More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2047 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2047  response regulator receiver and ANTAR domain protein  100 
 
 
191 aa  377  1e-104  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  unclonable  0.000000169009  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3658  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  87.83 
 
 
194 aa  335  1.9999999999999998e-91  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.568485 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4102  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  87.3 
 
 
194 aa  334  5e-91  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4203  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  78.53 
 
 
195 aa  318  1.9999999999999998e-86  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.793788  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1110  response regulator receiver and ANTAR domain protein  65.97 
 
 
197 aa  257  8e-68  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0520878  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1081  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  56.67 
 
 
247 aa  218  3.9999999999999997e-56  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_25990  response regulator with putative antiterminator output domain protein  56.22 
 
 
204 aa  216  1e-55  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2955  response regulator  56.52 
 
 
199 aa  216  2e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1223  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.59 
 
 
229 aa  215  4e-55  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal  0.788892 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  56.52 
 
 
212 aa  213  9.999999999999999e-55  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5687  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.68 
 
 
210 aa  212  2.9999999999999995e-54  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1181  response regulator receiver  55.98 
 
 
207 aa  211  5.999999999999999e-54  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.928438  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.95 
 
 
220 aa  210  1e-53  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1977  response regulator receiver and ANTAR domain protein  55.14 
 
 
227 aa  210  1e-53  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.239234  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3151  response regulator receiver  54.95 
 
 
206 aa  209  2e-53  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.332536 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_1506  response regulator receiver and ANTAR domain protein  54.95 
 
 
220 aa  208  5e-53  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_2035  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.75 
 
 
199 aa  207  6e-53  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.480822 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1468  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  54.89 
 
 
197 aa  207  6e-53  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20250  response regulator with putative antiterminator output domain  54.95 
 
 
226 aa  207  9e-53  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  normal  0.0947543 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1618  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.65 
 
 
199 aa  206  1e-52  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.144201  normal  0.292856 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3575  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.3 
 
 
229 aa  206  1e-52  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.10936  normal  0.0183031 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5540  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.3 
 
 
200 aa  206  2e-52  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3021  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.3 
 
 
210 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3067  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.3 
 
 
210 aa  205  2e-52  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_14950  response regulator with putative antiterminator output domain  52.43 
 
 
215 aa  205  3e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.117628  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3036  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  53.3 
 
 
210 aa  205  3e-52  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.222389  normal  0.216241 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3378  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  54.95 
 
 
206 aa  205  4e-52  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0248143 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3208  response regulator receiver and ANTAR domain protein  56.59 
 
 
200 aa  204  6e-52  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2840  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.2 
 
 
213 aa  204  8e-52  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0401204  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3061  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.3 
 
 
194 aa  203  1e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00113676  hitchhiker  0.000689676 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2958  response regulator receiver and ANTAR domain protein  53.26 
 
 
229 aa  201  4e-51  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.799557  normal  0.502809 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1689  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.89 
 
 
201 aa  201  7e-51  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000385738 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2517  response regulator receiver and ANTAR domain protein  49.73 
 
 
194 aa  200  9.999999999999999e-51  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1694  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  51.89 
 
 
201 aa  200  9.999999999999999e-51  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.136848  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2860  response regulator receiver and ANTAR domain protein  52.75 
 
 
214 aa  199  1.9999999999999998e-50  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.153721  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_11030  response regulator with putative antiterminator output domain  52.75 
 
 
198 aa  199  1.9999999999999998e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.241703  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2893  response regulator receiver  51.65 
 
 
206 aa  197  7e-50  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.723289  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_11642  two component system transcriptional regulator  51.65 
 
 
205 aa  197  9e-50  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  0.0378541  normal  0.634495 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2483  response regulator receiver and ANTAR domain protein  51.04 
 
 
205 aa  192  2e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1146  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  52.2 
 
 
188 aa  191  4e-48  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000000356105  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2822  response regulator  52.17 
 
 
191 aa  191  5e-48  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3761  response regulator receiver and ANTAR domain protein  48.17 
 
 
194 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000015775  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_3775  response regulator receiver and ANTAR domain-containing protein  50 
 
 
207 aa  187  5.999999999999999e-47  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.665226  normal  0.0118196 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3018  response regulator receiver  53.85 
 
 
207 aa  187  5.999999999999999e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_12950  response regulator with putative antiterminator output domain  49.45 
 
 
189 aa  186  2e-46  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.22629  normal  0.269406 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2808  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.68 
 
 
220 aa  186  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00041222  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3118  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  47.12 
 
 
196 aa  183  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0660  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  48.91 
 
 
202 aa  182  2.0000000000000003e-45  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.132289  normal  0.0166929 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2361  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  46.6 
 
 
196 aa  180  1e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1295  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.46 
 
 
208 aa  172  1.9999999999999998e-42  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.153579  normal  0.0128304 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2028  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.92 
 
 
192 aa  171  3.9999999999999995e-42  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  hitchhiker  0.000049817  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0084  response regulator receiver and ANTAR domain protein  43.32 
 
