223 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2338 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2338  Tetratricopeptide TPR_4  100 
 
 		 1089 aa  2195    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.878035  normal  0.026565 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3987  TPR repeat-containing protein  55.17 
 
 		 1092 aa  1105    Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.017736 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1146  TPR repeat-containing protein  55.77 
 
 		 1091 aa  1122    Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.000383652 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0090  TPR repeat-containing protein  46.43 
 
 		 1090 aa  894    Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.763002  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02941  hypothetical protein  21.2 
 
 		 1676 aa  99.8  2e-19  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.673691 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1300  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 878 aa  76.6  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7349  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.86 
 
 		 988 aa  74.7  0.000000000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0738846  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0258  TPR repeat-containing protein  28.82 
 
 		 974 aa  74.3  0.00000000001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1328  peptidase S1 and S6 chymotrypsin/Hap  24.07 
 
 		 810 aa  70.9  0.0000000001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.929548  normal  0.0143336 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0696  TPR repeat-containing protein  26.58 
 
 		 893 aa  66.6  0.000000002  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6182  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.03 
 
 		 1056 aa  66.6  0.000000002  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2526  tetratricopeptide TPR_2  20.42 
 
 		 1154 aa  65.9  0.000000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.240995 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0685  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  26.67 
 
 		 883 aa  64.7  0.00000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4380  TPR repeat-containing protein  25.27 
 
 		 900 aa  63.2  0.00000003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2853  TPR repeat-containing protein  20 
 
 		 3172 aa  62.4  0.00000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3643  TPR domain-containing protein  22.11 
 
 		 1979 aa  61.6  0.00000007  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2942  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.31 
 
 		 632 aa  61.2  0.0000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2349  TPR repeat-containing protein  21.62 
 
 		 649 aa  59.7  0.0000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0186841  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0083  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.09 
 
 		 2240 aa  59.3  0.0000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1499  TPR repeat-containing protein  27.62 
 
 		 486 aa  59.3  0.0000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.329638 
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0661  TPR repeat-containing methyltransferase  21.71 
 
 		 561 aa  58.5  0.0000007  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.25847  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2480  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  21.3 
 
 		 1022 aa  58.2  0.0000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_3201  TPR repeat-containing protein  24.32 
 
 		 955 aa  57.8  0.000001  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.0757905 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0651  TPR repeat-containing protein  24.24 
 
 		 878 aa  57.8  0.000001  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.10746  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2862  TPR repeat-containing protein  24.29 
 
 		 448 aa  57.4  0.000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.375816 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2854  glycosyl transferase family 2  22.9 
 
 		 1252 aa  56.2  0.000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.956112  normal  0.0955707 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2523  hypothetical protein  24.23 
 
 		 795 aa  56.6  0.000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.184422  normal  0.460331 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2515  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  27.33 
 
 		 265 aa  56.6  0.000003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000326196  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1492  glycosyl transferase family protein  20.88 
 
 		 1737 aa  56.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.315595  normal  0.552274 
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1516  tetratricopeptide repeat family protein  21.43 
 
 		 561 aa  56.2  0.000003  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2526  hypothetical protein  21.47 
 
 		 732 aa  55.8  0.000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0463083 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0060  TPR repeat-containing protein  24.43 
 
 		 562 aa  55.8  0.000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0122  glycosyl transferase, group 1  25 
 
 		 3301 aa  55.8  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.326818 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2708  tetratricopeptide TPR_2  24.46 
 
 		 979 aa  56.2  0.000004  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.169437 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7517  hypothetical protein  25 
 
 		 703 aa  55.8  0.000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.328747  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_0540  peptidase C14 caspase catalytic subunit p20  22.98 
 
 		 1056 aa  55.5  0.000005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0423513  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6918  TPR repeat-containing protein  20.23 
 
 		 847 aa  55.8  0.000005  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.378966  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24081  hypothetical protein  25.13 
 
 		 764 aa  55.5  0.000006  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2417  TPR repeat-containing protein  23.34 
 
 		 762 aa  55.5  0.000006  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2139  TPR repeat-containing protein  29.49 
 
 		 654 aa  55.1  0.000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.43176  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1704  TPR repeat-containing protein  26.71 
 
 		 265 aa  55.1  0.000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.12979e-21 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0987  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 611 aa  54.7  0.000008  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.384547  normal  0.0740288 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4945  TPR repeat-containing protein  22.92 
 
 		 750 aa  54.7  0.000008  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4803  tetratricopeptide TPR_3  26.87 
 
 		 340 aa  54.7  0.000009  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4770  sulfotransferase  25.24 
 
 		 887 aa  54.7  0.000009  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.185793 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3267  glycosyl transferase family 2  23.19 
 
 		 1252 aa  54.7  0.000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1172  TPR repeat-containing protein  23.67 
 
 		 4079 aa  54.3  0.00001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3213  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.25 
 
 		 639 aa  54.7  0.00001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  unclonable  0.000022774  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3120  TPR repeat-containing protein  28.65 
 
 		 767 aa  54.7  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0215  TPR repeat-containing protein  29.3 
 
 		 2262 aa  53.1  0.00002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0297822 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0693  TPR repeat-containing protein  26.98 
 
