23 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1878 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1878  cell wall hydrolase/autolysin  100 
 
 		 380 aa  753    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.0023458  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0094  cell wall hydrolase/autolysin  49.48 
 
 		 342 aa  258  1e-67  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1578  cell wall hydrolase/autolysin  28.57 
 
 		 240 aa  54.3  0.000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.36346  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2360  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  30.81 
 
 		 344 aa  52  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.26107  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_4010  cell wall hydrolase/autolysin  27.81 
 
 		 254 aa  50.8  0.00004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.864975  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2753  cell wall hydrolase/autolysin  26.98 
 
 		 254 aa  48.9  0.0001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.984252  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0776  cell wall hydrolase/autolysin  26.29 
 
 		 236 aa  48.5  0.0002  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0671  cell wall hydrolase/autolysin  26.74 
 
 		 320 aa  48.9  0.0002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_06811  cell wall hydrolase/autolysin  29.94 
 
 		 364 aa  47.8  0.0003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.197381  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1668  cell wall hydrolase/autolysin  27.87 
 
 		 213 aa  47.8  0.0003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.462607  normal  0.158626 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_15510  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.78 
 
 		 746 aa  47.4  0.0005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0290  cell wall hydrolase/autolysin  27.21 
 
 		 283 aa  46.2  0.0008  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0743  cell wall hydrolase/autolysin  23.98 
 
 		 249 aa  46.6  0.0008  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.508174  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1398  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase domain-containing protein  25.56 
 
 		 241 aa  44.7  0.002  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.373553  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_06421  cell wall hydrolase/autolysin  32.35 
 
 		 361 aa  44.3  0.004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3732  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.38 
 
 		 338 aa  43.5  0.005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  unclonable  0.00000534753  normal  0.117524 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0862  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.09 
 
 		 619 aa  43.5  0.006  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  hitchhiker  0.00159133  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1281  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  29.32 
 
 		 287 aa  43.5  0.006  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1465  cell wall hydrolase/autolysin  30.23 
 
 		 627 aa  43.5  0.006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000155726  normal  0.0455493 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4394  cell wall hydrolase/autolysin  26.4 
 
 		 296 aa  43.1  0.007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3678  N-acetylmuramoyl-L-alanine amidase  28.38 
 
 		 338 aa  43.1  0.008  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_10331  cell wall hydrolase/autolysin  29.14 
 
 		 362 aa  43.1  0.008  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.374691  normal  0.548996 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2134  cell wall hydrolase/autolysin  26.14 
 
 		 349 aa  43.1  0.008  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.373316  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>