More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2020 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_2020  single-strand binding protein  100 
 
 		 126 aa  258  2e-68  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.00175419  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1771  single-strand binding protein  52.54 
 
 		 138 aa  129  1.0000000000000001e-29  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0689148  normal  0.0680563 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4370  single-strand binding protein  55.75 
 
 		 119 aa  127  4.0000000000000003e-29  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.00000199018  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2049  single-strand binding protein  48.76 
 
 		 138 aa  123  7e-28  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3926  single-strand binding protein  48.11 
 
 		 156 aa  102  1e-21  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2388  single-strand binding protein  47.22 
 
 		 138 aa  102  1e-21  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.875154 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_3808  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 163 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.39281  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3951  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.290115  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3865  single-strand binding protein  49.06 
 
 		 161 aa  101  3e-21  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.672811  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1124  single-strand binding protein  48.62 
 
 		 156 aa  99.8  1e-20  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.228328  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4110  single-strand binding protein  40.98 
 
 		 192 aa  99  2e-20  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.000157926  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_1545  single-strand binding protein  49.07 
 
 		 166 aa  97.8  4e-20  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  hitchhiker  0.00898888  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2223  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 164 aa  97.4  5e-20  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  decreased coverage  0.000000351539  normal  0.108037 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3307  single-strand binding protein  46.22 
 
 		 167 aa  96.3  1e-19  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.358097  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0640  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 225 aa  96.3  1e-19  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  unclonable  0.0000000164603  unclonable  0.0000000189971 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_4025  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 231 aa  95.9  2e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  unclonable  0.0000000941126  unclonable  0.000000000110243 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1595  single-strand binding protein  45.05 
 
 		 184 aa  95.9  2e-19  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0535  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 220 aa  94.7  3e-19  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000686084  normal  1 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0813  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 180 aa  94.7  4e-19  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.307719 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3710  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 242 aa  94  7e-19  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  unclonable  0.000000000568362  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2690  single-strand binding protein  43.93 
 
 		 172 aa  93.6  9e-19  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0960941  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2703  single-strand binding protein  45.28 
 
 		 175 aa  93.6  9e-19  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1964  single-strand binding protein  42.11 
 
 		 166 aa  93.2  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.0586806  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_0455  single-strand binding protein  46.73 
 
 		 174 aa  93.2  1e-18  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  hitchhiker  0.00934995  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0779  single-strand binding protein  42.15 
 
 		 147 aa  93.2  1e-18  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4963  single-strand binding protein  45.79 
 
 		 166 aa  92.8  1e-18  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008826  Mpe_B0351  single-stranded DNA-binding protein  41.67 
 
 		 169 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.0967385  normal  0.582722 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0111  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 173 aa  92.4  2e-18  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  hitchhiker  0.00797744  hitchhiker  0.00729769 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0261  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 163 aa  92.4  2e-18  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0918801  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0555  single-strand binding protein  45.37 
 
 		 183 aa  92.8  2e-18  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0223  single-strand binding protein  40.34 
 
 		 172 aa  91.7  3e-18  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1683  putative single-strand binding protein  41.44 
 
 		 213 aa  90.9  5e-18  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1019  single-strand binding protein  44.86 
 
 		 176 aa  91.3  5e-18  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0415033  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0027  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 175 aa  90.5  6e-18  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.664632  normal  0.0441795 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0746  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 161 aa  90.9  6e-18  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  unclonable  0.00000000549741  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4439  single-strand binding protein  42.73 
 
 		 170 aa  90.5  7e-18  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1958  single-strand binding protein  41.44 
 
 		 219 aa  90.1  9e-18  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  decreased coverage  0.0000182579  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0828  single-strand binding protein  40.34 
 
 		 176 aa  89.7  1e-17  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  hitchhiker  0.00178667  hitchhiker  0.000998915 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1992  single-strand binding protein  42.99 
 
 		 230 aa  89.4  1e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000347052  decreased coverage  0.0000711736 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1527  single-strand binding protein  41.59 
 
 		 152 aa  88.6  3e-17  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.52347  normal  0.0316845 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2200  single-strand binding protein  39.66 
 
 		 157 aa  88.2  3e-17  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  0.886044 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2149  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 165 aa  87.8  4e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2576  single-strand binding protein  40.37 
 
 		 158 aa  88.2  4e-17  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2151  single-strand binding protein  39.67 
 
 		 139 aa  87.4  6e-17  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0325  single-strand binding protein  41.28 
 
 		 160 aa  87  7e-17  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0643  ssDNA-binding protein  40.19 
 
 		 157 aa  85.5  2e-16  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  5.25623e-22  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2424  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 167 aa  85.9  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  decreased coverage  0.00208547  normal  1 
 
 
-
 
NC_002936  DET1045  single-strand binding protein  43.52 
 
 		 135 aa  85.1  3e-16  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000000383918  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0483  single-strand binding protein  39.81 
 
 		 156 aa  85.1  3e-16  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3401  single-strand binding protein  40.83 
 
 		 151 aa  85.1  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.413025  normal  0.54881 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3391  single-strand binding protein  37.5 
 
