solute-binding protein  29.55 
 
 
533 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1954  extracellular solute-binding protein family 5  31.21 
 
 
547 aa  215  1.9999999999999998e-54  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0214  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  28.06 
 
 
536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2701  extracellular solute-binding protein  31.8 
 
 
545 aa  215  1.9999999999999998e-54  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.301975  hitchhiker  0.00251286 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0209  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.39 
 
 
536 aa  215  1.9999999999999998e-54  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0467  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  31.6 
 
 
525 aa  215  1.9999999999999998e-54  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0603  extracellular solute-binding protein family 5  31.96 
 
 
534 aa  214  2.9999999999999995e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4685  extracellular solute-binding protein  29.39 
 
 
532 aa  214  2.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.192999  normal  0.292705 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0233  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.49 
 
 
536 aa  214  3.9999999999999995e-54  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_07058  hypothetical protein  29.82 
 
 
559 aa  214  3.9999999999999995e-54  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1602  extracellular solute-binding protein family 5  30.57 
 
 
534 aa  213  5.999999999999999e-54  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0174  extracellular solute-binding protein  28.94 
 
 
536 aa  213  7e-54  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0609  oligopeptide ABC transporter, periplasmic oligopeptide-binding protein  30.35 
 
 
543 aa  213  7.999999999999999e-54  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5110  oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  27.49 
 
 
536 aa  213  9e-54  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2027  periplasmic oligopeptide-binding protein precursor  30.44 
 
 
555 aa  213  9e-54  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.197641  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4639  extracellular solute-binding protein family 5  31.58 
 
 
532 aa  213  1e-53  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0267  extracellular solute-binding protein family 5  29.73 
 
 
538 aa  212  2e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0586  extracellular solute-binding protein family 5  29.46 
 
 
544 aa  211  3e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4272  extracellular solute-binding protein  31.91 
 
 
532 aa  210  5e-53  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.0380913  normal  0.650765 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_0728  extracellular solute-binding protein family 5  31.38 
 
 
535 aa  210  5e-53  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_001004  oligopeptide ABC transporter periplasmic oligopeptide-binding protein OppA  29.62 
 
 
541 aa  209  1e-52  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1436  4-phytase  32.7 
 
 
546 aa  209  1e-52  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A3609  putative oligopeptide ABC transporter, oligopeptide-binding protein  29.57 
 
 
568 aa  209  1e-52  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0365619  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A3695  oligopeptide-binding protein OppA  29.39 
 
 
571 aa  209  1e-52  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00658046  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>