More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_2009 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_2009  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
752 aa  1501    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1619  multi-sensor signal transduction histidine kinase  43.65 
 
 
899 aa  275  2.0000000000000002e-72  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3419  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.35 
 
 
899 aa  256  9e-67  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4657  multi-sensor signal transduction histidine kinase  41.81 
 
 
893 aa  252  2e-65  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.36 
 
 
880 aa  211  3e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2494  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.84 
 
 
489 aa  201  5e-50  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal  0.228009 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0250  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.31 
 
 
612 aa  199  1.0000000000000001e-49  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0530317 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1571  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.09 
 
 
592 aa  199  2.0000000000000003e-49  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  decreased coverage  0.0000011549  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.79 
 
 
589 aa  197  8.000000000000001e-49  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4061  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.35 
 
 
885 aa  195  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.193403  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0828  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.59 
 
 
604 aa  194  5e-48  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  unclonable  0.000000000197924  normal  0.403449 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2921  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.08 
 
 
589 aa  193  1e-47  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0234  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
581 aa  193  1e-47  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0136  sensory box sensor histidine kinase  29.93 
 
 
581 aa  192  2.9999999999999997e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.75 
 
 
537 aa  191  4e-47  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1418  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.03 
 
 
444 aa  191  5e-47  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0140272  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2295  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.49 
 
 
905 aa  189  1e-46  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_144  sensor kinase, two-component system, OmpR family  29.81 
 
 
581 aa  189  2e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1987  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.18 
 
 
577 aa  189  2e-46  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0589  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.67 
 
 
581 aa  188  3e-46  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.59 
 
 
460 aa  187  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3156  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.68 
 
 
587 aa  187  9e-46  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.619386  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1898  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
571 aa  186  1.0000000000000001e-45  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.589687  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4452  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.61 
 
 
2153 aa  185  2.0000000000000003e-45  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.758306 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1757  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.67 
 
 
614 aa  186  2.0000000000000003e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0484  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.51 
 
 
901 aa  183  8.000000000000001e-45  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0770667 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3170  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
911 aa  182  1e-44  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1702  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.18 
 
 
608 aa  182  1e-44  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2621  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
610 aa  183  1e-44  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.272408  normal 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0336  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
612 aa  182  2e-44  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.84228  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3408  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.13 
 
 
608 aa  182  2e-44  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_3611  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.63 
 
 
566 aa  182  2e-44  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.716129  hitchhiker  0.000346414 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21630  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.76 
 
 
594 aa  181  2.9999999999999997e-44  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000143993  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1272  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.64 
 
 
584 aa  180  8e-44  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1970  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.67 
 
 
555 aa  179  1e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.18999  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1727  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  31.02 
 
 
590 aa  179  2e-43  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1078  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.93 
 
 
458 aa  178  3e-43  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0012  multi-sensor signal transduction histidine kinase  35.25 
 
 
2783 aa  177  4e-43  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.296104 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
600 aa  175  1.9999999999999998e-42  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.71 
 
 
609 aa  176  1.9999999999999998e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0007  sensory box histidine kinase  29.15 
 
 
762 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2951  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.05 
 
 
584 aa  174  6.999999999999999e-42  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0805  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.28 
 
 
2161 aa  174  6.999999999999999e-42  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.354922 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5258  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.19 
 
 
611 aa  172  2e-41  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.197794  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4005  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.84 
 
 
619 aa  172  2e-41  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.402475  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5347  sensory box histidine kinase YycG  27.59 
 
 
613 aa  171  3e-41  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000719997  hitchhiker  0.000000000000990225 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4852  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.92 
 
 
884 aa  171  3e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_0382  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.64 
 
 
577 aa  171  5e-41  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.0000000224875  normal  0.139003 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1693  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.19 
 
 
608 aa  171  7e-41  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.575555  decreased coverage  0.000125186 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3393  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.3 
 
 
607 aa  170  1e-40  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.391866  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4114  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.24 
 
 
3470 aa  169  1e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0019  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.3 
 
 
608 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0019  PAS sensor protein  29.3 
 