 		 395 aa  53.5  0.00002  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.0712051  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2893  O-linked N-acetylglucosamine transferase  23.3 
 
 		 397 aa  53.5  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.272299 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1619  TPR domain-containing protein  26.82 
 
 		 626 aa  53.5  0.00002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0978258  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0516  TPR repeat-containing protein  25.54 
 
 		 673 aa  53.5  0.00002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000776603  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1432  TPR domain-containing protein  20.71 
 
 		 573 aa  52.8  0.00003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4141  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 637 aa  52.8  0.00003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.780051  normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0301  TPR repeat-containing protein  25.44 
 
 		 1827 aa  52.8  0.00003  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02961  hypothetical protein  24.39 
 
 		 594 aa  53.1  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0722  TPR repeat-containing protein  27.08 
 
 		 615 aa  52.8  0.00003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.434562 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2369  TPR repeat-containing protein  28.33 
 
 		 639 aa  52.8  0.00004  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.319986  normal  1 
 
 
-
 
NC_009425  Ent638_4265  TPR repeat-containing protein  24.91 
 
 		 697 aa  52.4  0.00004  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0436  tetratricopeptide TPR_2  22.06 
 
 		 1056 aa  52.4  0.00005  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0646  TPR repeat-containing protein  30.84 
 
 		 611 aa  52.4  0.00005  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0665559  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3191  TPR domain-containing protein  22.22 
 
 		 638 aa  51.6  0.00007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7855  TPR domain-containing protein  29.37 
 
 		 648 aa  51.6  0.00007  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.126864 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1745  TPR repeat-containing protein  26.47 
 
 		 402 aa  52  0.00007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2680  peptidase S41  22.92 
 
 		 745 aa  51.6  0.00007  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.20871  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1094  TPR repeat-containing protein  26.27 
 
 		 685 aa  51.6  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19711  hypothetical protein  33.33 
 
 		 865 aa  51.6  0.00008  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.372007  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3865  TPR repeat protein  28.86 
 
 		 503 aa  51.2  0.00009  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4211  TPR repeat-containing protein  25.8 
 
 		 522 aa  51.6  0.00009  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.185796 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2735  TPR repeat-containing protein  26.4 
 
 		 384 aa  50.8  0.0001  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1796  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  24.24 
 
 		 465 aa  51.2  0.0001  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.769841  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1719  TPR repeat-containing protein  31.11 
 
 		 583 aa  51.2  0.0001  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3770  TPR domain protein  27.63 
 
 		 420 aa  51.2  0.0001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0549  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 635 aa  51.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0481  TPR repeat-containing protein  22.22 
 
 		 3145 aa  50.8  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.948354 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1028  TPR repeat-containing protein  26.14 
 
 		 635 aa  51.2  0.0001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.608823  n/a   
 
 
-
 
NC_002950  PG0954  TPR domain-containing protein  27.59 
 
 		 579 aa  50.4  0.0002  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.178394 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0602  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  25.4 
 
 		 645 aa  50.1  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00000607684  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0441  TPR repeat-containing protein  26.49 
 
 		 1085 aa  50.8  0.0002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  0.239248 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2895  O-linked N-acetylglucosamine transferase  30.97 
 
 		 292 aa  50.4  0.0002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  0.0140366 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_24101  hypothetical protein  28.87 
 
 		 725 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3747  TPR repeat-containing protein  30.25 
 
 		 1005 aa  50.4  0.0002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_02811  hypothetical protein  23.47 
 
 		 837 aa  50.1  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.370164 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_18191  hypothetical protein  31.18 
 
 		 425 aa  50.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  0.888115 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1187  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  23.21 
 
 		 293 aa  50.4  0.0002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0548059  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0955  tetratricopeptide TPR_2  21.22 
 
 		 635 aa  50.4  0.0002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  0.750671 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3831  Tetratricopeptide TPR_2 repeat protein  30.08 
 
 		 1034 aa  50.4  0.0002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0133068 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2707  glycosyl transferase family protein  18.52 
 
 		 1486 aa  50.8  0.0002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.228337 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0087  TPR repeat-containing protein  32.67 
 
 		 366 aa  50.4  0.0002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3333  TPR repeat-containing protein  28.05 
 
 		 274 aa  49.7  0.0003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.34116  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1657  TPR repeat-containing protein  21.95 
 
 		 594 aa  49.7  0.0003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.0658919  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_19131  hypothetical protein  23.96 
 
 		 936 aa  49.7  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.105709 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0031  TPR repeat-containing protein  25.48 
 
 		 522 aa  49.7  0.0003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.918489 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1787  TPR repeat-containing protein  27.83 
 
 		 543 aa  49.3  0.0004  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.662156  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2604  TPR repeat-containing protein  21.32 
 
 		 927 aa  49.3  0.0004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.010408  normal  0.426767 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2904  TPR repeat-containing protein  29.73 
 
 		 265 aa  49.3  0.0004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000121078  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_2530  TPR repeat-containing protein  27.92 
 
 		 608 aa  49.3  0.0004  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187337  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2917  SEFIR domain protein  23.67 
 
 		 1611 aa  49.3  0.0004  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.362761  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>