More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2064 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2064  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  260  4e-69  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0776  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 121 aa  105  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.428997  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1289  chemotaxis protein CheY  40.17 
 
 		 121 aa  103  1e-21  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1625  response regulator receiver domain-containing protein  42.15 
 
 		 120 aa  100  5e-21  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  0.608115 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2428  response regulator receiver domain-containing protein  38.46 
 
 		 128 aa  98.6  3e-20  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0310268  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0880  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 123 aa  98.2  3e-20  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  39.83 
 
 		 2458 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0896  CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 1725 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.720203  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1020  putative CheA signal transduction histidine kinase  41.18 
 
 		 1725 aa  97.8  4e-20  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  39.83 
 
 		 2476 aa  97.8  4e-20  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0631  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 121 aa  97.8  5e-20  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1329  CheA signal transduction histidine kinase  42.37 
 
 		 777 aa  97.4  5e-20  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1417  response regulator receiver protein  40.17 
 
 		 120 aa  97.4  6e-20  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.212789  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  40.71 
 
 		 1758 aa  97.4  6e-20  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1606  response regulator receiver protein  36.21 
 
 		 121 aa  97.1  8e-20  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  39.5 
 
 		 1989 aa  96.7  9e-20  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2168  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 120 aa  96.7  9e-20  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.747517  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3350  CheA signal transduction histidine kinases  44.54 
 
 		 1970 aa  95.9  1e-19  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2900  putative CheA signal transduction histidine kinase  39.67 
 
 		 1974 aa  96.3  1e-19  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  39.66 
 
 		 2048 aa  95.9  2e-19  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1813  putative hybrid two-component sensor and regulatory protein  40.68 
 
 		 2284 aa  95.1  2e-19  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.409027  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2324  two component LuxR family transcriptional regulator  40.17 
 
 		 245 aa  95.9  2e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42123  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_2096  CheA signal transduction histidine kinases  40.68 
 
 		 2301 aa  95.9  2e-19  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2396  response regulator receiver protein  45.87 
 
 		 126 aa  95.5  2e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.612966  normal  0.464694 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  39.52 
 
 		 2423 aa  95.5  2e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1866  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  44.25 
 
 		 326 aa  95.5  2e-19  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1264  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0578681  hitchhiker  0.00155192 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4622  CheA signal transduction histidine kinase  44.95 
 
 		 2022 aa  94.7  3e-19  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1234  response regulator receiver protein  31.4 
 
 		 122 aa  95.1  3e-19  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_2969  two component transcriptional regulator  43.1 
 
 		 229 aa  94.4  4e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  decreased coverage  0.000000855765  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1375  CheA signal transduction histidine kinases  41.03 
 
 		 1888 aa  94  6e-19  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3427  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 126 aa  94  7e-19  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.296723  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1873  response regulator receiver  43.75 
 
 		 326 aa  94  7e-19  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.402703 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 2012 aa  94  7e-19  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3692  CheA signal transduction histidine kinase  41.03 
 
 		 1907 aa  93.6  8e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2957  CheA signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 758 aa  93.6  8e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3085  CheA signal transduction histidine kinase  40.52 
 
 		 2212 aa  93.6  8e-19  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  1  normal  0.284349 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2804  response regulator receiver protein  41.88 
 
 		 139 aa  93.6  9e-19  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.202418  normal  0.168942 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0616  CheA signal transduction histidine kinase  38.14 
 
 		 2009 aa  93.6  9e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1576  CheA signal transduction histidine kinase  39.83 
 
 		 2137 aa  92.8  1e-18  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.167147  normal  0.557453 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1980  chemotaxis protein CheY  41.03 
 
 		 124 aa  93.2  1e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.26082  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1340  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  43.2 
 
 		 457 aa  93.2  1e-18  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1339  response regulator receiver protein  37.19 
 
 		 126 aa  93.2  1e-18  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.336226  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02869  chemotaxis protein CheY  39.67 
 
 		 131 aa  92.8  1e-18  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0269936  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0580  response regulator receiver protein  38.66 
 
 		 123 aa  93.2  1e-18  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0476  CheA signal transduction histidine kinase  41.23 
 
 		 1629 aa  92.8  1e-18  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1246  CheA signal transduction histidine kinases  37.07 
 
 		 1643 aa  93.2  1e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0708097  normal  0.755815 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4379  response regulator receiver protein  37.82 
 
 		 120 aa  93.2  1e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1739  response regulator receiver protein  35.34 
 
 		 121 aa  92.8  1e-18  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0375564  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  40.65 
 
 		 235 aa  93.2  1e-18  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2749  two component transcriptional regulator  41.38 
 
