More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Cagg_1834 on replicon NC_011831
Organism: Chloroflexus aggregans DSM 9485



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011831  Cagg_1834  (Uracil-5)-methyltransferase  100 
 
 
398 aa  816    Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3339  (Uracil-5)-methyltransferase  54.59 
 
 
405 aa  406  1.0000000000000001e-112  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.0683491  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3894  (Uracil-5)-methyltransferase  52.97 
 
 
407 aa  392  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1216  RNA methyltransferase  31.33 
 
 
452 aa  207  2e-52  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0994  RNA methyltransferase, TrmA family  30.57 
 
 
457 aa  195  1e-48  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2258  RNA methyltransferase, TrmA family  29.05 
 
 
456 aa  189  8e-47  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0702589  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1688  RNA methyltransferase, TrmA family  31.12 
 
 
476 aa  186  5e-46  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.618499 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2060  RNA methyltransferase  33.84 
 
 
468 aa  181  2e-44  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  normal  0.23059 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1383  RNA methyltransferase, TrmA family  34.55 
 
 
479 aa  181  2.9999999999999997e-44  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1544  RNA methyltransferase  28.61 
 
 
435 aa  180  4e-44  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.144945  n/a   
 
 
-
 
NC_010830  Aasi_0005  TrmA family RNA methyltransferase  29.65 
 
 
468 aa  177  2e-43  Candidatus Amoebophilus asiaticus 5a2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2557  RNA methyltransferase, TrmA family  32.49 
 
 
466 aa  175  9.999999999999999e-43  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_2332  RNA methyltransferase, TrmA family  31.94 
 
 
478 aa  174  2.9999999999999996e-42  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.45026 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0862  RNA methyltransferase, TrmA family  29.16 
 
 
472 aa  171  1e-41  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_2518  RNA methyltransferase  29.25 
 
 
479 aa  172  1e-41  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1235  RNA methyltransferase, TrmA family  32.66 
 
 
462 aa  171  2e-41  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0289  RNA methyltransferase  30.24 
 
 
488 aa  171  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.198099  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0340  RNA methyltransferase  28.72 
 
 
446 aa  167  2.9999999999999998e-40  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  0.0121257  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_08576  putative RNA methyltransferase  27.23 
 
 
470 aa  167  2.9999999999999998e-40  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.695835  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1225  RNA methyltransferase, TrmA family  32.46 
 
 
457 aa  164  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2500  RNA methyltransferase  27.8 
 
 
470 aa  164  2.0000000000000002e-39  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1818  RNA methyltransferase  27.67 
 
 
446 aa  164  3e-39  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_2518  RNA methyltransferase, TrmA family  30.94 
 
 
482 aa  164  4.0000000000000004e-39  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.391256  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1722  RNA methyltransferase  30.24 
 
 
439 aa  163  5.0000000000000005e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2370  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.11 
 
 
451 aa  162  8.000000000000001e-39  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2082  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  31.19 
 
 
452 aa  162  1e-38  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_1077  RNA methyltransferase, TrmA family  26.49 
 
 
465 aa  161  2e-38  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  hitchhiker  0.00000901811  normal  0.660905 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1649  RNA methyltransferase  29.44 
 
 
439 aa  161  2e-38  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1585  RNA methyltransferase  29.93 
 
 
471 aa  160  4e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.953972  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0406  RNA methyltransferase  28.2 
 
 
387 aa  158  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.59395  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2558  RNA methyltransferase, TrmA family  29.51 
 
 
480 aa  158  2e-37  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1355  RNA methyltransferase  30.73 
 
 
463 aa  158  2e-37  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.547923  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2868  RNA methyltransferase, TrmA family  30.08 
 
 
460 aa  157  4e-37  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00253017  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2157  RNA methyltransferase, TrmA family  28.22 
 
 
471 aa  157  4e-37  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.615925  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0703  RNA methyltransferase, TrmA family  29.55 
 
 
448 aa  155  1e-36  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0337  RNA methyltransferase, TrmA family  30.39 
 
 
459 aa  153  4e-36  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.95395  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0643  RNA methyltransferase, TrmA family  26.97 
 
 
466 aa  153  5e-36  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1308  RNA methyltransferase, TrmA family  30.05 
 
 
467 aa  152  8e-36  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0782  RNA methyltransferase, TrmA family  30.87 
 
 
456 aa  152  1e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.14607  normal  0.115427 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1628  RNA methyltransferase, TrmA family  28.46 
 
 
415 aa  151  2e-35  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  hitchhiker  0.00000158934  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1197  RNA methyltransferase  28.17 
 
 
454 aa  151  2e-35  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.0000142692  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_2126  23S rRNA methyltransferase  29.1 
 
 
476 aa  150  5e-35  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.965938  normal  0.654469 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3623  RNA methyltransferase, TrmA family  28.19 
 
 
481 aa  149  6e-35  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1751  RNA methyltransferase  29.35 
 
 
453 aa  149  8e-35  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00216476  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2909  RNA methyltransferase, TrmA family  27.7 
 
 
488 aa  149  1.0000000000000001e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.501194  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1435  RNA methyltransferase  28.61 
 
 
456 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1951  RNA methyltransferase  28.17 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.602794  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1985  RNA methyltransferase  28.17 
 
 
453 aa  148  2.0000000000000003e-34  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0159  RNA methyltransferase  30.03 
 
