More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2054 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2054  two component transcriptional regulator, AraC family  100 
 
 
1201 aa  2454    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.695732  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3446  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.09 
 
 
791 aa  244  5e-63  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.285515  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3699  histidine kinase  33.53 
 
 
998 aa  238  4e-61  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1816  periplasmic sensor hybrid histidine kinase  34.17 
 
 
977 aa  236  2.0000000000000002e-60  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218789  normal  0.39116 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0204  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.69 
 
 
687 aa  236  2.0000000000000002e-60  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.478023 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0135  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  31.12 
 
 
858 aa  232  3e-59  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.711395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1722  histidine kinase  33.53 
 
 
1361 aa  226  2e-57  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.169999 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2495  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  33.27 
 
 
1362 aa  226  2e-57  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1052  sensory transduction histidine kinase  30.99 
 
 
1046 aa  226  3e-57  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2672  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.67 
 
 
991 aa  223  1.9999999999999999e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.646953  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0213  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.73 
 
 
974 aa  221  7e-56  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0934932  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2159  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33 
 
 
796 aa  219  2e-55  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.758044 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3552  Cache sensor hybrid histidine kinase  31.22 
 
 
970 aa  218  5.9999999999999996e-55  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2143  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.42 
 
 
755 aa  214  5.999999999999999e-54  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2208  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.1 
 
 
823 aa  214  5.999999999999999e-54  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.73393 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2420  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.07 
 
 
933 aa  213  2e-53  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.42243  hitchhiker  0.0000359369 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1526  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.59 
 
 
975 aa  207  8e-52  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.77 
 
 
1352 aa  207  9e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0022  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 
1356 aa  205  3e-51  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4217  PAS sensor protein  31.66 
 
 
792 aa  205  4e-51  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.423052  normal  0.639944 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4587  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.66 
 
 
803 aa  205  5e-51  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0699795  normal  0.0670662 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0587  ATP-binding region ATPase domain protein  28.67 
 
 
1161 aa  203  1.9999999999999998e-50  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3764  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.39 
 
 
917 aa  202  3e-50  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.432635  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2805  integral membrane sensor hybrid histidine kinase  32.49 
 
 
927 aa  201  5e-50  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3876  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1022 aa  201  7.999999999999999e-50  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00475  two-component system sensor histidine kinase-response regulator hybridprotein  30.33 
 
 
1364 aa  200  1.0000000000000001e-49  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.679058  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2145  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.55 
 
 
1271 aa  200  1.0000000000000001e-49  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.152151  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5109  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
2099 aa  200  2.0000000000000003e-49  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0669819 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6353  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.48 
 
 
1839 aa  200  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4734  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.04 
 
 
798 aa  199  2.0000000000000003e-49  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00660973 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.45 
 
 
1195 aa  195  5e-48  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3786  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.48 
 
 
1155 aa  194  7e-48  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3419  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.57 
 
 
1767 aa  194  8e-48  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.82 
 
 
1771 aa  192  2e-47  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1705  histidine kinase  29.92 
 
 
910 aa  192  2e-47  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.96 
 
 
1767 aa  192  2.9999999999999997e-47  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.08 
 
 
1767 aa  192  4e-47  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0626  histidine kinase  30.28 
 
 
1137 aa  191  7e-47  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2952  sensory box histidine kinase/response regulator  30.99 
 
 
1763 aa  190  1e-46  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.684028  normal  0.230032 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5393  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.54 
 
 
2099 aa  189  2e-46  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0480029  normal  0.0859175 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3847  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.38 
 
 
921 aa  189  2e-46  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0647  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.97 
 
 
1137 aa  189  3e-46  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0238  multi-component transcriptional regulator  31.23 
 
 
1629 aa  189  3e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1555  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.13 
 
 
1172 aa  189  3e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal  0.0698206 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3350  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase, HAMP region:histidine kinase A, N-terminal:Hpt  31.15 
 
 
923 aa  188  6e-46  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.634179 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0119  Signal transduction histidine kinase  32.84 
 
 
754 aa  187  8e-46  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.959467  normal  0.1561 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002502  BarA sensory histidine kinase  30.59 
 
 
932 aa  187  1.0000000000000001e-45  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.49 
 
 
1768 aa  186  2.0000000000000003e-45  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A2032  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.76 
 
 
927 aa  186  2.0000000000000003e-45  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.0864566  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1135  GAF sensor hybrid histidine kinase  30.2 
 
 
1142 aa  186  2.0000000000000003e-45  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0522922  normal  0.044499 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.93 
 
