More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1858 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011831  Cagg_1858  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 227 aa  452  1.0000000000000001e-126  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0761  two component transcriptional regulator  65.62 
 
 		 229 aa  312  2.9999999999999996e-84  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.179681 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4445  two component transcriptional regulator  64 
 
 		 229 aa  309  2e-83  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.14031 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2725  two component transcriptional regulator  53.81 
 
 		 226 aa  251  7e-66  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.0716975  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2658  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.13 
 
 		 234 aa  199  3e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0249  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.96 
 
 		 232 aa  198  3.9999999999999996e-50  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 231 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4344  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 239 aa  194  8.000000000000001e-49  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.325933  normal  0.345767 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0195  two component transcriptional regulator  46.19 
 
 		 243 aa  194  9e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00716616 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2343  two component transcriptional regulator  47.09 
 
 		 243 aa  194  1e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00929975  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.84 
 
 		 247 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.520505  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.98 
 
 		 231 aa  193  2e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2262  two component transcriptional regulator  44.93 
 
 		 231 aa  192  2e-48  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0080  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.44 
 
 		 230 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5254  regulatory protein VanR  42.48 
 
 		 234 aa  192  5e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3248  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 224 aa  191  6e-48  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1875  response regulator receiver  43.3 
 
 		 230 aa  191  1e-47  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.72432  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4801  response regulator protein  42.04 
 
 		 234 aa  189  4e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0000584394  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.64 
 
 		 229 aa  189  4e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4157  winged helix family two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  187  1e-46  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.507569  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1498  two component transcriptional regulator  45.13 
 
 		 247 aa  187  1e-46  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.220919  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1711  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  187  2e-46  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0359  two component transcriptional regulator  45.06 
 
 		 236 aa  187  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.274157  normal  0.104876 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2274  two component transcriptional regulator  44.1 
 
 		 231 aa  186  2e-46  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4029  two component transcriptional regulator  40.97 
 
 		 241 aa  186  3e-46  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.871415 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3729  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3104  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 233 aa  186  4e-46  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.317177  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3482  two component transcriptional regulator  40.09 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_2051  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  40.09 
 
 		 230 aa  185  4e-46  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.191031  normal  0.53595 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3600  two component transcriptional regulator  43.42 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1963  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 246 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.470012 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1936  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.25 
 
 		 246 aa  183  1.0000000000000001e-45  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_5207  winged helix family two component transcriptional regulator  44.25 
 
 		 247 aa  184  1.0000000000000001e-45  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  47.49 
 
 		 228 aa  184  1.0000000000000001e-45  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0439  two component transcriptional regulator  43.44 
 
 		 225 aa  184  1.0000000000000001e-45  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000223011  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3518  two component transcriptional regulator  39.32 
 
 		 234 aa  183  2.0000000000000003e-45  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1791  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 240 aa  182  3e-45  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000000442123 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_1312  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.6 
 
 		 232 aa  182  4.0000000000000006e-45  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  0.1865 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3742  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.36 
 
 		 263 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3637  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.81 
 
 		 246 aa  182  4.0000000000000006e-45  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0294  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 233 aa  182  5.0000000000000004e-45  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4663  two component transcriptional regulator  45.81 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0994  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 232 aa  182  5.0000000000000004e-45  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5905  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.98 
 
 		 237 aa  181  6e-45  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_10580  Response regulator  43.23 
 
 		 229 aa  181  6e-45  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4937  two component transcriptional regulator  43.81 
 
 		 257 aa  181  7e-45  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.565868 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2313  two component transcriptional regulator  40.17 
 
 		 228 aa  181  8.000000000000001e-45  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0313786  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.38 
 
 		 234 aa  181  9.000000000000001e-45  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2246  KDP operon transcriptional regulatory protein kdpE  39.65 
 
 		 230 aa  180  1e-44  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.683582  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_2200  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.365248  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3248  two component transcriptional regulator  42.6 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.743  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_2322  two component transcriptional regulator  41.85 
 
