93 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2082 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2082  NHL repeat containing protein  100 
 
 
660 aa  1305    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2986  PA14 domain-containing protein  30.24 
 
 
1293 aa  100  9e-20  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0755  Carbohydrate binding family 6  27.86 
 
 
627 aa  97.8  5e-19  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.40711 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1421  NHL repeat containing protein  27.57 
 
 
930 aa  94.7  4e-18  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.368909  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2630  PKD domain containing protein  25.17 
 
 
930 aa  82  0.00000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.668358  decreased coverage  0.0001414 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0416  hypothetical protein  31.12 
 
 
346 aa  82  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.0322809  normal  0.695963 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1389  periplasmic copper-binding  26.52 
 
 
709 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0136597  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0423  NHL repeat containing protein  27.57 
 
 
831 aa  81.6  0.00000000000004  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0378567  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2631  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  29.46 
 
 
343 aa  79  0.0000000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.118189  hitchhiker  0.000564983 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2074  NHL repeat containing protein  27.31 
 
 
522 aa  76.6  0.000000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.614793 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3620  putative surface layer protein  25.27 
 
 
752 aa  75.5  0.000000000003  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1345  NHL repeat containing protein  26.35 
 
 
676 aa  74.7  0.000000000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.871064 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_2369  NHL repeat containing protein  25 
 
 
579 aa  72.8  0.00000000002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.547997 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2137  hypothetical protein  32.06 
 
 
322 aa  71.6  0.00000000004  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.982688 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0295  hypothetical protein  33.56 
 
 
239 aa  70.9  0.00000000008  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.54265 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1474  NHL repeat containing protein  27.6 
 
 
668 aa  70.1  0.0000000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0914572  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1601  NHL repeat-containing protein  27.51 
 
 
491 aa  69.7  0.0000000002  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.0447928  normal  0.136115 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1273  NHL repeat containing protein  29.56 
 
 
387 aa  68.9  0.0000000003  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.349999  normal  0.851657 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0408  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  28.44 
 
 
693 aa  65.5  0.000000003  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.785735  normal  0.15039 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1167  hypothetical protein  23.65 
 
 
588 aa  63.9  0.00000001  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.233122  normal  0.0121867 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1395  NHL repeat containing protein  29.41 
 
 
391 aa  61.2  0.00000005  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.597363 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1050  NHL repeat-containing protein  27.83 
 
 
318 aa  60.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.400914  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1056  NHL repeat-containing protein  27.9 
 
 
328 aa  60.5  0.00000009  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0422  hypothetical protein  25.79 
 
 
1068 aa  59.3  0.0000002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.248115  normal 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0370  Fibronectin type III domain protein  25.16 
 
 
841 aa  57.8  0.0000006  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.800383  normal  0.932394 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1869  NHL repeat containing protein  25 
 
 
307 aa  57.8  0.0000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4618  NHL repeat-containing protein  26.23 
 
 
1026 aa  57.4  0.0000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0840  NHL repeat containing protein  27.62 
 
 
390 aa  57  0.000001  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0361513  normal  0.0920788 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7287  serine/threonine protein kinase  27.84 
 
 
892 aa  57  0.000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0443497  normal  0.301808 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0728  serine/threonine protein kinase  27.22 
 
 
683 aa  55.5  0.000003  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2818  hypothetical protein  24.5 
 
 
392 aa  55.5  0.000003  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.587259  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4764  NHL repeat-containing protein  28.04 
 
 
284 aa  55.5  0.000003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0242  NHL repeat-containing protein  26.83 
 
 
1146 aa  54.3  0.000007  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00900908 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2150  hypothetical protein  27.75 
 
 
321 aa  53.9  0.000008  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.909302 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0816  twin-arginine translocation pathway signal  29.17 
 
 
414 aa  53.9  0.000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0923  NHL repeat-containing protein  27.81 
 
 
379 aa  53.1  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3164  NHL repeat containing protein  28.1 
 
 
297 aa  53.9  0.00001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2135  hypothetical protein  30.71 
 
 
326 aa  52.8  0.00002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_4759  NHL repeat-containing protein  37.88 
 
 
211 aa  52.4  0.00003  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0256  NHL repeat-containing protein  32.41 
 
 
384 aa  52  0.00003  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0556  immunoglobulin I-set domain-containing protein  26.97 
 
 
1130 aa  52.4  0.00003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.329662  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0355  NHL repeat-containing protein  25.47 
 
 
1030 aa  51.6  0.00004  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.64892  normal  0.0641589 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2854  SMP-30/gluconolaconase/LRE domain-containing protein  26.49 
 
 
1292 aa  51.6  0.00005  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0274394  normal  0.093276 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1869  NHL repeat-containing protein  27.27 
 
 
353 aa  51.6  0.00005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.0563587 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3222  NHL repeat-containing protein  25.18 
 
 
412 aa  51.2  0.00005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0293  NHL repeat-containing protein  25.83 
 
 
1163 aa  51.6  0.00005  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.368653  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7086  serine/threonine protein kinase  31.47 
 