 		 222 aa  85.1  3e-16  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1462  single-stranded DNA-binding protein  39.25 
 
 		 120 aa  84.7  4e-16  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  unclonable  0.0000000000000299636  hitchhiker  0.000565917 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0327  single-strand binding protein  41.58 
 
 		 201 aa  84.7  4e-16  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.00747942  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2393  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 150 aa  84.3  5e-16  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000094495  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2303  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 171 aa  84.3  5e-16  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  0.0375599  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3392  single-strand binding protein  37.38 
 
 		 123 aa  84.3  5e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.196775 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_0996  single-stranded DNA-binding protein  39.81 
 
 		 175 aa  84  7e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  unclonable  0.00000000000000269191  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0255  single-strand binding protein  38.84 
 
 		 139 aa  84  7e-16  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1863  single-strand binding protein  42.98 
 
 		 166 aa  83.6  8e-16  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.621974 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0421  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.89 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl0397  single-strand binding protein (SSB) (helix-destabilizing protein)  38.89 
 
 		 159 aa  83.6  9e-16  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1823  single-strand DNA binding protein  42.06 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  unclonable  0.0000000500943  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4397  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 149 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.00000143406  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0928  single-strand binding protein  42.59 
 
 		 135 aa  83.2  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.000000199282  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0362  single-strand binding protein  46 
 
 		 147 aa  82.8  0.000000000000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000000141012  normal  1 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0980  single-strand binding protein  41.18 
 
 		 136 aa  83.2  0.000000000000001  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0370  single-stranded DNA-binding protein  42.06 
 
 		 158 aa  83.2  0.000000000000001  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  unclonable  4.28253e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_916  single-stranded DNA-binding protein  42.59 
 
 		 135 aa  83.6  0.000000000000001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  decreased coverage  0.0000000000232202  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0200  single-strand binding protein  38.84 
 
 		 139 aa  83.6  0.000000000000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0817  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 188 aa  82.4  0.000000000000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.517323  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1362  single-strand binding protein  41.53 
 
 		 146 aa  82.4  0.000000000000002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  decreased coverage  0.000000000124693  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0637  single-strand binding protein  42.45 
 
 		 133 aa  82  0.000000000000002  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  hitchhiker  0.000000900407  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5071  single-strand binding protein  43.4 
 
 		 186 aa  82  0.000000000000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.836187 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1149  single-stranded DNA-binding protein  38.32 
 
 		 119 aa  82  0.000000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00499901 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3665  single-strand binding protein  43.43 
 
 		 180 aa  82  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  hitchhiker  0.00000121761  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2140  single-strand binding protein  39.62 
 
 		 160 aa  81.6  0.000000000000003  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.0840686 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1350  single-strand binding protein  41.12 
 
 		 134 aa  81.3  0.000000000000004  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.000000023456  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0865  single-strand-binding protein  34.75 
 
 		 120 aa  81.3  0.000000000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.0459658  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0148  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 200 aa  81.3  0.000000000000004  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  decreased coverage  0.000650066  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_00235  single-strand binding protein  40.57 
 
 		 196 aa  81.6  0.000000000000004  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.508026  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3307  single-strand binding protein  42.06 
 
 		 140 aa  81.3  0.000000000000004  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.000227913  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1729  single-stranded DNA binding protein  38.89 
 
 		 149 aa  81.3  0.000000000000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3117  single-strand binding protein  45 
 
 		 146 aa  80.9  0.000000000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0130  single-strand binding protein  41.51 
 
 		 142 aa  81.3  0.000000000000005  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0450  single-strand binding protein  38.39 
 
 		 188 aa  80.9  0.000000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.544035  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1469  single-strand binding protein  38.32 
 
 		 121 aa  80.9  0.000000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.254699  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1676  single-strand binding protein  40.8 
 
 		 158 aa  80.9  0.000000000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1595  single-strand DNA-binding protein  40 
 
 		 129 aa  80.9  0.000000000000006  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.0000620191  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0674  single-strand binding protein  37.82 
 
 		 136 aa  80.5  0.000000000000007  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000262978  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A0369  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  80.5  0.000000000000008  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007984  BCI_0107  single-strand binding protein  43.88 
 
 		 165 aa  80.5  0.000000000000008  Baumannia cicadellinicola str. Hc (Homalodisca coagulata)  Bacteria  normal  0.0655467  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0691  single-strand binding protein  43.56 
 
 		 182 aa  79.7  0.00000000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0749  single-stranded DNA-binding protein  43.88 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  0.0561709 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3850  single-stranded DNA-binding protein  43.88 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0315  single-stranded DNA-binding protein  38.89 
 
 		 181 aa  80.1  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3975  single-strand binding protein  38.18 
 
 		 146 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  unclonable  0.00000000156614  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_4062  single-strand binding protein  38.89 
 
 		 148 aa  79.7  0.00000000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3760  single-stranded DNA-binding protein  43.88 
 
 		 182 aa  79.3  0.00000000000001  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.637198  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_4066  single-strand binding protein  41.67 
 
 		 181 aa  79.3  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2184  single-strand binding protein  40.74 
 
 		 160 aa  79.7  0.00000000000001  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>