 		 232 aa  181  1e-44  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.521655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1493  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.86 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1714  two component transcriptional regulator, winged helix family  41.07 
 
 		 234 aa  180  2e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.233786  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0303  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 233 aa  180  2e-44  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0610099  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0242  response regulator  42.04 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA1872  DNA-binding response regulator KdpE  42.11 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.0800306  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1397  DNA-binding response regulator KdpE  42.11 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.089264  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0371  DNA-binding response regulator KdpE  42.11 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_24530  Response regulator KdpE  42.15 
 
 		 232 aa  180  2e-44  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.0689152  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1254  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  42.11 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  decreased coverage  0.00667548  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1025  DNA-binding response regulator KdpE  42.11 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0779  DNA-binding response regulator KdpE  42.11 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.97246  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1587  two component transcriptional regulator, winged helix family  40.09 
 
 		 231 aa  180  2e-44  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1246  KDP operon transcriptional regulatory protein KdpE  42.11 
 
 		 232 aa  179  2e-44  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1088  DNA-binding response regulator KdpE  42.11 
 
 		 234 aa  179  2e-44  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0296  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 233 aa  179  2e-44  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0256  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0245  response regulator  41.59 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3636  two-component response regulator KdpE  41.85 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.9171  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2289  response regulator receiver:transcriptional regulatory protein, C-terminal  44.05 
 
 		 231 aa  179  2.9999999999999997e-44  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  hitchhiker  0.0000420296  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0271  DNA-binding response regulator  41.59 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.439326  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0322  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 233 aa  179  2.9999999999999997e-44  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000418869  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1672  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.193412  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0488  two component transcriptional regulator, winged helix family  39.91 
 
 		 235 aa  179  2.9999999999999997e-44  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00220414 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.53 
 
 		 230 aa  179  2.9999999999999997e-44  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_2284  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.21195  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_2307  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 232 aa  179  2.9999999999999997e-44  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5021  DNA-binding response regulator  42.04 
 
 		 233 aa  179  4e-44  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0330449  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_20650  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  44.25 
 
 		 231 aa  178  7e-44  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0260682  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0509  two component transcriptional regulator  41.63 
 
 		 232 aa  178  7e-44  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.163629  normal  1 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2053  two component transcriptional regulator  43.05 
 
 		 232 aa  178  8e-44  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.745879 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0785  two component transcriptional regulator  42.54 
 
 		 229 aa  177  1e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0635827  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1750  two component transcriptional regulator  42.48 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4666  two component transcriptional regulator  40.89 
 
 		 233 aa  177  1e-43  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A5611  two component transcriptional regulator  41.41 
 
 		 232 aa  177  1e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0731674  normal  0.970504 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1784  alkaline phosphatase synthesis transcriptional regulatory protein  42.48 
 
 		 234 aa  177  1e-43  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.561076  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0095  two component transcriptional regulator  43.36 
 
 		 249 aa  177  1e-43  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0942  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.0532517  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_43340  two-component response regulator KdpE  41.26 
 
 		 230 aa  177  1e-43  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.807414  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0939  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.89 
 
 		 231 aa  177  1e-43  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.102691  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1892  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.29 
 
 		 228 aa  177  2e-43  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.0000392  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2813  two component transcriptional regulator  36.73 
 
 		 231 aa  176  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000151023  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0019  two component transcriptional regulator  43.11 
 
 		 235 aa  177  2e-43  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1847  two component transcriptional regulator  40.36 
 
 		 234 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000121968  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.79 
 
 		 232 aa  177  2e-43  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4619  two component transcriptional regulator  40.54 
 
 		 245 aa  176  3e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0926269 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0450  two component transcriptional regulator  42.08 
 
 		 232 aa  176  3e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.153023  normal  0.103513 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_08590  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  43.84 
 
 		 239 aa  176  3e-43  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  0.857083 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2378  two component transcriptional regulator  41.67 
 
 		 262 aa  175  4e-43  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  1  normal  0.936352 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>