 
608 aa  169  2e-40  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2503  ATP-binding region ATPase domain protein  29.08 
 
 
586 aa  169  2e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  0.626629  normal  0.221976 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0633  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.27 
 
 
596 aa  168  4e-40  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.987147  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1031  histidine kinase  33.43 
 
 
617 aa  167  5e-40  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0770  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.04 
 
 
599 aa  167  5.9999999999999996e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1740  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.93 
 
 
1319 aa  167  6.9999999999999995e-40  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4530  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.53 
 
 
492 aa  167  8e-40  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0351302  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2902  multi-sensor signal transduction histidine kinase  25.85 
 
 
612 aa  166  1.0000000000000001e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.84 
 
 
623 aa  166  1.0000000000000001e-39  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5588  sensory box histidine kinase YycG  27.65 
 
 
613 aa  167  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.8382  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0020  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  27.2 
 
 
621 aa  166  2.0000000000000002e-39  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3226  multi-sensor Signal transduction histidine kinase  28.43 
 
 
650 aa  165  2.0000000000000002e-39  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS5318  sensory box histidine kinase YycG  27.81 
 
 
613 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5714  sensory box histidine kinase YycG  27.81 
 
 
613 aa  165  3e-39  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0985  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.4 
 
 
597 aa  165  3e-39  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.0752971 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0009  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.41 
 
 
754 aa  164  7e-39  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1491  PAS sensor protein  29.94 
 
 
584 aa  164  7e-39  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.419494  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5614  sensory box histidine kinase YycG  27.81 
 
 
613 aa  163  9e-39  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5146  sensor histidine kinase  27.59 
 
 
613 aa  163  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5162  sensor histidine kinase  27.43 
 
 
613 aa  163  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2218  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
597 aa  163  1e-38  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5649  sensory box histidine kinase YycG  27.59 
 
 
613 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0306249  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5571  sensory box histidine kinase YycG  27.59 
 
 
613 aa  163  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.51773e-30 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1437  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.45 
 
 
785 aa  163  1e-38  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0708  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.34 
 
 
453 aa  162  2e-38  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0912  two-component sensor histidine kinase  27.42 
 
 
689 aa  162  2e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0147  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.44 
 
 
588 aa  162  3e-38  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  normal  0.96879 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2788  histidine kinase  37.44 
 
 
576 aa  160  5e-38  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0836  sensor histidine kinase PAS domain-containing protein  28.83 
 
 
599 aa  161  5e-38  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.342989  normal  0.397263 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3041  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.41 
 
 
873 aa  160  7e-38  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.616698  normal  0.0609988 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0102  multi-sensor signal transduction histidine kinase  34.75 
 
 
763 aa  160  8e-38  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0881  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.69 
 
 
590 aa  160  8e-38  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17681  two-component sensor histidine kinase  27.22 
 
 
689 aa  160  8e-38  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.335797  normal 
 
 
-
 
NC_002976  SERP2533  sensory box histidine kinase YycG  26.82 
 
 
610 aa  160  9e-38  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0773  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.31 
 
 
590 aa  160  1e-37  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.264921  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0403  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.95 
 
 
597 aa  159  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0047  alginate biosynthesis sensor protein KinB  30.34 
 
 
596 aa  160  1e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  normal  0.4033 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2868  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.58 
 
 
593 aa  159  1e-37  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_5096  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.07 
 
 
592 aa  160  1e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.207763 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0065  Signal transduction histidine kinase  26.9 
 
 
621 aa  160  1e-37  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4049  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30 
 
 
468 aa  159  1e-37  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.156826  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0068  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.55 
 
 
604 aa  159  1e-37  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0412  multi-sensor signal transduction histidine kinase  38.24 
 
 
695 aa  160  1e-37  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1393  multi-sensor signal transduction histidine kinase  27.29 
 
 
589 aa  159  2e-37  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000411549  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.85 
 
 
625 aa  159  2e-37  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15271  two-component sensor histidine kinase  27.99 
 
 
688 aa  158  4e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0782  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.51 
 
 
584 aa  157  7e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05451  two-component sensor histidine kinase  26.94 
 
 
685 aa  157  9e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>