81 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1965 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1965  polysaccharide biosynthesis protein  100 
 
 
463 aa  905    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.0295315 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2455  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
434 aa  157  3e-37  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0025  hypothetical protein  24.48 
 
 
439 aa  109  1e-22  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000686013  hitchhiker  0.00952871 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1846  polysaccharide biosynthesis protein  33.33 
 
 
433 aa  103  8e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3876  polysaccharide biosynthesis protein  31.55 
 
 
427 aa  101  3e-20  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2139  polysaccharide biosynthesis protein  32.07 
 
 
482 aa  97.8  4e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.00876576  normal  0.418146 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2777  O-antigen transporter  28.7 
 
 
413 aa  83.6  0.000000000000008  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.273029 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4269  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
440 aa  82.8  0.00000000000001  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0506  polysaccharide biosynthesis protein  27.46 
 
 
583 aa  74.7  0.000000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05310  hypothetical protein  30.28 
 
 
433 aa  74.7  0.000000000003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.198261  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1352  polysaccharide biosynthesis protein  25.63 
 
 
424 aa  71.2  0.00000000003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6501  Membrane protein involved in the export of O- antigen and teichoic acid-like protein  27.98 
 
 
448 aa  71.2  0.00000000004  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2185  hypothetical protein  26.93 
 
 
431 aa  70.1  0.00000000008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.483086  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1069  polysaccharide biosynthesis protein  30.34 
 
 
512 aa  68.2  0.0000000003  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.544527 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0736  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 
439 aa  67.8  0.0000000004  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3509  polysaccharide biosynthesis protein  27.27 
 
 
444 aa  65.9  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.00438e-16 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0483  polysaccharide biosynthesis protein  30.12 
 
 
477 aa  64.7  0.000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1020  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 
490 aa  62.4  0.00000002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_3041  polysaccharide biosynthesis protein  26.95 
 
 
471 aa  62  0.00000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0601  putative membrane protein involved in the export of O-antigen and teichoic acid  31.28 
 
 
424 aa  61.2  0.00000003  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1424  polysaccharide biosynthesis protein  23.44 
 
 
444 aa  61.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2028  polysaccharide biosynthesis protein  27.22 
 
 
423 aa  60.5  0.00000007  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.134656  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2304  polysaccharide biosynthesis protein  29.17 
 
 
494 aa  60.5  0.00000007  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.298994  normal  0.0362143 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2015  polysaccharide biosynthesis protein  23.49 
 
 
466 aa  60.1  0.00000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.42395 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1593  polysaccharide biosynthesis protein  30.77 
 
 
504 aa  59.7  0.0000001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1128  polysaccharide biosynthesis protein  27.94 
 
 
547 aa  59.3  0.0000001  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0929  polysaccharide biosynthesis protein  24.09 
 
 
489 aa  58.5  0.0000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3272  polysaccharide biosynthesis protein  28.93 
 
 
546 aa  58.5  0.0000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.509561  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0532  polysaccharide biosynthesis protein  25.37 
 
 
449 aa  58.2  0.0000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6017  polysaccharide efflux transporter  29.38 
 
 
506 aa  57.8  0.0000004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0341  polysaccharide biosynthesis protein  26.32 
 
 
500 aa  57.4  0.0000006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.467363  decreased coverage  0.0000100108 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2947  polysaccharide biosynthesis protein  28.86 
 
 
484 aa  57.4  0.0000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2047  polysaccharide biosynthesis protein  28.76 
 
 
504 aa  56.2  0.000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.82849  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3122  polysaccharide biosynthesis protein  25 
 
 
490 aa  55.5  0.000002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0414  polysaccharide biosynthesis protein  25.65 
 
 
500 aa  55.1  0.000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.37906  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2014  O-antigen and teichoic acid-like export protein  28.5 
 
 
439 aa  55.1  0.000003  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.601988  normal  0.638371 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22850  polysaccharide biosynthesis protein  22.77 
 
 
499 aa  53.9  0.000006  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2457  polysaccharide biosynthesis protein  27.8 
 
 
514 aa  53.9  0.000006  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.267844  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0040  polysaccharide biosynthesis protein  25.26 
 
 
435 aa  53.5  0.000008  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  hitchhiker  0.0000125854  normal  0.0319641 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_0869  polysaccharide biosynthesis protein  26.38 
 
 
509 aa  53.5  0.000009  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_2285  polysaccharide biosynthesis protein  30.06 
 