 
468 aa  147  4.0000000000000006e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0412  RNA methyltransferase  28.17 
 
 
458 aa  145  1e-33  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2695  RNA methyltransferase  27.84 
 
 
457 aa  145  1e-33  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_03000  RNA methyltransferase, TrmA family  29.95 
 
 
453 aa  145  2e-33  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0428  RNA methyltransferase, TrmA family  29.12 
 
 
460 aa  144  3e-33  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_39526  predicted protein  31.69 
 
 
536 aa  144  3e-33  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.612078  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2369  RNA methyltransferase  30.89 
 
 
489 aa  143  7e-33  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  1.1321200000000002e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0542  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.82 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus AH187  Bacteria  decreased coverage  0.00000351254  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0542  RNA methyltransferase  27.53 
 
 
459 aa  140  4.999999999999999e-32  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.016081  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0404  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase  27.89 
 
 
459 aa  139  6e-32  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.039244  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0400  RNA methyltransferase  27.89 
 
 
459 aa  139  6e-32  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.955809  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0472  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.89 
 
 
459 aa  139  6e-32  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0491  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.89 
 
 
459 aa  139  6e-32  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.116806  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_2028  23S rRNA methyltransferase/RumA  26.8 
 
 
477 aa  139  7.999999999999999e-32  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0414  RNA methyltransferase  27.85 
 
 
459 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.340399  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0426  RNA methyltransferase  27.85 
 
 
459 aa  138  1e-31  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0313  RNA methyltransferase  29.06 
 
 
458 aa  139  1e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0311  RNA methyltransferase  29.66 
 
 
458 aa  137  2e-31  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2737  RNA methyltransferase  26.76 
 
 
476 aa  138  2e-31  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0363  RNA methyltransferase  28.2 
 
 
460 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0381  RNA methyltransferase, TrmA family  29.02 
 
 
454 aa  137  3.0000000000000003e-31  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.432112  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002503  23S rRNA (Uracil-5-)-methyltransferase rumA  30.03 
 
 
439 aa  137  4e-31  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.088353  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4832  RNA methyltransferase, TrmA family  27.78 
 
 
459 aa  137  4e-31  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.0000374128  normal 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0348  RNA methyltransferase  27.04 
 
 
455 aa  136  5e-31  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  0.359971  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1332  RNA methyltransferase, TrmA family  30.91 
 
 
447 aa  136  5e-31  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000710273 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0305  RNA methyltransferase  28.35 
 
 
458 aa  136  6.0000000000000005e-31  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0517475  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2893  RNA methyltransferase, TrmA family  30.23 
 
 
572 aa  136  8e-31  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0407  RNA methyltransferase, TrmA family  28.23 
 
 
458 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0301  RNA methyltransferase  28.08 
 
 
458 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0406  RNA methyltransferase  27.63 
 
 
459 aa  135  9.999999999999999e-31  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1493  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  31.46 
 
 
450 aa  135  9.999999999999999e-31  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.00115343  normal 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_0053  RNA methyltransferase, TrmA family  28.88 
 
 
415 aa  135  9.999999999999999e-31  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0318  RNA methyltransferase  28.08 
 
 
458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.875741  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0333  RNA methyltransferase  28.08 
 
 
458 aa  134  1.9999999999999998e-30  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1912  RNA methyltransferase  30.12 
 
 
473 aa  134  1.9999999999999998e-30  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  decreased coverage  0.000000000182205  normal 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4938  RNA methyltransferase, TrmA family  28.35 
 
 
454 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.0464028  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0365  RNA methyltransferase, TrmA family  28.08 
 
 
458 aa  135  1.9999999999999998e-30  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0357  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  27.3 
 
 
455 aa  134  1.9999999999999998e-30  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.820235  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_2801  RNA methyltransferase  31.15 
 
 
470 aa  134  3.9999999999999996e-30  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0241  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  30.47 
 
 
455 aa  133  5e-30  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.468571  normal  0.547918 
 
 
-
 
NC_002950  PG1095  RNA methyltransferase  27.76 
 
 
465 aa  133  6e-30  Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    normal  0.31205 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0232  RNA methyltransferase, TrmA family  24.01 
 
 
419 aa  133  6e-30  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000193721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2309  RNA methyltransferase  30.33 
 
 
493 aa  133  6e-30  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.12141  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0535  RNA methyltransferase  30.52 
 
 
465 aa  132  7.999999999999999e-30  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0455  RNA methyltransferase, TrmA family  28.39 
 
 
451 aa  132  9e-30  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_0391  RNA methyltransferase, TrmA family  30.47 
 
 
457 aa  131  2.0000000000000002e-29  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0147  tRNA (uracil-5-)-methyltransferase related enzyme  27.75 
 
 
496 aa  130  3e-29  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  0.689993  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1654  RNA methyltransferase  27.27 
 
 
554 aa  130  3e-29  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000278759  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1989  RNA methyltransferase, TrmA family  25.33 
 
 
451 aa  130  4.0000000000000003e-29  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.0553091  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_05160  23S rRNA (uracil-5-)-methyltransferase RumA  28.61 
 
 
401 aa  129  9.000000000000001e-29  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.368035  normal  0.582976 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2261  RNA methyltransferase  27.15 
 
 
457 aa  129  9.000000000000001e-29  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  unclonable  0.000000592232  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1438  RNA methyltransferase  29.38 
 
 
459 aa  128  1.0000000000000001e-28  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>