 
242 aa  169  2e-41  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.682854  n/a   
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0739  putative response regulator  44.02 
 
 
261 aa  169  3e-41  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  hitchhiker  0.000540248  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2933  response regulator receiver and ANTAR domain protein  45.03 
 
 
194 aa  168  5e-41  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0803562  normal  0.225953 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0616  response regulator receiver domain protein  43.56 
 
 
249 aa  166  2e-40  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0888  response regulator  43.55 
 
 
191 aa  165  2.9999999999999998e-40  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2091  response regulator  43.24 
 
 
187 aa  164  5.9999999999999996e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3764  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.47 
 
 
194 aa  163  1.0000000000000001e-39  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0425638  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3459  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  43.65 
 
 
205 aa  162  4.0000000000000004e-39  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0297  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.43 
 
 
195 aa  151  5.9999999999999996e-36  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.719259  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4357  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.56 
 
 
198 aa  150  1e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.480943  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1051  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.64 
 
 
192 aa  150  1e-35  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1081  response regulator receiver and ANTAR domain protein  42.63 
 
 
203 aa  146  2.0000000000000003e-34  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1289  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  41.21 
 
 
221 aa  143  1e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.132207  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2177  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  39.78 
 
 
190 aa  141  7e-33  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5028  response regulator receiver and ANTAR domain protein  40.64 
 
 
198 aa  140  9e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.181706  normal  0.0113639 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1293  response regulator receiver protein  50.71 
 
 
159 aa  137  7.999999999999999e-32  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2864  Fis family transcriptional regulator  39.57 
 
 
191 aa  135  3.0000000000000003e-31  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000561884  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2031  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  36.02 
 
 
198 aa  129  2.0000000000000002e-29  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  unclonable  0.00000000027462  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0963  response regulator receiver and ANTAR domain protein  34.55 
 
 
191 aa  121  6e-27  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.0000231614  normal 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2282  histidine kinase  42.65 
 
 
667 aa  115  5e-25  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2811  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  35.48 
 
 
191 aa  114  6e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.00444481  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4528  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  40.85 
 
 
196 aa  113  2.0000000000000002e-24  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0678  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.48 
 
 
243 aa  113  2.0000000000000002e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2394  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.71 
 
 
218 aa  111  5e-24  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00108275  hitchhiker  0.000509226 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1528  response regulator receiver protein  48.36 
 
 
450 aa  111  7.000000000000001e-24  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  hitchhiker  0.00374994  normal  0.77554 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1632  response regulator receiver and ANTAR domain protein  37.1 
 
 
207 aa  111  8.000000000000001e-24  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.0623893 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2677  response regulator receiver sensor hybrid histidine kinase  44.19 
 
 
636 aa  110  2.0000000000000002e-23  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.068934 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1455  response regulator receiver and ANTAR domain protein  35.75 
 
 
195 aa  109  2.0000000000000002e-23  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.770993 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1724  response regulator receiver domain-containing protein  43.55 
 
 
352 aa  107  1e-22  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1448  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  31.38 
 
 
196 aa  104  8e-22  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0588  response regulator NasT  30.48 
 
 
191 aa  104  9e-22  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.419145  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1813  response regulator receiver protein  42.86 
 
 
316 aa  103  1e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.445517  normal  0.445863 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1488  response regulator receiver protein  44.07 
 
 
450 aa  101  6e-21  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.379239 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3178  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase with PAS/PAC sensor  36.13 
 
 
426 aa  99  4e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1808  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
603 aa  98.6  5e-20  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.268482 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_5900  two component response regulator  34.72 
 
 
195 aa  98.2  6e-20  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2637  putative PAS/PAC sensor protein  41.6 
 
 
461 aa  97.8  8e-20  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1151  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  28.02 
 
 
195 aa  97.4  1e-19  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2506  response regulator receiver/ANTAR domain-containing protein  30.65 
 
 
221 aa  97.4  1e-19  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.187461  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1497  putative PAS/PAC sensor protein  40 
 
 
380 aa  97.4  1e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.506851  normal  0.137069 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1738  response regulator receiver protein  41.53 
 
 
122 aa  96.7  2e-19  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0066  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.96 
 
 
377 aa  95.9  3e-19  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.359193  normal  0.0132857 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_5014  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31.61 
 
 
195 aa  95.9  3e-19  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.757534 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2285  response regulator receiver  42.4 
 
 
130 aa  95.5  4e-19  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  hitchhiker  0.000158247  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4498  ANTAR domain-containing protein  30.64 
 
 
195 aa  95.5  5e-19  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1494  response regulator  30 
 
 
194 aa  94.4  8e-19  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.621557  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4326  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  43.2 
 
 
571 aa  94  1e-18  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3039  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  42.86 
 
 
355 aa  93.6  1e-18  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.610599  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4961  response regulator receiver and ANTAR domain protein  30.64 
 
 
195 aa  93.6  2e-18  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.044252 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>