 
449 aa  53.1  0.00001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.398242  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1211  polysaccharide biosynthesis protein  24.74 
 
 
489 aa  52  0.00002  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.401485 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1123  transporter  27.14 
 
 
488 aa  52  0.00002  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4201  polysaccharide biosynthesis protein  26.37 
 
 
487 aa  52.4  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.964317 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3093  O-antigen and teichoic acid-like export protein  22.79 
 
 
507 aa  52.4  0.00002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.116162  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1495  polysaccharide biosynthesis protein  28.08 
 
 
503 aa  51.6  0.00003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.994963  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3446  polysaccharide biosynthesis protein  25.81 
 
 
444 aa  51.2  0.00004  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.823308  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2181  polysaccharide biosynthesis protein  27.41 
 
 
482 aa  51.2  0.00004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000138361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2520  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 
474 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.889784 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1828  polysaccharide biosynthesis protein  27.49 
 
 
529 aa  51.2  0.00004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3018  polysaccharide biosynthesis protein  27.21 
 
 
468 aa  50.4  0.00007  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1120  polysaccharide biosynthesis protein  28.65 
 
 
478 aa  49.7  0.0001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.77221  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3983  polysaccharide biosynthesis associated protein  25.73 
 
 
467 aa  48.9  0.0002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0446  putative polysaccharide export protein  27.75 
 
 
360 aa  48.9  0.0002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2971  polysaccharide biosynthesis protein  24.86 
 
 
475 aa  48.5  0.0002  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.224966  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1836  polysaccharide biosynthesis protein  26.94 
 
 
446 aa  48.5  0.0002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_2064  polysaccharide biosynthesis protein  26.96 
 
 
468 aa  47.8  0.0004  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0172  polysaccharide biosynthesis protein  25.08 
 
 
433 aa  47.8  0.0004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.663645  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0621  polysaccharide biosynthesis protein  24.32 
 
 
475 aa  47.8  0.0004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.914686  normal  0.0318754 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3797  polysaccharide biosynthesis protein  26.56 
 
 
461 aa  47.4  0.0006  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.683173  normal  0.302663 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2184  putative polysaccharide biosynthesis protein  22.98 
 
 
476 aa  47  0.0007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00000339542  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2664  hypothetical protein  25.67 
 
 
485 aa  46.6  0.0008  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1670  MATE efflux family protein  28.16 
 
 
466 aa  46.2  0.001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1384  polysaccharide biosynthesis protein  23.66 
 
 
440 aa  46.6  0.001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal  0.0293662 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0704  polysaccharide biosynthesis protein  28.92 
 
 
423 aa  46.2  0.001  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.786824  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2756  polysaccharide biosynthesis protein  25.83 
 
 
476 aa  46.6  0.001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.1976  normal  0.927782 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2653  polysaccharide biosynthesis protein  24.23 
 
 
448 aa  46.6  0.001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.0424985 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3541  polysaccharide biosynthesis protein  25.99 
 
 
474 aa  46.6  0.001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2073  polysaccharide biosynthesis protein  27.84 
 
 
492 aa  45.8  0.001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2438  polysaccharide biosynthesis protein  27.6 
 
 
495 aa  45.8  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3437  polysaccharide biosynthesis protein  22.36 
 
 
483 aa  45.4  0.002  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.655907  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0945  multi antimicrobial extrusion protein MatE  25.48 
 
 
495 aa  45.1  0.003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.903745  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4091  polysaccharide biosynthesis protein  20 
 
 
430 aa  44.7  0.004  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3355  polysaccharide biosynthesis protein  22.44 
 
 
423 aa  44.7  0.004  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1963  colanic acid exporter  24.07 
 
 
493 aa  44.3  0.004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1044  polysaccharide biosynthesis protein  26.92 
 
 
440 aa  44.3  0.004  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.041441  hitchhiker  0.00655602 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0406  polysaccharide biosynthesis protein  24.79 
 
 
458 aa  44.3  0.005  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1841  MATE efflux family protein  36.49 
 
 
469 aa  43.9  0.006  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0144  polysaccharide biosynthesis protein  29.9 
 
 
423 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.232636  normal  0.0172475 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2892  polysaccharide biosynthesis protein  26.55 
 
 
429 aa  43.9  0.007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008532  STER_1057  PST family polysaccharide transporter  26.86 
 
 
471 aa  43.1  0.009  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.140128  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>