More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2051 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 247 aa  495  1e-139  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  84.98 
 
 		 239 aa  420  1e-116  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  84.55 
 
 		 243 aa  419  1e-116  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  75.76 
 
 		 243 aa  377  1e-104  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  51.57 
 
 		 229 aa  221  6e-57  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  51.12 
 
 		 229 aa  221  8e-57  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.72 
 
 		 233 aa  211  1e-53  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  48.21 
 
 		 229 aa  211  1e-53  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  49.78 
 
 		 231 aa  209  2e-53  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11045  transcriptional regulatory protein kdpE  43.05 
 
 		 226 aa  207  1e-52  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4088  response regulator receiver  43.05 
 
 		 231 aa  206  2e-52  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 224 aa  205  6e-52  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1174  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.0181894  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1136  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 239 aa  202  3e-51  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000652217  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1222  two component transcriptional regulator  47.35 
 
 		 235 aa  202  5e-51  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 232 aa  201  9e-51  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  47.11 
 
 		 233 aa  200  1.9999999999999998e-50  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1838  two component transcriptional regulator  46.15 
 
 		 239 aa  200  1.9999999999999998e-50  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.00000194698  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  45.29 
 
 		 234 aa  200  1.9999999999999998e-50  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 226 aa  199  3e-50  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4763  two component transcriptional regulator  42.17 
 
 		 230 aa  199  3e-50  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.96205  normal  1 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2942  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.29 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0716  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.29 
 
 		 225 aa  199  3.9999999999999996e-50  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0593355  normal  0.505732 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.39 
 
 		 231 aa  199  5e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0741  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.29 
 
 		 225 aa  199  5e-50  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.000675118  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  44.84 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0720  DNA-binding transcriptional activator KdpE  45.29 
 
 		 225 aa  198  5e-50  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0669037  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  44.84 
 
 		 232 aa  198  5e-50  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  44.84 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4253  two component transcriptional regulator  45.54 
 
 		 228 aa  198  6e-50  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  44.84 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  44.84 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  44.84 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  44.84 
 
 		 234 aa  198  6e-50  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00651  DNA-binding response regulator in two-component regulatory system with KdpD  44.84 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_0386  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 229 aa  197  1.0000000000000001e-49  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_2540  two component transcriptional regulator  44.59 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.98 
 
 		 228 aa  197  1.0000000000000001e-49  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00642  hypothetical protein  44.84 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2962  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.84 
 
 		 225 aa  197  1.0000000000000001e-49  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1244  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.6 
 
 		 229 aa  197  2.0000000000000003e-49  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00224308  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 236 aa  196  2.0000000000000003e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0787  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.84 
 
 		 225 aa  197  2.0000000000000003e-49  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5362  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 230 aa  196  3e-49  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.0748621 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1206  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 225 aa  196  4.0000000000000005e-49  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00352252 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3778  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.05 
 
 		 232 aa  195  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0820994  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1708  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.11 
 
 		 228 aa  195  5.000000000000001e-49  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.476364 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 231 aa  195  5.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  44.49 
 
 		 239 aa  195  6e-49  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1196  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 240 aa  195  6e-49  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1079  two component transcriptional regulator  41.96 
 
 		 230 aa  195  7e-49  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  45.09 
 
 		 230 aa  194  8.000000000000001e-49  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc3087  response regulator transcription regulator protein  44.39 
 
 		 234 aa  194  9e-49  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.160744  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.5 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  47.53 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4649  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 230 aa  194  1e-48  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.424735  normal  1 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.41 
 
 		 231 aa  194  1e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  44.84 
 
 		 232 aa  194  1e-48  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0555  DNA-binding transcriptional activator KdpE  44.39 
 
 		 225 aa  194  1e-48  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_3023  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0875  two component transcriptional regulator  43.33 
 
 		 242 aa  193  2e-48  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  decreased coverage  0.000486966  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1269  two component transcriptional regulator  44.14 
 
 		 228 aa  193  2e-48  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0299  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.75 
 
 		 231 aa  194  2e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.867846 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 232 aa  193  2e-48  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  45.41 
 
 		 245 aa  193  2e-48  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 227 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3370  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.69 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0421  two component transcriptional regulator  45.85 
 
 		 245 aa  192  3e-48  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0518956  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  41.7 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2604  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.75 
 
 		 246 aa  193  3e-48  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 232 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 232 aa  193  3e-48  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.5 
 
 		 232 aa  192  3e-48  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  42.15 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3050  two component transcriptional regulator  43.5 
 
 		 224 aa  192  4e-48  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.519152  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  192  4e-48  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  42.86 
 
 		 236 aa  192  5e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4990  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.09 
 
 		 230 aa  191  7e-48  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  42.73 
 
 		 231 aa  191  7e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1237  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 232 aa  191  8e-48  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  43.23 
 
 		 236 aa  191  8e-48  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0860  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.15 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  42.15 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0750  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.15 
 
 		 225 aa  191  9e-48  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.358042  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1214  DNA-binding transcriptional activator KdpE  42.86 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00514307  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_2927  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 228 aa  191  1e-47  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  49.33 
 
 		 229 aa  191  1e-47  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2867  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.05 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1554  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.7 
 
 		 229 aa  190  2e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00709514 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A3578  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.81 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.693422  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  40.69 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  44.39 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  43.56 
 
 		 232 aa  190  2e-47  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5960  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.34 
 
 		 226 aa  190  2e-47  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.891848  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 231 aa  190  2e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.53 
 
 		 238 aa  190  2e-47  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1102  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.81 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  hitchhiker  0.000000603864  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1155  DNA-binding transcriptional activator KdpE  43.81 
 
 		 209 aa  190  2e-47  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.232679  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3780  two component transcriptional regulator  46.46 
 
 		 233 aa  190  2e-47  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.33 
 
 		 231 aa  189  2.9999999999999997e-47  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>