 
1165 aa  186  2.0000000000000003e-45  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0781  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.42 
 
 
1101 aa  186  3e-45  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.114215 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1136  GAF sensor hybrid histidine kinase  31.44 
 
 
1896 aa  184  6e-45  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.270239  normal  0.51439 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3719  sensor histidine kinase  28.3 
 
 
1278 aa  184  7e-45  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03530  hybrid sensory histidine kinase BarA  30 
 
 
932 aa  184  9.000000000000001e-45  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0647  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.7 
 
 
944 aa  184  9.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0902383 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.42 
 
 
1765 aa  184  1e-44  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3526  Hpt sensor hybrid histidine kinase  29.81 
 
 
920 aa  184  1e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00161337  normal 
 
 
-
 
NC_009507  Swit_5353  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.64 
 
 
1143 aa  183  2e-44  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.385348 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3396  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  29.5 
 
 
927 aa  182  2.9999999999999997e-44  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1035  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.07 
 
 
1201 aa  182  4.999999999999999e-44  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0366  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.3 
 
 
1266 aa  181  5.999999999999999e-44  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.926091  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1191  hybrid sensory histidine kinase BarA  31.27 
 
 
950 aa  181  5.999999999999999e-44  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.0000146059  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1576  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.86 
 
 
1267 aa  181  5.999999999999999e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0139  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
745 aa  181  7e-44  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.233978  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1284 aa  181  7e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.92301  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1250  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.06 
 
 
936 aa  181  7e-44  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1000  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.73 
 
 
1161 aa  181  1e-43  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_4248  ATP-binding region ATPase domain protein  27.55 
 
 
1196 aa  181  1e-43  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4432  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  26.82 
 
 
1002 aa  181  1e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4316  sensor histidine kinase  30.83 
 
 
1695 aa  180  1e-43  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.946527 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3505  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.54 
 
 
1784 aa  180  1e-43  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0425  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.81 
 
 
893 aa  180  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2394  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.61 
 
 
1788 aa  181  1e-43  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.0407078 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0859  sensory box histidine kinase/response regulator  28.99 
 
 
1765 aa  179  2e-43  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4582  sensor/response regulator hybrid  31.99 
 
 
925 aa  179  3e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4069  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.21 
 
 
1333 aa  178  4e-43  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000202305 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0540  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.22 
 
 
1816 aa  179  4e-43  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.46685  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4696  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.66 
 
 
1917 aa  179  4e-43  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.257042  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2689  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.63 
 
 
646 aa  178  5e-43  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.119288 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1200  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.67 
 
 
933 aa  178  5e-43  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.930165  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_0835  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.46 
 
 
1782 aa  178  6e-43  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0053  membrane associated response regulator,histidine kinase  27.9 
 
 
818 aa  177  7e-43  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.255701  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_52260  sensor/response regulator hybrid  31.92 
 
 
925 aa  178  7e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal  0.173365 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0357  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.98 
 
 
1310 aa  177  8e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.464939  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3028  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.16 
 
 
1426 aa  177  9e-43  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.514624  normal  0.437775 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4117  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.48 
 
 
948 aa  176  1.9999999999999998e-42  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.598015  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3768  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.62 
 
 
1954 aa  177  1.9999999999999998e-42  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_3355  hybrid sensory histidine kinase BarA  28.95 
 
 
937 aa  176  1.9999999999999998e-42  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0869798  hitchhiker  0.00259338 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4240  multi-sensor hybrid histidine kinase  29.28 
 
 
1064 aa  177  1.9999999999999998e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1950  PAS sensor protein  27.79 
 
 
1179 aa  177  1.9999999999999998e-42  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.488377  hitchhiker  0.000911769 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_0082  Hpt sensor hybrid histidine kinase  31.53 
 
 
866 aa  176  2.9999999999999996e-42  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0375698  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1217  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.87 
 
 
1877 aa  176  2.9999999999999996e-42  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0820  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.81 
 
 
1001 aa  175  3.9999999999999995e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3493  GAF sensor hybrid histidine kinase  28.98 
 
 
1782 aa  176  3.9999999999999995e-42  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.0298684  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4954  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.43 
 
 
1016 aa  175  5e-42  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal  0.0561599 
 
 
-
 
NC_011984  Avi_9103  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.96 
 
 
1145 aa  175  5e-42  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0913  PAS sensor protein  30.25 
 
 
2035 aa  175  5e-42  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.271495  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1942  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 
1038 aa  174  5.999999999999999e-42  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0482  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.8 
 
 
1681 aa  175  5.999999999999999e-42  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>