 
732 aa  51.2  0.00005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2758  NHL repeat-containing protein  25.4 
 
 
396 aa  51.2  0.00006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2878  hypothetical protein  30.16 
 
 
364 aa  50.8  0.00007  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.461679  normal  0.172876 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5930  NHL repeat containing protein  30 
 
 
367 aa  50.8  0.00008  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU3225  NHL repeat-containing protein  29.69 
 
 
365 aa  50.4  0.00009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4570  NHL repeat containing protein  33.33 
 
 
353 aa  50.1  0.0001  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal  0.532406 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2782  cell surface protein  25.73 
 
 
2122 aa  50.1  0.0001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.759691  hitchhiker  0.00484383 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1960  Carbohydrate binding family 6  30.19 
 
 
786 aa  49.7  0.0002  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0676284  normal  0.0447838 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1260  Type I secretion outer membrane protein, TolC  36 
 
 
372 aa  49.7  0.0002  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.551998  hitchhiker  0.00024653 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1305  Pyrrolo-quinoline quinone  25.11 
 
 
324 aa  49.3  0.0002  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.551369  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_3735  outer membrane protein  28.57 
 
 
670 aa  49.3  0.0002  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10949  transmembrane serine/threonine-protein kinase D pknD  25.11 
 
 
664 aa  49.3  0.0002  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3475  NHL repeat protein  42.42 
 
 
1140 aa  49.7  0.0002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1997  NHL repeat-containing protein  26.25 
 
 
303 aa  49.7  0.0002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000426581  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1962  peptidylglycine monooxygenase-like  26.63 
 
 
375 aa  48.9  0.0003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.217601  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1472  NHL/RHS/YD repeat-containing protein  25.44 
 
 
1834 aa  48.9  0.0003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1788  NHL repeat-containing protein  25.11 
 
 
354 aa  49.3  0.0003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.565326  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1379  Pyrrolo-quinoline quinone  27.17 
 
 
322 aa  48.9  0.0003  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0477  NHL repeat-containing protein  30.65 
 
 
525 aa  48.9  0.0003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.176502 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1297  Pyrrolo-quinoline quinone  26.01 
 
 
322 aa  48.5  0.0003  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.315704  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3789  putative hydrolase  25.76 
 
 
285 aa  48.5  0.0004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  hitchhiker  0.00804259  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1132  hypothetical protein  28.27 
 
 
323 aa  48.5  0.0004  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.425317  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4089  serine/threonine protein kinase  27.6 
 
 
772 aa  48.1  0.0005  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.205571  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3162  NHL repeat containing protein  23.45 
 
 
395 aa  48.1  0.0005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3259  NHL repeat containing protein  27.37 
 
 
297 aa  48.1  0.0005  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3430  hypothetical protein  29.19 
 
 
913 aa  48.1  0.0006  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.836468  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2158  NHL repeat-containing protein  24.3 
 
 
1750 aa  47.8  0.0007  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2914  NHL repeat-containing protein  32.35 
 
 
898 aa  47.4  0.0008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0718376  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3865  NHL repeat-containing protein  27.91 
 
 
1177 aa  47.4  0.0009  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0086  NHL repeat-containing protein  31.58 
 
 
680 aa  46.6  0.001  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1988  hypothetical protein  26.61 
 
 
322 aa  47  0.001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1414  SMP-30/Gluconolaconase/LRE domain protein  26.35 
 
 
279 aa  47  0.001  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal  0.853392 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4088  serine/threonine protein kinase  30.17 
 
 
850 aa  47  0.001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.527089  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7288  serine/threonine protein kinase  27.62 
 
 
807 aa  45.8  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.134567  normal  0.30608 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3465  copper amine oxidase domain protein  23.81 
 
 
447 aa  46.2  0.002  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0391  Pyrrolo-quinoline quinone  24.88 
 
 
486 aa  45.4  0.003  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  decreased coverage  0.00019845  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1109  NHL repeat-containing protein  26 
 
 
521 aa  45.4  0.003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.607782  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0746  NHL repeat-containing protein  30.95 
 
 
418 aa  45.1  0.004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1358  NHL repeat containing protein  26.47 
 
 
646 aa  44.7  0.005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal  0.967304 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3109  NHL repeat containing protein  23.55 
 
 
355 aa  44.7  0.006  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4723  NHL repeat containing protein  24.57 
 
 
1079 aa  44.7  0.006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.645184  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3066  NHL repeat-containing protein  25.45 
 
 
297 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1325  YD repeat protein  26.67 
 
 
2350 aa  44.3  0.007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2542  OmpA/MotB domain protein  34.15 
 
 
704 aa  44.3  0.007  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.0186796 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0556  NHL repeat-containing protein  32.46 
 
 
899 aa  43.9  0.008  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7126  serine/threonine protein kinase  43.08 
 
 
770 aa  44.3  0.008  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4135  NHL repeat-containing protein  30.71 
 
 
368 aa  43.9  0.008  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>