 		 241 aa  93.2  1e-18  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  decreased coverage  0.00000593879  unclonable  0.00000330773 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3772  CheA signal transduction histidine kinase  40.17 
 
 		 2539 aa  93.2  1e-18  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  36.89 
 
 		 239 aa  92.4  2e-18  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1861  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 126 aa  92  2e-18  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.218788  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  40.18 
 
 		 1987 aa  92  2e-18  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21640  two component transcriptional regulator, winged helix family  36.15 
 
 		 226 aa  92.8  2e-18  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000176926  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2839  response regulator receiver  42.98 
 
 		 748 aa  92  2e-18  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5304  CheA Signal transduction histidine Kinases (STHK)  41.96 
 
 		 1971 aa  92.4  2e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.266028 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2650  response regulator receiver protein  38.14 
 
 		 120 aa  92  2e-18  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0856  response regulator receiver domain-containing protein  36.52 
 
 		 120 aa  92.4  2e-18  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0758877  normal  0.0586548 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0333  CheA signal transduction histidine kinase  41.53 
 
 		 784 aa  92.4  2e-18  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.10768  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_3065  CheA signal transduction histidine kinase  42.98 
 
 		 748 aa  92  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.93771  normal  0.740192 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  39.32 
 
 		 2336 aa  92.4  2e-18  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1140  CheA signal transduction histidine kinases  41.88 
 
 		 2070 aa  92.8  2e-18  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.607614 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0193  response regulator receiver protein  39.66 
 
 		 127 aa  92.4  2e-18  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00528064  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0775  response regulator receiver protein  42.86 
 
 		 122 aa  92.4  2e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.212366  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0905  CheA signal transduction histidine kinase  43.12 
 
 		 2164 aa  92.8  2e-18  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.384813 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3186  twitching motility protein  39.52 
 
 		 2092 aa  92  3e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0988113  normal  0.323736 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  42.72 
 
 		 1992 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3436  response regulator receiver  38.84 
 
 		 128 aa  92  3e-18  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.169643  normal  0.60997 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3895  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  40.52 
 
 		 1866 aa  92  3e-18  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2795  response regulator receiver protein  36.61 
 
 		 121 aa  92  3e-18  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1564  response regulator receiver domain-containing protein  38.84 
 
 		 127 aa  92  3e-18  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.0533474  normal  0.0475001 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0989  CheA signal transduction histidine kinases  41.88 
 
 		 764 aa  91.7  3e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.166384  normal  0.27333 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1570  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.945276 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2994  response regulator receiver protein  35.04 
 
 		 121 aa  91.7  3e-18  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3029  response regulator receiver protein  40.5 
 
 		 127 aa  91.7  3e-18  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2186  CheA signal transduction histidine kinase  43.8 
 
 		 768 aa  91.7  3e-18  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01607  PilL protein  41.38 
 
 		 2301 aa  91.7  3e-18  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.68194  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2619  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  37.61 
 
 		 1956 aa  91.3  4e-18  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.51 
 
 		 227 aa  91.3  4e-18  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_3303  two component transcriptional regulator  39.17 
 
 		 229 aa  91.3  4e-18  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000702519  hitchhiker  0.00000106408 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_45620  two-component response regulator CheY  40.5 
 
 		 124 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.028564  normal  0.20809 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3871  two-component response regulator CheY  40.5 
 
 		 128 aa  91.3  4e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0838142  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2620  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1593  response regulator receiver protein  34.48 
 
 		 121 aa  90.9  5e-18  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2359  CheA signal transduction histidine kinase  37.29 
 
 		 756 aa  90.9  5e-18  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3017  CheA signal transduction histidine kinases  43.12 
 
 		 1983 aa  90.9  5e-18  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1208  phosphate regulon response regulator PhoB  35.83 
 
 		 233 aa  90.5  6e-18  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2107  response regulator receiver domain-containing protein  37.61 
 
 		 120 aa  90.9  6e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1176  response regulator receiver protein  39.32 
 
 		 126 aa  90.9  6e-18  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.149241  normal  0.34315 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1937  response regulator receiver domain-containing protein  40.34 
 
 		 121 aa  90.5  6e-18  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.644536  normal  1 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0146  response regulator receiver protein  36.13 
 
 		 121 aa  90.5  7e-18  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 1647 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 1646 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  41.07 
 
 		 1646 aa  90.5  8e-18  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0467  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 122 aa  90.1  8e-18  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1951  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  39.84 
 
 		 470 aa  90.1  8e-18  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.516267  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3791  response regulator receiver protein  38.84 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1598  response regulator receiver protein  38.02 
 
 		 120 aa  90.1  9e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00129925 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>